Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_13s0067g03000.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:13_random:1608306:1667929:-1 gene:VIT_13s0067g03000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCTTCTTTGGTGGCACAGCTTGCTTTTCCCTCAGATTATAATCGTAGAGTGTGGGAG GATCCATCATTCATCAAGTGGAGAAAAAAAGATGCACATGTTTCATTGCATTGTCATGAT ACTGTTGAAGGATCTCTTAGATACTGGTATGAACGCAACAAAGTGGATTTTATAGCATCT AGTTCAGCAGTTTGGAATGATGACGCTGTTGTTGGAGCTCTTGATTGTGCTGCTTTCTGG GTCAAGGGCCTGCCTTTTGTTAAGTCTTTGTCTGGCTACTGGAAATTTTACTTGGCTCCT GGACCTACCAGTGTTCCTATGAATTTTTATGATAGTTCATTTGAGGATTCTACATGGGAA ACTTTACCAGTGCCTTCGAATTGGCAGATGCATGGATTTGATCGGCCTATTTATACAAAT ATCGTATATCCGTTTCCTCTTGATCCACCTCATGTTCCTACAGAAAATCCTACTGGCTGT TACAGGACAGTCTTCCACATTCCTCACGAATGGAAGGGTCGTAGGATATTGTTACACTTT GAAGCTGTTGATTCTGCCTTTTTTGCATGGATAAATGGAGTTCCTGTTGGATATAGTCAG GATAGTAGACTTCCTGCTGAATTTGAAATCACTGATTACTGTCATCCATGTGGTTCCAAC AAGAAGAATGTTCTTGCTGTTCAAGTATTTAGATGGAGTGATGGCTCTTACCTTGAAGAT CAAGATCAATGGTGGTTATCCGGTATTCATCGAGACGTGCTTCTTTTAGCCAAGCCACAG GTCTATATTGAAGACTATTTTTTCAAATCAAACTTGGGCGAAAATTTTTCATATGCAGAT ATACAGGTTGAAGTGAAAATTGATAACTCGCTGGAAACATCGAAAGACAGCATTCTTAAC AAATTTTCTATAGAGGCTGAACTGTTTGACAGTGCGAAGTGGCATGACTCCGATGAATAT TGTGATCTGCATTCATCTAGTGTGGCTCATATGGAACTTGACCCATCCTCCTCTACTGCA ATATTCGGGTTTCTTGGATATGTTCTAGTGGGAAAACTGGAAAGCCCCAAGCTTTGGTCT GCAGAGCAACCTTATCTTTACACTCTTGTCGTCATCCTCAAAGATGAATTTGGGAAGGTA GTTGACTGTGAATCATGCCAAGTAGGTATACGGCAAGTATCAAAAGCCCCAAAACAGCTA CTTGTTAATGGGCATCCAGTAATTTTAAGAGGAGTAAATAGGCACGAACATCATCCACGT CTGGGGAAGACAAACATGGAATCCTGCATGGTTAAGGATTTGGTTCTAATGAAGCAAAAC AATATCAATGCTGTGAGAAACAGCCATTATCCCCAACATCCTCGATGGTACGAGTTGTGT GATTTGTTTGGCATGTACATGATTGATGAAGCCAATATTGAGACCCATGGTTTTTATGAT TCTCAACATTTAAAGAACCCCACATTAGAATCAAGTTGGGCTTCTTCTATGATGGATCGA GTGATAAGCATGGTGGAGAGGGACAAAAATCATGCATGCATTATTTCTTGGTCCTTGGGA AATGAGTCTGGTTATGGACCTAATCATTCTGCTTTGGCTGGTTGGATTAGAGGAAGGGAC TCCTCTAGGCTATTACATTACGAAGGGGGTGGAGCTAGGACTCCATCAACAGATATTGTC TGCCCCATGTATATGCGTGTTTGGGACATTGTAAAGATTGCAAAAGATCCAACTGAAATG CGACCTTTGATTCTATGCGAGTACTCACATTCCATGGGAAACAGCAACGGAAATATTCAA GAATATTGGGAAGCTATTGATAACACATTTGGATTACAAGGAGGCTTTATCTGGGATTGG GTTGATCAGGGGCTGCTGAAGGTTGGTGCAGATGGTGCTAAGCATTGGGCATATGGAGGT GACTTTGGGGATATCCCTAATGATTTGAACTTCTGTCTGAATGGCATTACATGGCCAGAT CGAACTCTTCATCCTGCAGTACATGAAGTTAAGTATGTCTATCAACCAATCAAGATTTCT TTAAGTGAGAGCACACTTAAGATAACAAACACTCATTTTTATGAAACAACAAAAGCAATG GAGTTTAGCTGGACTGTCTGTGGGGATGGATGCAAACTTGGATCTGGAACCCTATCTCTC CCCATAATAGAACCCCAGAGCAGCTACTCTATCGAATTTGAGTCAGGACCATGGTATTCT CTATGGGCTTCGTCTTCTGCAGAAGAACATTTTTTAACAATAACTGCAAAGCTCTTGCAA CCCACACGCTGGGTTGAAGCTGGTCATGTCATTTCATCAACACAAATCCTGTTGCCTGCC AAAAGAGAATTTGTTCCTCATGTCATCAAAAATAAAGATGCTCCTGTCCCTGGTGAAATT CTTGGGAATACGATTAGATTCTACCAGCAGAATGTTTGGGAGATACAATTTAACGCTCAA ACTGGAACCATTGAAAGCTGGAAGGTTGGTGGAGTTACTGTGATGAATAAGGGCATATTC CCATGCTTCTGGCGGGCACCTACAGATAATGACAATGGGGGAGGTGCAAAAAGTTATGTC TCTAAGTGGAAAGCAGCCCATCTTGATAACCTATCCTTTATCACTGAAAGCTGTTCTGTT CAGAATATAACAGATCATCCTGTAAAACTGGCTGTGGTTTATCTTGGCATCCCAAAGGGT GAGGAGAATTCTTTATCCAGATCTGAGAATCCAAAGGTTTTACTCAAGGTTGACATAACT TACACAGTCTATGGTTCTGGTGACATCATTATGGAATGTAATGTCCACCCATGCTCTGAT CTCCCACCCTTGCCACGTGTGGGGGTTGAATTTCAGTTGGAAAAAACAATTGATCAGATT AAATGGTATGGCAAAGGACCATTTGAATGTTATCCAGATCGGAAAGCAGCTGCTCATGTG GGGGTCTATGAGCAGAATGTGGGTGATATGCATGTTCCCTATATTGTTCCTGTAGAGTGT TCTGGTAGAGCAGATGTTAGGTGGGTAACATTTCAAAACAAAGATGGTTTTGGAATTTAT GCATCCATGTATGGCAGCTCTCCACCAATGCAAATGAATGCAAGTTACTATAGCACAGCG GAGCTTGAACGGGCAACACATAAGGAAAAGCTTATCAAAGGAGATGATATTGAGGTGCAT CTGGACCACAAGCACATGGGTTTGGGTGGTGATGATAGCTGGTCTCCCTGTGTCCATGAG AAATACCTGATTCCAGCGGTGCCATACTCATTCTCTATCAGGCTGTCTCCAATAACTGCA GCCATAACTGGCTATGACATCTACAAATCCCAGCTTCAGAACTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_13s0067g03000.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:13_random:1608306:1667929:-1 gene:VIT_13s0067g03000 transcript:VIT_13s0067g03000.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MASLVAQLAFPSDYNRRVWEDPSFIKWRKKDAHVSLHCHDTVEGSLRYWYERNKVDFIAS SSAVWNDDAVVGALDCAAFWVKGLPFVKSLSGYWKFYLAPGPTSVPMNFYDSSFEDSTWE TLPVPSNWQMHGFDRPIYTNIVYPFPLDPPHVPTENPTGCYRTVFHIPHEWKGRRILLHF EAVDSAFFAWINGVPVGYSQDSRLPAEFEITDYCHPCGSNKKNVLAVQVFRWSDGSYLED QDQWWLSGIHRDVLLLAKPQVYIEDYFFKSNLGENFSYADIQVEVKIDNSLETSKDSILN KFSIEAELFDSAKWHDSDEYCDLHSSSVAHMELDPSSSTAIFGFLGYVLVGKLESPKLWS AEQPYLYTLVVILKDEFGKVVDCESCQVGIRQVSKAPKQLLVNGHPVILRGVNRHEHHPR LGKTNMESCMVKDLVLMKQNNINAVRNSHYPQHPRWYELCDLFGMYMIDEANIETHGFYD SQHLKNPTLESSWASSMMDRVISMVERDKNHACIISWSLGNESGYGPNHSALAGWIRGRD SSRLLHYEGGGARTPSTDIVCPMYMRVWDIVKIAKDPTEMRPLILCEYSHSMGNSNGNIQ EYWEAIDNTFGLQGGFIWDWVDQGLLKVGADGAKHWAYGGDFGDIPNDLNFCLNGITWPD RTLHPAVHEVKYVYQPIKISLSESTLKITNTHFYETTKAMEFSWTVCGDGCKLGSGTLSL PIIEPQSSYSIEFESGPWYSLWASSSAEEHFLTITAKLLQPTRWVEAGHVISSTQILLPA KREFVPHVIKNKDAPVPGEILGNTIRFYQQNVWEIQFNAQTGTIESWKVGGVTVMNKGIF PCFWRAPTDNDNGGGAKSYVSKWKAAHLDNLSFITESCSVQNITDHPVKLAVVYLGIPKG EENSLSRSENPKVLLKVDITYTVYGSGDIIMECNVHPCSDLPPLPRVGVEFQLEKTIDQI KWYGKGPFECYPDRKAAAHVGVYEQNVGDMHVPYIVPVECSGRADVRWVTFQNKDGFGIY ASMYGSSPPMQMNASYYSTAELERATHKEKLIKGDDIEVHLDHKHMGLGGDDSWSPCVHE KYLIPAVPYSFSIRLSPITAAITGYDIYKSQLQN

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_13s0067g03000.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:13_random:1608306:1667929:-1 gene:VIT_13s0067g03000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCTTCTTTGGTGGCACAGCTTGCTTTTCCCTCAGATTATAATCGTAGAGTGTGGGAG GATCCATCATTCATCAAGTGGAGAAAAAAAGATGCACATGTTTCATTGCATTGTCATGAT ACTGTTGAAGGATCTCTTAGATACTGGTATGAACGCAACAAAGTGGATTTTATAGCATCT AGTTCAGCAGTTTGGAATGATGACGCTGTTGTTGGAGCTCTTGATTGTGCTGCTTTCTGG GTCAAGGGCCTGCCTTTTGTTAAGTCTTTGTCTGGCTACTGGAAATTTTACTTGGCTCCT GGACCTACCAGTGTTCCTATGAATTTTTATGATAGTTCATTTGAGGATTCTACATGGGAA ACTTTACCAGTGCCTTCGAATTGGCAGATGCATGGATTTGATCGGCCTATTTATACAAAT ATCGTATATCCGTTTCCTCTTGATCCACCTCATGTTCCTACAGAAAATCCTACTGGCTGT TACAGGACAGTCTTCCACATTCCTCACGAATGGAAGGGTCGTAGGATATTGTTACACTTT GAAGCTGTTGATTCTGCCTTTTTTGCATGGATAAATGGAGTTCCTGTTGGATATAGTCAG GATAGTAGACTTCCTGCTGAATTTGAAATCACTGATTACTGTCATCCATGTGGTTCCAAC AAGAAGAATGTTCTTGCTGTTCAAGTATTTAGATGGAGTGATGGCTCTTACCTTGAAGAT CAAGATCAATGGTGGTTATCCGGTATTCATCGAGACGTGCTTCTTTTAGCCAAGCCACAG GTCTATATTGAAGACTATTTTTTCAAATCAAACTTGGGCGAAAATTTTTCATATGCAGAT ATACAGGTTGAAGTGAAAATTGATAACTCGCTGGAAACATCGAAAGACAGCATTCTTAAC AAATTTTCTATAGAGGCTGAACTGTTTGACAGTGCGAAGTGGCATGACTCCGATGAATAT TGTGATCTGCATTCATCTAGTGTGGCTCATATGGAACTTGACCCATCCTCCTCTACTGCA ATATTCGGGTTTCTTGGATATGTTCTAGTGGGAAAACTGGAAAGCCCCAAGCTTTGGTCT GCAGAGCAACCTTATCTTTACACTCTTGTCGTCATCCTCAAAGATGAATTTGGGAAGGTA GTTGACTGTGAATCATGCCAAGTAGGTATACGGCAAGTATCAAAAGCCCCAAAACAGCTA CTTGTTAATGGGCATCCAGTAATTTTAAGAGGAGTAAATAGGCACGAACATCATCCACGT CTGGGGAAGACAAACATGGAATCCTGCATGGTTAAGGATTTGGTTCTAATGAAGCAAAAC AATATCAATGCTGTGAGAAACAGCCATTATCCCCAACATCCTCGATGGTACGAGTTGTGT GATTTGTTTGGCATGTACATGATTGATGAAGCCAATATTGAGACCCATGGTTTTTATGAT TCTCAACATTTAAAGAACCCCACATTAGAATCAAGTTGGGCTTCTTCTATGATGGATCGA GTGATAAGCATGGTGGAGAGGGACAAAAATCATGCATGCATTATTTCTTGGTCCTTGGGA AATGAGTCTGGTTATGGACCTAATCATTCTGCTTTGGCTGGTTGGATTAGAGGAAGGGAC TCCTCTAGGCTATTACATTACGAAGGGGGTGGAGCTAGGACTCCATCAACAGATATTGTC TGCCCCATGTATATGCGTGTTTGGGACATTGTAAAGATTGCAAAAGATCCAACTGAAATG CGACCTTTGATTCTATGCGAGTACTCACATTCCATGGGAAACAGCAACGGAAATATTCAA GAATATTGGGAAGCTATTGATAACACATTTGGATTACAAGGAGGCTTTATCTGGGATTGG GTTGATCAGGGGCTGCTGAAGGTTGGTGCAGATGGTGCTAAGCATTGGGCATATGGAGGT GACTTTGGGGATATCCCTAATGATTTGAACTTCTGTCTGAATGGCATTACATGGCCAGAT CGAACTCTTCATCCTGCAGTACATGAAGTTAAGTATGTCTATCAACCAATCAAGATTTCT TTAAGTGAGAGCACACTTAAGATAACAAACACTCATTTTTATGAAACAACAAAAGCAATG GAGTTTAGCTGGACTGTCTGTGGGGATGGATGCAAACTTGGATCTGGAACCCTATCTCTC CCCATAATAGAACCCCAGAGCAGCTACTCTATCGAATTTGAGTCAGGACCATGGTATTCT CTATGGGCTTCGTCTTCTGCAGAAGAACATTTTTTAACAATAACTGCAAAGCTCTTGCAA CCCACACGCTGGGTTGAAGCTGGTCATGTCATTTCATCAACACAAATCCTGTTGCCTGCC AAAAGAGAATTTGTTCCTCATGTCATCAAAAATAAAGATGCTCCTGTCCCTGGTGAAATT CTTGGGAATACGATTAGATTCTACCAGCAGAATGTTTGGGAGATACAATTTAACGCTCAA ACTGGAACCATTGAAAGCTGGAAGGTTGGTGGAGTTACTGTGATGAATAAGGGCATATTC CCATGCTTCTGGCGGGCACCTACAGATAATGACAATGGGGGAGGTGCAAAAAGTTATGTC TCTAAGTGGAAAGCAGCCCATCTTGATAACCTATCCTTTATCACTGAAAGCTGTTCTGTT CAGAATATAACAGATCATCCTGTAAAACTGGCTGTGGTTTATCTTGGCATCCCAAAGGGT GAGGAGAATTCTTTATCCAGATCTGAGAATCCAAAGGTTTTACTCAAGGTTGACATAACT TACACAGTCTATGGTTCTGGTGACATCATTATGGAATGTAATGTCCACCCATGCTCTGAT CTCCCACCCTTGCCACGTGTGGGGGTTGAATTTCAGTTGGAAAAAACAATTGATCAGATT AAATGGTATGGCAAAGGACCATTTGAATGTTATCCAGATCGGAAAGCAGCTGCTCATGTG GGGGTCTATGAGCAGAATGTGGGTGATATGCATGTTCCCTATATTGTTCCTGTAGAGTGT TCTGGTAGAGCAGATGTTAGGTGGGTAACATTTCAAAACAAAGATGGTTTTGGAATTTAT GCATCCATGTATGGCAGCTCTCCACCAATGCAAATGAATGCAAGTTACTATAGCACAGCG GAGCTTGAACGGGCAACACATAAGGAAAAGCTTATCAAAGGAGATGATATTGAGGTGCAT CTGGACCACAAGCACATGGGTTTGGGTGGTGATGATAGCTGGTCTCCCTGTGTCCATGAG AAATACCTGATTCCAGCGGTGCCATACTCATTCTCTATCAGGCTGTCTCCAATAACTGCA GCCATAACTGGCTATGACATCTACAAATCCCAGCTTCAGAACTAATACCATCCACTTAGG TTCCTTTTCTTTCTCTCCTTCTCTACTGGGTTACTTTCTTTGATGATGGTAAAAAAAGAA TGACAAGAATTTAATTATTTGATGTTATTATGAACCATGCATTTTAATTATCAACCTAGA TTTTTATGACATTGTTTATGTTAAGTTTTTCCTTTCAA