Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_13s0074g00410.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:13:8138688:8141489:1 gene:VIT_13s0074g00410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATTCGATGGAGAACCGCATCAACCCCATACCCAGTGATTCGTCGTTTCCTCTGTACG TTTCGCTGTATCTCTACTCTCTCTCTGCCGATCCAGGAGACCCCTCAAACCCATCTTTTC CAATGCAACACCAGGATTCAGGAACTGGGTCGACTTGGGCGAGTCGAGGAAGCCCGCCGA GTGTTCAATGAAATGATTCAACGAGATGTTGTTTCATGGAACTCGATGATTAATGGGTAT TCCCAGAATGGAAAAGTGGATGAGGCTAGATTGCTTTTTGACGCTTTTGTGGGTAAGAAT ATAAGGACTTGGACGATTTTGTTAACCGGGTATGCGAAGGAAGGGCGAATAGAAGAAGCT CGGGAGGTGTTTGAATCAATGACGGAGCGTAACGTCGTTTCTTGGAATGCTATGATTAGT GGATATGTTCAGAATGGTGATTTGAAGAATGCACGGAAGTTGTTTGATGAAATGCCAGAG AAAAATGTTGCATCATGGAATTCGGTTGTCACTGGGTATTGTCATTGTTATCGGATGAGT GAAGCGCGTGAGCTTTTTGATCAAATGCCTGAGAGGAACTCGGTTTCTTGGATGGTGATG ATTTCTGGGTATGTTCATATAAGTGATTATTGGGAAGCATGGGACGTTTTTGTGAAGATG TGCAGAACTGTGGCGAGACCTGACCAGTCAATATTTGTGGTTGTTCTCTCAGCAATTACT GGTTTGGATGATTTGGAATTGATTGGGAGTTTGCGTCCAATTGCAATCAAGACAGGATAT GAGGGGGATGTGGTTGTGGGCTCAGCAATATTGAATGCTTATACAAGGAATGGGAGTTTG GATTTGGCAATGCACTTTTTTGAAACAATGCCAGAGCGAAATGAATACTCTTGGACCACA ATGATAGCAGCTTTTGCACAGTGTGGTAGATTGGATGATGCAATTCAACTGTATGAGCGA GTCCCTGAACAAACTGTTGCCACAAAAACAGCAATGATGACAGCATATGCCCAGGTTGGA AGAATTCAGAAAGCCAGACTTATATTTGATGAGATCCTGAACCCGAATGTGGTTGCATGG AATGCTATTATTGCTGGATATACACAGAATGGAATGCTTAAAGAAGCAAAAGATTTGTTT CAGAAAATGCCTGTAAAGAATTCTGCTTCTTGGGCAGCCATGATTGCTGGGTTTGTGCAG AATGAAGAAAGCAGAGAAGCTTTAGAGCTGTTAATTGAGCTCCATAGATCAGGTTCTGTT CCAAGTGATTCCAGTTTCACCAGTGCTCTCTCTGCATGTGCCAACATTGGAGATGTTGAG ATAGGTAGAGTAATACACTCACTTGCAATTAAAACAGGGTGCCAATTCAATTCATATGTA ATGAATGGGTTGATCTCCATGTATGCTAAGTGTGGGAATGTGGAAGATGGTTCTCATGTC TTCAGGACAATAAGAGTGAAAGACACAGTGTCTTGGAATTCTCTCATCTCTGGACTTTCA GAGAATTACATGTTGGATGATGCCCGTGTTGTTTTTGAAAAGATGCCCAAACGGGATGTT GTGTCTTGGACTGCGATTATATCAGCTTATGTGCAAGCAGGGCATGGAGAAGTTGCCTTG GACTTGTTCCTCGACATGTTAGCCAGAGGAATAAAACCAAACCAATTAACAGTTACTAGC CTTTTGAGTGCTTGTGGGAACCTGGGTGCCATCAAATTGGGGGAACAGTTCCATGCCTTG ATATTTAAACTTGGATTTGATACATTTTTATTTGTTGGAAATTCTCTAATAACAATGTAT TTCAAGTGTGGATATGAGGATGGCTTTTGTGTGTTTGAGGAAATGCCTGAGCATGACTTG ATCACATGGAATGCAGTTTTAGTTGGCTGTGCACAAAATGGATTAGGTAAAGAAGCCATC AAGATTTTTGAACAAATGGAGGTTGAAGGGATTTTGCCTGATCAAATGAGCTTTCTTGGG GTTTTATGTGCTTGCAGCCATGCAGGGTTAGTGGATGAGGGGTGGGCGCATTTCAATTCC ATGACCCAAAAGTATGGGATCATGCCATTGGTTTATCACTATACTTGTATGGTTGATCTT CTTGGGCGGGCTGGATACCTCTCTGAAGCTGAGGCTCTAATCGAGAACATGCCTGTAAAG CCAGATTCTGTAATTTGGGAGGCTCTACTTGGGGCTTGTAGGATCCATCGTAATGTTGAG CTTGGCCAGAGAGTTGCTGAAAGGCTTTTTCAGATGACAAAACCAAAATCTGCGACATAC GTCTTATTATCCAATTTATTTGCTTCTCAAGGTATGTGGGACAAGGTAGCGGAAATACGA AAATTGATGAAAGATCAGGGATTGACCAAAGAACCAGGAATCAGTTGGATACAGGTCAAG AACAAGTTGCATTGTTTTGTTACAGGGGATAGGACACATGATCAGATTGAAGAGATTTAC TCAGCACTGAAGGAGTACTATGGATGCTTCAGAGCAACAGGTTACATGCCAGACACGAAC TTTGTTCTTCATGATGTGGAAGAAGAACAAAAGCAGAATGAGCTTCTCTACCACAGTGAG AAACTTGCTGTTGTCTTTGGAATCTTGAGCACGCCAAATGGATCACCCATTCAGATTATA AAGAACCTGCGTATTTGTGGTGACTGCCACACTTTCATGAAATTCATGTCCAAGGTCACC CTGCGTAAGATCATTATTCGAGATGGAAATAGATTCCACCATTTTCGCGATGGTTCATGT TCTTGTGGGGACTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_13s0074g00410.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:13:8138688:8141489:1 gene:VIT_13s0074g00410 transcript:VIT_13s0074g00410.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MIRWRTASTPYPVIRRFLCTFRCISTLSLPIQETPQTHLFQCNTRIQELGRLGRVEEARR VFNEMIQRDVVSWNSMINGYSQNGKVDEARLLFDAFVGKNIRTWTILLTGYAKEGRIEEA REVFESMTERNVVSWNAMISGYVQNGDLKNARKLFDEMPEKNVASWNSVVTGYCHCYRMS EARELFDQMPERNSVSWMVMISGYVHISDYWEAWDVFVKMCRTVARPDQSIFVVVLSAIT GLDDLELIGSLRPIAIKTGYEGDVVVGSAILNAYTRNGSLDLAMHFFETMPERNEYSWTT MIAAFAQCGRLDDAIQLYERVPEQTVATKTAMMTAYAQVGRIQKARLIFDEILNPNVVAW NAIIAGYTQNGMLKEAKDLFQKMPVKNSASWAAMIAGFVQNEESREALELLIELHRSGSV PSDSSFTSALSACANIGDVEIGRVIHSLAIKTGCQFNSYVMNGLISMYAKCGNVEDGSHV FRTIRVKDTVSWNSLISGLSENYMLDDARVVFEKMPKRDVVSWTAIISAYVQAGHGEVAL DLFLDMLARGIKPNQLTVTSLLSACGNLGAIKLGEQFHALIFKLGFDTFLFVGNSLITMY FKCGYEDGFCVFEEMPEHDLITWNAVLVGCAQNGLGKEAIKIFEQMEVEGILPDQMSFLG VLCACSHAGLVDEGWAHFNSMTQKYGIMPLVYHYTCMVDLLGRAGYLSEAEALIENMPVK PDSVIWEALLGACRIHRNVELGQRVAERLFQMTKPKSATYVLLSNLFASQGMWDKVAEIR KLMKDQGLTKEPGISWIQVKNKLHCFVTGDRTHDQIEEIYSALKEYYGCFRATGYMPDTN FVLHDVEEEQKQNELLYHSEKLAVVFGILSTPNGSPIQIIKNLRICGDCHTFMKFMSKVT LRKIIIRDGNRFHHFRDGSCSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_13s0074g00410.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:13:8138688:8141489:1 gene:VIT_13s0074g00410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATTCGATGGAGAACCGCATCAACCCCATACCCAGTGATTCGTCGTTTCCTCTGTACG TTTCGCTGTATCTCTACTCTCTCTCTGCCGATCCAGGAGACCCCTCAAACCCATCTTTTC CAATGCAACACCAGGATTCAGGAACTGGGTCGACTTGGGCGAGTCGAGGAAGCCCGCCGA GTGTTCAATGAAATGATTCAACGAGATGTTGTTTCATGGAACTCGATGATTAATGGGTAT TCCCAGAATGGAAAAGTGGATGAGGCTAGATTGCTTTTTGACGCTTTTGTGGGTAAGAAT ATAAGGACTTGGACGATTTTGTTAACCGGGTATGCGAAGGAAGGGCGAATAGAAGAAGCT CGGGAGGTGTTTGAATCAATGACGGAGCGTAACGTCGTTTCTTGGAATGCTATGATTAGT GGATATGTTCAGAATGGTGATTTGAAGAATGCACGGAAGTTGTTTGATGAAATGCCAGAG AAAAATGTTGCATCATGGAATTCGGTTGTCACTGGGTATTGTCATTGTTATCGGATGAGT GAAGCGCGTGAGCTTTTTGATCAAATGCCTGAGAGGAACTCGGTTTCTTGGATGGTGATG ATTTCTGGGTATGTTCATATAAGTGATTATTGGGAAGCATGGGACGTTTTTGTGAAGATG TGCAGAACTGTGGCGAGACCTGACCAGTCAATATTTGTGGTTGTTCTCTCAGCAATTACT GGTTTGGATGATTTGGAATTGATTGGGAGTTTGCGTCCAATTGCAATCAAGACAGGATAT GAGGGGGATGTGGTTGTGGGCTCAGCAATATTGAATGCTTATACAAGGAATGGGAGTTTG GATTTGGCAATGCACTTTTTTGAAACAATGCCAGAGCGAAATGAATACTCTTGGACCACA ATGATAGCAGCTTTTGCACAGTGTGGTAGATTGGATGATGCAATTCAACTGTATGAGCGA GTCCCTGAACAAACTGTTGCCACAAAAACAGCAATGATGACAGCATATGCCCAGGTTGGA AGAATTCAGAAAGCCAGACTTATATTTGATGAGATCCTGAACCCGAATGTGGTTGCATGG AATGCTATTATTGCTGGATATACACAGAATGGAATGCTTAAAGAAGCAAAAGATTTGTTT CAGAAAATGCCTGTAAAGAATTCTGCTTCTTGGGCAGCCATGATTGCTGGGTTTGTGCAG AATGAAGAAAGCAGAGAAGCTTTAGAGCTGTTAATTGAGCTCCATAGATCAGGTTCTGTT CCAAGTGATTCCAGTTTCACCAGTGCTCTCTCTGCATGTGCCAACATTGGAGATGTTGAG ATAGGTAGAGTAATACACTCACTTGCAATTAAAACAGGGTGCCAATTCAATTCATATGTA ATGAATGGGTTGATCTCCATGTATGCTAAGTGTGGGAATGTGGAAGATGGTTCTCATGTC TTCAGGACAATAAGAGTGAAAGACACAGTGTCTTGGAATTCTCTCATCTCTGGACTTTCA GAGAATTACATGTTGGATGATGCCCGTGTTGTTTTTGAAAAGATGCCCAAACGGGATGTT GTGTCTTGGACTGCGATTATATCAGCTTATGTGCAAGCAGGGCATGGAGAAGTTGCCTTG GACTTGTTCCTCGACATGTTAGCCAGAGGAATAAAACCAAACCAATTAACAGTTACTAGC CTTTTGAGTGCTTGTGGGAACCTGGGTGCCATCAAATTGGGGGAACAGTTCCATGCCTTG ATATTTAAACTTGGATTTGATACATTTTTATTTGTTGGAAATTCTCTAATAACAATGTAT TTCAAGTGTGGATATGAGGATGGCTTTTGTGTGTTTGAGGAAATGCCTGAGCATGACTTG ATCACATGGAATGCAGTTTTAGTTGGCTGTGCACAAAATGGATTAGGTAAAGAAGCCATC AAGATTTTTGAACAAATGGAGGTTGAAGGGATTTTGCCTGATCAAATGAGCTTTCTTGGG GTTTTATGTGCTTGCAGCCATGCAGGGTTAGTGGATGAGGGGTGGGCGCATTTCAATTCC ATGACCCAAAAGTATGGGATCATGCCATTGGTTTATCACTATACTTGTATGGTTGATCTT CTTGGGCGGGCTGGATACCTCTCTGAAGCTGAGGCTCTAATCGAGAACATGCCTGTAAAG CCAGATTCTGTAATTTGGGAGGCTCTACTTGGGGCTTGTAGGATCCATCGTAATGTTGAG CTTGGCCAGAGAGTTGCTGAAAGGCTTTTTCAGATGACAAAACCAAAATCTGCGACATAC GTCTTATTATCCAATTTATTTGCTTCTCAAGGTATGTGGGACAAGGTAGCGGAAATACGA AAATTGATGAAAGATCAGGGATTGACCAAAGAACCAGGAATCAGTTGGATACAGGTCAAG AACAAGTTGCATTGTTTTGTTACAGGGGATAGGACACATGATCAGATTGAAGAGATTTAC TCAGCACTGAAGGAGTACTATGGATGCTTCAGAGCAACAGGTTACATGCCAGACACGAAC TTTGTTCTTCATGATGTGGAAGAAGAACAAAAGCAGAATGAGCTTCTCTACCACAGTGAG AAACTTGCTGTTGTCTTTGGAATCTTGAGCACGCCAAATGGATCACCCATTCAGATTATA AAGAACCTGCGTATTTGTGGTGACTGCCACACTTTCATGAAATTCATGTCCAAGGTCACC CTGCGTAAGATCATTATTCGAGATGGAAATAGATTCCACCATTTTCGCGATGGTTCATGT TCTTGTGGGGACTATTGGTGAGTTTGTCATGGGTGAGCATTC