Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_15s0021g01160.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:15:11210613:11216259:-1 gene:VIT_15s0021g01160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCCTCCCAGAGCGGTAAAGAAAACCGCGGCGGCCACGAAGCGGACGCCGAGAGCCACA AGGGGGACTCCTAAGGTCCAACCCCAGCCAGAAGCCTCGGTAGAGCCGGTCAAAGCAGAG GAAGTTTCGGTTCCTGTTGTTGAGGTCAAGGAAGAAGTTAAGGTTGCGGAGGCTGTTGAA GTAAAGGTCGTAGAAAAGGCTCCAGAACCTGAGCCGGTGCCGGAACCTGAACCTGAGCCG GAACCTGAACCGGAACCGGAATCGAAGGCCGAACCTGAACAGGAATCGAATACAAATAGA TTGTCTCCCGTGAAGAAGGAAGATGAGATAAAGGAGTCTGTTGACGAATATGAGAAAAAT GAATATGAAAAAGATGAGCGGCTGGATCTGGAAGATAATGAACCTGAATATGAAACTGAA GAATATGGTGGGGTTGATTATGATGAGAAGGAAATCGAACAAGAGGACATTCCTGATGGG GGAGATGAAGTGGAGGAGGAAAATGAGGAGGGGGATGTTGGTGAGGAGGAAGATGGTGAT GTAGGTGAAGAAGGAATGGAAGATGTTCCTGAAGAACTTGAGGGTGAAGAGGATGATGAA CATGCTGGTGAATTGCAGGAGCATGCAGAGATGGTTGATGCAGAGGATGAAGAGCACCAT GAAGTTTTTAAGGAGAGGCGTAAGCGGAAGGAGTTTGAAGTATTTGTTGGGGGTCTAGAC AAAGATGCAACTGAGGATGATCTAAGGAAGGTTTTCAGTCAAGTTGGTGAGGTTACTGAA GTCAGACTGATGATGAATCCTCAGACAAAGAAGAACAAGGGGTTTGCTTTTTTGCGTTTT GCAACTGTTGAACAGGCGAAACGTGCTGTCACAGAGCTAAAAAATCCAGTGGTTAATGGG AAACAGTGTGGTGTCACTCCAAGTCAAGACAGCGACACCCTTTTTCTGGGTAATATATGC AAGACATGGACCAAGGAAGCTTTGAAAGAGAAGTTAAAACATTATGGAGTAGAGAATGTT GAGGATTTGACATTGGTTGAAGATAGTAACAATGAGGGAATGAATCGGGGTTTTGCTTTC TTGGAGTTCTCTTCCCGTTCTGATGCCATGGACGCTTTTAAGCGTCTCCAGAAGAGAGAT GTTGTGTTTGGTGTAGATAGGACTGCAAAGGTTTCATTTGCAGATTCCTTCATTGACCCT GGTGATGAAATCATGGCACAGGTTAAAACAGTTTTCATTGATGGTCTTCCTGCTTCATGG GATGAGGATCGTGTTCGGGAGCTTCTCAAGAAATATGGGGAGATTGAAAAGATTGAGCTT GCACGGAACATGCCATCTGCCAAGAGAAAGGATTTTGGTTTTGTCACTTTTGACACTCAT GATGCTGCAGTTACATGTGCTAAAAGCATCAACAATGCAGAGTTGGGGGAAGGAGAAAAC AAGGCTAAAGTGAGGGCTAGGCTGTCAAGACCACTTCAGAGAGGTAAAGGGAAACACATT TCTCGAGGAGACTTCCGACCTGGCCGTGGTGGGCCTGTACGAGGTGTCAGGGGTTCCTGG GCTCGGCCAGCGCTACGTAGCTTTCCTGGGCGTGGGGCAAGAGGTTTAGGGCCTCGTCTC CCACCAGCTGCTGTAAAGAGGCCAATTGGATTTAGGGATAGACGCCCAGTTATGGCCATG CCTCCAAGAGGCAGGCCCTTGCCTCCTCCATCAAGGTCCTATGACAGGAGAGCACCTGTT CCTGCTTACCCTAAGCCGAACTTGAAGAGGGATTATGGGCGGCGTGAGGAGGTTCCTTTG AGGAGTAGACCTGCTGTAGACTATGGTTCTAGAGTTGCCCCAGAGAGACGCCCATCATAT AGAGATGACTATGCTACCCGAGGATCTGGATACTCTGATATTCCAAGAAATACATCTCGG ACTGCAGCAAGGAGAACTTACGAAGATGATGCTTATGGGCAAAGGTTTGAGAGGCCTCCT CCCCCAAGTTACCGTGAGGGACGTCCCCGTGATTACGACTCTATTGCAGGTTCAAAACGG CCATATGGTGCACTGGATGATGTTCCCCCTCGTTATGCTGATGCAAGTGTCCGGCAATCA AGGGCTCGTTTGGACTATGAAATGAGTGCTGGTGCTTCTCAATATGGAGATGCTTATGGT GATAGACTTGGAAGATCTAATCTGGGATATGGGGGCAGCCGAAGTTCTATGTCCAGTCAG GATTCACATGGTCTTTATAGCAGTCGTCAGGGTATGGGCTATGGAGGAGGTTCTTTTGGT GGTAGTGATGTTGGAGGGATGTACTCATCCAGTTATGGCAGTGATTACATGCCTCGTGGA GCAGATGTTGGTGGTAGCTCTTACTCATCTCTTTATTCCAGTCGTGGTGTTGGTGGCAGC AGTTACATGGGTAGTGGTGGTTCTGGATCATACTATTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_15s0021g01160.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:15:11210613:11216259:-1 gene:VIT_15s0021g01160 transcript:VIT_15s0021g01160.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MPPRAVKKTAAATKRTPRATRGTPKVQPQPEASVEPVKAEEVSVPVVEVKEEVKVAEAVE VKVVEKAPEPEPVPEPEPEPEPEPEPESKAEPEQESNTNRLSPVKKEDEIKESVDEYEKN EYEKDERLDLEDNEPEYETEEYGGVDYDEKEIEQEDIPDGGDEVEEENEEGDVGEEEDGD VGEEGMEDVPEELEGEEDDEHAGELQEHAEMVDAEDEEHHEVFKERRKRKEFEVFVGGLD KDATEDDLRKVFSQVGEVTEVRLMMNPQTKKNKGFAFLRFATVEQAKRAVTELKNPVVNG KQCGVTPSQDSDTLFLGNICKTWTKEALKEKLKHYGVENVEDLTLVEDSNNEGMNRGFAF LEFSSRSDAMDAFKRLQKRDVVFGVDRTAKVSFADSFIDPGDEIMAQVKTVFIDGLPASW DEDRVRELLKKYGEIEKIELARNMPSAKRKDFGFVTFDTHDAAVTCAKSINNAELGEGEN KAKVRARLSRPLQRGKGKHISRGDFRPGRGGPVRGVRGSWARPALRSFPGRGARGLGPRL PPAAVKRPIGFRDRRPVMAMPPRGRPLPPPSRSYDRRAPVPAYPKPNLKRDYGRREEVPL RSRPAVDYGSRVAPERRPSYRDDYATRGSGYSDIPRNTSRTAARRTYEDDAYGQRFERPP PPSYREGRPRDYDSIAGSKRPYGALDDVPPRYADASVRQSRARLDYEMSAGASQYGDAYG DRLGRSNLGYGGSRSSMSSQDSHGLYSSRQGMGYGGGSFGGSDVGGMYSSSYGSDYMPRG ADVGGSSYSSLYSSRGVGGSSYMGSGGSGSYY

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_15s0021g01160.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:15:11210613:11216259:-1 gene:VIT_15s0021g01160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	CTTTTGGTCCCTAGGGTTTTCTCTCTTATCTCATAGTTTTTCCTGGCAATTTACCCTCAC TTTCTGGACCCTCTGCTAGGGTTTTCCTCTGTGCTGTTCGCCCTTTCTTGGAAAATTCTA TCACTTTTTCGAAATCTTTTATAGGGTTTCGATCCTTCCTATTAGGGTTTTTATTACAAG TCTTGAGCTTTTGTGCCTTCGATCTGAAAAATCTCTGCAGTATGCCTCCCAGAGCGGTAA AGAAAACCGCGGCGGCCACGAAGCGGACGCCGAGAGCCACAAGGGGGACTCCTAAGGTCC AACCCCAGCCAGAAGCCTCGGTAGAGCCGGTCAAAGCAGAGGAAGTTTCGGTTCCTGTTG TTGAGGTCAAGGAAGAAGTTAAGGTTGCGGAGGCTGTTGAAGTAAAGGTCGTAGAAAAGG CTCCAGAACCTGAGCCGGTGCCGGAACCTGAACCTGAGCCGGAACCTGAACCGGAACCGG AATCGAAGGCCGAACCTGAACAGGAATCGAATACAAATAGATTGTCTCCCGTGAAGAAGG AAGATGAGATAAAGGAGTCTGTTGACGAATATGAGAAAAATGAATATGAAAAAGATGAGC GGCTGGATCTGGAAGATAATGAACCTGAATATGAAACTGAAGAATATGGTGGGGTTGATT ATGATGAGAAGGAAATCGAACAAGAGGACATTCCTGATGGGGGAGATGAAGTGGAGGAGG AAAATGAGGAGGGGGATGTTGGTGAGGAGGAAGATGGTGATGTAGGTGAAGAAGGAATGG AAGATGTTCCTGAAGAACTTGAGGGTGAAGAGGATGATGAACATGCTGGTGAATTGCAGG AGCATGCAGAGATGGTTGATGCAGAGGATGAAGAGCACCATGAAGTTTTTAAGGAGAGGC GTAAGCGGAAGGAGTTTGAAGTATTTGTTGGGGGTCTAGACAAAGATGCAACTGAGGATG ATCTAAGGAAGGTTTTCAGTCAAGTTGGTGAGGTTACTGAAGTCAGACTGATGATGAATC CTCAGACAAAGAAGAACAAGGGGTTTGCTTTTTTGCGTTTTGCAACTGTTGAACAGGCGA AACGTGCTGTCACAGAGCTAAAAAATCCAGTGGTTAATGGGAAACAGTGTGGTGTCACTC CAAGTCAAGACAGCGACACCCTTTTTCTGGGTAATATATGCAAGACATGGACCAAGGAAG CTTTGAAAGAGAAGTTAAAACATTATGGAGTAGAGAATGTTGAGGATTTGACATTGGTTG AAGATAGTAACAATGAGGGAATGAATCGGGGTTTTGCTTTCTTGGAGTTCTCTTCCCGTT CTGATGCCATGGACGCTTTTAAGCGTCTCCAGAAGAGAGATGTTGTGTTTGGTGTAGATA GGACTGCAAAGGTTTCATTTGCAGATTCCTTCATTGACCCTGGTGATGAAATCATGGCAC AGGTTAAAACAGTTTTCATTGATGGTCTTCCTGCTTCATGGGATGAGGATCGTGTTCGGG AGCTTCTCAAGAAATATGGGGAGATTGAAAAGATTGAGCTTGCACGGAACATGCCATCTG CCAAGAGAAAGGATTTTGGTTTTGTCACTTTTGACACTCATGATGCTGCAGTTACATGTG CTAAAAGCATCAACAATGCAGAGTTGGGGGAAGGAGAAAACAAGGCTAAAGTGAGGGCTA GGCTGTCAAGACCACTTCAGAGAGGTAAAGGGAAACACATTTCTCGAGGAGACTTCCGAC CTGGCCGTGGTGGGCCTGTACGAGGTGTCAGGGGTTCCTGGGCTCGGCCAGCGCTACGTA GCTTTCCTGGGCGTGGGGCAAGAGGTTTAGGGCCTCGTCTCCCACCAGCTGCTGTAAAGA GGCCAATTGGATTTAGGGATAGACGCCCAGTTATGGCCATGCCTCCAAGAGGCAGGCCCT TGCCTCCTCCATCAAGGTCCTATGACAGGAGAGCACCTGTTCCTGCTTACCCTAAGCCGA ACTTGAAGAGGGATTATGGGCGGCGTGAGGAGGTTCCTTTGAGGAGTAGACCTGCTGTAG ACTATGGTTCTAGAGTTGCCCCAGAGAGACGCCCATCATATAGAGATGACTATGCTACCC GAGGATCTGGATACTCTGATATTCCAAGAAATACATCTCGGACTGCAGCAAGGAGAACTT ACGAAGATGATGCTTATGGGCAAAGGTTTGAGAGGCCTCCTCCCCCAAGTTACCGTGAGG GACGTCCCCGTGATTACGACTCTATTGCAGGTTCAAAACGGCCATATGGTGCACTGGATG ATGTTCCCCCTCGTTATGCTGATGCAAGTGTCCGGCAATCAAGGGCTCGTTTGGACTATG AAATGAGTGCTGGTGCTTCTCAATATGGAGATGCTTATGGTGATAGACTTGGAAGATCTA ATCTGGGATATGGGGGCAGCCGAAGTTCTATGTCCAGTCAGGATTCACATGGTCTTTATA GCAGTCGTCAGGGTATGGGCTATGGAGGAGGTTCTTTTGGTGGTAGTGATGTTGGAGGGA TGTACTCATCCAGTTATGGCAGTGATTACATGCCTCGTGGAGCAGATGTTGGTGGTAGCT CTTACTCATCTCTTTATTCCAGTCGTGGTGTTGGTGGCAGCAGTTACATGGGTAGTGGTG GTTCTGGATCATACTATTGAGATTTTTGACATGACAGAGGCTGCTGTAGGATGTGGACTA TTTGAAGCTTATTCACTGTGACCCTAAAGTTTTGGAAGGAAAGCATGTTACCAAGCATAA ACAGCCTCAATTTATCAGTTGAGAGAACGCGCTTTAGTTTTATGGTCAATGGGCTGTTAT TGCTTTGGCTCATCTTAGATTGCAGATGGGGTTCTCTCAGCCAGTCTTATTTCATATTGT AAGGAATCTTGGGTTTTGGTGCAGAAACCAAAAAGTGCTTTAGTATGTGGTATTGTATGA ATTGCACCTTTTTATTCTATATAAGAACTTACTGGGTGGAGAAT