Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_15s0024g01510.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:15:3017026:3019695:1 gene:VIT_15s0024g01510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAAAACTCTCAGGGTTTTACATGAATGTTCACGACAAACCCTCTTTTCCTCGATCTCA AGAGCTTTAGCATCAGCAGCAACAACTACACAGCTCCACAAACTCCACTCCCTTATCATC ACTTTGGGTCTCCACCACTCTGTCATCTTCTCCGCTAAGCTCATTGCCAAGTACGCTCAT TTCAGAGACCCCACTTCTTCTTTCTCTGTTTTTCGACTTGCTTCTCCTTCAAACAATGTT TATTTGTGGAATTCAATCATAAGGGCACTAACCCATAATGGGCTTTTCTCCGAAGCTCTT AGTTTATACTCTGAAACGCAGAGAATTAGGCTTCAGCCTGATACTTACACTTTCCCTTCT GTCATCAATGCCTGTGCCGGGTTATTGGACTTTGAGATGGCTAAGAGCATTCATGATCGT GTTTTGGATATGGGTTTTGGTTCGGATTTGTATATTGGGAACGCTTTGATTGACATGTAT TGTAGGTTCAATGATTTGGATAAGGCGCGTAAGGTGTTTGAAGAAATGCCTCTTAGAGAT GTTGTTTCTTGGAATAGTCTGATTTCGGGGTATAATGCAAATGGGTATTGGAATGAAGCT TTGGAAATTTATTATCGTTTCAGAAATCTTGGTGTGGTGCCAGATTCGTACACTATGTCC AGTGTTTTACGAGCCTGTGGAGGTTTAGGTTCTGTTGAAGAGGGTGATATAATTCATGGA TTGATAGAAAAGATTGGGATAAAAAAGGATGTAATTGTGAACAATGGGCTCCTTTCCATG TACTGCAAGTTTAATGGATTAATAGATGGTAGAAGGATTTTTGATAAGATGGTACTTAGA GATGCGGTTTCTTGGAACACAATGATTTGTGGGTATTCTCAAGTGGGGTTGTATGAAGAA TCTATCAAATTGTTTATGGAGATGGTGAATCAATTTAAACCAGACTTGTTGACCATCACA TCCATCCTTCAAGCTTGTGGTCATCTAGGGGACTTAGAATTTGGAAAATATGTCCATGAC TACATGATCACAAGTGGGTATGAATGTGATACTACAGCGAGCAATATTCTTATCAATATG TATGCAAAGTGTGGTAATTTATTGGCTTCACAGGAAGTTTTTTCTGGAATGAAATGCAAG GATTCTGTGTCATGGAACTCAATGATCAATGTTTATATTCAAAATGGAAGTTTTGATGAA GCAATGAAGTTGTTTAAGATGATGAAGACCGATGTGAAACCAGATTCAGTCACTTATGTG ATGCTCCTATCTATGTCCACTCAATTAGGAGACCTACACCTGGGGAAGGAACTTCACTGT GATCTAGCAAAAATGGGATTCAATTCAAATATAGTTGTGAGTAACACTCTTGTGGATATG TATGCCAAATGTGGAGAAATGGGGGATTCACTTAAAGTATTTGAGAATATGAAAGCCCGT GATATAATCACATGGAATACTATTATTGCCTCATGTGTTCATTCTGAGGATTGTAATTTA GGATTGAGAATGATCAGTCGAATGAGGACTGAAGGAGTGACACCAGATATGGCTACGATG TTAAGCATCTTGCCTGTGTGTTCTTTACTTGCTGCCAAACGACAAGGGAAAGAGATCCAT GGCTGCATTTTCAAATTGGGTTTGGAGTCAGATGTTCCAGTTGGTAATGTATTGATTGAA ATGTACTCCAAATGTGGTAGTTTAAGGAATTCATTTCAAGTATTCAAGCTTATGAAGACA AAAGATGTGGTGACATGGACAGCGTTGATCTCTGCATGTGGTATGTATGGTGAAGGCAAG AAAGCTGTGAGAGCTTTTGGAGAGATGGAAGCAGCTGGTATTGTTCCTGACCATGTTGCC TTTGTTGCTATCATCTTTGCATGTAGCCATTCTGGTTTGGTAGAAGAAGGTCTTAATTAC TTTCACCGGATGAAGAAAGACTATAAAATTGAGCCTAGGATTGAGCACTATGCTTGTGTA GTTGATCTTCTATCCCGATCTGCTCTTTTAGATAAAGCAGAGGATTTCATCCTTTCCATG CCATTGAAGCCAGATTCAAGTATATGGGGGGCTTTACTTAGTGCTTGTCGGATGAGTGGA GACACTGAGATTGCAGAACGTGTCTCAGAACGGATCATCGAATTGAATCCAGATGATACT GGGTATTATGTTTTAGTCTCAAATATTTATGCAGCTTTAGGGAAATGGGATCAAGTGCGC TCAATACGGAAATCGATCAAAGCTAGAGGATTGAAAAAAGACCCTGGATGTAGCTGGATG GAAATTCAAAACAAGGTCTATGTTTTTGGCACTGGGACCAAGTTCTTTGAACAGTTTGAA GAGGTTAATAAGTTATTAGGCATGCTTGCAGGCTTGATGGCTAAGGAAGGTTATATTGCC AATTTGCAATTTGTACTGCATGACATTGATGAGGATGAGAAGAGAGACATACTTTGTGGG CACAGTGAAAGGCTTGCCATAGCATTTGGGTTGTTAAATACTAAACCAGGTACCCCTTTG CAGGTAATGAAAAATCTTCGGGTTTGTGAGGATTGCCACACTGTGACCAAGTACATATCA AAGATAGTGCAAAGAGAATTATTAGTTAGAGATGCCAATCGCTTTCATGTGTTCAAGGAT GGAGCCTGTAGTTGTGGAGATTATTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_15s0024g01510.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:15:3017026:3019695:1 gene:VIT_15s0024g01510 transcript:VIT_15s0024g01510.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MKTLRVLHECSRQTLFSSISRALASAATTTQLHKLHSLIITLGLHHSVIFSAKLIAKYAH FRDPTSSFSVFRLASPSNNVYLWNSIIRALTHNGLFSEALSLYSETQRIRLQPDTYTFPS VINACAGLLDFEMAKSIHDRVLDMGFGSDLYIGNALIDMYCRFNDLDKARKVFEEMPLRD VVSWNSLISGYNANGYWNEALEIYYRFRNLGVVPDSYTMSSVLRACGGLGSVEEGDIIHG LIEKIGIKKDVIVNNGLLSMYCKFNGLIDGRRIFDKMVLRDAVSWNTMICGYSQVGLYEE SIKLFMEMVNQFKPDLLTITSILQACGHLGDLEFGKYVHDYMITSGYECDTTASNILINM YAKCGNLLASQEVFSGMKCKDSVSWNSMINVYIQNGSFDEAMKLFKMMKTDVKPDSVTYV MLLSMSTQLGDLHLGKELHCDLAKMGFNSNIVVSNTLVDMYAKCGEMGDSLKVFENMKAR DIITWNTIIASCVHSEDCNLGLRMISRMRTEGVTPDMATMLSILPVCSLLAAKRQGKEIH GCIFKLGLESDVPVGNVLIEMYSKCGSLRNSFQVFKLMKTKDVVTWTALISACGMYGEGK KAVRAFGEMEAAGIVPDHVAFVAIIFACSHSGLVEEGLNYFHRMKKDYKIEPRIEHYACV VDLLSRSALLDKAEDFILSMPLKPDSSIWGALLSACRMSGDTEIAERVSERIIELNPDDT GYYVLVSNIYAALGKWDQVRSIRKSIKARGLKKDPGCSWMEIQNKVYVFGTGTKFFEQFE EVNKLLGMLAGLMAKEGYIANLQFVLHDIDEDEKRDILCGHSERLAIAFGLLNTKPGTPL QVMKNLRVCEDCHTVTKYISKIVQRELLVRDANRFHVFKDGACSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_15s0024g01510.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:15:3017026:3019695:1 gene:VIT_15s0024g01510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAAAACTCTCAGGGTTTTACATGAATGTTCACGACAAACCCTCTTTTCCTCGATCTCA AGAGCTTTAGCATCAGCAGCAACAACTACACAGCTCCACAAACTCCACTCCCTTATCATC ACTTTGGGTCTCCACCACTCTGTCATCTTCTCCGCTAAGCTCATTGCCAAGTACGCTCAT TTCAGAGACCCCACTTCTTCTTTCTCTGTTTTTCGACTTGCTTCTCCTTCAAACAATGTT TATTTGTGGAATTCAATCATAAGGGCACTAACCCATAATGGGCTTTTCTCCGAAGCTCTT AGTTTATACTCTGAAACGCAGAGAATTAGGCTTCAGCCTGATACTTACACTTTCCCTTCT GTCATCAATGCCTGTGCCGGGTTATTGGACTTTGAGATGGCTAAGAGCATTCATGATCGT GTTTTGGATATGGGTTTTGGTTCGGATTTGTATATTGGGAACGCTTTGATTGACATGTAT TGTAGGTTCAATGATTTGGATAAGGCGCGTAAGGTGTTTGAAGAAATGCCTCTTAGAGAT GTTGTTTCTTGGAATAGTCTGATTTCGGGGTATAATGCAAATGGGTATTGGAATGAAGCT TTGGAAATTTATTATCGTTTCAGAAATCTTGGTGTGGTGCCAGATTCGTACACTATGTCC AGTGTTTTACGAGCCTGTGGAGGTTTAGGTTCTGTTGAAGAGGGTGATATAATTCATGGA TTGATAGAAAAGATTGGGATAAAAAAGGATGTAATTGTGAACAATGGGCTCCTTTCCATG TACTGCAAGTTTAATGGATTAATAGATGGTAGAAGGATTTTTGATAAGATGGTACTTAGA GATGCGGTTTCTTGGAACACAATGATTTGTGGGTATTCTCAAGTGGGGTTGTATGAAGAA TCTATCAAATTGTTTATGGAGATGGTGAATCAATTTAAACCAGACTTGTTGACCATCACA TCCATCCTTCAAGCTTGTGGTCATCTAGGGGACTTAGAATTTGGAAAATATGTCCATGAC TACATGATCACAAGTGGGTATGAATGTGATACTACAGCGAGCAATATTCTTATCAATATG TATGCAAAGTGTGGTAATTTATTGGCTTCACAGGAAGTTTTTTCTGGAATGAAATGCAAG GATTCTGTGTCATGGAACTCAATGATCAATGTTTATATTCAAAATGGAAGTTTTGATGAA GCAATGAAGTTGTTTAAGATGATGAAGACCGATGTGAAACCAGATTCAGTCACTTATGTG ATGCTCCTATCTATGTCCACTCAATTAGGAGACCTACACCTGGGGAAGGAACTTCACTGT GATCTAGCAAAAATGGGATTCAATTCAAATATAGTTGTGAGTAACACTCTTGTGGATATG TATGCCAAATGTGGAGAAATGGGGGATTCACTTAAAGTATTTGAGAATATGAAAGCCCGT GATATAATCACATGGAATACTATTATTGCCTCATGTGTTCATTCTGAGGATTGTAATTTA GGATTGAGAATGATCAGTCGAATGAGGACTGAAGGAGTGACACCAGATATGGCTACGATG TTAAGCATCTTGCCTGTGTGTTCTTTACTTGCTGCCAAACGACAAGGGAAAGAGATCCAT GGCTGCATTTTCAAATTGGGTTTGGAGTCAGATGTTCCAGTTGGTAATGTATTGATTGAA ATGTACTCCAAATGTGGTAGTTTAAGGAATTCATTTCAAGTATTCAAGCTTATGAAGACA AAAGATGTGGTGACATGGACAGCGTTGATCTCTGCATGTGGTATGTATGGTGAAGGCAAG AAAGCTGTGAGAGCTTTTGGAGAGATGGAAGCAGCTGGTATTGTTCCTGACCATGTTGCC TTTGTTGCTATCATCTTTGCATGTAGCCATTCTGGTTTGGTAGAAGAAGGTCTTAATTAC TTTCACCGGATGAAGAAAGACTATAAAATTGAGCCTAGGATTGAGCACTATGCTTGTGTA GTTGATCTTCTATCCCGATCTGCTCTTTTAGATAAAGCAGAGGATTTCATCCTTTCCATG CCATTGAAGCCAGATTCAAGTATATGGGGGGCTTTACTTAGTGCTTGTCGGATGAGTGGA GACACTGAGATTGCAGAACGTGTCTCAGAACGGATCATCGAATTGAATCCAGATGATACT GGGTATTATGTTTTAGTCTCAAATATTTATGCAGCTTTAGGGAAATGGGATCAAGTGCGC TCAATACGGAAATCGATCAAAGCTAGAGGATTGAAAAAAGACCCTGGATGTAGCTGGATG GAAATTCAAAACAAGGTCTATGTTTTTGGCACTGGGACCAAGTTCTTTGAACAGTTTGAA GAGGTTAATAAGTTATTAGGCATGCTTGCAGGCTTGATGGCTAAGGAAGGTTATATTGCC AATTTGCAATTTGTACTGCATGACATTGATGAGGATGAGAAGAGAGACATACTTTGTGGG CACAGTGAAAGGCTTGCCATAGCATTTGGGTTGTTAAATACTAAACCAGGTACCCCTTTG CAGGTAATGAAAAATCTTCGGGTTTGTGAGGATTGCCACACTGTGACCAAGTACATATCA AAGATAGTGCAAAGAGAATTATTAGTTAGAGATGCCAATCGCTTTCATGTGTTCAAGGAT GGAGCCTGTAGTTGTGGAGATTATTGGTAA