Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_12s0057g01170.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:12:9904808:9908324:-1 gene:VIT_12s0057g01170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGTGGAGGCTCACATGCCGATCTTTCATGGCGAAGCCCAGACCCATTTCTCACAAAGCT
GCGAGCTTTTCGTCCTCACAAGCTCTCACCCAAAACGAAGATTCAGTACGAGAAATCACC
ACCCTGCTCAACTCCCACAACTGGCAAGCCCTCATGGAATCTTCAGACATACCCAAGAAG
CTAAACACGGATATAATTCGCTCCGTTATTCTTCAAAACCAGGTGGGTGACCCCAAACGC
CTCCTCAATTTCTTCTACTGGTCCCAACACAAAATGGGTACTAGTACTGCCCAACAAGAC
TTGGATGTGTTGTCAGCCCTTGCTGTTAATCTATGCAACTCTAACTGGTATGGGCCTGCA
AGCGATTTGATTAAATGTATCATAAGAAATTCTGACTCCCCATTGGCTGTTTTGGGTTCA
ATTGTTAAATGTTATAGAAGCTGTAATGGGTCACCCAATTCTGTGATTTTTGATATGTTG
ATGGATTCTTATAGGAAAATGGGATTTTTGGTTGAAGCTGTTAATGTGTTCTTGGGTCCT
AAAAATTTCGAATTTAGGCCCAGTTTGTTGAGCTGCAATTCATTATTGGGAGACTTGTTG
AAGGGTAATAAGGTGGAGTTGTTTTGGAAGGTTTTTGATGGGATGTGTGCGCATAAGGTA
TTGCCCGATGTGTATACTTACACTAATATGATTAGTGCTCACTGTAAGGTTGGAAATGTT
AAAGATGCAAAAAGAGTACTTCTGGAGATGGGAGAAAAGGCACGGCTTCTTGATGAAGCT
ATTGAGCTCAAGAGATCTATGGTTGACAAGGGCTTGGTCCCTGATCTTTATACTTATGAT
ATCCTTATTAATGGTTTTTGCATGGAAAAGAGATCAAGAGAGGCAAAATTAATGTTATTG
GAGATGATCGATGTGGGTCTGAAGCCAGAACCAATCACCTATAATGCTTTGATTGATGGG
TTCATGAGACAGGGTGATATAGAACAGGCTTTTAGGATTAAGGATGAGATGGTCGCTTGT
GGTATTGAGGCAAATTTAATCATATGGAACACGCTTCTTAATGGGGTTTGTAAGGCTGGT
AAGATGGAGAAGGCATTAGAAATCATGCAAGAGATGATGGAAAAGGGTGTGGAACCTGAT
TCCCAAACTTATAGTCTATTGATTGAAGGGCACTGCCGAGGGCAGAACATGGCTCGTGCT
TTTGAATTACTGGATGAGATGAAGAAGAGAAAACTGGCACCGACAGTGTTGACTTATAGT
GTGATAATTAATGGTCTATGCCGATGTGGAAACCTCCAAGGAACCAATGCTATTTTGCGG
GAAATGGTTATGAATGGTTTGAAACCAAATGCCGTTGTGTACACAACTCTTATGACAGCT
CACGCCAAGGAAGGTAGAGTTGAAGAGTCAAGAATGATTTTGGAGAGAATGAGGGAGCAA
GGAATTCTGCCAGATGTATTTTGCTACAACTCTCTTATAATTGGTTTCTGCAAAGCCAAA
AGAATGGAAGAAGCAAGGACTTACTTGATGGAAATGTTGGAAAGAAGATTGAGGCCAAAT
GCTCATACGTATGGAGCATTTATAGATGGATATAGTAAGGCAGGGGAGATGGAAATTGCA
GACAGGTACTTCAATGAAATGCTGAGTTGTGGCGTGCTGCCAAATGTTGGAATTTACACG
GCCTTGATAGAAGGGCACTGCAAAGAGGGAAATGTGACAGAAGCCTTCTCAGTATTTAGA
TTTATTCTTTCACGACGTGTTCTACAAGATGTTCAAACTTACAGTGTGCTCATCCATGGT
CTCTCAAGGAATGGAAAAATGCATGAAGCTTTTGGGATCTTCTCTGAACTCCAGGAGAAG
GGTCTGCTTCCTAATGCTTTCACTTACAACTCCCTCATCTCTGGTTCTTGTAAACAGGGA
AATGTTGATAAGGCTTCACAACTTCTTGAAGAGATGTGCATAAAAGGCATTAATCCAGAT
ATTGTTACTTACAATATCTTGATTGATGGGCTATGTAAGGCTGGTGAAATTGAGAGAGCT
AAGAACTTGTTTGATGACATTGAGGGCAGAGGTTTGACACCCAACTGTGTAACATATGCT
GCAATGGTAGATGGTTATTGCAAATCTAAGAACCCCACTGCGGCATTTCAGTTACTAGAA
GAGATGCTGTTAAGGGGAGTCCCACCAGATGCTTTCATATACAATGTCATTCTCAACTTT
TGCTGCAAGGAAGAAAAATTTGAGAAAGCTTTGGATTTATTTCAAGAAATGTTGGAAAAA
GGTTTTGCCTCCACTGTCTCTTTCAATACATTAATTGAGGGGTATTGCAAGAGTGGGAAG
CTGCAAGAAGCTAACCACCTGTTGGAAGAAATGATAGAAAAACAGTTCATTCCTAATCAT
GTCACGTACACATCCCTGATTGATCATAATTGCAAGGCAGGAATGATGGGGGAAGCAAAA
CGACTCTGGCTTGAAATGCAGGAAAGGAATGTGATGCCAACTGCCAAAACTTACACTTCA
CTCTTACATGGTTACCACAACATAGGGAACATGTCAGAGGTTTCTGCCCTGTTTGAAGAG
ATGGTGGCAAAGGGAATTGAACCTGATAAAATGACCTATTATGTAATGATTGATGCTTAT
TGTAGAGAAGGGAATGTGATGGAAGCCTGTAAGTTGAAGGATGAGATATTGGTGAAAGGT
ATGCCAATGAAGAGTGGATTTAGGCTCGGTCTTCCCACATGTAGCGTCATAGCTCGAGGC
TTTCAAATAGCAGGGAACATGGATGAAGCTGCAGAGGTTTTGCGAAGCATGGTGAAATTT
GGATGGGTTTCAAACACAACTAGTTTAGGTGACTTGGTTGATGGAAACCAAAATGGTGCA
AATTCTGAGGATTCTGACAATCTCTTAAAGCAAATGGCTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_12s0057g01170.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:12:9904808:9908324:-1 gene:VIT_12s0057g01170 transcript:VIT_12s0057g01170.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MWRLTCRSFMAKPRPISHKAASFSSSQALTQNEDSVREITTLLNSHNWQALMESSDIPKK
LNTDIIRSVILQNQVGDPKRLLNFFYWSQHKMGTSTAQQDLDVLSALAVNLCNSNWYGPA
SDLIKCIIRNSDSPLAVLGSIVKCYRSCNGSPNSVIFDMLMDSYRKMGFLVEAVNVFLGP
KNFEFRPSLLSCNSLLGDLLKGNKVELFWKVFDGMCAHKVLPDVYTYTNMISAHCKVGNV
KDAKRVLLEMGEKARLLDEAIELKRSMVDKGLVPDLYTYDILINGFCMEKRSREAKLMLL
EMIDVGLKPEPITYNALIDGFMRQGDIEQAFRIKDEMVACGIEANLIIWNTLLNGVCKAG
KMEKALEIMQEMMEKGVEPDSQTYSLLIEGHCRGQNMARAFELLDEMKKRKLAPTVLTYS
VIINGLCRCGNLQGTNAILREMVMNGLKPNAVVYTTLMTAHAKEGRVEESRMILERMREQ
GILPDVFCYNSLIIGFCKAKRMEEARTYLMEMLERRLRPNAHTYGAFIDGYSKAGEMEIA
DRYFNEMLSCGVLPNVGIYTALIEGHCKEGNVTEAFSVFRFILSRRVLQDVQTYSVLIHG
LSRNGKMHEAFGIFSELQEKGLLPNAFTYNSLISGSCKQGNVDKASQLLEEMCIKGINPD
IVTYNILIDGLCKAGEIERAKNLFDDIEGRGLTPNCVTYAAMVDGYCKSKNPTAAFQLLE
EMLLRGVPPDAFIYNVILNFCCKEEKFEKALDLFQEMLEKGFASTVSFNTLIEGYCKSGK
LQEANHLLEEMIEKQFIPNHVTYTSLIDHNCKAGMMGEAKRLWLEMQERNVMPTAKTYTS
LLHGYHNIGNMSEVSALFEEMVAKGIEPDKMTYYVMIDAYCREGNVMEACKLKDEILVKG
MPMKSGFRLGLPTCSVIARGFQIAGNMDEAAEVLRSMVKFGWVSNTTSLGDLVDGNQNGA
NSEDSDNLLKQMA

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_12s0057g01170.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:12:9904808:9908324:-1 gene:VIT_12s0057g01170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGTGGAGGCTCACATGCCGATCTTTCATGGCGAAGCCCAGACCCATTTCTCACAAAGCT
GCGAGCTTTTCGTCCTCACAAGCTCTCACCCAAAACGAAGATTCAGTACGAGAAATCACC
ACCCTGCTCAACTCCCACAACTGGCAAGCCCTCATGGAATCTTCAGACATACCCAAGAAG
CTAAACACGGATATAATTCGCTCCGTTATTCTTCAAAACCAGGTGGGTGACCCCAAACGC
CTCCTCAATTTCTTCTACTGGTCCCAACACAAAATGGGTACTAGTACTGCCCAACAAGAC
TTGGATGTGTTGTCAGCCCTTGCTGTTAATCTATGCAACTCTAACTGGTATGGGCCTGCA
AGCGATTTGATTAAATGTATCATAAGAAATTCTGACTCCCCATTGGCTGTTTTGGGTTCA
ATTGTTAAATGTTATAGAAGCTGTAATGGGTCACCCAATTCTGTGATTTTTGATATGTTG
ATGGATTCTTATAGGAAAATGGGATTTTTGGTTGAAGCTGTTAATGTGTTCTTGGGTCCT
AAAAATTTCGAATTTAGGCCCAGTTTGTTGAGCTGCAATTCATTATTGGGAGACTTGTTG
AAGGGTAATAAGGTGGAGTTGTTTTGGAAGGTTTTTGATGGGATGTGTGCGCATAAGGTA
TTGCCCGATGTGTATACTTACACTAATATGATTAGTGCTCACTGTAAGGTTGGAAATGTT
AAAGATGCAAAAAGAGTACTTCTGGAGATGGGAGAAAAGGCACGGCTTCTTGATGAAGCT
ATTGAGCTCAAGAGATCTATGGTTGACAAGGGCTTGGTCCCTGATCTTTATACTTATGAT
ATCCTTATTAATGGTTTTTGCATGGAAAAGAGATCAAGAGAGGCAAAATTAATGTTATTG
GAGATGATCGATGTGGGTCTGAAGCCAGAACCAATCACCTATAATGCTTTGATTGATGGG
TTCATGAGACAGGGTGATATAGAACAGGCTTTTAGGATTAAGGATGAGATGGTCGCTTGT
GGTATTGAGGCAAATTTAATCATATGGAACACGCTTCTTAATGGGGTTTGTAAGGCTGGT
AAGATGGAGAAGGCATTAGAAATCATGCAAGAGATGATGGAAAAGGGTGTGGAACCTGAT
TCCCAAACTTATAGTCTATTGATTGAAGGGCACTGCCGAGGGCAGAACATGGCTCGTGCT
TTTGAATTACTGGATGAGATGAAGAAGAGAAAACTGGCACCGACAGTGTTGACTTATAGT
GTGATAATTAATGGTCTATGCCGATGTGGAAACCTCCAAGGAACCAATGCTATTTTGCGG
GAAATGGTTATGAATGGTTTGAAACCAAATGCCGTTGTGTACACAACTCTTATGACAGCT
CACGCCAAGGAAGGTAGAGTTGAAGAGTCAAGAATGATTTTGGAGAGAATGAGGGAGCAA
GGAATTCTGCCAGATGTATTTTGCTACAACTCTCTTATAATTGGTTTCTGCAAAGCCAAA
AGAATGGAAGAAGCAAGGACTTACTTGATGGAAATGTTGGAAAGAAGATTGAGGCCAAAT
GCTCATACGTATGGAGCATTTATAGATGGATATAGTAAGGCAGGGGAGATGGAAATTGCA
GACAGGTACTTCAATGAAATGCTGAGTTGTGGCGTGCTGCCAAATGTTGGAATTTACACG
GCCTTGATAGAAGGGCACTGCAAAGAGGGAAATGTGACAGAAGCCTTCTCAGTATTTAGA
TTTATTCTTTCACGACGTGTTCTACAAGATGTTCAAACTTACAGTGTGCTCATCCATGGT
CTCTCAAGGAATGGAAAAATGCATGAAGCTTTTGGGATCTTCTCTGAACTCCAGGAGAAG
GGTCTGCTTCCTAATGCTTTCACTTACAACTCCCTCATCTCTGGTTCTTGTAAACAGGGA
AATGTTGATAAGGCTTCACAACTTCTTGAAGAGATGTGCATAAAAGGCATTAATCCAGAT
ATTGTTACTTACAATATCTTGATTGATGGGCTATGTAAGGCTGGTGAAATTGAGAGAGCT
AAGAACTTGTTTGATGACATTGAGGGCAGAGGTTTGACACCCAACTGTGTAACATATGCT
GCAATGGTAGATGGTTATTGCAAATCTAAGAACCCCACTGCGGCATTTCAGTTACTAGAA
GAGATGCTGTTAAGGGGAGTCCCACCAGATGCTTTCATATACAATGTCATTCTCAACTTT
TGCTGCAAGGAAGAAAAATTTGAGAAAGCTTTGGATTTATTTCAAGAAATGTTGGAAAAA
GGTTTTGCCTCCACTGTCTCTTTCAATACATTAATTGAGGGGTATTGCAAGAGTGGGAAG
CTGCAAGAAGCTAACCACCTGTTGGAAGAAATGATAGAAAAACAGTTCATTCCTAATCAT
GTCACGTACACATCCCTGATTGATCATAATTGCAAGGCAGGAATGATGGGGGAAGCAAAA
CGACTCTGGCTTGAAATGCAGGAAAGGAATGTGATGCCAACTGCCAAAACTTACACTTCA
CTCTTACATGGTTACCACAACATAGGGAACATGTCAGAGGTTTCTGCCCTGTTTGAAGAG
ATGGTGGCAAAGGGAATTGAACCTGATAAAATGACCTATTATGTAATGATTGATGCTTAT
TGTAGAGAAGGGAATGTGATGGAAGCCTGTAAGTTGAAGGATGAGATATTGGTGAAAGGT
ATGCCAATGAAGAGTGGATTTAGGCTCGGTCTTCCCACATGTAGCGTCATAGCTCGAGGC
TTTCAAATAGCAGGGAACATGGATGAAGCTGCAGAGGTTTTGCGAAGCATGGTGAAATTT
GGATGGGTTTCAAACACAACTAGTTTAGGTGACTTGGTTGATGGAAACCAAAATGGTGCA
AATTCTGAGGATTCTGACAATCTCTTAAAGCAAATGGCTTAGGTGTTTTCTGATTGGGAT
CAACCCTGATTTCAAACACTTTGATTGATCTCTTTCTGCTGCTTCATATCTGATCATTTA
ACCTCACTGACGAGCAGAGGCATGAAGAACAACCCTCATCAATGAAGTTAGCAGGTTGTA
ATTGATGCCACTACTCTATTTCCCACCAAACAGCTGTTTCAAAATTTTCTGCCTCGATAA
TGGTGGATGCTTACAACCGAGGAATGGCAAATTGAAGGGTTGGAAGGGTTTGAATGGACC
AATAAACTCCCCAGTTGCTGGCACCCAAAAGACAAGAATCTTCCTGGCCATTTTGAGGCC
AATTCAAGCTTTTGAATCATGAAAGGTAGCAGAAGGC