Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_14s0060g00670.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:14:584926:587037:-1 gene:VIT_14s0060g00670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCAGTCTTTGCTGATGCCATGTCGTAGATATTGCACAAGTGTTGCGATTGCCTATAAT TCTCAAATTGCTCGCTATGCTAGAATCGGGCAAATCGAGAGTGCTAGAAGGGTGTTTGAT GAAATGCCTGATAAGGGTATTGTTTCTTGGAACTCGATGGTTGCTGGGTATTTCCAAAAT AATCGGCCTCGTGAAGCTCGGTATCTGTTTGATAAAATGCCTGAGAGGAACACTGTTTCT TGGAATGGGTTGATATCTGGGTATGTAAAAAATAGAATGGTTAGTGAAGCTCGTAAAGCT TTTGATACAATGCCTGAAAGGAATGTCGTTTCGTGGACTGCCATGGTTAGGGGATATGTG CAAGAGGGTTTGGTTTCAGAGGCCGAAACTCTTTTTTGGCAAATGCCTGAAAAGAATGTT GTGTCATGGACAGTGATGTTGGGTGGTTTAATTCAAGTGCGGCGGATTGATGAGGCCCGG GGGCTTTTTGATATTATGCCAGTTAAAGATGTGGTTGCTAGGACTAATATGATATCTGGG TATTGTCAGGAAGGTCGATTGGCGGAAGCTAGAGAGCTCTTTGATGAAATGCCTCGTCGG AATGTGATTTCTTGGACTACTATGATATCTGGGTATGTCCAGAATGGGCAGGTGGATGTT GCGAGGAAACTTTTTGAGGTGATGCCAGAGAAGAACGAGGTGTCATGGACAGCAATGTTG ATGGGTTACACCCAGGGTGGGAGGATTGAAGAGGCTTCTGAGCTTTTTGATGCAATGCCT GTGAAGGCTGTTGTTGCTTGTAATGCCATGATCCTCGGGTTTGGCCAGAATGGGGAGGTA GCTAAAGCAAGGCAAGTGTTTGATCAAATTAGGGAAAAGGATGATGGAACATGGAGTGCA ATGATTAAGGTTTATGAGCGGAAGGGGTTTGAAGTAGAAGCACTTAATTTGTTTGCGTTA ATGCAAAGAGAAGGAGTTCAATCAAATTTCCCTTCTTTGATCAGTGTTCTTTCTGTTTGT GCTAGCCTAGCAAGTCTTGATCATGGTAGACAGGTGCATGCGGAGTTGGTGAAATCTCAA TTTGATTCCGATGTATTTGTTGCCTCAGTTCTGATCACAATGTATGTTAAGTGTGGTGAT CTTGTGAAGGCAAGACAGATTTTTGACCGGTTTTCTCCCAAGGATATTGTCATGTGGAAT TCTATTATCACAGGTTATGCTCAGCATGGCTTGGTAGAAGAAGCCTTGCAAGTTTTCCAT GAAATGTGTTCTTCCGGCATGGCAACTGATGGTGTTACCTTTGTTGGAGTTCTGTCAGCA TGTAGCTACACCGGGAAAGTAAAAGAAGGCCTTGAAATTTTTGAGTCAATGAAATCTAAG TACCTGGTGGAGCCAAAAACTGAACATTATGCTTGCATGGTTGATCTGCTTGGCCGAGCA GGCCTTGTAAATGATGCAATGGATTTAATACAAAAGATGCCAGTAGAAGCAGATGCCATT ATTTGGGGTGCCTTACTAGGTGCATGTAGAACCCACATGAACATGAATTTGGCTGAAGTG GCAGCAAAGAAACTTCTACAGCTTGAGCCCAAAAATGCTGGGCCTTATATACTATTATCA AATATTTATGCATCAAAAGGTAGATGGGGCGATGTTGCAGAGCTGAGGAGAAATATGAGG GTGAAGAAGGTGAGCAAATCACCTGGATGTAGTTGGATTGAGGTGGAGAAAAGAGTGCAT ATGTTTACTGGGGGTGTGAGTACGAAGCATCCTGAGCTTTCAAGTATCATGAAAATGCTG GAGAAATTAGATGGGATGTTGAGAGAAGCTGGATATTATCCTGATAGCAGTTTTGTGCTG CATGATGTGGATGAGGAAGAGAAAGTGCGTAGCTTGGGGCATCACAGTGAGAGGCTGGCC GTGGCATTTGGACTTTTGAAGGTACCTGAAGGGATGCCCATTCGGGTAATGAAGAATCTT CGGGTTTGTGGAGATTGCCATTCTGCAATTAAATTAATAGCAAAAATAACAGGCCGAGAG ATCATTTTGAGGGATGCTAACAGATTCCATCACTTTAAGGATGGCTTCTGTTCTTGCAGG GACTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_14s0060g00670.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:14:584926:587037:-1 gene:VIT_14s0060g00670 transcript:VIT_14s0060g00670.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MQSLLMPCRRYCTSVAIAYNSQIARYARIGQIESARRVFDEMPDKGIVSWNSMVAGYFQN NRPREARYLFDKMPERNTVSWNGLISGYVKNRMVSEARKAFDTMPERNVVSWTAMVRGYV QEGLVSEAETLFWQMPEKNVVSWTVMLGGLIQVRRIDEARGLFDIMPVKDVVARTNMISG YCQEGRLAEARELFDEMPRRNVISWTTMISGYVQNGQVDVARKLFEVMPEKNEVSWTAML MGYTQGGRIEEASELFDAMPVKAVVACNAMILGFGQNGEVAKARQVFDQIREKDDGTWSA MIKVYERKGFEVEALNLFALMQREGVQSNFPSLISVLSVCASLASLDHGRQVHAELVKSQ FDSDVFVASVLITMYVKCGDLVKARQIFDRFSPKDIVMWNSIITGYAQHGLVEEALQVFH EMCSSGMATDGVTFVGVLSACSYTGKVKEGLEIFESMKSKYLVEPKTEHYACMVDLLGRA GLVNDAMDLIQKMPVEADAIIWGALLGACRTHMNMNLAEVAAKKLLQLEPKNAGPYILLS NIYASKGRWGDVAELRRNMRVKKVSKSPGCSWIEVEKRVHMFTGGVSTKHPELSSIMKML EKLDGMLREAGYYPDSSFVLHDVDEEEKVRSLGHHSERLAVAFGLLKVPEGMPIRVMKNL RVCGDCHSAIKLIAKITGREIILRDANRFHHFKDGFCSCRDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_14s0060g00670.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:14:584926:587037:-1 gene:VIT_14s0060g00670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGCAGTCTTTGCTGATGCCATGTCGTAGATATTGCACAAGTGTTGCGATTGCCTATAAT TCTCAAATTGCTCGCTATGCTAGAATCGGGCAAATCGAGAGTGCTAGAAGGGTGTTTGAT GAAATGCCTGATAAGGGTATTGTTTCTTGGAACTCGATGGTTGCTGGGTATTTCCAAAAT AATCGGCCTCGTGAAGCTCGGTATCTGTTTGATAAAATGCCTGAGAGGAACACTGTTTCT TGGAATGGGTTGATATCTGGGTATGTAAAAAATAGAATGGTTAGTGAAGCTCGTAAAGCT TTTGATACAATGCCTGAAAGGAATGTCGTTTCGTGGACTGCCATGGTTAGGGGATATGTG CAAGAGGGTTTGGTTTCAGAGGCCGAAACTCTTTTTTGGCAAATGCCTGAAAAGAATGTT GTGTCATGGACAGTGATGTTGGGTGGTTTAATTCAAGTGCGGCGGATTGATGAGGCCCGG GGGCTTTTTGATATTATGCCAGTTAAAGATGTGGTTGCTAGGACTAATATGATATCTGGG TATTGTCAGGAAGGTCGATTGGCGGAAGCTAGAGAGCTCTTTGATGAAATGCCTCGTCGG AATGTGATTTCTTGGACTACTATGATATCTGGGTATGTCCAGAATGGGCAGGTGGATGTT GCGAGGAAACTTTTTGAGGTGATGCCAGAGAAGAACGAGGTGTCATGGACAGCAATGTTG ATGGGTTACACCCAGGGTGGGAGGATTGAAGAGGCTTCTGAGCTTTTTGATGCAATGCCT GTGAAGGCTGTTGTTGCTTGTAATGCCATGATCCTCGGGTTTGGCCAGAATGGGGAGGTA GCTAAAGCAAGGCAAGTGTTTGATCAAATTAGGGAAAAGGATGATGGAACATGGAGTGCA ATGATTAAGGTTTATGAGCGGAAGGGGTTTGAAGTAGAAGCACTTAATTTGTTTGCGTTA ATGCAAAGAGAAGGAGTTCAATCAAATTTCCCTTCTTTGATCAGTGTTCTTTCTGTTTGT GCTAGCCTAGCAAGTCTTGATCATGGTAGACAGGTGCATGCGGAGTTGGTGAAATCTCAA TTTGATTCCGATGTATTTGTTGCCTCAGTTCTGATCACAATGTATGTTAAGTGTGGTGAT CTTGTGAAGGCAAGACAGATTTTTGACCGGTTTTCTCCCAAGGATATTGTCATGTGGAAT TCTATTATCACAGGTTATGCTCAGCATGGCTTGGTAGAAGAAGCCTTGCAAGTTTTCCAT GAAATGTGTTCTTCCGGCATGGCAACTGATGGTGTTACCTTTGTTGGAGTTCTGTCAGCA TGTAGCTACACCGGGAAAGTAAAAGAAGGCCTTGAAATTTTTGAGTCAATGAAATCTAAG TACCTGGTGGAGCCAAAAACTGAACATTATGCTTGCATGGTTGATCTGCTTGGCCGAGCA GGCCTTGTAAATGATGCAATGGATTTAATACAAAAGATGCCAGTAGAAGCAGATGCCATT ATTTGGGGTGCCTTACTAGGTGCATGTAGAACCCACATGAACATGAATTTGGCTGAAGTG GCAGCAAAGAAACTTCTACAGCTTGAGCCCAAAAATGCTGGGCCTTATATACTATTATCA AATATTTATGCATCAAAAGGTAGATGGGGCGATGTTGCAGAGCTGAGGAGAAATATGAGG GTGAAGAAGGTGAGCAAATCACCTGGATGTAGTTGGATTGAGGTGGAGAAAAGAGTGCAT ATGTTTACTGGGGGTGTGAGTACGAAGCATCCTGAGCTTTCAAGTATCATGAAAATGCTG GAGAAATTAGATGGGATGTTGAGAGAAGCTGGATATTATCCTGATAGCAGTTTTGTGCTG CATGATGTGGATGAGGAAGAGAAAGTGCGTAGCTTGGGGCATCACAGTGAGAGGCTGGCC GTGGCATTTGGACTTTTGAAGGTACCTGAAGGGATGCCCATTCGGGTAATGAAGAATCTT CGGGTTTGTGGAGATTGCCATTCTGCAATTAAATTAATAGCAAAAATAACAGGCCGAGAG ATCATTTTGAGGGATGCTAACAGATTCCATCACTTTAAGGATGGCTTCTGTTCTTGCAGG GACTATTGGTGA