Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_15s0046g00030.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:15:17127531:17129315:1 gene:VIT_15s0046g00030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAACCGGTTGAAGCAAATCCAAGCTTACACCCTCAGAAATGGCATAGAACACACCAAA CAACTCATAGTGAGCCTCCTCCAAATCCCCAGTATTCCCTATGCACACAAACTGTTCGAC TTTATTCCTAAACCAACTGTTTTTCTCTATAACAAGCTCATTCAGGCCTACTCTTCACAT GGGCCTCACCATCAATGCTTTTCCCTCTACACTCAGATGTGCCTCCAAGGCTGCTCACCA AATGAACACTCCTTCACCTTCCTCTTTTCAGCTTGTGCCTCCCTTTCCTCCCACCAACAA GGCCGAATGCTGCACACCCATTTCGTAAAATCGGGGTTTGGTTGTGATGTTTTCGCCTTA ACTGCCTTGGTTGACATGTATGCTAAATTGGGCTTGTTATCATTGGCCAGAAAACAGTTT GATGAGATGACGGTAAGGGATGTGCCCACATGGAATTCAATGATTGCGGGTTATGCAAGG TGTGGGGATTTGGAGGGGGCTTTGGAGTTGTTCAGGTTGATGCCTGCTAGGAATGTGACT TCATGGACAGCAATGATATCTGGGTATGCGCAAAATGGGCAGTATGCGAAGGCCTTGTCG ATGTTTCTGATGATGGAAGAGGAGACAGAAATGAGGCCTAATGAAGTGACTCTGGCCAGT GTTCTGCCGGCATGTGCAAATCTCGGGGCATTGGAGGTTGGGGAGAGGATTGAAGTGTAC GCAAGGGGGAATGGTTACTTCAAGAACTTGTATGTGAGCAATGCATTGTTGGAAATGTAT GCAAGGTGTGGCAGAATTGATAAGGCATGGGGGGTGTTTGAGGAGATTGATGGCAGGAGA AACTTGTGCTCTTGGAATTCTATGATCATGGGGTTGGCTGTACATGGAAGATGCGATGAG GCTATTGAGCTTTTCTACAAAATGCTGAGAGAAGGAGCTGCACCCGACGATGTAACATTT GTTGGAGTTCTTTTAGCATGCACCCATGGAGGCATGGTTGTAGAAGGCCAGCATTTCTTT GAATCCATGGAGAGGGATTTCTCAATTGCTCCCAAACTGGAGCACTATGGATGCATGGTT GATTTGCTGGGTCGTGCTGGAGAATTGAGAGAAGCTCATGATCTCATACTAAGAATGCCA ATGGAACCAGATTCTGTGGTTTGGGGGACTCTTCTGGGGGCATGCAGTTTCCATGGCCAT GTAGAGCTGGCTGAAAAGGCAGCTGGGGCTCTCTTTGAGCTTGAGCCATCGAATCCTGGA AACTATGTCATTCTTTCCAATATTTATGCAACTGCAGGCCGATGGGATGGGGTTGCAAGG CTAAGGAAGCTCATGAAAGGTGGCAAGATTACAAAGGCAGCTGGATATAGTTTCATTGAG GAGGGAGGCCACATTCATAAATTCATTGTGGAGGATAGATCACATTCAAGATCTGATGAG ATATATGCATTACTGGATGAAGTTTCAATGAAGATGAAGCTTCATGGGAATGTAAATGAT TCAGATTCTGAAATCGAAACAGCATGCCTAATGGTGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_15s0046g00030.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:15:17127531:17129315:1 gene:VIT_15s0046g00030 transcript:VIT_15s0046g00030.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MNRLKQIQAYTLRNGIEHTKQLIVSLLQIPSIPYAHKLFDFIPKPTVFLYNKLIQAYSSH GPHHQCFSLYTQMCLQGCSPNEHSFTFLFSACASLSSHQQGRMLHTHFVKSGFGCDVFAL TALVDMYAKLGLLSLARKQFDEMTVRDVPTWNSMIAGYARCGDLEGALELFRLMPARNVT SWTAMISGYAQNGQYAKALSMFLMMEEETEMRPNEVTLASVLPACANLGALEVGERIEVY ARGNGYFKNLYVSNALLEMYARCGRIDKAWGVFEEIDGRRNLCSWNSMIMGLAVHGRCDE AIELFYKMLREGAAPDDVTFVGVLLACTHGGMVVEGQHFFESMERDFSIAPKLEHYGCMV DLLGRAGELREAHDLILRMPMEPDSVVWGTLLGACSFHGHVELAEKAAGALFELEPSNPG NYVILSNIYATAGRWDGVARLRKLMKGGKITKAAGYSFIEEGGHIHKFIVEDRSHSRSDE IYALLDEVSMKMKLHGNVNDSDSEIETACLMV

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_15s0046g00030.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:15:17127531:17129315:1 gene:VIT_15s0046g00030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	TGAGTTTGTTATGAACCGGTTGAAGCAAATCCAAGCTTACACCCTCAGAAATGGCATAGA ACACACCAAACAACTCATAGTGAGCCTCCTCCAAATCCCCAGTATTCCCTATGCACACAA ACTGTTCGACTTTATTCCTAAACCAACTGTTTTTCTCTATAACAAGCTCATTCAGGCCTA CTCTTCACATGGGCCTCACCATCAATGCTTTTCCCTCTACACTCAGATGTGCCTCCAAGG CTGCTCACCAAATGAACACTCCTTCACCTTCCTCTTTTCAGCTTGTGCCTCCCTTTCCTC CCACCAACAAGGCCGAATGCTGCACACCCATTTCGTAAAATCGGGGTTTGGTTGTGATGT TTTCGCCTTAACTGCCTTGGTTGACATGTATGCTAAATTGGGCTTGTTATCATTGGCCAG AAAACAGTTTGATGAGATGACGGTAAGGGATGTGCCCACATGGAATTCAATGATTGCGGG TTATGCAAGGTGTGGGGATTTGGAGGGGGCTTTGGAGTTGTTCAGGTTGATGCCTGCTAG GAATGTGACTTCATGGACAGCAATGATATCTGGGTATGCGCAAAATGGGCAGTATGCGAA GGCCTTGTCGATGTTTCTGATGATGGAAGAGGAGACAGAAATGAGGCCTAATGAAGTGAC TCTGGCCAGTGTTCTGCCGGCATGTGCAAATCTCGGGGCATTGGAGGTTGGGGAGAGGAT TGAAGTGTACGCAAGGGGGAATGGTTACTTCAAGAACTTGTATGTGAGCAATGCATTGTT GGAAATGTATGCAAGGTGTGGCAGAATTGATAAGGCATGGGGGGTGTTTGAGGAGATTGA TGGCAGGAGAAACTTGTGCTCTTGGAATTCTATGATCATGGGGTTGGCTGTACATGGAAG ATGCGATGAGGCTATTGAGCTTTTCTACAAAATGCTGAGAGAAGGAGCTGCACCCGACGA TGTAACATTTGTTGGAGTTCTTTTAGCATGCACCCATGGAGGCATGGTTGTAGAAGGCCA GCATTTCTTTGAATCCATGGAGAGGGATTTCTCAATTGCTCCCAAACTGGAGCACTATGG ATGCATGGTTGATTTGCTGGGTCGTGCTGGAGAATTGAGAGAAGCTCATGATCTCATACT AAGAATGCCAATGGAACCAGATTCTGTGGTTTGGGGGACTCTTCTGGGGGCATGCAGTTT CCATGGCCATGTAGAGCTGGCTGAAAAGGCAGCTGGGGCTCTCTTTGAGCTTGAGCCATC GAATCCTGGAAACTATGTCATTCTTTCCAATATTTATGCAACTGCAGGCCGATGGGATGG GGTTGCAAGGCTAAGGAAGCTCATGAAAGGTGGCAAGATTACAAAGGCAGCTGGATATAG TTTCATTGAGGAGGGAGGCCACATTCATAAATTCATTGTGGAGGATAGATCACATTCAAG ATCTGATGAGATATATGCATTACTGGATGAAGTTTCAATGAAGATGAAGCTTCATGGGAA TGTAAATGATTCAGATTCTGAAATCGAAACAGCATGCCTAATGGTGTGATAGCTCCAACT TCACAAGCCATTACTTCAGTTGCTGCAGATTGCCCAAATAAATGTAAAACAACCGAGAAC TTCATTTCAGGACATGTAAAATCTGGCTACAGGTTCAGAAATTACAAACAATGG