Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_13s0067g03080.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:13:1671489:1678965:1 gene:VIT_13s0067g03080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)] [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F6HC70]
Sequence	ATGGTGGCGTCACGGCTACAACCACCGTTTTTGAACCCACTCTTCTCTTCAAATTATTAT TCTTCTCACCCTCTTCCTTCACCATCAAGACCCACATTTCTGGCGCTGTCAGCCAACCCT CAAGAGACTTCAGAACCAGCCAAAGACCGCCAGAAAGTGGTGAGAATCGCCTGGGAGAAG CTGGTCCGCTGGTCCCGTTCTTGGCGTTCCAAGGCCAAGACCGATGTGCTTGAGCGCACC AACAAGGTGGTGGTCCTTGGAGGTGGATCATTTGGTACGGCAATGGCTGCCCATATTGCA GCTAGAAAGGCTCAATTGGAAGTTAACATGCTTGTACGTAATTCTCAAGTTTGTCAATCT ATTAATGAGAACCACTGTAATTGTAAGTATTTCCCAGAACACAAGCTACCAGAAAATGTA ATTGCAACAACTGATGCCAGAGCTGCTTTGCTCGGTGCGGACTATTGTCTTCATGCTGTA CCTGTGCAGTTCAGCTCGTCTTTTCTTGAAGGCATTGCAGACTCTGTTGATCCAACCTTG CCATTCATATCCCTTAGCAAAGGCTTGGAGCTCAATACATTCAGGATGATGTCTCAGATT ATTCCCCAAGCTCTGGGGAATCCTCGACAACCTTTTATTGCACTATCAGGACCTTCGTTT GCATTGGAATTGATGAATAAATTACCAACAGCAATGGTTGTGGCATCAAAAGACAAGAAA CTTGCAAATGCCACTCAGCAGCTACTAGCTTCTAGTCATCTAAGAATTAGCACATCAAGT GATGTTACAGGGGTGGAAATTGCAGGTGCACTCAAGAATGTACTTGCAATAGCAGCTGGT ATTGTGGAGGGGATGAATCTTGGTAATAATTCTATGGCAGCTCTTGTTGCACAAGGTTGT TCCGAGATAAGATGGTTAGCGACAAAGATGGGGGCCAAATCAACAACAATTATGGGTCTA TCAGGAACTGGGGACATTATGCTTACATGTTTTGTGAATCTATCGAGAAACAAAACAGTT GGAATTCGTCTTGGATCAGGAGAGAAGCTTGATGACATACTGGGTTCCATGAATCAGGTA GCTGAAGGTGTATCAACAGCTGGTGCTGTGATTGCATTGGCCCAAAAATACAATGTTAAG ATGCCAGTTTTAACAGCAGTTGCTCGGATTATTGACAATGAACTAACCCCAAAAAAGGCT GTGCTTGAGTTGATGAACCTACCTCAGGTTGAAGAAGTCTCACCCTCGATCAATTCCAAG ATCAAGGCCTTAGTTCAACAAGGAAAATATTCCCAAGCCCTGGAATTACACTCCAAAACA CCCCATTCCGCTCTCACCACCGCCAAATTCACCTTCCCATCTCTTCTCAAAACCTGTGCC TCCCTTTCAAATCTCTACCATGGAAGAACAATCCATGCCTCCATTGTCACAATGGGTCTG CAATCTGATCCATACATAGCCACCTCTTTGATCAATATGTATGTGAAATGTGGGTTACTC GGGAGTGCACTCCAAGTGTTTGACAAAATGTCTGAGAGTAGAGACTCAGCTCCAGACATC ACTGTTTGGAACCCTGTGATTGATGGGTACTTTAAATATGGCCATTTTGAGGAGGGTCTT GCGCAGTTTTGTAGAATGCAGGAGTTGGGTATTAGGCCTGATGGGTACTCTCTTAGTATA GTCCTTGGCATTTGTAACAGACTTTCATGGTACATGGCAGGGAGGCAAATTCATGGTTAC ATTATCAGAAACATGTTTGAGGGTGACCCTTATTTGGAGACAGCACTGATTGGGATGTAC TCCAGTTGCAGTAGACCAATGGAGGCTTGGAGTCTGTTTGGTAAGCTGGAAAATAGAAGC AATATTGTAGCATGGAACGTGATGATTGGGGGGTTTGTTGAGAATGGGATGTGGGAAAAA AGCTTGGAATTGTATTCATTGGCTAAGAATGAGAACTGCAAACTTGTTTCAGCATCATTT ACTGGTGCATTCACTGCTTGCTCTCATGGTGAAGTTCTAGACTTTGGCAGGCAGGTTCAT TGTGATGTGATAAAAATGAATTTCCAGGATGACCCTTATGTCTGCACTTCCCTCTTAACC ATGTATGCCAAGTCTGGATCAGTTGAAGATGCCAAAAAGGTTTTTGATCAGGTACTGGAC AAAGAAGTTGAACTACGGAATGCAATGATTTCAGCTTTTATCGGTAATGGTCGCGCTTAT GATGCTTTGGGGCTCTACAACAAGATGAAAGCAGGTGAAACCCCAGTTGATTCATTCACT ATTTCAAGTCTTTTATCAGGTTGCAGTGTGGTTGGATCTTATGATTTTGGTAGGACAGTT CATGCAGAAGTAATAAAGAGATCGATGCAGAGTAATGTTGCTATACAGAGTGCATTGTTG ACAATGTACTACAAATGTGGAAGTACGGAAGATGCTGATTCAGTTTTTTATACAATGAAG GAAAGGGATGTTGTAGCATGGGGCTCCATGATTGCAGGTTTTTGCCAGAACAGAAGGTTC AAGGATGCTCTGGATTTGTTCAGAGCCATGGAGAAGGAAGGAGTGAAAGCAGACTCCGAT GTTATGACTAGTGTGATCAGTGCGGGTTTGGGACTGGAGAATGTAGAACTGGGTCACTTA ATCCATGGATTTGCTATTAAGCGTGGATTAGAATCGGATGTCTTTGTCGCTTGTTCCCTG GTTGATATGTACTCCAAATTTGGTTTTGCAGAGAGCGCTGAAATGGTATTCTCTAGTATG CCAAACAAGAATCTGGTGGCTTGGAATTCTATGATTTCATGCTATTCTTGGAATGGCCTT CCAGAGATGTCCATTAATCTTCTTCCTCAAATTCTACAGCATGGCTTCTACCTGGATTCC GTCTCCATTACCACTGTCCTCGTTGCGGTTTCATCAGTTGCAGCACTGCTTAAAGGGAAG ACTTTGCATGCATACCAGATAAGACTACAAATTCCATCCGACCTTCAAGTGGAGAATGCA TTAATCGATATGTATGTGAAGTGTGGATGTTTGAAATATGCTCAGTTGATCTTTGAAAAC ATGCCCAGAAGAAACCTAGTGACATGGAACTCAATGATAGCTGGTTATGGATCTCATGGG AACTGCGAAGAAGCAGTCAGATTATTTAAAGAGATGAAGAGATCGGAAACAGCTCCCGAT GAGGTAACTTTTCTTGCCCTGATCACATCTTGCAGCCATTCTGGTATGGTTGAAGAAGGC CTGAATCTATTTCAATTGATGAGAATCGAGTATGGGGTTGAGCCTAGAATGGAGCATTAT GCGAGTGTAGTTGATCTATTGGGCCGTGCTGGACGCTTGGACGACGCTTATAGCTTCATA CGGGGCATGCCAATTGACGCTGACAGGAGTGTTTGGCTATGTTTGTTGTTTGCCTGTCGA GCTCATCGGAACATGGAGCTTGGGGAGTTGGTTGCTGATAACCTACTGAAGATGGAGCCA GCCAGGGGCAGCAACTATGTGCCACTGCTGAACCTTTATGGAGAAGTTGAGATGTGGGAC AGGGCTGCAAACTTAAGGGCATCTATGAAGGGGAGGGGCTTGAAGAAGAGTCCCGGATGC AGTTGGATTGAAGTGAAAAACAGGGTTGATGTTTTCTTCTCAGGAGACTCATCTTCCACA AGGAGGATCGAAATCTACAAGACATTGAGTAGTCTTAAGAGTAACATGGAAGGGAAAGGA TGCTCCTATGAAGGGATTGAGGTGTGTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_13s0067g03080.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:13:1671489:1678965:1 gene:VIT_13s0067g03080 transcript:VIT_13s0067g03080.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)] [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F6HC70]
Sequence	MVASRLQPPFLNPLFSSNYYSSHPLPSPSRPTFLALSANPQETSEPAKDRQKVVRIAWEK LVRWSRSWRSKAKTDVLERTNKVVVLGGGSFGTAMAAHIAARKAQLEVNMLVRNSQVCQS INENHCNCKYFPEHKLPENVIATTDARAALLGADYCLHAVPVQFSSSFLEGIADSVDPTL PFISLSKGLELNTFRMMSQIIPQALGNPRQPFIALSGPSFALELMNKLPTAMVVASKDKK LANATQQLLASSHLRISTSSDVTGVEIAGALKNVLAIAAGIVEGMNLGNNSMAALVAQGC SEIRWLATKMGAKSTTIMGLSGTGDIMLTCFVNLSRNKTVGIRLGSGEKLDDILGSMNQV AEGVSTAGAVIALAQKYNVKMPVLTAVARIIDNELTPKKAVLELMNLPQVEEVSPSINSK IKALVQQGKYSQALELHSKTPHSALTTAKFTFPSLLKTCASLSNLYHGRTIHASIVTMGL QSDPYIATSLINMYVKCGLLGSALQVFDKMSESRDSAPDITVWNPVIDGYFKYGHFEEGL AQFCRMQELGIRPDGYSLSIVLGICNRLSWYMAGRQIHGYIIRNMFEGDPYLETALIGMY SSCSRPMEAWSLFGKLENRSNIVAWNVMIGGFVENGMWEKSLELYSLAKNENCKLVSASF TGAFTACSHGEVLDFGRQVHCDVIKMNFQDDPYVCTSLLTMYAKSGSVEDAKKVFDQVLD KEVELRNAMISAFIGNGRAYDALGLYNKMKAGETPVDSFTISSLLSGCSVVGSYDFGRTV HAEVIKRSMQSNVAIQSALLTMYYKCGSTEDADSVFYTMKERDVVAWGSMIAGFCQNRRF KDALDLFRAMEKEGVKADSDVMTSVISAGLGLENVELGHLIHGFAIKRGLESDVFVACSL VDMYSKFGFAESAEMVFSSMPNKNLVAWNSMISCYSWNGLPEMSINLLPQILQHGFYLDS VSITTVLVAVSSVAALLKGKTLHAYQIRLQIPSDLQVENALIDMYVKCGCLKYAQLIFEN MPRRNLVTWNSMIAGYGSHGNCEEAVRLFKEMKRSETAPDEVTFLALITSCSHSGMVEEG LNLFQLMRIEYGVEPRMEHYASVVDLLGRAGRLDDAYSFIRGMPIDADRSVWLCLLFACR AHRNMELGELVADNLLKMEPARGSNYVPLLNLYGEVEMWDRAANLRASMKGRGLKKSPGC SWIEVKNRVDVFFSGDSSSTRRIEIYKTLSSLKSNMEGKGCSYEGIEVC

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_13s0067g03080.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:13:1671489:1678965:1 gene:VIT_13s0067g03080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)] [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F6HC70]
Sequence	ATGGTGGCGTCACGGCTACAACCACCGTTTTTGAACCCACTCTTCTCTTCAAATTATTAT TCTTCTCACCCTCTTCCTTCACCATCAAGACCCACATTTCTGGCGCTGTCAGCCAACCCT CAAGAGACTTCAGAACCAGCCAAAGACCGCCAGAAAGTGGTGAGAATCGCCTGGGAGAAG CTGGTCCGCTGGTCCCGTTCTTGGCGTTCCAAGGCCAAGACCGATGTGCTTGAGCGCACC AACAAGGTGGTGGTCCTTGGAGGTGGATCATTTGGTACGGCAATGGCTGCCCATATTGCA GCTAGAAAGGCTCAATTGGAAGTTAACATGCTTGTACGTAATTCTCAAGTTTGTCAATCT ATTAATGAGAACCACTGTAATTGTAAGTATTTCCCAGAACACAAGCTACCAGAAAATGTA ATTGCAACAACTGATGCCAGAGCTGCTTTGCTCGGTGCGGACTATTGTCTTCATGCTGTA CCTGTGCAGTTCAGCTCGTCTTTTCTTGAAGGCATTGCAGACTCTGTTGATCCAACCTTG CCATTCATATCCCTTAGCAAAGGCTTGGAGCTCAATACATTCAGGATGATGTCTCAGATT ATTCCCCAAGCTCTGGGGAATCCTCGACAACCTTTTATTGCACTATCAGGACCTTCGTTT GCATTGGAATTGATGAATAAATTACCAACAGCAATGGTTGTGGCATCAAAAGACAAGAAA CTTGCAAATGCCACTCAGCAGCTACTAGCTTCTAGTCATCTAAGAATTAGCACATCAAGT GATGTTACAGGGGTGGAAATTGCAGGTGCACTCAAGAATGTACTTGCAATAGCAGCTGGT ATTGTGGAGGGGATGAATCTTGGTAATAATTCTATGGCAGCTCTTGTTGCACAAGGTTGT TCCGAGATAAGATGGTTAGCGACAAAGATGGGGGCCAAATCAACAACAATTATGGGTCTA TCAGGAACTGGGGACATTATGCTTACATGTTTTGTGAATCTATCGAGAAACAAAACAGTT GGAATTCGTCTTGGATCAGGAGAGAAGCTTGATGACATACTGGGTTCCATGAATCAGGTA GCTGAAGGTGTATCAACAGCTGGTGCTGTGATTGCATTGGCCCAAAAATACAATGTTAAG ATGCCAGTTTTAACAGCAGTTGCTCGGATTATTGACAATGAACTAACCCCAAAAAAGGCT GTGCTTGAGTTGATGAACCTACCTCAGGTTGAAGAAGTCTCACCCTCGATCAATTCCAAG ATCAAGGCCTTAGTTCAACAAGGAAAATATTCCCAAGCCCTGGAATTACACTCCAAAACA CCCCATTCCGCTCTCACCACCGCCAAATTCACCTTCCCATCTCTTCTCAAAACCTGTGCC TCCCTTTCAAATCTCTACCATGGAAGAACAATCCATGCCTCCATTGTCACAATGGGTCTG CAATCTGATCCATACATAGCCACCTCTTTGATCAATATGTATGTGAAATGTGGGTTACTC GGGAGTGCACTCCAAGTGTTTGACAAAATGTCTGAGAGTAGAGACTCAGCTCCAGACATC ACTGTTTGGAACCCTGTGATTGATGGGTACTTTAAATATGGCCATTTTGAGGAGGGTCTT GCGCAGTTTTGTAGAATGCAGGAGTTGGGTATTAGGCCTGATGGGTACTCTCTTAGTATA GTCCTTGGCATTTGTAACAGACTTTCATGGTACATGGCAGGGAGGCAAATTCATGGTTAC ATTATCAGAAACATGTTTGAGGGTGACCCTTATTTGGAGACAGCACTGATTGGGATGTAC TCCAGTTGCAGTAGACCAATGGAGGCTTGGAGTCTGTTTGGTAAGCTGGAAAATAGAAGC AATATTGTAGCATGGAACGTGATGATTGGGGGGTTTGTTGAGAATGGGATGTGGGAAAAA AGCTTGGAATTGTATTCATTGGCTAAGAATGAGAACTGCAAACTTGTTTCAGCATCATTT ACTGGTGCATTCACTGCTTGCTCTCATGGTGAAGTTCTAGACTTTGGCAGGCAGGTTCAT TGTGATGTGATAAAAATGAATTTCCAGGATGACCCTTATGTCTGCACTTCCCTCTTAACC ATGTATGCCAAGTCTGGATCAGTTGAAGATGCCAAAAAGGTTTTTGATCAGGTACTGGAC AAAGAAGTTGAACTACGGAATGCAATGATTTCAGCTTTTATCGGTAATGGTCGCGCTTAT GATGCTTTGGGGCTCTACAACAAGATGAAAGCAGGTGAAACCCCAGTTGATTCATTCACT ATTTCAAGTCTTTTATCAGGTTGCAGTGTGGTTGGATCTTATGATTTTGGTAGGACAGTT CATGCAGAAGTAATAAAGAGATCGATGCAGAGTAATGTTGCTATACAGAGTGCATTGTTG ACAATGTACTACAAATGTGGAAGTACGGAAGATGCTGATTCAGTTTTTTATACAATGAAG GAAAGGGATGTTGTAGCATGGGGCTCCATGATTGCAGGTTTTTGCCAGAACAGAAGGTTC AAGGATGCTCTGGATTTGTTCAGAGCCATGGAGAAGGAAGGAGTGAAAGCAGACTCCGAT GTTATGACTAGTGTGATCAGTGCGGGTTTGGGACTGGAGAATGTAGAACTGGGTCACTTA ATCCATGGATTTGCTATTAAGCGTGGATTAGAATCGGATGTCTTTGTCGCTTGTTCCCTG GTTGATATGTACTCCAAATTTGGTTTTGCAGAGAGCGCTGAAATGGTATTCTCTAGTATG CCAAACAAGAATCTGGTGGCTTGGAATTCTATGATTTCATGCTATTCTTGGAATGGCCTT CCAGAGATGTCCATTAATCTTCTTCCTCAAATTCTACAGCATGGCTTCTACCTGGATTCC GTCTCCATTACCACTGTCCTCGTTGCGGTTTCATCAGTTGCAGCACTGCTTAAAGGGAAG ACTTTGCATGCATACCAGATAAGACTACAAATTCCATCCGACCTTCAAGTGGAGAATGCA TTAATCGATATGTATGTGAAGTGTGGATGTTTGAAATATGCTCAGTTGATCTTTGAAAAC ATGCCCAGAAGAAACCTAGTGACATGGAACTCAATGATAGCTGGTTATGGATCTCATGGG AACTGCGAAGAAGCAGTCAGATTATTTAAAGAGATGAAGAGATCGGAAACAGCTCCCGAT GAGGTAACTTTTCTTGCCCTGATCACATCTTGCAGCCATTCTGGTATGGTTGAAGAAGGC CTGAATCTATTTCAATTGATGAGAATCGAGTATGGGGTTGAGCCTAGAATGGAGCATTAT GCGAGTGTAGTTGATCTATTGGGCCGTGCTGGACGCTTGGACGACGCTTATAGCTTCATA CGGGGCATGCCAATTGACGCTGACAGGAGTGTTTGGCTATGTTTGTTGTTTGCCTGTCGA GCTCATCGGAACATGGAGCTTGGGGAGTTGGTTGCTGATAACCTACTGAAGATGGAGCCA GCCAGGGGCAGCAACTATGTGCCACTGCTGAACCTTTATGGAGAAGTTGAGATGTGGGAC AGGGCTGCAAACTTAAGGGCATCTATGAAGGGGAGGGGCTTGAAGAAGAGTCCCGGATGC AGTTGGATTGAAGTGAAAAACAGGGTTGATGTTTTCTTCTCAGGAGACTCATCTTCCACA AGGAGGATCGAAATCTACAAGACATTGAGTAGTCTTAAGAGTAACATGGAAGGGAAAGGA TGCTCCTATGAAGGGATTGAGGTGTGTTAA