Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_12s0059g01940.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:12:6803521:6806512:1 gene:VIT_12s0059g01940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCTAAAAATGGTGTTTTACCAACAAACAACACCTATGGAATGCTGGTTGATGTGTAT GGCAAAGCAGGTCTTGTGAAAGAAGCACTCTTGTGGATTAAGCACATGAAATTAAGGGGA GTTTTTCCAGATGAGGTTGCAATGAATACTGTTGTTCGGGTTTTAAAGGATGCAGGAGAG TTTGATTGGGCGGATAGGTTTTATAGGGATTGGTGTGTTGGGAAGGTTGAATTGGGTGAT TTTGATTTGGAATCTGTAGCTGATTCAGATGATGAGATAGGTTCTGCACCTGTCAGTCTT AAACATTTTTTGTCAACTGAGCTTTTCAAGATTGGTGGGAGAAGGCCTATTTCGAATATT ATGGATTCATCGAACACAGATGGTTCCAGACGTAAGCCACGACTTACGGCTACTTATAAT ACTTTAATTGATTTGTATGGTAAGGCGGGTCGCCTGAAGGATGCAGCTGATGTGTTTGCA GAAATGTTAAAATTGGGTGTTGCAATGGATACTATTACTTTCAACACTATGATCTATACT TGTGGAAGCCATGGGCATTTATCAGAGGCAGAGACTTTGCTTACCGAGATGGAAGAAAGG GGAATATCTCCTGACACAAAAACTTACAACATATTTCTTTCTTTGTATGCTGATGGGGGA AACATTGATGCAGCCCTCAAGTGTTACAGGAAGATCAGAGAGGTGGGACTTTTCCCTGAT GTTGTAACTCACAGAGCTGTTCTTCATGTATTATGCGAGAGGAATATGGTTGGAGAGGTG GAGACTGTGATTGCAGAAATGAAAAGATCTCGTGTGCGGGTTGATGAGCATTCTATCCCT GTTGTTATTAAGATGTATGTAAATGAAGGATTGCTTGATAAGGCAAAAATCTTTTTGGAA GAACATCTTTTGGAGGATGAGTTATCATCAAGAACACGTGTAGCAATTATAGATGCTTAT GCTGAAAAGGGTCTTTGGGCGGAGGCTGAGAATGTGTTCATTGGAAAGAGGGATTTAGGA CAGAAGAAGGATGTTGTGGAATATAATGTCATGGTCAAAGCTTATGGCAAAGCAAAACTT TACGATAAAGCCTTTTCACTCTTCAAGGGCATGCGAAATCATGGGACCTGGCCCAATGAA AGCACTTATAATTCTCTCATACAAATGTTTTCTGGAGGTGATTTGGTGGACGAAGCAAGA GGTATCTTAGCTGAAATGCAAAAAATGGGATTCAAACCGCAGTGTCTAACCTTCTCTGCT GTTATTGCATGCTATGCCCGACTGGGACGGCTTCCTGATGCAGTTGGTGTCTATGAAGAA ATGGTAAGGTTGGGAGTCAAACCAAATGAAGTTGTTTATGGATCTTTAATAAATGGATTT TCAGAAACTGGAAACGTTGAAGAAGCTCTTTGTTATTTCCGCAAAATGGATGAATTTGGC ATTTCAGCAAATCAGATAGTGTTGACTTCCCTGATTAAGGCTTATAGTAAGGTGGGGTGC CTGGAAGGAGCAAAAACACTCTATGAGGGAATGAAGGATTTGGAGGGTGGTCCAGATATT GTGGCATCAAATAGTATGATAAATCTCTATGCTGATCTTGGGTTAGTATCTGAAGCCAAG TTGATTTTTGATGATTTGAGACAAAAGGGTAGCGCAGATGGGGTTTCATTTGCAACAATG ATGTATCTGTACAAGAACTTGGGTATGCTTGATGAAGCCATTGATGTTGCTGACGAGATG AAACAGTCGGGGTTGCTGAGGGACTGTGCTTCGTTCAATAAGGTAATGGCATGTTATGCA ACAAATGGACAGTTGAGTGCTTGTGGTGAATTATTGCATGAGATGATATCAAGGAGGATT CTACCTGATACTGGGACATTTAAAGTAATGTTTACGGTGTTGAAAAAGGGGGGCCTTCCA ACTGAAGCAGTAACACAGCTCGAATCATCTTACCAAGAAGGGAAACCTTATGCTAGACAA GCTGTAATAACCTCTGTCTTCTCTACAGTGGGTTTGCATGCTTTTGCACTTGAATCCTGT GAAACCTTCTTAAACGCTGAAGTAGATCTTGATTCTTCTTTCTATAATGTTGCAATATAT GCTTATGGAGCATCTGGATCAATCGACAAGGCTTTGAAAATGTTCATGAAAATGCAGGAT GAGGGCCTGGAACCAGATCTTGTTACTTATATTAATCTTGCTGGTTGTTATGGAAAAGCT GGTATGCTTGAAGGTTTGAAGCGGATTTACAGCCAACTAAAATATCGAGAGATTGAGCCC AATGAGTCCTTGTTCAAGGCTATTATAGATGCCTATAGAAGTGCCAAGAGGCATGACCTT GCTGAATTGGTTAGCCAGGAGATGAAATTTGCCTTTGACACAACAATGCTTCCACTCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_12s0059g01940.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:12:6803521:6806512:1 gene:VIT_12s0059g01940 transcript:VIT_12s0059g01940.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MAKNGVLPTNNTYGMLVDVYGKAGLVKEALLWIKHMKLRGVFPDEVAMNTVVRVLKDAGE FDWADRFYRDWCVGKVELGDFDLESVADSDDEIGSAPVSLKHFLSTELFKIGGRRPISNI MDSSNTDGSRRKPRLTATYNTLIDLYGKAGRLKDAADVFAEMLKLGVAMDTITFNTMIYT CGSHGHLSEAETLLTEMEERGISPDTKTYNIFLSLYADGGNIDAALKCYRKIREVGLFPD VVTHRAVLHVLCERNMVGEVETVIAEMKRSRVRVDEHSIPVVIKMYVNEGLLDKAKIFLE EHLLEDELSSRTRVAIIDAYAEKGLWAEAENVFIGKRDLGQKKDVVEYNVMVKAYGKAKL YDKAFSLFKGMRNHGTWPNESTYNSLIQMFSGGDLVDEARGILAEMQKMGFKPQCLTFSA VIACYARLGRLPDAVGVYEEMVRLGVKPNEVVYGSLINGFSETGNVEEALCYFRKMDEFG ISANQIVLTSLIKAYSKVGCLEGAKTLYEGMKDLEGGPDIVASNSMINLYADLGLVSEAK LIFDDLRQKGSADGVSFATMMYLYKNLGMLDEAIDVADEMKQSGLLRDCASFNKVMACYA TNGQLSACGELLHEMISRRILPDTGTFKVMFTVLKKGGLPTEAVTQLESSYQEGKPYARQ AVITSVFSTVGLHAFALESCETFLNAEVDLDSSFYNVAIYAYGASGSIDKALKMFMKMQD EGLEPDLVTYINLAGCYGKAGMLEGLKRIYSQLKYREIEPNESLFKAIIDAYRSAKRHDL AELVSQEMKFAFDTTMLPL

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_12s0059g01940.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:12:6803521:6806512:1 gene:VIT_12s0059g01940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	AAGTATAGTGGTGTGCTGCCGTCCATTTTACGGGCTTTGGAGTCTGAAAACAACATCGAA GATACCCTAAGTTCATGTGGGAAACTGAGCCCAAAAGAACAGACTGTGATTCTCAAAGAG CAGAGCAGTTGGGAAAGAGTTTTGCGGGTTTTTGAGTGGATTAAATCACAGGAGGATTAC GTGCCCAATGTAATTCACTACAATGTCGTGCTTCGGGTGCTGGGTAGAGCTCAAAAATGG GATGAATTGAGGCTGTGTTGGATTGAAATGGCTAAAAATGGTGTTTTACCAACAAACAAC ACCTATGGAATGCTGGTTGATGTGTATGGCAAAGCAGGTCTTGTGAAAGAAGCACTCTTG TGGATTAAGCACATGAAATTAAGGGGAGTTTTTCCAGATGAGGTTGCAATGAATACTGTT GTTCGGGTTTTAAAGGATGCAGGAGAGTTTGATTGGGCGGATAGGTTTTATAGGGATTGG TGTGTTGGGAAGGTTGAATTGGGTGATTTTGATTTGGAATCTGTAGCTGATTCAGATGAT GAGATAGGTTCTGCACCTGTCAGTCTTAAACATTTTTTGTCAACTGAGCTTTTCAAGATT GGTGGGAGAAGGCCTATTTCGAATATTATGGATTCATCGAACACAGATGGTTCCAGACGT AAGCCACGACTTACGGCTACTTATAATACTTTAATTGATTTGTATGGTAAGGCGGGTCGC CTGAAGGATGCAGCTGATGTGTTTGCAGAAATGTTAAAATTGGGTGTTGCAATGGATACT ATTACTTTCAACACTATGATCTATACTTGTGGAAGCCATGGGCATTTATCAGAGGCAGAG ACTTTGCTTACCGAGATGGAAGAAAGGGGAATATCTCCTGACACAAAAACTTACAACATA TTTCTTTCTTTGTATGCTGATGGGGGAAACATTGATGCAGCCCTCAAGTGTTACAGGAAG ATCAGAGAGGTGGGACTTTTCCCTGATGTTGTAACTCACAGAGCTGTTCTTCATGTATTA TGCGAGAGGAATATGGTTGGAGAGGTGGAGACTGTGATTGCAGAAATGAAAAGATCTCGT GTGCGGGTTGATGAGCATTCTATCCCTGTTGTTATTAAGATGTATGTAAATGAAGGATTG CTTGATAAGGCAAAAATCTTTTTGGAAGAACATCTTTTGGAGGATGAGTTATCATCAAGA ACACGTGTAGCAATTATAGATGCTTATGCTGAAAAGGGTCTTTGGGCGGAGGCTGAGAAT GTGTTCATTGGAAAGAGGGATTTAGGACAGAAGAAGGATGTTGTGGAATATAATGTCATG GTCAAAGCTTATGGCAAAGCAAAACTTTACGATAAAGCCTTTTCACTCTTCAAGGGCATG CGAAATCATGGGACCTGGCCCAATGAAAGCACTTATAATTCTCTCATACAAATGTTTTCT GGAGGTGATTTGGTGGACGAAGCAAGAGGTATCTTAGCTGAAATGCAAAAAATGGGATTC AAACCGCAGTGTCTAACCTTCTCTGCTGTTATTGCATGCTATGCCCGACTGGGACGGCTT CCTGATGCAGTTGGTGTCTATGAAGAAATGGTAAGGTTGGGAGTCAAACCAAATGAAGTT GTTTATGGATCTTTAATAAATGGATTTTCAGAAACTGGAAACGTTGAAGAAGCTCTTTGT TATTTCCGCAAAATGGATGAATTTGGCATTTCAGCAAATCAGATAGTGTTGACTTCCCTG ATTAAGGCTTATAGTAAGGTGGGGTGCCTGGAAGGAGCAAAAACACTCTATGAGGGAATG AAGGATTTGGAGGGTGGTCCAGATATTGTGGCATCAAATAGTATGATAAATCTCTATGCT GATCTTGGGTTAGTATCTGAAGCCAAGTTGATTTTTGATGATTTGAGACAAAAGGGTAGC GCAGATGGGGTTTCATTTGCAACAATGATGTATCTGTACAAGAACTTGGGTATGCTTGAT GAAGCCATTGATGTTGCTGACGAGATGAAACAGTCGGGGTTGCTGAGGGACTGTGCTTCG TTCAATAAGGTAATGGCATGTTATGCAACAAATGGACAGTTGAGTGCTTGTGGTGAATTA TTGCATGAGATGATATCAAGGAGGATTCTACCTGATACTGGGACATTTAAAGTAATGTTT ACGGTGTTGAAAAAGGGGGGCCTTCCAACTGAAGCAGTAACACAGCTCGAATCATCTTAC CAAGAAGGGAAACCTTATGCTAGACAAGCTGTAATAACCTCTGTCTTCTCTACAGTGGGT TTGCATGCTTTTGCACTTGAATCCTGTGAAACCTTCTTAAACGCTGAAGTAGATCTTGAT TCTTCTTTCTATAATGTTGCAATATATGCTTATGGAGCATCTGGATCAATCGACAAGGCT TTGAAAATGTTCATGAAAATGCAGGATGAGGGCCTGGAACCAGATCTTGTTACTTATATT AATCTTGCTGGTTGTTATGGAAAAGCTGGTATGCTTGAAGGTTTGAAGCGGATTTACAGC CAACTAAAATATCGAGAGATTGAGCCCAATGAGTCCTTGTTCAAGGCTATTATAGATGCC TATAGAAGTGCCAAGAGGCATGACCTTGCTGAATTGGTTAGCCAGGAGATGAAATTTGCC TTTGACACAACAATGCTTCCACTCTGAATCAGAACATGAGCTTGATGAACCATCTCCTGG TCTTTAGAATCTGCAGATTTTGCATGCTTGAAGCTATTATCTTCCGGTGGAATAAGATGT ATAGAGAAAACCTTCTGCAGCAAGTTCAAGTTTGAGGGTGCAGGTAACCATGTATGGACA GTGCAAGAACACAGCCATTGATGGAAGATTTGAAGGTAATTTTGGGTTTGATGAATTACA TGTAAAATCTGGATGTAGGGGACAGTAAATTGTTAGTTACAAGGTGTATTATATTTATTA TGCATGTTTTCTAGACAGATATATATGAATAGAAGCTTTGACATTTTGTTTC