Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_12s0057g01200.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:12:9967097:9973949:1 gene:VIT_12s0057g01200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGACGGAAAAGTGATGATAGAGTGTTCGTTGATGGCTCCAGCAGCAGCAGCTTCAATA
AAGCCTAGAGATGTTTGCATTGTTGGTGTTGCACGTACGCCAATGGGTGGCTTTTTGGGT
ACACTTTCATCTTTATCAGCTACCAAGCTTGGATCTATAGCCATTGAAGCCGCTCTTAAA
AGGGCAAATGTTGATGCATCACTTGTACAAGAAGTTTTCTTTGGAAATGTTCTCAGTGCA
AATTTAGGACAGGCTCCTGCTAGACAAGCTGCATTAGGTGCAGGAATACCTAATTCAGTG
GTCTGTACCACCATCAACAAAGTTTGTGCATCAGGAATGAAAGCAACAATGCTCGCAGCA
CAGAGTATCCAGTTGGGTGTCAATGATATTGTTGTGTCTGGTGGTATGGAAAGCATGTCT
AATGTGCCTAAATACCTAGCAGAAGCAAGGAAGGGATCTCGATTTGGACATGATTCTCTT
GTTGATGGAATGCTGAAGGATGGGCTGTGGGATGTTTACAGTGATACAGGGATGGGTGTT
TGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGGATGCTTATGCT
ATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGTGGTGCCTTTGCATGGGAAATT
GTTCCGGTTGAAGTTTCTGGGGGAAGAGGGAGACCATCAACTATTGTTGACAAGGATGAA
GGTCTAGGAAAATTTGACCCTGTGAAATTAAAGAAGCTCCGACCCAGTTTTAAGGAGAAT
GGAGGTTCTGTCACTGCAGGCAATGCTTCTAGCATAAGTGATGGTGCTGCTGCTTTAGTT
TTGGTAAGTGGAGAGAAGGCACTTCAACTTGGGCTGTCAGTCATTGCTAAGATTGCAGGA
TACGCTGATGCTGCTCAGGCACCAGAATTATTTACTACAGCTCCAGCCCTTGCAATTCCA
AAAGCTATTTCAAATGCAGGCTTGGAGGCTTCTCAAATTGATTACTATGAAATAAATGAA
GCCTTTGCTGTTGTGGCTCTTGCAAATCAGAAACTGCTTGGACTTAGTCCCGAAAAAGTT
AATGTGCATGGTGGTGCTGTATCCTTGGGACATCCTCTAGGTTGCAGTGGAGCCCGAATC
TTGGTCACACTTTTGGGGGTACTGAGGCAGAAAGATGGGAAATATGGAGTCGGTGGTGTT
TGCAATGGTGGAGGTGGTGCATCAGCACTAGTTGTAGAGCTTGTGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_12s0057g01200.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:12:9967097:9973949:1 gene:VIT_12s0057g01200 transcript:VIT_12s0057g01200.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MDGKVMIECSLMAPAAAASIKPRDVCIVGVARTPMGGFLGTLSSLSATKLGSIAIEAALK
RANVDASLVQEVFFGNVLSANLGQAPARQAALGAGIPNSVVCTTINKVCASGMKATMLAA
QSIQLGVNDIVVSGGMESMSNVPKYLAEARKGSRFGHDSLVDGMLKDGLWDVYSDTGMGV
CAELCADNHVISREEQDAYAIHSFERGIAAQDGGAFAWEIVPVEVSGGRGRPSTIVDKDE
GLGKFDPVKLKKLRPSFKENGGSVTAGNASSISDGAAALVLVSGEKALQLGLSVIAKIAG
YADAAQAPELFTTAPALAIPKAISNAGLEASQIDYYEINEAFAVVALANQKLLGLSPEKV
NVHGGAVSLGHPLGCSGARILVTLLGVLRQKDGKYGVGGVCNGGGGASALVVELV

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_12s0057g01200.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:12:9967097:9973949:1 gene:VIT_12s0057g01200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGACGGAAAAGTGATGATAGAGTGTTCGTTGATGGCTCCAGCAGCAGCAGCTTCAATA
AAGCCTAGAGATGTTTGCATTGTTGGTGTTGCACGTACGCCAATGGGTGGCTTTTTGGGT
ACACTTTCATCTTTATCAGCTACCAAGCTTGGATCTATAGCCATTGAAGCCGCTCTTAAA
AGGGCAAATGTTGATGCATCACTTGTACAAGAAGTTTTCTTTGGAAATGTTCTCAGTGCA
AATTTAGGACAGGCTCCTGCTAGACAAGCTGCATTAGGTGCAGGAATACCTAATTCAGTG
GTCTGTACCACCATCAACAAAGTTTGTGCATCAGGAATGAAAGCAACAATGCTCGCAGCA
CAGAGTATCCAGTTGGGTGTCAATGATATTGTTGTGTCTGGTGGTATGGAAAGCATGTCT
AATGTGCCTAAATACCTAGCAGAAGCAAGGAAGGGATCTCGATTTGGACATGATTCTCTT
GTTGATGGAATGCTGAAGGATGGGCTGTGGGATGTTTACAGTGATACAGGGATGGGTGTT
TGTGCTGAATTATGTGCAGATAATCATGTAATATCAAGGGAGGAGCAGGATGCTTATGCT
ATTCATAGCTTTGAGCGTGGTATTGCTGCCCAAGATGGTGGTGCCTTTGCATGGGAAATT
GTTCCGGTTGAAGTTTCTGGGGGAAGAGGGAGACCATCAACTATTGTTGACAAGGATGAA
GGTCTAGGAAAATTTGACCCTGTGAAATTAAAGAAGCTCCGACCCAGTTTTAAGGAGAAT
GGAGGTTCTGTCACTGCAGGCAATGCTTCTAGCATAAGTGATGGTGCTGCTGCTTTAGTT
TTGGTAAGTGGAGAGAAGGCACTTCAACTTGGGCTGTCAGTCATTGCTAAGATTGCAGGA
TACGCTGATGCTGCTCAGGCACCAGAATTATTTACTACAGCTCCAGCCCTTGCAATTCCA
AAAGCTATTTCAAATGCAGGCTTGGAGGCTTCTCAAATTGATTACTATGAAATAAATGAA
GCCTTTGCTGTTGTGGCTCTTGCAAATCAGAAACTGCTTGGACTTAGTCCCGAAAAAGTT
AATGTGCATGGTGGTGCTGTATCCTTGGGACATCCTCTAGGTTGCAGTGGAGCCCGAATC
TTGGTCACACTTTTGGGGGTACTGAGGCAGAAAGATGGGAAATATGGAGTCGGTGGTGTT
TGCAATGGTGGAGGTGGTGCATCAGCACTAGTTGTAGAGCTTGTGTAAGCCTTGTTATAT
TTGGCCAGTTATGAGTGCAGGAGCCTGGGAGAGATGAATCTCCATCACCCGCCAAGTTAG
ACGAAGTGCAACTTAATCTCGGTTTCTTTTTCCTTTTTGCCTTTTTGTGTTTGTCGTCTG
AGAAATAAAAATGTACTTAGCTTCAGAAGAAAATAGAATAATAACTGTTCTTCCGT