Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_15s0021g02230.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:15:13163529:13176175:-1 gene:VIT_15s0021g02230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGGCTCTCTCAGCACAAACTCCCGATATTATGGGCGAACGTCAGTCGGGCCAGGACGTC
CGTTCTCAAAACGTGGTGGCGTGTCAAGCGGTTGCCAACATTGTAAAGTCCTCTCTCGGG
CCTGTTGGACTGGACAAGATGCTGGTTGATGATATTGGTGATGTAACAATTACTAATGAT
GGTGCTACAATACTCAAGATGTTGGAAGTTGAGCATCCAGCTGCCAAGGTACTTGTTGAA
TTGGCTGAACTTCAGGACCGAGAAGTTGGGGATGGGACAACTTCAGTGGTTATTGTTGCT
GCAGAGTTGCTTAAGAGAGCTAATGATCTGGTGAGAAATAAGATTCATCCAACATCTATA
ATTAGTGGATACAGGCTTGCTATGAGGGAAGCATGCAAATATGTGGATGAAAAATTGGCC
GTAAAGGTTGAAAAACTTGGAAAAGATTCACTTATAAATTGTGCCAAGACAAGCATGTCC
TCAAAGTTGATAGCTGGTGACAGTGACTTCTTCGCAAGTTTGGTTGTAGATGCAGTACAA
GCAGTAAAAACAACCAATGCACGGGGTGAAGTTAAATACCCAATTAAGGGAATTAATATT
TTGAAAGCTCATGGAAAAAGTGCAAAAGATAGCTACCTGTTGAATGGTTATGCTCTAAAT
ACTGGCCGTGCGGCCCAAGGAATGCCTCTTAGAGTTGCCCCTGCAAGGATTGCCTGCCTC
GACTTTAATCTTCAAAGGACAAAGATGCAATTGGGTGTCCAAGTATTGGTCACCGATCCA
AGGGAGCTTGAGAAAATTCGTCAAAGAGAAGCTGATATGACTAAAGAGCGAATTGAGAAA
CTTCTGAAAGCTGGAGCCAATGTTGTTCTAACTACAAAAGGGATTGATGACATGGCACTT
AAGTACTTTGTGGAGGCTGGGGCAATTGCTGTGAGGCGTGTTCGGAAAGATGACATGCGC
CATGTTGCCAAGGCAACTGGTGCAACTATGGTTTCAACGTTTGCTGACATGGAAGGGGAT
GAGACATTTGATTCATCATTTCTTGGATATGCAGATGAAGTTGTGGAGGAACGCATTGCA
GATGATGATGTTATTATGATAAAAGGAACCAAAACGACTAGCGGCGTTTCCTTAATCCTC
AGAGGTGCTAATGACTATATGCTTGATGAGATGGATAGGGCTTTGCATGATGCTCTATCA
ATTGTCAAGAGGACCCTTGAATCCAACACGGTGGTAGCAGGTGGAGGTGCTGTTGAGGCT
GCTTTATCTGTGTATTTGGAGTACCTTGCAACAACTTTAGGATCCCGAGAGCAGTTGGCA
ATTGCAGAATTTGCTGAATCTTTACTAATAATACCGAAGGTGCTTGCTGTGAATGCTGCA
AAAGACGCGACTGAATTAGTTGCAAAACTACGGGCTTACCACCACACTGCCCAAACGAAG
GCAGATAAGAAGCATCTCTCAAGCATGGGACTGGATCTTTTAAAAGGAACTGTCCGTAAT
AACCTAGAAGCTGGGGTTATTGAGCCTGCAATGAGCAAAGTGAAGATCCTACAGTTTGCA
ACAGAAGCAGCCATAACAATTCTTCGAATTGACGACATGATCAAGCTTGTCAAAGATGAA
ACTCAGAATGAAGAAGATTAG

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_15s0021g02230.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:15:13163529:13176175:-1 gene:VIT_15s0021g02230 transcript:VIT_15s0021g02230.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MALSAQTPDIMGERQSGQDVRSQNVVACQAVANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTITND
GATILKMLEVEHPAAKVLVELAELQDREVGDGTTSVVIVAAELLKRANDLVRNKIHPTSI
ISGYRLAMREACKYVDEKLAVKVEKLGKDSLINCAKTSMSSKLIAGDSDFFASLVVDAVQ
AVKTTNARGEVKYPIKGINILKAHGKSAKDSYLLNGYALNTGRAAQGMPLRVAPARIACL
DFNLQRTKMQLGVQVLVTDPRELEKIRQREADMTKERIEKLLKAGANVVLTTKGIDDMAL
KYFVEAGAIAVRRVRKDDMRHVAKATGATMVSTFADMEGDETFDSSFLGYADEVVEERIA
DDDVIMIKGTKTTSGVSLILRGANDYMLDEMDRALHDALSIVKRTLESNTVVAGGGAVEA
ALSVYLEYLATTLGSREQLAIAEFAESLLIIPKVLAVNAAKDATELVAKLRAYHHTAQTK
ADKKHLSSMGLDLLKGTVRNNLEAGVIEPAMSKVKILQFATEAAITILRIDDMIKLVKDE
TQNEED

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_15s0021g02230.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:15:13163529:13176175:-1 gene:VIT_15s0021g02230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

CTTTTAAAATGGCTCTCTCAGCACAAACTCCCGATATTATGGGCGAACGTCAGTCGGGCC
AGGACGTCCGTTCTCAAAACGTGGTGGCGTGTCAAGCGGTTGCCAACATTGTAAAGTCCT
CTCTCGGGCCTGTTGGACTGGACAAGATGCTGGTTGATGATATTGGTGATGTAACAATTA
CTAATGATGGTGCTACAATACTCAAGATGTTGGAAGTTGAGCATCCAGCTGCCAAGGTAC
TTGTTGAATTGGCTGAACTTCAGGACCGAGAAGTTGGGGATGGGACAACTTCAGTGGTTA
TTGTTGCTGCAGAGTTGCTTAAGAGAGCTAATGATCTGGTGAGAAATAAGATTCATCCAA
CATCTATAATTAGTGGATACAGGCTTGCTATGAGGGAAGCATGCAAATATGTGGATGAAA
AATTGGCCGTAAAGGTTGAAAAACTTGGAAAAGATTCACTTATAAATTGTGCCAAGACAA
GCATGTCCTCAAAGTTGATAGCTGGTGACAGTGACTTCTTCGCAAGTTTGGTTGTAGATG
CAGTACAAGCAGTAAAAACAACCAATGCACGGGGTGAAGTTAAATACCCAATTAAGGGAA
TTAATATTTTGAAAGCTCATGGAAAAAGTGCAAAAGATAGCTACCTGTTGAATGGTTATG
CTCTAAATACTGGCCGTGCGGCCCAAGGAATGCCTCTTAGAGTTGCCCCTGCAAGGATTG
CCTGCCTCGACTTTAATCTTCAAAGGACAAAGATGCAATTGGGTGTCCAAGTATTGGTCA
CCGATCCAAGGGAGCTTGAGAAAATTCGTCAAAGAGAAGCTGATATGACTAAAGAGCGAA
TTGAGAAACTTCTGAAAGCTGGAGCCAATGTTGTTCTAACTACAAAAGGGATTGATGACA
TGGCACTTAAGTACTTTGTGGAGGCTGGGGCAATTGCTGTGAGGCGTGTTCGGAAAGATG
ACATGCGCCATGTTGCCAAGGCAACTGGTGCAACTATGGTTTCAACGTTTGCTGACATGG
AAGGGGATGAGACATTTGATTCATCATTTCTTGGATATGCAGATGAAGTTGTGGAGGAAC
GCATTGCAGATGATGATGTTATTATGATAAAAGGAACCAAAACGACTAGCGGCGTTTCCT
TAATCCTCAGAGGTGCTAATGACTATATGCTTGATGAGATGGATAGGGCTTTGCATGATG
CTCTATCAATTGTCAAGAGGACCCTTGAATCCAACACGGTGGTAGCAGGTGGAGGTGCTG
TTGAGGCTGCTTTATCTGTGTATTTGGAGTACCTTGCAACAACTTTAGGATCCCGAGAGC
AGTTGGCAATTGCAGAATTTGCTGAATCTTTACTAATAATACCGAAGGTGCTTGCTGTGA
ATGCTGCAAAAGACGCGACTGAATTAGTTGCAAAACTACGGGCTTACCACCACACTGCCC
AAACGAAGGCAGATAAGAAGCATCTCTCAAGCATGGGACTGGATCTTTTAAAAGGAACTG
TCCGTAATAACCTAGAAGCTGGGGTTATTGAGCCTGCAATGAGCAAAGTGAAGATCCTAC
AGTTTGCAACAGAAGCAGCCATAACAATTCTTCGAATTGACGACATGATCAAGCTTGTCA
AAGATGAAACTCAGAATGAAGAAGATTAGAGGAGAGCAGCCTCGGAGTTGTTGCACGTAT
TGCAGTATTATTGTTATTATTACGGGGAAACAATTGACGACAAGGGCCTTTTTGTCATTT
CTGTTTTTCTCCAATGGTCCCTTTTCATGGTTTGAGATGGAAAATATGGTTTGGGAACAA
GAGCAATCTCTCCAATTTTTCTATTGTTTGGTTAATGTATTATGGTAGTTCAATTTTGTG
GGAATTAGGCAAAATTTCATAGAGGAGTTTGGTCGTCGAATGTGATTTGGGAAGCATGGT
CCTAAGGTGCTTGGTGTTTACACCACATATATGGAATCCAGAT