Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_13s0067g02260.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:13:1263235:1266792:1 gene:VIT_13s0067g02260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGAGTTTCTTCATGAAACTCAGTGCTTCTCAACTGCCCCTGTTTGAATTGCCAACTGCT
GTTTCCAACAATAGAACTGGAAGTTTGGCTGTAAGTGTACCATCTCAAACAGCCAAAAAA
TCTAAGATTGTTGTTGGAAGAAACCGTCCAGAGTCAATTGGCATTAGTGAAACTTACCAG
CAAACTCAAGTCCAAGATTTGATTGATGTTTTACGCGATTGTGCAGAGAAAGGATCTATA
AGAGAAGCAAAAGCGGTTCATGGGCTTGTGTTAAAATCCAATTTTGAAGATAAGGATTTA
ATGGTGTTGTTTAACCATGCAGCTCATGTGTATTCAAAATGTTCAGAATTTAGGGCAGCT
TGTGGTGTGTTTGATGAAATGCCACAGAGAAATGTATTCTCTTGGACCGTCATGATTGTA
GGATCAACGGAGCATGGGTTGTTTTTTGATGGGTTCAAGTTTTTCTGCGAGATGTTGAAT
AGTGGGATCTTGCCAGATAAATTTGCATATTCTGCAATCATCCAGTCATGTATTGGTCTA
GACTCTCTTGAATTGGGTAAAATGGTACATGCCCAGATAGTTATGAGAGGCTTTGCAACT
CATATTTTTGTTAGTACATCTCTTCTTAACATGTATGCAAAGTTAGGGAGTATAGAGGAT
TCATATTGGGTGTTCAACATGATGACAGAACATAATCAAGTCTCTTGGAATGCCATGATA
TCAGGATGTACGTCAAATGGTCTTCACTTAGAAGCATTTGATCTTTTTGTTAGAATGAAG
AATGGAGCATGTACACCAAATATGTACACACTTGTTAGTGTTTCGAAGGCAGTTGGGAAG
TTAGTTGATGTTAATATGGGAAAAGAAGTTCAAAATTGTGCCTCTGAATTAGGTATAGAG
GGTAATGTTCTAGTGGGAACTGCACTGATTGATATGTACTCAAAATGTGGGTCCTTACAT
GATGCAAGAAGTGTTTTTGACACAAATTTCATTAATTGTGGAGTGAATACACCATGGAAT
GCAATGATCTCTGGCTACTCACAGTCTGGGTGTAGCCAAGAAGCTTTGGAACTCTATGTT
CAAATGTGTCAAAATGGCATAACGTCAGACCTTTACACTTATTGTAGTGTCTTCAATGCA
ATAGCTGCTTCAAAAAGTTTGCAGTTTGGGAGGGTAGTTCATGGGATGGTTTTGAAGTGT
GGACTTGATTTGATGGTTGTTAGCGTTAACAATGCCATTGCTGATGCATATTCCAAATGT
GGGTTTCTTGAAGATGTAAGGAAGGTTTTCGACAGGATGGAAGAAAGAGATATAGTCTCG
TGGACAACCCTGGTGACTGCTTACTCTCAGTCTTCTTTAGGGGAGGAAGCACTGGCCACT
TTCTGTCTGATGAGAGAAGAAGGGTTTGCACCCAATCAGTTTACCTTTTCCAGTGTGCTG
ATTTCATGTGCTAGCCTTTGTTTTCTTGAGTATGGGAGGCAAGTTCATGGTCTTCTCTGC
AAGGCTGGCCTGGACACCGAAAAATGCATAGAAAGTGCTCTGATTGACATGTATGCCAAA
TGTGGTAGTATAACTGAGGCAGGAAAGGTTTTCGACAAGATTTCTAACCCTGATATTGTT
TCATGGACTGCCATAATATCAGGTTACGCTCAACATGGTTTGGTGGAAGATGCCCTTCAA
CTCTTTAGGAGGATGGAGCTGTCAGGCATCAAGGCCAATGCTGTTACCTTATTGTGTGTA
CTGTTCGCTTGTAGTCATGGGGGTATGGTAGAGGAAGGCCTTTTCTATTTTCAACAAATG
GAAGATGGTTATGGTGTGGTTCCAGAGATGGAACATTATGCTTGTATTATTGATCTCTTA
GGTCGTGTGGGCCGCCTTGATGATGCTATGGAGTTCATAAGAAAAATGCCAATGGAGCCA
AATGAAATGGTCTGGCAAACCCTGTTGGGAGGTTGTAGGGTCCATGGCAATGTTGAGTTG
GGAGAGATAGCTGCCAGGAAGATCCTTTCCATTCGGCCAGAGTACTCAGCTACGTACGTT
CTTTTATCCAACACATACATTGAGACAGGGAGTTATGAAGATGGCCTTAGTTTGAGAAAT
GTAATGAAAGACCAAGGAGTGAAAAAGGAACCAGGATACAGCTGGATTTCTGTGAAAGGT
AGAGTCCACAAATTCTACTCTGGAGATCAGCAACATCCACAAAAAAAGGAGATATATGTC
AAGTTAGAAGAGTTGAGAGAGAAGATTAAAGCTATGGGTTATGTACCTGACTTGAGATAT
GTATTGAATAATGCAGATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_13s0067g02260.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:13:1263235:1266792:1 gene:VIT_13s0067g02260 transcript:VIT_13s0067g02260.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MSFFMKLSASQLPLFELPTAVSNNRTGSLAVSVPSQTAKKSKIVVGRNRPESIGISETYQ
QTQVQDLIDVLRDCAEKGSIREAKAVHGLVLKSNFEDKDLMVLFNHAAHVYSKCSEFRAA
CGVFDEMPQRNVFSWTVMIVGSTEHGLFFDGFKFFCEMLNSGILPDKFAYSAIIQSCIGL
DSLELGKMVHAQIVMRGFATHIFVSTSLLNMYAKLGSIEDSYWVFNMMTEHNQVSWNAMI
SGCTSNGLHLEAFDLFVRMKNGACTPNMYTLVSVSKAVGKLVDVNMGKEVQNCASELGIE
GNVLVGTALIDMYSKCGSLHDARSVFDTNFINCGVNTPWNAMISGYSQSGCSQEALELYV
QMCQNGITSDLYTYCSVFNAIAASKSLQFGRVVHGMVLKCGLDLMVVSVNNAIADAYSKC
GFLEDVRKVFDRMEERDIVSWTTLVTAYSQSSLGEEALATFCLMREEGFAPNQFTFSSVL
ISCASLCFLEYGRQVHGLLCKAGLDTEKCIESALIDMYAKCGSITEAGKVFDKISNPDIV
SWTAIISGYAQHGLVEDALQLFRRMELSGIKANAVTLLCVLFACSHGGMVEEGLFYFQQM
EDGYGVVPEMEHYACIIDLLGRVGRLDDAMEFIRKMPMEPNEMVWQTLLGGCRVHGNVEL
GEIAARKILSIRPEYSATYVLLSNTYIETGSYEDGLSLRNVMKDQGVKKEPGYSWISVKG
RVHKFYSGDQQHPQKKEIYVKLEELREKIKAMGYVPDLRYVLNNAD

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_13s0067g02260.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:13:1263235:1266792:1 gene:VIT_13s0067g02260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

TTGGGAGTGGGTTACTAGCTATGCAGATTTTTGTTGTTTCTTCCTCTGGTTTGGTTCAAA
AAGAATTCTGGGTTTGGTTCAGAAACTGAAGCTGTAGTTGCATTGAGAATTGGACACAAA
AATGAGTTTCTTCATGAAACTCAGTGCTTCTCAACTGCCCCTGTTTGAATTGCCAACTGC
TGTTTCCAACAATAGAACTGGAAGTTTGGCTGTAAGTGTACCATCTCAAACAGCCAAAAA
ATCTAAGATTGTTGTTGGAAGAAACCGTCCAGAGTCAATTGGCATTAGTGAAACTTACCA
GCAAACTCAAGTCCAAGATTTGATTGATGTTTTACGCGATTGTGCAGAGAAAGGATCTAT
AAGAGAAGCAAAAGCGGTTCATGGGCTTGTGTTAAAATCCAATTTTGAAGATAAGGATTT
AATGGTGTTGTTTAACCATGCAGCTCATGTGTATTCAAAATGTTCAGAATTTAGGGCAGC
TTGTGGTGTGTTTGATGAAATGCCACAGAGAAATGTATTCTCTTGGACCGTCATGATTGT
AGGATCAACGGAGCATGGGTTGTTTTTTGATGGGTTCAAGTTTTTCTGCGAGATGTTGAA
TAGTGGGATCTTGCCAGATAAATTTGCATATTCTGCAATCATCCAGTCATGTATTGGTCT
AGACTCTCTTGAATTGGGTAAAATGGTACATGCCCAGATAGTTATGAGAGGCTTTGCAAC
TCATATTTTTGTTAGTACATCTCTTCTTAACATGTATGCAAAGTTAGGGAGTATAGAGGA
TTCATATTGGGTGTTCAACATGATGACAGAACATAATCAAGTCTCTTGGAATGCCATGAT
ATCAGGATGTACGTCAAATGGTCTTCACTTAGAAGCATTTGATCTTTTTGTTAGAATGAA
GAATGGAGCATGTACACCAAATATGTACACACTTGTTAGTGTTTCGAAGGCAGTTGGGAA
GTTAGTTGATGTTAATATGGGAAAAGAAGTTCAAAATTGTGCCTCTGAATTAGGTATAGA
GGGTAATGTTCTAGTGGGAACTGCACTGATTGATATGTACTCAAAATGTGGGTCCTTACA
TGATGCAAGAAGTGTTTTTGACACAAATTTCATTAATTGTGGAGTGAATACACCATGGAA
TGCAATGATCTCTGGCTACTCACAGTCTGGGTGTAGCCAAGAAGCTTTGGAACTCTATGT
TCAAATGTGTCAAAATGGCATAACGTCAGACCTTTACACTTATTGTAGTGTCTTCAATGC
AATAGCTGCTTCAAAAAGTTTGCAGTTTGGGAGGGTAGTTCATGGGATGGTTTTGAAGTG
TGGACTTGATTTGATGGTTGTTAGCGTTAACAATGCCATTGCTGATGCATATTCCAAATG
TGGGTTTCTTGAAGATGTAAGGAAGGTTTTCGACAGGATGGAAGAAAGAGATATAGTCTC
GTGGACAACCCTGGTGACTGCTTACTCTCAGTCTTCTTTAGGGGAGGAAGCACTGGCCAC
TTTCTGTCTGATGAGAGAAGAAGGGTTTGCACCCAATCAGTTTACCTTTTCCAGTGTGCT
GATTTCATGTGCTAGCCTTTGTTTTCTTGAGTATGGGAGGCAAGTTCATGGTCTTCTCTG
CAAGGCTGGCCTGGACACCGAAAAATGCATAGAAAGTGCTCTGATTGACATGTATGCCAA
ATGTGGTAGTATAACTGAGGCAGGAAAGGTTTTCGACAAGATTTCTAACCCTGATATTGT
TTCATGGACTGCCATAATATCAGGTTACGCTCAACATGGTTTGGTGGAAGATGCCCTTCA
ACTCTTTAGGAGGATGGAGCTGTCAGGCATCAAGGCCAATGCTGTTACCTTATTGTGTGT
ACTGTTCGCTTGTAGTCATGGGGGTATGGTAGAGGAAGGCCTTTTCTATTTTCAACAAAT
GGAAGATGGTTATGGTGTGGTTCCAGAGATGGAACATTATGCTTGTATTATTGATCTCTT
AGGTCGTGTGGGCCGCCTTGATGATGCTATGGAGTTCATAAGAAAAATGCCAATGGAGCC
AAATGAAATGGTCTGGCAAACCCTGTTGGGAGGTTGTAGGGTCCATGGCAATGTTGAGTT
GGGAGAGATAGCTGCCAGGAAGATCCTTTCCATTCGGCCAGAGTACTCAGCTACGTACGT
TCTTTTATCCAACACATACATTGAGACAGGGAGTTATGAAGATGGCCTTAGTTTGAGAAA
TGTAATGAAAGACCAAGGAGTGAAAAAGGAACCAGGATACAGCTGGATTTCTGTGAAAGG
TAGAGTCCACAAATTCTACTCTGGAGATCAGCAACATCCACAAAAAAAGGAGATATATGT
CAAGTTAGAAGAGTTGAGAGAGAAGATTAAAGCTATGGGTTATGTACCTGACTTGAGATA
TGTATTGAATAATGCAGATTGAGAGAGAATTTGGGGCCACCTCTTGGTGAAAGCACTTGG
CAGCATATAAACTATATTTATATGACTACACGGTGTTATCCAACAAAAGCAAAAAAATTG
GCAATTCAAAGTAACATCTATCATCTCTAAGAATAGAACTTCCGTGTTCGAAGGTGCAGA
ATAAAGCTTAGAATTGTCCCAATGGAGGAAATGGATCCCCAGATGATGAAGGTTTTATGA
TGGCATTCAAATCCCTTGCATATCCCATAATTCCCACCACCACCAGTTTCATAATTGATA
ACATCCAAGTAACCAAAAAGCAGAGTACCTATGGGAATGTTTGTAAGGACAATGTTTTGG
TTTACAACTGAATTCTGGGGCCCGAACAGCTCGGAAATTGTGGATGCAGTTGTGGCTCGT
ATGGCTCCTGAACAGGCTCCTAGGATGCCTGTGCTAATGTATAAGCCTGTTTTGCTGCCG
TTGATAAGCAAGAAGAAAGATACAGGCATGGGAATCATCATGAGCACTATTGATGCTGGT
TTGGATAATATTGACCTTCTCCTGAAACAGAGTCAATCTGTTAATGTTTTGAACAATTTA
ATCAATTGAGTTGCAGAATAGTTGGAAGTGAGCTCAATTGGATGACTATGGAGACTTGAT
CTGTTGAATACTATTTCACAGCAAATTGCTTAAATTGGGATGGTTCGGATTATCTATTGG
ATTATTTC