Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_12s0059g01000.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:12:5894279:5904767:1 gene:VIT_12s0059g01000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGCCAAATCAATCCCCTCTCCTCTCTATGAAAAAATCCCCCAGAAAAACACACTCCAT
AGAGCCTTGGACCTCACCATCTTCTTCCTTCTCCTCTCTCTCCTTGCTTATCGTCTCCTC
TCCCTCAAAAACAATGGCCTCACTTGGCTCGTCGCCTTCCTCTGTGAGTCATGGTTCACC
TTTCTTTGGGTTCTTAACTTGAGCTCCAAATGGAATCCTGTGTCCTACAAAACATACCCT
GAACGCCTTCTACAGTGTCATCGGGTTGATGAGCTTCCTCCAGTGGACATGTTTGTGACA
ACTGCAGATCCCATCCTGGAACCTCCTATCATCACTGTAAACACTGTCCTCTCCCTGCTG
GCGGTTGACTATCCAGCTAACAAGCTTTCTTGCTATGTGTCCGATGATGGGGCTTCCCCT
CTCACCTTTTACGCTCTCCTTGAAGCATCCAAGTTTGCCAAGCTTTGGGTTCCTTTCTGT
AAGAAGTATGGTATTCAAACTAGAGCTCCCTTTAGATACTTTTCCAGCGAGTTGGTCTCA
TCCCATGATAATTCAATGGACTTCCTAAAAGAATATAGAAAAATTAAGGAAGGATACCAA
GAGCTTGGACGAAAAATTGAAGATGCAGCCCTAAAGTCAATGCCGTATGAGCTTAGTACT
GCAGAGTTTGTTGCTTTCTCAAATGTAGAAAGGAGAAACCATCCGACCATAATCAAGGTT
ATATTGGAGAACAAGGAGAGCAGCTCTGATGGGTTGCCACATCTAGTCTATGTATCCAGA
GAGAAGCATCCCAAGCATCCACACCATTACAAAGCCGGTGCCATGAATGTTCTGACCAGA
GTCTCTGGAGCTATGACAAATGCTCCTTTCATGCTGAACGTAGACTGTGATATGTACGCC
AACAATCCACAGATTTTTCATCATGCAATGTGTTTGCTCCTCGGTTCCAAGAGTGAACAG
GACTGCGGGTTTGTTCAGTCTCCACAAATGTTCTATGATGTAGTAAAGGACGACCCACTT
GGAAATCAGATGGTAGTTTTGTTTAAGTATGTGGGAAGTGGGATAGCAGGGCTTCAAGGA
CCTCTGTATTCTGGAACGGGATGTTTTCATCGAAGAAAAGTTATCTATGGGTCATGGCCG
GATGGCAGGATGGAGATTAAAGGAAGAAATGGAAAATTAACCGATGAGAGATTAGAAAAA
ACATTCGGAAATTCAAAGGAATTCACAAAAACAGCTGCAAGGATTTTATCAGGGTTGAGC
GGGATTTCGGATTGTCCATATGATCTTTCGAATCGGGTTGAGGCAGCATACCAAATTGCA
AGTTGCAGCTATGAGTATGGAACTAGCTGGGGCACAAAGATTGGTTGGTTATATGGAACC
ACAACAGAAGACATCCTCACAGGTATGAGGATACATGCAAGAGGTTGGAAATCCACAGAT
TGCCGGCCTGACCCTCCTGCATTTCTTGGGTGCGCACCCTCAGACGGGCCTGCTGCACTT
ACCCAACAGAAGAGATGGGCCACTGGCCTCCTTGAGGTCCTGTTCAGCAAGAACAGCCCA
CCCATTGCCACCTTCACTGCAAAGCTTCAATTTCGCCAATGCCTCGCATACATGTGGATT
ATTTCATGGGGTTTAAGGCCAATTCCGGAGCTTTGTTATCTTGCTTTGCCAGCATATTGC
ATCATGGCCGGCTCACATTTCTTGCCCAAGGTCCATGAGCCAGCTGTGTTGATACCAATA
TCCCTCTTTGTCAGTTACAAATTTCACACTCTATTTGAATACTATGGAGCTGGGTTTTCA
ATCCGAGCATGCTTGAACAACTTGATGATGGGGAGAATAATCACAGTGACCTCATGGTTA
TTTGGATTTTTAAGTGTCATTCTGAAGCTCCTGGGGTTATTGGAGACCGTCTTTGAAGTT
ACAAAAAAAGACCTATATACTACTCCTGGGGAGGGCAGTGACAAGGATGCTGGTGGGTTC
ACCTTTGATGGGTCTCTGATTTTTGTTCCGGCCACTACTCTTTTGTTGGTGCACCTGATG
GCACTTGTTACAGCCTTGTTAGGACTATTTGATCATGTCGGGATTGAATCAAGAATAGGG
GAGATAATATGTAGTGTGTGGGTGGTGCTATGCTTCTCGCCGTTTCTTAAAGGCTTGTTT
GGGAAAGGAAAATATGGGATACCCACATCCACTATATGCAAGTCAGCAGCTTTGGCATTG
CTTTTTCTTGCTTGCACTATTACAGTAGGTCACCAGCTTAGTCGACAGTTGCTCGACCAC
CACTTGTTCGAGGTCGGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_12s0059g01000.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:12:5894279:5904767:1 gene:VIT_12s0059g01000 transcript:VIT_12s0059g01000.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MAKSIPSPLYEKIPQKNTLHRALDLTIFFLLLSLLAYRLLSLKNNGLTWLVAFLCESWFT
FLWVLNLSSKWNPVSYKTYPERLLQCHRVDELPPVDMFVTTADPILEPPIITVNTVLSLL
AVDYPANKLSCYVSDDGASPLTFYALLEASKFAKLWVPFCKKYGIQTRAPFRYFSSELVS
SHDNSMDFLKEYRKIKEGYQELGRKIEDAALKSMPYELSTAEFVAFSNVERRNHPTIIKV
ILENKESSSDGLPHLVYVSREKHPKHPHHYKAGAMNVLTRVSGAMTNAPFMLNVDCDMYA
NNPQIFHHAMCLLLGSKSEQDCGFVQSPQMFYDVVKDDPLGNQMVVLFKYVGSGIAGLQG
PLYSGTGCFHRRKVIYGSWPDGRMEIKGRNGKLTDERLEKTFGNSKEFTKTAARILSGLS
GISDCPYDLSNRVEAAYQIASCSYEYGTSWGTKIGWLYGTTTEDILTGMRIHARGWKSTD
CRPDPPAFLGCAPSDGPAALTQQKRWATGLLEVLFSKNSPPIATFTAKLQFRQCLAYMWI
ISWGLRPIPELCYLALPAYCIMAGSHFLPKVHEPAVLIPISLFVSYKFHTLFEYYGAGFS
IRACLNNLMMGRIITVTSWLFGFLSVILKLLGLLETVFEVTKKDLYTTPGEGSDKDAGGF
TFDGSLIFVPATTLLLVHLMALVTALLGLFDHVGIESRIGEIICSVWVVLCFSPFLKGLF
GKGKYGIPTSTICKSAALALLFLACTITVGHQLSRQLLDHHLFEVG

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_12s0059g01000.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:12:5894279:5904767:1 gene:VIT_12s0059g01000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

TCCAATGGCCAAATCAATCCCCTCTCCTCTCTATGAAAAAATCCCCCAGAAAAACACACT
CCATAGAGCCTTGGACCTCACCATCTTCTTCCTTCTCCTCTCTCTCCTTGCTTATCGTCT
CCTCTCCCTCAAAAACAATGGCCTCACTTGGCTCGTCGCCTTCCTCTGTGAGTCATGGTT
CACCTTTCTTTGGGTTCTTAACTTGAGCTCCAAATGGAATCCTGTGTCCTACAAAACATA
CCCTGAACGCCTTCTACAGTGTCATCGGGTTGATGAGCTTCCTCCAGTGGACATGTTTGT
GACAACTGCAGATCCCATCCTGGAACCTCCTATCATCACTGTAAACACTGTCCTCTCCCT
GCTGGCGGTTGACTATCCAGCTAACAAGCTTTCTTGCTATGTGTCCGATGATGGGGCTTC
CCCTCTCACCTTTTACGCTCTCCTTGAAGCATCCAAGTTTGCCAAGCTTTGGGTTCCTTT
CTGTAAGAAGTATGGTATTCAAACTAGAGCTCCCTTTAGATACTTTTCCAGCGAGTTGGT
CTCATCCCATGATAATTCAATGGACTTCCTAAAAGAATATAGAAAAATTAAGGAAGGATA
CCAAGAGCTTGGACGAAAAATTGAAGATGCAGCCCTAAAGTCAATGCCGTATGAGCTTAG
TACTGCAGAGTTTGTTGCTTTCTCAAATGTAGAAAGGAGAAACCATCCGACCATAATCAA
GGTTATATTGGAGAACAAGGAGAGCAGCTCTGATGGGTTGCCACATCTAGTCTATGTATC
CAGAGAGAAGCATCCCAAGCATCCACACCATTACAAAGCCGGTGCCATGAATGTTCTGAC
CAGAGTCTCTGGAGCTATGACAAATGCTCCTTTCATGCTGAACGTAGACTGTGATATGTA
CGCCAACAATCCACAGATTTTTCATCATGCAATGTGTTTGCTCCTCGGTTCCAAGAGTGA
ACAGGACTGCGGGTTTGTTCAGTCTCCACAAATGTTCTATGATGTAGTAAAGGACGACCC
ACTTGGAAATCAGATGGTAGTTTTGTTTAAGTATGTGGGAAGTGGGATAGCAGGGCTTCA
AGGACCTCTGTATTCTGGAACGGGATGTTTTCATCGAAGAAAAGTTATCTATGGGTCATG
GCCGGATGGCAGGATGGAGATTAAAGGAAGAAATGGAAAATTAACCGATGAGAGATTAGA
AAAAACATTCGGAAATTCAAAGGAATTCACAAAAACAGCTGCAAGGATTTTATCAGGGTT
GAGCGGGATTTCGGATTGTCCATATGATCTTTCGAATCGGGTTGAGGCAGCATACCAAAT
TGCAAGTTGCAGCTATGAGTATGGAACTAGCTGGGGCACAAAGATTGGTTGGTTATATGG
AACCACAACAGAAGACATCCTCACAGGTATGAGGATACATGCAAGAGGTTGGAAATCCAC
AGATTGCCGGCCTGACCCTCCTGCATTTCTTGGGTGCGCACCCTCAGACGGGCCTGCTGC
ACTTACCCAACAGAAGAGATGGGCCACTGGCCTCCTTGAGGTCCTGTTCAGCAAGAACAG
CCCACCCATTGCCACCTTCACTGCAAAGCTTCAATTTCGCCAATGCCTCGCATACATGTG
GATTATTTCATGGGGTTTAAGGCCAATTCCGGAGCTTTGTTATCTTGCTTTGCCAGCATA
TTGCATCATGGCCGGCTCACATTTCTTGCCCAAGGTCCATGAGCCAGCTGTGTTGATACC
AATATCCCTCTTTGTCAGTTACAAATTTCACACTCTATTTGAATACTATGGAGCTGGGTT
TTCAATCCGAGCATGCTTGAACAACTTGATGATGGGGAGAATAATCACAGTGACCTCATG
GTTATTTGGATTTTTAAGTGTCATTCTGAAGCTCCTGGGGTTATTGGAGACCGTCTTTGA
AGTTACAAAAAAAGACCTATATACTACTCCTGGGGAGGGCAGTGACAAGGATGCTGGTGG
GTTCACCTTTGATGGGTCTCTGATTTTTGTTCCGGCCACTACTCTTTTGTTGGTGCACCT
GATGGCACTTGTTACAGCCTTGTTAGGACTATTTGATCATGTCGGGATTGAATCAAGAAT
AGGGGAGATAATATGTAGTGTGTGGGTGGTGCTATGCTTCTCGCCGTTTCTTAAAGGCTT
GTTTGGGAAAGGAAAATATGGGATACCCACATCCACTATATGCAAGTCAGCAGCTTTGGC
ATTGCTTTTTCTTGCTTGCACTATTACAGTAGGTCACCAGCTTAGTCGACAGTTGCTCGA
CCACCACTTGTTCGAGGTCGGTTGA