Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_13s0073g00130.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:13:13277706:13346478:1 gene:VIT_13s0073g00130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGATATTTTCTCCCTTGCCTCCCCACTCTGCCCCCACACCACCACCTTCTCCGCCAGC ATCCTCGCCGGGAAAACCCACCCCACCACTGCTTTCTGTTTCTCCTCCAAAACTTCTCCT GAACCCGACGAACCTTCGAACTCCTCCGGCCACCTCCGCCGCCCCAAAACCCTCAAACCA TCCCTCAACCCCACTCCTCCAAGTCCTAAAACTACCAAAAATCCCCTCAAAAACATCGTA AATCCCACTATTTCTCCCACCAATCCTGCCAATCTCACCAACAAACTCTGGTTATCCAGC CAACTCTCTCCTCCTCCTCCTCCACCACCAACGCGGCCGCCACAAGAAACAATTGACGAT AATGAGGTTACGGTTTCGAGTAATTTGGATAATTTATGTTCAGATGGTTCACCGGAAATT GAGTTCCGACAAGAGGGTAAAATCTTTGTGGGCAACCTTCCAAATTGGGTTAAAAAGAAC GAGGTTTCGGAGTTTTTCCGGCAATTCGGGCCGATAGAGAATGTGATACTGATTAAAGGC CACAATGACAACCAAAGGAATGCGGGTTTCGGGTTTGTTATCTATGGTGGCCCAATGGCG TCGGGCTCTGCAATGAGGGCGGTGGAGTTTGATGGTGTGGAGTTTCATGGGAGGGTTTTG ACTGTGAAGTTGGATGATGGGAGAAGACTAAGAGGGAGGTCTGAGGAAAGGGCGAGGTGG GTTCAAGGGCATGGTGTGGATCAACGGTCCAAGTGGCACGAAGAGAGGGAAAGTTCCAGG AAGGATTTCCGGAAAGTTCTAGAAACTGAGCCCGAGAACTGGCAGGCTGTGGTTCAGGCT TTTGAGAGGATTAAGAAGCCTTCTAGAAAAGAGTTTGGGTTGATGGTGACCTATTATGCA CGGCGAGGGGATATGCATCATGCACGTGGAACTTTTGAAAGCATGCGAGCAAGGGGAATA GAGCCAACCTCTCATGTCTATACAAGTCTTATCCATGCTTATGCAGTTGGTAGAGACATG GAAGAAGCATTATCTTGTGTGAGGAAAATGAAAGAAGAGGGCATTGAAATGAGTTTGGTG ACTTATAGCATTCTTGTGGGTGGATTTGCCAAAATTGCTGATGCTGAAGCTGCAGATCAT TGGTTTAAGGAGGCAAAAGAGAGACATACAACTCTAAATGCAATTATATATGGGAATATA ATATATGCTCATTGCCAGGCCTGTAATATGACTCAAGCTGAAGCCTTGGTGAGAGAGATG GAAGAAGAAGGCATTGATGCTCCAATTGACATATATCATACCATGATGGATGGCTACACA ATTATTGGAAATGAAGAGAAATGTCTAATTGTGTTTGACAGACTTAAGGAATGTGGCTTT ACACCTTCAGTAATCAGTTATGGATGTCTCATTAATCTTTACATTAAGATTGGAAAAGTT TCCAAAGCCTTAGAGGTTAGCAAAATGATGGAAGTGGCTGGCATAAAACATAATATGAAA ACATATTCCATGTTAATCAATGGATTTGTACGGTTAAAAGATTGGGCAAATGCATTTGCA GTTTTTGAAGATGTTGTGAAAGATGGTTTGAAGCCTGATGTTGTGCTGTATAATAACATC ATCAGAGCATTCTGTGGGATGGGTAACATGGATCGTGCCATTCGTACTGTCAAGGAAATG CAGAAGGAGAGGCATAGGCCTACCACACGAACTTTTATGCCCATTATACATGGTTTTGCA AGATCTGGGGATATGAGAAGAGCCCTAGAGATCTTTGATATGATGAGGTGGAGTGGATGC ATTCCTACTGTGCACACTTTCAATGCTCTGATTCTTGGTCTTGTTGAAAAATGTCAGATG GAGAAAGCTGTTGAAATATTAGATGAGATGTCACTGGCAGGCATAAGTCCAAATGAGCAT ACATACACAACCATCATGCATGGTTATGCATCATTGGGTGACACTGGAAAAGCTTTTGAG TATTTTACTAAACTAAAAACTGAGGGCTTGGAGCTTGATGTGTACACATATGAGGCATTA CTTAAGGCATGTTGCAAGTCAGGCAGGATGCAGAGTGCTTTAGCAGTCACAAGGGAAATG AGTTCTCAAAAGATTCCAAGAAACACCTTTGTCTACAACATATTAATTGATGGATGGGCT CGTAGAGGTGATGTTTGGGAGGCTGCAGAGCTCATGCAACAAATGAAACAAGAAGGGGTA CAGCCTGATATACATACATACACATCTTTCATAAATGCTTGTTGCAAGGCTGGAGACATG CAGAGAGCAACAAAAACAATTCAAGAGATGGAAGTTGTTGGAGTGAAGCCAAATATTAAA ACCTACACGACATTAATACATGGCTGGGCCCGTGCGTCTCTTCCAGAGAAGGCTTTGAAA TGCTTCCAGGAGATGAAGTCAGCAGGTTTGAAGCCAGACAAAGCAGTATACCATTGCTTG ATGACATCATTGCTGTCAAGAGCAAGTGTTGCAGAAGAGTACATATATTCTGGAGTTGTG GGTATTTGCAGAGAGATGATAGAGTGTGAATTGACTGTTGATATGGGAACTGCTGTTCAC TGGTCCAAGTGTTTACGGAAGATTGAGAGGACTGGTGGAGAACTTACAGAAGCCTTGCAG AAGACCTTCCCTCCTGACTGGAATTCATACAATATTCATGTGAATTCTGATGATGAACTG GATGTTGATGATGCATACTCTGGCGGTGAGACAGATACTGATGATGATGATGACAACGAT GATGATGATCCTGGCCTTAGCTTATGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_13s0073g00130.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:13:13277706:13346478:1 gene:VIT_13s0073g00130 transcript:VIT_13s0073g00130.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MDIFSLASPLCPHTTTFSASILAGKTHPTTAFCFSSKTSPEPDEPSNSSGHLRRPKTLKP SLNPTPPSPKTTKNPLKNIVNPTISPTNPANLTNKLWLSSQLSPPPPPPPTRPPQETIDD NEVTVSSNLDNLCSDGSPEIEFRQEGKIFVGNLPNWVKKNEVSEFFRQFGPIENVILIKG HNDNQRNAGFGFVIYGGPMASGSAMRAVEFDGVEFHGRVLTVKLDDGRRLRGRSEERARW VQGHGVDQRSKWHEERESSRKDFRKVLETEPENWQAVVQAFERIKKPSRKEFGLMVTYYA RRGDMHHARGTFESMRARGIEPTSHVYTSLIHAYAVGRDMEEALSCVRKMKEEGIEMSLV TYSILVGGFAKIADAEAADHWFKEAKERHTTLNAIIYGNIIYAHCQACNMTQAEALVREM EEEGIDAPIDIYHTMMDGYTIIGNEEKCLIVFDRLKECGFTPSVISYGCLINLYIKIGKV SKALEVSKMMEVAGIKHNMKTYSMLINGFVRLKDWANAFAVFEDVVKDGLKPDVVLYNNI IRAFCGMGNMDRAIRTVKEMQKERHRPTTRTFMPIIHGFARSGDMRRALEIFDMMRWSGC IPTVHTFNALILGLVEKCQMEKAVEILDEMSLAGISPNEHTYTTIMHGYASLGDTGKAFE YFTKLKTEGLELDVYTYEALLKACCKSGRMQSALAVTREMSSQKIPRNTFVYNILIDGWA RRGDVWEAAELMQQMKQEGVQPDIHTYTSFINACCKAGDMQRATKTIQEMEVVGVKPNIK TYTTLIHGWARASLPEKALKCFQEMKSAGLKPDKAVYHCLMTSLLSRASVAEEYIYSGVV GICREMIECELTVDMGTAVHWSKCLRKIERTGGELTEALQKTFPPDWNSYNIHVNSDDEL DVDDAYSGGETDTDDDDDNDDDDPGLSLW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_13s0073g00130.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:13:13277706:13346478:1 gene:VIT_13s0073g00130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGATATTTTCTCCCTTGCCTCCCCACTCTGCCCCCACACCACCACCTTCTCCGCCAGC ATCCTCGCCGGGAAAACCCACCCCACCACTGCTTTCTGTTTCTCCTCCAAAACTTCTCCT GAACCCGACGAACCTTCGAACTCCTCCGGCCACCTCCGCCGCCCCAAAACCCTCAAACCA TCCCTCAACCCCACTCCTCCAAGTCCTAAAACTACCAAAAATCCCCTCAAAAACATCGTA AATCCCACTATTTCTCCCACCAATCCTGCCAATCTCACCAACAAACTCTGGTTATCCAGC CAACTCTCTCCTCCTCCTCCTCCACCACCAACGCGGCCGCCACAAGAAACAATTGACGAT AATGAGGTTACGGTTTCGAGTAATTTGGATAATTTATGTTCAGATGGTTCACCGGAAATT GAGTTCCGACAAGAGGGTAAAATCTTTGTGGGCAACCTTCCAAATTGGGTTAAAAAGAAC GAGGTTTCGGAGTTTTTCCGGCAATTCGGGCCGATAGAGAATGTGATACTGATTAAAGGC CACAATGACAACCAAAGGAATGCGGGTTTCGGGTTTGTTATCTATGGTGGCCCAATGGCG TCGGGCTCTGCAATGAGGGCGGTGGAGTTTGATGGTGTGGAGTTTCATGGGAGGGTTTTG ACTGTGAAGTTGGATGATGGGAGAAGACTAAGAGGGAGGTCTGAGGAAAGGGCGAGGTGG GTTCAAGGGCATGGTGTGGATCAACGGTCCAAGTGGCACGAAGAGAGGGAAAGTTCCAGG AAGGATTTCCGGAAAGTTCTAGAAACTGAGCCCGAGAACTGGCAGGCTGTGGTTCAGGCT TTTGAGAGGATTAAGAAGCCTTCTAGAAAAGAGTTTGGGTTGATGGTGACCTATTATGCA CGGCGAGGGGATATGCATCATGCACGTGGAACTTTTGAAAGCATGCGAGCAAGGGGAATA GAGCCAACCTCTCATGTCTATACAAGTCTTATCCATGCTTATGCAGTTGGTAGAGACATG GAAGAAGCATTATCTTGTGTGAGGAAAATGAAAGAAGAGGGCATTGAAATGAGTTTGGTG ACTTATAGCATTCTTGTGGGTGGATTTGCCAAAATTGCTGATGCTGAAGCTGCAGATCAT TGGTTTAAGGAGGCAAAAGAGAGACATACAACTCTAAATGCAATTATATATGGGAATATA ATATATGCTCATTGCCAGGCCTGTAATATGACTCAAGCTGAAGCCTTGGTGAGAGAGATG GAAGAAGAAGGCATTGATGCTCCAATTGACATATATCATACCATGATGGATGGCTACACA ATTATTGGAAATGAAGAGAAATGTCTAATTGTGTTTGACAGACTTAAGGAATGTGGCTTT ACACCTTCAGTAATCAGTTATGGATGTCTCATTAATCTTTACATTAAGATTGGAAAAGTT TCCAAAGCCTTAGAGGTTAGCAAAATGATGGAAGTGGCTGGCATAAAACATAATATGAAA ACATATTCCATGTTAATCAATGGATTTGTACGGTTAAAAGATTGGGCAAATGCATTTGCA GTTTTTGAAGATGTTGTGAAAGATGGTTTGAAGCCTGATGTTGTGCTGTATAATAACATC ATCAGAGCATTCTGTGGGATGGGTAACATGGATCGTGCCATTCGTACTGTCAAGGAAATG CAGAAGGAGAGGCATAGGCCTACCACACGAACTTTTATGCCCATTATACATGGTTTTGCA AGATCTGGGGATATGAGAAGAGCCCTAGAGATCTTTGATATGATGAGGTGGAGTGGATGC ATTCCTACTGTGCACACTTTCAATGCTCTGATTCTTGGTCTTGTTGAAAAATGTCAGATG GAGAAAGCTGTTGAAATATTAGATGAGATGTCACTGGCAGGCATAAGTCCAAATGAGCAT ACATACACAACCATCATGCATGGTTATGCATCATTGGGTGACACTGGAAAAGCTTTTGAG TATTTTACTAAACTAAAAACTGAGGGCTTGGAGCTTGATGTGTACACATATGAGGCATTA CTTAAGGCATGTTGCAAGTCAGGCAGGATGCAGAGTGCTTTAGCAGTCACAAGGGAAATG AGTTCTCAAAAGATTCCAAGAAACACCTTTGTCTACAACATATTAATTGATGGATGGGCT CGTAGAGGTGATGTTTGGGAGGCTGCAGAGCTCATGCAACAAATGAAACAAGAAGGGGTA CAGCCTGATATACATACATACACATCTTTCATAAATGCTTGTTGCAAGGCTGGAGACATG CAGAGAGCAACAAAAACAATTCAAGAGATGGAAGTTGTTGGAGTGAAGCCAAATATTAAA ACCTACACGACATTAATACATGGCTGGGCCCGTGCGTCTCTTCCAGAGAAGGCTTTGAAA TGCTTCCAGGAGATGAAGTCAGCAGGTTTGAAGCCAGACAAAGCAGTATACCATTGCTTG ATGACATCATTGCTGTCAAGAGCAAGTGTTGCAGAAGAGTACATATATTCTGGAGTTGTG GGTATTTGCAGAGAGATGATAGAGTGTGAATTGACTGTTGATATGGGAACTGCTGTTCAC TGGTCCAAGTGTTTACGGAAGATTGAGAGGACTGGTGGAGAACTTACAGAAGCCTTGCAG AAGACCTTCCCTCCTGACTGGAATTCATACAATATTCATGTGAATTCTGATGATGAACTG GATGTTGATGATGCATACTCTGGCGGTGAGACAGATACTGATGATGATGATGACAACGAT GATGATGATCCTGGCCTTAGCTTATGGTGA