Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_15s0021g00360.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:15:9858063:9859805:1 gene:VIT_15s0021g00360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCCTCATCATGATAATGTCTCTTACACAGCCATGATCACTGCATATCTGAAGAATAAT GAGCTGCGCAAAGCTGAAAAGCTCTTTCAGACAATGCCTGACCGAACCATTGTGGCTGAA TCTGCCATGATTGATGGTTATGCAAAAGCTGGTCTGATGGACAGTGCTCAGAAAGTCTTT GATGCTATGATAGACACAAATGTATTCTCATGGACTAGTTTGATTTCTGGGTACTTTAGG GATGGACAAGTTGCTAAGGCTTGCCAGCTTTTTGATCAAATGCCGGCAAAAAATGTGGTC TCTTGGACTACAATGGTGTTGGGTTATGCTCGAAATGGTTTGATTGATCAAGCTCGTAGT GTTTTCAATCAGATGCCTGAAAAAAACACCATATCTTGGACAGCTATGATGAAATCTTAT GTTGATAATGGTCGAACTGATGAGGCTCTTAAGCTCTTCCATGAAATGCCTCAGCGAAAC TTGTATTCTTGGAACACAATGATCTCTGGTTGTCTAGATGGTAAGAGAGTAAATGAAGCA TTTAAACTATTTCATTTGATGCCTCTAAGAAATGCAGTTTCTTGGACAATTATGGTTTCA GGCCTAGCACGAAATGGGTTCACCAAACTTGCAAGAGAGTACTTTGATCAAATGCCTAAC AAAGATATAGCTGCATGGAATGCAATGATCACAGCATATGTGGATGAATGTCTCATAGTT GAAGCAAGTGAGCTTTTCAATTTGATGACGGAAAGAAATATTGTGACTTGGAATGCAATG ATTGATGGCTATGCAAGGCACAGGCCAGATGGCGAAGCCATGAAGCACCTAATCCTCATG CTTCGCTCTTGCATTAGACCTAACGAGACTACTATGACCATCATACTGACCTCATGTTGG GGAATGCTAGAACTCATGCAAGCTCATGCACTTGCCATAGTAGTTGGATGTGAGTGTGAA ACATCACTTTCCAATGCTCTTATTACTATGTATTCAAGAATTGGGGATATTAGCTCTTCT AGGATTGCTTTTGAGAGCCTCAAGGCCAAGGATGTTGTGTCATGGACAGCAATGCTATTA GCATTTACTTACCATGGCCATGGTGACCATGCCTTACATGTCTTTGGACACATGCTAAAA TCAGGAACCAAGCCTGATGAGATTACTTTTGTAGGAGTCTTGTCAGCTTGTAGTCATGCT GGTCTTGTTAAGAAAGGTCAAAAGCTTTTTGACTCAATGAGTCGTGCTTATGGTTTAGAA CCAAGGGCTGAGCACTATTCATGCCTTGTTGACATCCTTGGTCGAGCAGGACAGGTGCAT GAGGCTATGGATGTTGTTTGGAAAATGCCTGAATGTGAGAGGGATGGTGCTGTTCTAGGG GCATTGCTTGGTGCATGCAGGTTGCATGGGAATGTTGAAATGGCAGATTATATTGGTCAG AAGCTTATCGAGCTACAGCCAAATAGCTCAGGTGGGTATGTACTCTTAGCCAATGTTTTT GCAGCTCGTGGAAATTGGGATGAATTTGCAGAAGTTAGGAAAAAGATGAAGGACCGGAAT GTGAGGAAAGTACCGGGTTTTAGTCAAATAGAGGTAAAGGGAAAGTGTCATGCATTCTTT GCGGGAGACAAATCTCATCCTCAGGTTGAGGAAATTTACGAACTGCTACGAGAGAAGCTT CTCCCCATAATGCATGAGATGGGCTACTCGCAATGGAACCAATTTGTACCATCATGGTTT TAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_15s0021g00360.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:15:9858063:9859805:1 gene:VIT_15s0021g00360 transcript:VIT_15s0021g00360.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MPHHDNVSYTAMITAYLKNNELRKAEKLFQTMPDRTIVAESAMIDGYAKAGLMDSAQKVF DAMIDTNVFSWTSLISGYFRDGQVAKACQLFDQMPAKNVVSWTTMVLGYARNGLIDQARS VFNQMPEKNTISWTAMMKSYVDNGRTDEALKLFHEMPQRNLYSWNTMISGCLDGKRVNEA FKLFHLMPLRNAVSWTIMVSGLARNGFTKLAREYFDQMPNKDIAAWNAMITAYVDECLIV EASELFNLMTERNIVTWNAMIDGYARHRPDGEAMKHLILMLRSCIRPNETTMTIILTSCW GMLELMQAHALAIVVGCECETSLSNALITMYSRIGDISSSRIAFESLKAKDVVSWTAMLL AFTYHGHGDHALHVFGHMLKSGTKPDEITFVGVLSACSHAGLVKKGQKLFDSMSRAYGLE PRAEHYSCLVDILGRAGQVHEAMDVVWKMPECERDGAVLGALLGACRLHGNVEMADYIGQ KLIELQPNSSGGYVLLANVFAARGNWDEFAEVRKKMKDRNVRKVPGFSQIEVKGKCHAFF AGDKSHPQVEEIYELLREKLLPIMHEMGYSQWNQFVPSWF

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_15s0021g00360.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:15:9858063:9859805:1 gene:VIT_15s0021g00360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCCTCATCATGATAATGTCTCTTACACAGCCATGATCACTGCATATCTGAAGAATAAT GAGCTGCGCAAAGCTGAAAAGCTCTTTCAGACAATGCCTGACCGAACCATTGTGGCTGAA TCTGCCATGATTGATGGTTATGCAAAAGCTGGTCTGATGGACAGTGCTCAGAAAGTCTTT GATGCTATGATAGACACAAATGTATTCTCATGGACTAGTTTGATTTCTGGGTACTTTAGG GATGGACAAGTTGCTAAGGCTTGCCAGCTTTTTGATCAAATGCCGGCAAAAAATGTGGTC TCTTGGACTACAATGGTGTTGGGTTATGCTCGAAATGGTTTGATTGATCAAGCTCGTAGT GTTTTCAATCAGATGCCTGAAAAAAACACCATATCTTGGACAGCTATGATGAAATCTTAT GTTGATAATGGTCGAACTGATGAGGCTCTTAAGCTCTTCCATGAAATGCCTCAGCGAAAC TTGTATTCTTGGAACACAATGATCTCTGGTTGTCTAGATGGTAAGAGAGTAAATGAAGCA TTTAAACTATTTCATTTGATGCCTCTAAGAAATGCAGTTTCTTGGACAATTATGGTTTCA GGCCTAGCACGAAATGGGTTCACCAAACTTGCAAGAGAGTACTTTGATCAAATGCCTAAC AAAGATATAGCTGCATGGAATGCAATGATCACAGCATATGTGGATGAATGTCTCATAGTT GAAGCAAGTGAGCTTTTCAATTTGATGACGGAAAGAAATATTGTGACTTGGAATGCAATG ATTGATGGCTATGCAAGGCACAGGCCAGATGGCGAAGCCATGAAGCACCTAATCCTCATG CTTCGCTCTTGCATTAGACCTAACGAGACTACTATGACCATCATACTGACCTCATGTTGG GGAATGCTAGAACTCATGCAAGCTCATGCACTTGCCATAGTAGTTGGATGTGAGTGTGAA ACATCACTTTCCAATGCTCTTATTACTATGTATTCAAGAATTGGGGATATTAGCTCTTCT AGGATTGCTTTTGAGAGCCTCAAGGCCAAGGATGTTGTGTCATGGACAGCAATGCTATTA GCATTTACTTACCATGGCCATGGTGACCATGCCTTACATGTCTTTGGACACATGCTAAAA TCAGGAACCAAGCCTGATGAGATTACTTTTGTAGGAGTCTTGTCAGCTTGTAGTCATGCT GGTCTTGTTAAGAAAGGTCAAAAGCTTTTTGACTCAATGAGTCGTGCTTATGGTTTAGAA CCAAGGGCTGAGCACTATTCATGCCTTGTTGACATCCTTGGTCGAGCAGGACAGGTGCAT GAGGCTATGGATGTTGTTTGGAAAATGCCTGAATGTGAGAGGGATGGTGCTGTTCTAGGG GCATTGCTTGGTGCATGCAGGTTGCATGGGAATGTTGAAATGGCAGATTATATTGGTCAG AAGCTTATCGAGCTACAGCCAAATAGCTCAGGTGGGTATGTACTCTTAGCCAATGTTTTT GCAGCTCGTGGAAATTGGGATGAATTTGCAGAAGTTAGGAAAAAGATGAAGGACCGGAAT GTGAGGAAAGTACCGGGTTTTAGTCAAATAGAGGTAAAGGGAAAGTGTCATGCATTCTTT GCGGGAGACAAATCTCATCCTCAGGTTGAGGAAATTTACGAACTGCTACGAGAGAAGCTT CTCCCCATAATGCATGAGATGGGCTACTCGCAATGGAACCAATTTGTACCATCATGGTTT TAA