Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_14s0108g01340.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:14:29950421:29952392:1 gene:VIT_14s0108g01340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGTCAGTACCAATTCGAAACCCCACTTGGGTCTCCAAGCGAAGGCTTCTCGAGCAGAAG
ATCTCAGACCTCCATAGATGCTCTAGCCTCAACCAAGTAAAGCAAATTCATGCCCAGGTC
CTCAAAGCTAATCTCCATCGGGAATCTTTTGTGGGGCAGAAGCTCATTGCTGCATTCTCT
CTCTGTCGCCAGATGACGCTGGCTGTCAATGTTTTTAATCAAATTCAAGACCCAGATGTG
CTTTTGTATAATACTTTGATTAGAGCACACGTTCGGAACTCGGAGCCATTGCTGGCGTTT
TCGGTTTTCTTTGAAATGCAGGATAGTGGGGTGTGTGCGGATAATTTCACGTACCCGTTT
CTTTTAAAGGCGTGTTCGGGGAAGGTTTGGGTGCGGGTAGTGGAAATGATCCATGCCCAA
GTGGAAAAAATGGGGTTTTGCTTGGATATTTTTGTGCCCAATTCGCTTATTGATAGTTAC
TTCAAGTGTGGTTTGGATGGCGTTGCTGCGGCGAGGAAGGTGTTTGAGGTGATGGCGGAG
AGAGATACTGTTTCCTGGAATTCGATGATTGGAGGGTTGGTGAAAGTGGGCGAGTTGGGG
GAAGCTCGGAGGTTGTTTGATGAAATGCCAGAGAGAGATACTGTGAGTTGGAATACGATA
TTAGACGGGTATGTTAAGGCGGGAGAGATGAATGCGGCATTTGAATTGTTTGAGAAGATG
CCGGCCAGGAATGTTGTGTCCTGGTCCACGATGGTTTTGGGTTATAGCAAGGCCGGGGAT
ATGGATATGGCGAGAATCTTGTTTGATAAGATGCCTGTCAAGAACTTGGTTCCGTGGACC
ATAATGATATCGGGGTATGCTGAAAAGGGGCTTGCTAAAGATGCAATTAACTTGTACAAC
CAAATGGAGGAGGCTGGATTGAAGTTTGATGATGGGACTGTTATTAGTATTTTATCTGCC
TGTGCAGTTTCTGGTTTGCTTGGATTGGGTAAGAGAGTTCATGCCTCCATTGAGAGGACC
AGGTTTAAGTGCAGCACTCCAGTGAGCAATGCATTGATTGATATGTATGCAAAGTGTGGT
AGTTTGGAGAATGCCTTAAGCATCTTTCATGGAATGGTGAGGAAAGATGTGGTGTCTTGG
AATGCCATAATTCAAGGACTAGCCATGCATGGACATGGTGAGAAAGCACTTCAGCTCTTC
TCTAGAATGAAAGGAGAAGGGTTTGTGCCTGATAAGGTCACCTTTGTTGGTGTCTTATGT
GCATGTACCCATGCAGGTTTTGTTGATGAGGGCCTTCATTATTTTCATGCAATGGAGAGA
GATTATGGGGTTCCTCCCGAAGTTGAGCATTATGGTTGCATGGTTGACCTTTTGGGGCGT
GGTGGGCGTCTTAAGGAAGCTTTTCGGCTTGTACATAGCATGCCATTGGAACCAAATGCA
ATCATTTGGGGTACCCTTTTGGGAGCATGCCGGATGCATAGTGCTACTGGACTTGCAGAG
GAGGTGTTTGATCGTCTGGTTAAATCTGAGCTATCAGACTCAGGGAATTTATCTATGTTG
TCAAATATTTATGCTGCAGCAGGAGATTGGGACAATTTTGCTAATATAAGGCTAAGAATG
AAGAGCACAAGCATCCAAAAACCATCAGGGGGTAGTTCAATTGAAGTGGATGATGAGGTT
CATGAATTTACAGTTTTTGATAGATCACACCCTAAATCGGATAGAATCTACAAGACGATT
GATGGGTTGGGCCAGCACATTAACAAGCTGACTACGAGTAGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_14s0108g01340.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:14:29950421:29952392:1 gene:VIT_14s0108g01340 transcript:VIT_14s0108g01340.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MSVPIRNPTWVSKRRLLEQKISDLHRCSSLNQVKQIHAQVLKANLHRESFVGQKLIAAFS
LCRQMTLAVNVFNQIQDPDVLLYNTLIRAHVRNSEPLLAFSVFFEMQDSGVCADNFTYPF
LLKACSGKVWVRVVEMIHAQVEKMGFCLDIFVPNSLIDSYFKCGLDGVAAARKVFEVMAE
RDTVSWNSMIGGLVKVGELGEARRLFDEMPERDTVSWNTILDGYVKAGEMNAAFELFEKM
PARNVVSWSTMVLGYSKAGDMDMARILFDKMPVKNLVPWTIMISGYAEKGLAKDAINLYN
QMEEAGLKFDDGTVISILSACAVSGLLGLGKRVHASIERTRFKCSTPVSNALIDMYAKCG
SLENALSIFHGMVRKDVVSWNAIIQGLAMHGHGEKALQLFSRMKGEGFVPDKVTFVGVLC
ACTHAGFVDEGLHYFHAMERDYGVPPEVEHYGCMVDLLGRGGRLKEAFRLVHSMPLEPNA
IIWGTLLGACRMHSATGLAEEVFDRLVKSELSDSGNLSMLSNIYAAAGDWDNFANIRLRM
KSTSIQKPSGGSSIEVDDEVHEFTVFDRSHPKSDRIYKTIDGLGQHINKLTTSS

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_14s0108g01340.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:14:29950421:29952392:1 gene:VIT_14s0108g01340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

CTGGCACTGTCCTCTGACTCCTTCTCTTCGACTCTGAACCACAAATGTCAGTACCAATTC
GAAACCCCACTTGGGTCTCCAAGCGAAGGCTTCTCGAGCAGAAGATCTCAGACCTCCATA
GATGCTCTAGCCTCAACCAAGTAAAGCAAATTCATGCCCAGGTCCTCAAAGCTAATCTCC
ATCGGGAATCTTTTGTGGGGCAGAAGCTCATTGCTGCATTCTCTCTCTGTCGCCAGATGA
CGCTGGCTGTCAATGTTTTTAATCAAATTCAAGACCCAGATGTGCTTTTGTATAATACTT
TGATTAGAGCACACGTTCGGAACTCGGAGCCATTGCTGGCGTTTTCGGTTTTCTTTGAAA
TGCAGGATAGTGGGGTGTGTGCGGATAATTTCACGTACCCGTTTCTTTTAAAGGCGTGTT
CGGGGAAGGTTTGGGTGCGGGTAGTGGAAATGATCCATGCCCAAGTGGAAAAAATGGGGT
TTTGCTTGGATATTTTTGTGCCCAATTCGCTTATTGATAGTTACTTCAAGTGTGGTTTGG
ATGGCGTTGCTGCGGCGAGGAAGGTGTTTGAGGTGATGGCGGAGAGAGATACTGTTTCCT
GGAATTCGATGATTGGAGGGTTGGTGAAAGTGGGCGAGTTGGGGGAAGCTCGGAGGTTGT
TTGATGAAATGCCAGAGAGAGATACTGTGAGTTGGAATACGATATTAGACGGGTATGTTA
AGGCGGGAGAGATGAATGCGGCATTTGAATTGTTTGAGAAGATGCCGGCCAGGAATGTTG
TGTCCTGGTCCACGATGGTTTTGGGTTATAGCAAGGCCGGGGATATGGATATGGCGAGAA
TCTTGTTTGATAAGATGCCTGTCAAGAACTTGGTTCCGTGGACCATAATGATATCGGGGT
ATGCTGAAAAGGGGCTTGCTAAAGATGCAATTAACTTGTACAACCAAATGGAGGAGGCTG
GATTGAAGTTTGATGATGGGACTGTTATTAGTATTTTATCTGCCTGTGCAGTTTCTGGTT
TGCTTGGATTGGGTAAGAGAGTTCATGCCTCCATTGAGAGGACCAGGTTTAAGTGCAGCA
CTCCAGTGAGCAATGCATTGATTGATATGTATGCAAAGTGTGGTAGTTTGGAGAATGCCT
TAAGCATCTTTCATGGAATGGTGAGGAAAGATGTGGTGTCTTGGAATGCCATAATTCAAG
GACTAGCCATGCATGGACATGGTGAGAAAGCACTTCAGCTCTTCTCTAGAATGAAAGGAG
AAGGGTTTGTGCCTGATAAGGTCACCTTTGTTGGTGTCTTATGTGCATGTACCCATGCAG
GTTTTGTTGATGAGGGCCTTCATTATTTTCATGCAATGGAGAGAGATTATGGGGTTCCTC
CCGAAGTTGAGCATTATGGTTGCATGGTTGACCTTTTGGGGCGTGGTGGGCGTCTTAAGG
AAGCTTTTCGGCTTGTACATAGCATGCCATTGGAACCAAATGCAATCATTTGGGGTACCC
TTTTGGGAGCATGCCGGATGCATAGTGCTACTGGACTTGCAGAGGAGGTGTTTGATCGTC
TGGTTAAATCTGAGCTATCAGACTCAGGGAATTTATCTATGTTGTCAAATATTTATGCTG
CAGCAGGAGATTGGGACAATTTTGCTAATATAAGGCTAAGAATGAAGAGCACAAGCATCC
AAAAACCATCAGGGGGTAGTTCAATTGAAGTGGATGATGAGGTTCATGAATTTACAGTTT
TTGATAGATCACACCCTAAATCGGATAGAATCTACAAGACGATTGATGGGTTGGGCCAGC
ACATTAACAAGCTGACTACGAGTAGTTGATGCAGAGAACTGTTTGGGAAGGAATATTGCT
GAAGTGGTGCTTATACTGCATGCATCCTCTCAGTCCAAGTGGCAGGAGCACTTTGGCAAA
AGCTATATTGGACAATATTTAAGAAAGGACATCCTCAAGGATGCTTTTCCCT