Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_12s0142g00040.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:12:22150:24190:1 gene:VIT_12s0142g00040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGTGTTTCCAATGGTTTTTCTCAAGATTATGGACTGGGTTGTGTACCAACTATTGGCC
AACTCATGTTATAGAGCTGCAAGGAAGATGAGGAACTATGGTTTCTTTCTGAGGAACCCT
TCTCTTAGAACATCACAACAATATCCCTCGTTCCCTAGTGTGACCAAATGTTGTTTGGAG
GGCAGAGGGTCTCATACTTTGGTCTGTGACATTGATGGAGCTTTGTTAAGATCCCAGTCT
TTCTTTCCTTATTTCATGTTGGTTGCTTTTGAAGGTGGTAGCATTTTCAGAGCATTTCTC
TTGCTGCTATCTTGGCCCTTTTTGTGGGTGCTTGACTCTGAGCTCAGATTCAGGGTAATG
ATTTTCATTTCCTTTTGTGGGCTTAGGTTGAAGGACATGGAGAGTGTTGGTAGGTCTGTT
TTGCCTAAGTTTTATCTTGAGAACCTCAACCTTCAGGTCTATGAGTTATGGGCTTCAACT
GGCTCTAGGGTTGTCTTCACAAGTGTCCCTAGAGTGATGGTTGAAGGCTTTCTCAAGGAA
TATTTGAGTGTTAACCATGTTATAGGAACTGAGTTGCAGACTGTTGGGCAATATTTTACT
GGTTTGCTGTCTGGTTCTGGTTTGCTTGTAAAGTGCAGTGCTCTCAAGGAATTCTTTGGA
GAGAAAAAGCCTGATATTGGCCTTGGAAGTTCAAGCCTCCATGACCACCATTTCATCTCC
TTGTGCAAGGAAAGTTATGTGGTGACCAATGAGGACAGTAAGAGCAGCGCAAGTTCAGTG
ATGACAAGGGACAAATACCCAAAGCCTCTGGTGTTTCATGATGGAAGGTTAGCTTTCTTG
CCCACCCCTTGGGCAACTCTTTCCATGTTCTTGTGGCTTCCTCTAGGCATAGTCCTAGCC
ATCTATAGGGTTTGTATTGGCATCTTCCTTCCCTACAAGATGGCCAATTTGTTGGGTGTT
TGGAGTGGTATTGACATAAGGCTCAAAGGGAATGACATTAACCCTTCAAAGTATAATAAT
AGAAAAGGGGTTCTCTATGTTTGCTCACATAGGACACTCTTGGATCCTGTTTTTCTGTGT
ACAACCCTGGGGAAGCCCTTGACTGCAGTCACATACAGCCTAAGCAAGACGTCTGAGATT
ATAGCTCCAATAAGAACAGTTAGGTTGACAAGGGACAGAAAAAAAGATGGAGAAACCATG
CAGAGGTTGCTGAGTGAGGGTGACTTGGTGGTTTGCCCTGAAGGAACCACATGCAGAGAG
CCTTATCTCTTGAGGTTTAGCTCTTTGTTTGCCGAGTTAGCTGATGAGATTGTTCCTGTT
GCCATGTACACACATGTGACCATGTTCTATGGCACAACTGCAAGTGGTTTGAAATGCCTA
GACCCCATCTTCTTCCTCATGAACCCTAGGCCAAGCTACCATGTTCACGTCCTTGGGAAA
TTGCCCAAGGAACTCACATGCGCTGGAGGGAGACCTAGCTGTGAAGTGGCGAACTACATT
CAAAGACAACTGGCTGATGCTTTGGGCTTTGAGTGCACCACTCTTACAAGAAGGGACAAA
TACATGATGCTTGCTGGGAATGAAGGGGTGGTCCAGAACAAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_12s0142g00040.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:12:22150:24190:1 gene:VIT_12s0142g00040 transcript:VIT_12s0142g00040.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MVFPMVFLKIMDWVVYQLLANSCYRAARKMRNYGFFLRNPSLRTSQQYPSFPSVTKCCLE
GRGSHTLVCDIDGALLRSQSFFPYFMLVAFEGGSIFRAFLLLLSWPFLWVLDSELRFRVM
IFISFCGLRLKDMESVGRSVLPKFYLENLNLQVYELWASTGSRVVFTSVPRVMVEGFLKE
YLSVNHVIGTELQTVGQYFTGLLSGSGLLVKCSALKEFFGEKKPDIGLGSSSLHDHHFIS
LCKESYVVTNEDSKSSASSVMTRDKYPKPLVFHDGRLAFLPTPWATLSMFLWLPLGIVLA
IYRVCIGIFLPYKMANLLGVWSGIDIRLKGNDINPSKYNNRKGVLYVCSHRTLLDPVFLC
TTLGKPLTAVTYSLSKTSEIIAPIRTVRLTRDRKKDGETMQRLLSEGDLVVCPEGTTCRE
PYLLRFSSLFAELADEIVPVAMYTHVTMFYGTTASGLKCLDPIFFLMNPRPSYHVHVLGK
LPKELTCAGGRPSCEVANYIQRQLADALGFECTTLTRRDKYMMLAGNEGVVQNK

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_12s0142g00040.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:12:22150:24190:1 gene:VIT_12s0142g00040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

CATGGTGTTTCCAATGGTTTTTCTCAAGATTATGGACTGGGTTGTGTACCAACTATTGGC
CAACTCATGTTATAGAGCTGCAAGGAAGATGAGGAACTATGGTTTCTTTCTGAGGAACCC
TTCTCTTAGAACATCACAACAATATCCCTCGTTCCCTAGTGTGACCAAATGTTGTTTGGA
GGGCAGAGGGTCTCATACTTTGGTCTGTGACATTGATGGAGCTTTGTTAAGATCCCAGTC
TTTCTTTCCTTATTTCATGTTGGTTGCTTTTGAAGGTGGTAGCATTTTCAGAGCATTTCT
CTTGCTGCTATCTTGGCCCTTTTTGTGGGTGCTTGACTCTGAGCTCAGATTCAGGGTAAT
GATTTTCATTTCCTTTTGTGGGCTTAGGTTGAAGGACATGGAGAGTGTTGGTAGGTCTGT
TTTGCCTAAGTTTTATCTTGAGAACCTCAACCTTCAGGTCTATGAGTTATGGGCTTCAAC
TGGCTCTAGGGTTGTCTTCACAAGTGTCCCTAGAGTGATGGTTGAAGGCTTTCTCAAGGA
ATATTTGAGTGTTAACCATGTTATAGGAACTGAGTTGCAGACTGTTGGGCAATATTTTAC
TGGTTTGCTGTCTGGTTCTGGTTTGCTTGTAAAGTGCAGTGCTCTCAAGGAATTCTTTGG
AGAGAAAAAGCCTGATATTGGCCTTGGAAGTTCAAGCCTCCATGACCACCATTTCATCTC
CTTGTGCAAGGAAAGTTATGTGGTGACCAATGAGGACAGTAAGAGCAGCGCAAGTTCAGT
GATGACAAGGGACAAATACCCAAAGCCTCTGGTGTTTCATGATGGAAGGTTAGCTTTCTT
GCCCACCCCTTGGGCAACTCTTTCCATGTTCTTGTGGCTTCCTCTAGGCATAGTCCTAGC
CATCTATAGGGTTTGTATTGGCATCTTCCTTCCCTACAAGATGGCCAATTTGTTGGGTGT
TTGGAGTGGTATTGACATAAGGCTCAAAGGGAATGACATTAACCCTTCAAAGTATAATAA
TAGAAAAGGGGTTCTCTATGTTTGCTCACATAGGACACTCTTGGATCCTGTTTTTCTGTG
TACAACCCTGGGGAAGCCCTTGACTGCAGTCACATACAGCCTAAGCAAGACGTCTGAGAT
TATAGCTCCAATAAGAACAGTTAGGTTGACAAGGGACAGAAAAAAAGATGGAGAAACCAT
GCAGAGGTTGCTGAGTGAGGGTGACTTGGTGGTTTGCCCTGAAGGAACCACATGCAGAGA
GCCTTATCTCTTGAGGTTTAGCTCTTTGTTTGCCGAGTTAGCTGATGAGATTGTTCCTGT
TGCCATGTACACACATGTGACCATGTTCTATGGCACAACTGCAAGTGGTTTGAAATGCCT
AGACCCCATCTTCTTCCTCATGAACCCTAGGCCAAGCTACCATGTTCACGTCCTTGGGAA
ATTGCCCAAGGAACTCACATGCGCTGGAGGGAGACCTAGCTGTGAAGTGGCGAACTACAT
TCAAAGACAACTGGCTGATGCTTTGGGCTTTGAGTGCACCACTCTTACAAGAAGGGACAA
ATACATGATGCTTGCTGGGAATGAAGGGGTGGTCCAGAACAAGTGAAAGGAA