Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_14s0066g02510.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:14:28677309:28678881:-1 gene:VIT_14s0066g02510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGAAGCATGGAAGCGCTGCATATCCCTTGCGCAAAGCTGCTCCAACATGCGTCAATTC
AAGGCTATTCACGCCTTGTTCATTGTCAATGGCCTCCATCTCAACAACTATGCTATCAGC
AAGCTGATTTCCTTTTGTGCGCTTTCCAACTCCGGTAGCCTCTCCTATGCGTCTCTCATT
TTCAGCCAAATTCAAAACCCAAATTTATTTGCTTACAATACTCTCATCAGAGCCTATTCT
CGCAGTTCCACACCCCAGCTGGCTCTACATTACTTCCAATTAATGTTAGATGATGAAAAC
GTAGGTCCTGATCAGCATACTTTTCCTTTTATTATTTCTGCGTGTACCAACTCATTGTGG
ATGCTCTTAGGGAAGCAAATACATAATTGGGTCTTGAAAAATGGTGTTGCTTCATCGGAC
AGGCATGTCCAGACAGCGCTGGTTCGTTTCTACGCAGAGTGCTGTGCTATGGGCGATGCC
CGTAAATTGTTTGATGAAATTCCGAACTTGGACGTTGTCCAATGGAATGTACTTTTAAAT
GGGTACGTTCGGCGTGGTTTGGCTCCTGAGGCTTTGAATGCTTTCCGGAATATGTTGGTG
TCCGGAGTTGAGCCTGATGAGTTCTGTTTGACCACTGCGCTTAAGGGTTGTGCTCAGTTG
GGAGCTCTTCAGCAAGGAAAGTGGATCCATGAGTATGTTACTAAAAGGAAATGGTTGGAG
GCTGATGTGTTTATTGGGACTGCGCTAGTTGATATGTATGCCAAATGTGGATGCATTGAC
AGGAGTGTGGAGGTTTTTGAGGGGATGACTAAGAGGAATGTGTTCTCATGGTCTGCTATG
ATTGGGGGCTTTGCACTACATGGGCATGTGAGAAAAGCAATGCAATGCTTGGAGAGAATG
CAAGTAGAAGATGGGCTTAGACCAGATGGGGTTGTCCTTCTTGGAGTCATAATGGCTTGT
GCCCATGCAGGACTCCAGGAAGAAGGCCAGTTTCTACTAGAAAACATGGAAGCTCGGTAT
GGTATCTTACCCAAACATGAGCACTATAGTTGCATGGTCGACTTGCTCTGCAGGGCAGGT
CAGTTAGACGAAGCACTCAAGCTCATAAGAAGAATGCCCATGAAGCCCCGTGCTGCAGTC
TGGGGTGCCTTACTGAGTGGTTGTCGAACTCATAATAACGTTGATCTCGCAGAGCTTGCT
GCAAGAGAGCTTCTAATGGTGGGAAATGGAGATGGAACAGAAGAAGATGGAGCTTATGTT
CAGCTATCCAACATCTATTTGGCTGCACAGAAATGTGAAGATGCTTGTAGGATCCGAAGG
ATGATTGGAGATAAAAGGATTAAAACAAAGCCAGGATGCAGTCTGATAGAGGTGGAAGGG
GAGGTTAATCAGTTTGTTTCAGGAGATATCTCACATCCATGTCTAGCTCAAATACATGAA
ATGCTGGATTTAGTGTCCCTTCAACACTCCTACAAGCTGGCTTTCCACACAACATGGAGC
TCTTGTGATGAGATGGAGCTGACTTTTCAGCCATGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_14s0066g02510.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:14:28677309:28678881:-1 gene:VIT_14s0066g02510 transcript:VIT_14s0066g02510.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MEAWKRCISLAQSCSNMRQFKAIHALFIVNGLHLNNYAISKLISFCALSNSGSLSYASLI
FSQIQNPNLFAYNTLIRAYSRSSTPQLALHYFQLMLDDENVGPDQHTFPFIISACTNSLW
MLLGKQIHNWVLKNGVASSDRHVQTALVRFYAECCAMGDARKLFDEIPNLDVVQWNVLLN
GYVRRGLAPEALNAFRNMLVSGVEPDEFCLTTALKGCAQLGALQQGKWIHEYVTKRKWLE
ADVFIGTALVDMYAKCGCIDRSVEVFEGMTKRNVFSWSAMIGGFALHGHVRKAMQCLERM
QVEDGLRPDGVVLLGVIMACAHAGLQEEGQFLLENMEARYGILPKHEHYSCMVDLLCRAG
QLDEALKLIRRMPMKPRAAVWGALLSGCRTHNNVDLAELAARELLMVGNGDGTEEDGAYV
QLSNIYLAAQKCEDACRIRRMIGDKRIKTKPGCSLIEVEGEVNQFVSGDISHPCLAQIHE
MLDLVSLQHSYKLAFHTTWSSCDEMELTFQP

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_14s0066g02510.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:14:28677309:28678881:-1 gene:VIT_14s0066g02510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

GGTGTGTACTGATTTGCTTCTTGGAATAGATACATGAATGGAAGCATGGAAGCGCTGCAT
ATCCCTTGCGCAAAGCTGCTCCAACATGCGTCAATTCAAGGCTATTCACGCCTTGTTCAT
TGTCAATGGCCTCCATCTCAACAACTATGCTATCAGCAAGCTGATTTCCTTTTGTGCGCT
TTCCAACTCCGGTAGCCTCTCCTATGCGTCTCTCATTTTCAGCCAAATTCAAAACCCAAA
TTTATTTGCTTACAATACTCTCATCAGAGCCTATTCTCGCAGTTCCACACCCCAGCTGGC
TCTACATTACTTCCAATTAATGTTAGATGATGAAAACGTAGGTCCTGATCAGCATACTTT
TCCTTTTATTATTTCTGCGTGTACCAACTCATTGTGGATGCTCTTAGGGAAGCAAATACA
TAATTGGGTCTTGAAAAATGGTGTTGCTTCATCGGACAGGCATGTCCAGACAGCGCTGGT
TCGTTTCTACGCAGAGTGCTGTGCTATGGGCGATGCCCGTAAATTGTTTGATGAAATTCC
GAACTTGGACGTTGTCCAATGGAATGTACTTTTAAATGGGTACGTTCGGCGTGGTTTGGC
TCCTGAGGCTTTGAATGCTTTCCGGAATATGTTGGTGTCCGGAGTTGAGCCTGATGAGTT
CTGTTTGACCACTGCGCTTAAGGGTTGTGCTCAGTTGGGAGCTCTTCAGCAAGGAAAGTG
GATCCATGAGTATGTTACTAAAAGGAAATGGTTGGAGGCTGATGTGTTTATTGGGACTGC
GCTAGTTGATATGTATGCCAAATGTGGATGCATTGACAGGAGTGTGGAGGTTTTTGAGGG
GATGACTAAGAGGAATGTGTTCTCATGGTCTGCTATGATTGGGGGCTTTGCACTACATGG
GCATGTGAGAAAAGCAATGCAATGCTTGGAGAGAATGCAAGTAGAAGATGGGCTTAGACC
AGATGGGGTTGTCCTTCTTGGAGTCATAATGGCTTGTGCCCATGCAGGACTCCAGGAAGA
AGGCCAGTTTCTACTAGAAAACATGGAAGCTCGGTATGGTATCTTACCCAAACATGAGCA
CTATAGTTGCATGGTCGACTTGCTCTGCAGGGCAGGTCAGTTAGACGAAGCACTCAAGCT
CATAAGAAGAATGCCCATGAAGCCCCGTGCTGCAGTCTGGGGTGCCTTACTGAGTGGTTG
TCGAACTCATAATAACGTTGATCTCGCAGAGCTTGCTGCAAGAGAGCTTCTAATGGTGGG
AAATGGAGATGGAACAGAAGAAGATGGAGCTTATGTTCAGCTATCCAACATCTATTTGGC
TGCACAGAAATGTGAAGATGCTTGTAGGATCCGAAGGATGATTGGAGATAAAAGGATTAA
AACAAAGCCAGGATGCAGTCTGATAGAGGTGGAAGGGGAGGTTAATCAGTTTGTTTCAGG
AGATATCTCACATCCATGTCTAGCTCAAATACATGAAATGCTGGATTTAGTGTCCCTTCA
ACACTCCTACAAGCTGGCTTTCCACACAACATGGAGCTCTTGTGATGAGATGGAGCTGAC
TTTTCAGCCATGA