Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_14s0066g02540.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:14:28706772:28740199:1 gene:VIT_14s0066g02540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGTGGTGTTAGGGGGAGGTGTTGGTAAAAAGATAGCGGTTGGTGTATGTGTAATGGAA AAGAAGGTGTTTTCGGCTCCCATGGGGCAGATTCTTGAGAGACTCCAAGCATTTGGTGAA TTTGAGATCATAATTTTCGGCGACAAGGTTATTCTTGAAGATCCTGTAGAGAGCTGGCCA ATATGTGATTGCTTGGTTGCCTTCTATTCATCTGGCTACCCTCTTGAAAAGGCTGAAGCT TATGCTGCTTTGAGAAAGCCTTTTCTTGTCAATGAATTGGAACAGCAACACCTTCTTCAT GATCGAAGGAAAGTATATGAGTGTCTTGAAATGTATGGTATTCCCATTCCAAGATACGCC CTTGTCAATAGGGAAGTACCATGTCAAGAGCTGGATTATTTTGTTGAGGAAGAAGATTTT GTTGAGGTTCATGGAAACCGTTTCTGGAAGCCATTTGTGGAGAAGCCTGTTGATGGGGAT GATCATAGTATAATGATATATTACCCTAGCTCAGCAGGTGGGGGTATGAAGGAATTGTTT AGGAAGGTTGGTAACCGCTCAAGTGAGTTCCATCCAGAGGTTAGAAGAGTGAGGCGTGAA GGCTCTTATATATATGAGGAATTTATGCCAACTGGAGGAACAGATGTCAAGGTGTATACA GTTGGCCCTGAATATGCACATGCTGAGGCAAGGAAGTCTCCTGTTGTTGATGGCGTTGTT ATGAGAAACCCCGATGGGAAAGAAGTAAGGTATCCTGTATTGCTGACTCCTACTGAGAAG CAAATGGCAAGGGATGTTTGCCTTGCCTTTAGGCAAGCGGTTTGTGGGTTTGATCTCTTG CGTTGTGAGGGACGCTCATATGTCTGTGATGTGAATGGATGGAGTTTTGTGAAGAACTCT CACAAGTATTATGATGATGCTGCTTGTGTGTTGAGGAAGATGTTTATAGACGCGAAGGCC CCTCATCTTTCTTCAACAATTCCACCAACTTTACCTTGGAAGGTCAATGAACCCCTCCAG CCTTCGGAAGGATTAACACGTCAGGGGAGTGGGATCATTGGCACATTTGGACAGTCTGAG GAGCTAAGATGCGTTATTACTATTATTCGTCATGGTGATAGGACTCCCAAACAGAAGGTG AAATTGAAAGTCACAGAGGAGAAGCTATTGAATTTGATGTTAAAATACAATGGGGGGAGG CCTAGATCTGAGACAAAACTCAAGAGTGCTATCCAGTTGCAAGATTTGTTGGATGCCACA CGGATGCTTGTACCACGCACAAGACCTGGTCGAGAAAGTGACAGTGAAGCAGAAGATCTT GAGCATGCTGAAAAACTTCGTCAAGTTAAAGCAGTCCTTGAAGAGGGGGGACATTTCTCT GGTATTTATCGGAAGGTTCAACTAAAGCCACTAAAGTGGGTTAAAGTTCCAAAAAGTAAT GGTGAAGGTGAAGAAGAACGGCCTGTTGAAGCTCTTATGGTTCTTAAATATGGTGGTGTT CTTACACATGCTGGCAGAAAGCAGGCAGAAGAACTAGGTAGATATTTTCGAAACAATATG TACCCAGGTGAAGGCACTGGCCTGCTTCGCCTTCATAGTACTTATCGTCATGATCTAAAA ATTTACAGCTCAGATGAGGGTCGTGTACAGATGTCAGCGGCAGCATTTGCTAAAGGCCTT CTTGATTTGGAAGGGCAATTAACGCCAATCCTGGTTTCCCTTGTTAGCAAGGACTCATCT ATGTTGGATGGACTTGACAATGCCAGTATTGAGATGGAAGAAGCTAAGGCTCGGTTGAAT GAGATTATAACATCTGGTGCAAAGAATCATACCAATGGATCATCTGATGTTCCTTGGATG ACTGATGGTGGTGGACTGCCTTCTAATGCTTCAGAACTTCTACCAAAATTGGTAAAATTG ACTAAGAAGGTCACTGAACAAGTAAGACTACTAGCTAAGGATGAAGATGAGAATCTTTCA GTGACAAGTTCGTATGATGTGATTCCTCCATATGACGAAGCAAAGGCACTTGGTAAGACC AATATTGATGTAGACCGTATTGCTGCTGGATTACCATGTGGTAGTGAGGGATTCCTTTTG ATGTTTGCTCGCTGGAGAAAACTTGAGAGAGACTTATACAATGAACGCAAAGATCGATTT GATATAACACAAATTCCAGATGTTTATGACTCTTGCAAATATGATCTCTTGCACAATGCA CATCTTAATCTAGAAGATCTGGATGAGCTTTTCAAAGTTGCTCAGTTACTTGCAGATGGT GTCATCCCAAATGAGTACGGCATTAACCCAAAGCAGAAGTTGAAGATTGGATCAAAGATT GCACGTCGTTTGTTGGGTAAAATTTTAATTGATCTGAGGAACACTCGTGAAGAAGCTATC AGTGTTGCTGAATTAAAGAGTAATCAAGACCAAGATTCAGTGTCTGCTAAATCTGGAAAG GAAGATGCAGATTACCATTCAAAGCCTCACAATAAGAATGAAGACACAAGAAGATCTAGT ACCACAAGTGAAAAGTCAATGGATCAAGATGACGATGATGACAAAGAGCCCCAATACCGT TTGGATCCCAAGTATGCAAATGTGAAGACACCAGAACGCCATGTGCGCACACGCCTCTAT TTTACATCAGAATCACACATCCATTCCCTAATGAATGTTCTCCGCTACTGTAACTTGGAT GATTCTCTTCTTGGTGAGGATAGCCTTGTTTGCGATAATGCTTTGGAGCGATTGTATAGA ACTAAGGAGCTTGACTATATGAGTTATCTCGTGTTGAGGATGTTTGAGAACACAGAGGTA GCTCTGGAAGACCCGAAAAGATTCCGCATAGAGATGACTTTTAGTCGTGGTGCAGATCTA TCCCCCTTAGAGAAGAACGATAGTGAGGCTAACTCATTGCATCAGGAACACACGCTGCCA ATCAATGGCCCAGAAAGGCTGCAAGAAGTTGGATCATATCTCACGTTAGAGAAGATGGAG AAGATGGTTCGCCCATTTGCCATGCCAGCTGAAGATTTTCCTCCACCATCAACACCCCAA GGGTTCTCAGGCTACTTCTCCAAAAGTGCATCAGTGCTGGAGCGCCTGGTAAATCTTTGG CCTTTTCACAAGCATGCAAATGCTAATGGGAAGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_14s0066g02540.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:14:28706772:28740199:1 gene:VIT_14s0066g02540 transcript:VIT_14s0066g02540.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MVVLGGGVGKKIAVGVCVMEKKVFSAPMGQILERLQAFGEFEIIIFGDKVILEDPVESWP ICDCLVAFYSSGYPLEKAEAYAALRKPFLVNELEQQHLLHDRRKVYECLEMYGIPIPRYA LVNREVPCQELDYFVEEEDFVEVHGNRFWKPFVEKPVDGDDHSIMIYYPSSAGGGMKELF RKVGNRSSEFHPEVRRVRREGSYIYEEFMPTGGTDVKVYTVGPEYAHAEARKSPVVDGVV MRNPDGKEVRYPVLLTPTEKQMARDVCLAFRQAVCGFDLLRCEGRSYVCDVNGWSFVKNS HKYYDDAACVLRKMFIDAKAPHLSSTIPPTLPWKVNEPLQPSEGLTRQGSGIIGTFGQSE ELRCVITIIRHGDRTPKQKVKLKVTEEKLLNLMLKYNGGRPRSETKLKSAIQLQDLLDAT RMLVPRTRPGRESDSEAEDLEHAEKLRQVKAVLEEGGHFSGIYRKVQLKPLKWVKVPKSN GEGEEERPVEALMVLKYGGVLTHAGRKQAEELGRYFRNNMYPGEGTGLLRLHSTYRHDLK IYSSDEGRVQMSAAAFAKGLLDLEGQLTPILVSLVSKDSSMLDGLDNASIEMEEAKARLN EIITSGAKNHTNGSSDVPWMTDGGGLPSNASELLPKLVKLTKKVTEQVRLLAKDEDENLS VTSSYDVIPPYDEAKALGKTNIDVDRIAAGLPCGSEGFLLMFARWRKLERDLYNERKDRF DITQIPDVYDSCKYDLLHNAHLNLEDLDELFKVAQLLADGVIPNEYGINPKQKLKIGSKI ARRLLGKILIDLRNTREEAISVAELKSNQDQDSVSAKSGKEDADYHSKPHNKNEDTRRSS TTSEKSMDQDDDDDKEPQYRLDPKYANVKTPERHVRTRLYFTSESHIHSLMNVLRYCNLD DSLLGEDSLVCDNALERLYRTKELDYMSYLVLRMFENTEVALEDPKRFRIEMTFSRGADL SPLEKNDSEANSLHQEHTLPINGPERLQEVGSYLTLEKMEKMVRPFAMPAEDFPPPSTPQ GFSGYFSKSASVLERLVNLWPFHKHANANGK

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_14s0066g02540.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:14:28706772:28740199:1 gene:VIT_14s0066g02540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	CGAGAGAAAGATGGTGGTGTTAGGGGGAGGTGTTGGTAAAAAGATAGCGGTTGGTGTATG TGTAATGGAAAAGAAGGTGTTTTCGGCTCCCATGGGGCAGATTCTTGAGAGACTCCAAGC ATTTGGTGAATTTGAGATCATAATTTTCGGCGACAAGGTTATTCTTGAAGATCCTGTAGA GAGCTGGCCAATATGTGATTGCTTGGTTGCCTTCTATTCATCTGGCTACCCTCTTGAAAA GGCTGAAGCTTATGCTGCTTTGAGAAAGCCTTTTCTTGTCAATGAATTGGAACAGCAACA CCTTCTTCATGATCGAAGGAAAGTATATGAGTGTCTTGAAATGTATGGTATTCCCATTCC AAGATACGCCCTTGTCAATAGGGAAGTACCATGTCAAGAGCTGGATTATTTTGTTGAGGA AGAAGATTTTGTTGAGGTTCATGGAAACCGTTTCTGGAAGCCATTTGTGGAGAAGCCTGT TGATGGGGATGATCATAGTATAATGATATATTACCCTAGCTCAGCAGGTGGGGGTATGAA GGAATTGTTTAGGAAGGTTGGTAACCGCTCAAGTGAGTTCCATCCAGAGGTTAGAAGAGT GAGGCGTGAAGGCTCTTATATATATGAGGAATTTATGCCAACTGGAGGAACAGATGTCAA GGTGTATACAGTTGGCCCTGAATATGCACATGCTGAGGCAAGGAAGTCTCCTGTTGTTGA TGGCGTTGTTATGAGAAACCCCGATGGGAAAGAAGTAAGGTATCCTGTATTGCTGACTCC TACTGAGAAGCAAATGGCAAGGGATGTTTGCCTTGCCTTTAGGCAAGCGGTTTGTGGGTT TGATCTCTTGCGTTGTGAGGGACGCTCATATGTCTGTGATGTGAATGGATGGAGTTTTGT GAAGAACTCTCACAAGTATTATGATGATGCTGCTTGTGTGTTGAGGAAGATGTTTATAGA CGCGAAGGCCCCTCATCTTTCTTCAACAATTCCACCAACTTTACCTTGGAAGGTCAATGA ACCCCTCCAGCCTTCGGAAGGATTAACACGTCAGGGGAGTGGGATCATTGGCACATTTGG ACAGTCTGAGGAGCTAAGATGCGTTATTACTATTATTCGTCATGGTGATAGGACTCCCAA ACAGAAGGTGAAATTGAAAGTCACAGAGGAGAAGCTATTGAATTTGATGTTAAAATACAA TGGGGGGAGGCCTAGATCTGAGACAAAACTCAAGAGTGCTATCCAGTTGCAAGATTTGTT GGATGCCACACGGATGCTTGTACCACGCACAAGACCTGGTCGAGAAAGTGACAGTGAAGC AGAAGATCTTGAGCATGCTGAAAAACTTCGTCAAGTTAAAGCAGTCCTTGAAGAGGGGGG ACATTTCTCTGGTATTTATCGGAAGGTTCAACTAAAGCCACTAAAGTGGGTTAAAGTTCC AAAAAGTAATGGTGAAGGTGAAGAAGAACGGCCTGTTGAAGCTCTTATGGTTCTTAAATA TGGTGGTGTTCTTACACATGCTGGCAGAAAGCAGGCAGAAGAACTAGGTAGATATTTTCG AAACAATATGTACCCAGGTGAAGGCACTGGCCTGCTTCGCCTTCATAGTACTTATCGTCA TGATCTAAAAATTTACAGCTCAGATGAGGGTCGTGTACAGATGTCAGCGGCAGCATTTGC TAAAGGCCTTCTTGATTTGGAAGGGCAATTAACGCCAATCCTGGTTTCCCTTGTTAGCAA GGACTCATCTATGTTGGATGGACTTGACAATGCCAGTATTGAGATGGAAGAAGCTAAGGC TCGGTTGAATGAGATTATAACATCTGGTGCAAAGAATCATACCAATGGATCATCTGATGT TCCTTGGATGACTGATGGTGGTGGACTGCCTTCTAATGCTTCAGAACTTCTACCAAAATT GGTAAAATTGACTAAGAAGGTCACTGAACAAGTAAGACTACTAGCTAAGGATGAAGATGA GAATCTTTCAGTGACAAGTTCGTATGATGTGATTCCTCCATATGACGAAGCAAAGGCACT TGGTAAGACCAATATTGATGTAGACCGTATTGCTGCTGGATTACCATGTGGTAGTGAGGG ATTCCTTTTGATGTTTGCTCGCTGGAGAAAACTTGAGAGAGACTTATACAATGAACGCAA AGATCGATTTGATATAACACAAATTCCAGATGTTTATGACTCTTGCAAATATGATCTCTT GCACAATGCACATCTTAATCTAGAAGATCTGGATGAGCTTTTCAAAGTTGCTCAGTTACT TGCAGATGGTGTCATCCCAAATGAGTACGGCATTAACCCAAAGCAGAAGTTGAAGATTGG ATCAAAGATTGCACGTCGTTTGTTGGGTAAAATTTTAATTGATCTGAGGAACACTCGTGA AGAAGCTATCAGTGTTGCTGAATTAAAGAGTAATCAAGACCAAGATTCAGTGTCTGCTAA ATCTGGAAAGGAAGATGCAGATTACCATTCAAAGCCTCACAATAAGAATGAAGACACAAG AAGATCTAGTACCACAAGTGAAAAGTCAATGGATCAAGATGACGATGATGACAAAGAGCC CCAATACCGTTTGGATCCCAAGTATGCAAATGTGAAGACACCAGAACGCCATGTGCGCAC ACGCCTCTATTTTACATCAGAATCACACATCCATTCCCTAATGAATGTTCTCCGCTACTG TAACTTGGATGATTCTCTTCTTGGTGAGGATAGCCTTGTTTGCGATAATGCTTTGGAGCG ATTGTATAGAACTAAGGAGCTTGACTATATGAGTTATCTCGTGTTGAGGATGTTTGAGAA CACAGAGGTAGCTCTGGAAGACCCGAAAAGATTCCGCATAGAGATGACTTTTAGTCGTGG TGCAGATCTATCCCCCTTAGAGAAGAACGATAGTGAGGCTAACTCATTGCATCAGGAACA CACGCTGCCAATCAATGGCCCAGAAAGGCTGCAAGAAGTTGGATCATATCTCACGTTAGA GAAGATGGAGAAGATGGTTCGCCCATTTGCCATGCCAGCTGAAGATTTTCCTCCACCATC AACACCCCAAGGGTTCTCAGGCTACTTCTCCAAAAGTGCATCAGTGCTGGAGCGCCTGGT AAATCTTTGGCCTTTTCACAAGCATGCAAATGCTAATGGGAAGTAGTAACCACCTTCGCT TCCCTTTT