Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_12s0057g00970.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:12:9653478:9656683:-1 gene:VIT_12s0057g00970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGTTTCGCGGCTTCCACTCATGCAAATCGAGGAGAATCTCCTACAATTCAACTCCTACT TTTACTACATTCACTGCTTCACCTTTTCCACCACTCAAATCTCTTCTTTTCAAACCCCTT AACCCCAATCAATGTACCAAATCATTGCAAGACTTGGTTGATCATTACAAGACATCTACT TCCCATTGCAACACCACACTGTTTTCGAGTTCTGAAACGTTTGAGTCCCTGATTAACCGA TATCAAGGTTCTTGCTGCTCTGAAGAGGCTAGAGAGCTTCATTTGCAAAGTATCAAATAT GGGTTTGTGGGCAATTTGTTCCTATCCAACACCCTTATTAATATATATGTCAGAATTGGC GATCTGGGTTCAGCACAGAAGTTGTTTGATGAAATGTCAAATAGGAATTTGGTTACGTGG GCTTGCTTGATTTCGGGTTATACTCAGAATGGCAAGCCTGATGAGGCGTGTGCTCGTTTT CGGGACATGGTTAGAGCAGGATTTATTCCAAATCATTATGCTTTTGGTAGTGCTCTACGG GCGTGCCAGGAGTCTGGGCCAAGTGGGTGCAAACTTGGGGTGCAAATTCATGGTTTAATT TCGAAAACACGGTATGGATCCGATGTGGTTGTTTGTAATGTGCTGATTTCCATGTATGGA AGTTGTTTAGATTCTGCCAATGACGCTCGTTCTGTTTTTGATGGGATAGGAATTAGGAAT TCAATATCATGGAATTCAATCATTTCTGTTTATTCTCGTAGAGGAGATGCTGTTTCTGCA TATGACCTTTTCTCAAGCATGCAAAAGGAAGGCTTAGGATTCAGTTTTAAACCCAATGAG TATACTTTTGGGAGCTTAATAACCACAGCCTGCTCTTCTGTTGATTTTGGTTTGTGTGTG CTTGAGCAGATGCTTGCCAGGGTTGAGAAATCAGGATTCTTACAAGATTTGTATGTAAGT AGTGCTTTGGTTAGTGGTTTTGCGAGGTTTGGGTTAACAGACGATGCCAAGAATATTTTT GAGCAGATGGGTGTGAGGAATGTGGTTTCCATGAATGGGCTGATGGTTGGATTGGTAAAG CAGAAGCAAGGAGAAGCAGCAGCTAAGGTATTCCATGAGATGAAGGACTTGGTTGGAATA AACTCTGATTCTTATGTGGTCCTTTTAAGCGCTTTTTCCGAATTTTCTGTGTTGGAAGAA GGAAGAAGAAAGGGTAGAGAAGTTCATGCACATGTAATCCGAACTGGATTAAATGACAAT AAGGTTGCAATTGGAAATGGGCTAGTCAATATGTATGCCAAATCTGGAGCCATTGCTGAT GCTTGCTCCGTTTTTGAACTCATGGTTGAGAAAGATTCAGTCTCTTGGAACTCCCTAATC TCTGGTCTTGACCAGAATGAATGTTCTGAAGATGCAGCTGAGAGTTTCCATAGAATGAGG AGAACTGGATCGATGCCTTCAAATTTCACATTGATAAGCACTTTGAGCTCTTGTGCAAGT TTGGGTTGGATCATGTTGGGGGAACAAATACATTGTGATGGGCTTAAATTAGGACTTGAT ACAGATGTTTCAGTCTCAAATGCCCTTCTTGCATTATATGCAGAGACTGGATGTTTCACT GAATGCCTAAAAGTGTTTTCCTTGATGCCAGAGTATGATCAAGTTTCATGGAATTCTGTT ATTGGGGCATTATCCGATTCAGAGGCATCAGTTTCCCAAGCTGTGAAATATTTCTTGCAA ATGATGCGAGGCGGATGGGGTCTTAGTAGAGTAACCTTTATAAACATTCTTTCAGCTGTG TCATCTCTTTCACTTCATGAAGTAAGCCATCAGATTCATGCTCTGGTGCTAAAATACTGT CTTTCTGATGACACTGCTATTGGGAACGCCCTTCTCTCTTGCTATGGGAAGTGTGGAGAG ATGAACGAGTGTGAGAAAATTTTTGCTAGAATGTCTGAGACAAGGGATGAAGTGAGTTGG AATTCCATGATTTCTGGATACATACATAATGAACTCCTGCACAAGGCAATGGATTTGGTC TGGTTTATGATGCAGAAGGGTCAGAGATTAGATAGCTTCACCTTTGCCACCATTCTTAGT GCATGTGCCTCAGTTGCAACATTGGAGCGTGGCATGGAAGTTCACGCATGTGGGATTAGA GCTTGTTTGGAATCTGATGTTGTAGTTGGGAGTGCACTTGTAGACATGTACTCCAAATGC GGAAGAATAGACTATGCTTCAAGATTCTTTGAGTTGATGCCCCTGAGGAATGTATATTCA TGGAATTCAATGATATCAGGATATGCACGACACGGGCATGGGGAGAAAGCTTTAAAGCTT TTTACACGAATGATGCTAGATGGTCAACCACCCGATCATGTCACCTTTGTTGGGGTCTTA TCAGCTTGTAGCCATGTGGGGTTTGTAGAAGAAGGGTTTGAGCATTTCAAATCTATGAGT GAGGTATACAGGTTGTCTCCTCGGGTGGAGCACTTTTCATGTATGGTGGATCTTCTTGGG CGGGCGGGCAAACTCGATGAGGTAGGGGACTTCATCAATAGCATGCCAATGAAGCCTAAT GTTCTCATTTGGAGGACAGTTCTTGGGGCTTGCTGTCGAGCAAATGGTCGCAACACAGAG CTGGGTAGGAGGGCTGCTGAAATGCTTTTGGAGTTGGAACCTCAAAATGCTGTGAACTAT GTGCTTCTTGCTAACATGTATGCCTCTGGAGAGAAGTGGGAAGACGTTGCAAAGGCTCGG ACGGCAATGAAGGAGGCGGCAGTGAAGAAGGAAGCGGGCTGCAGTTGGGTCACCATGAAG GATGGAGTTCATGTTTTTGTAGCTGGAGACAAATTACACCCTGAAAAAGACTTGATATAT GACAAACTCCGGGAACTGAACAGAAAAATGAGGGATGCAGGGTACATTCCGCAGACAAAA TATGCACTGTTTGATCTGGAGCTGGAGAACAAGGAAGAACTCCTGAGCTACCACAGTGAG AAAATTGCAGTTGCCTTTGTCCTCACCCGCCAATCAGCATTGCCTATAAGGATAATGAAA AATCTCCGGGTTTGTGGTGACTGTCACTCTGCCTTTGGATACATTTCAAAGATTGTCGGT CGACAAATAGTCCTACGAGATTCAAACAGATTTCATCATTTTGAAGATGGCAAATGTTCA TGTGGGGATTACTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_12s0057g00970.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:12:9653478:9656683:-1 gene:VIT_12s0057g00970 transcript:VIT_12s0057g00970.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MFRGFHSCKSRRISYNSTPTFTTFTASPFPPLKSLLFKPLNPNQCTKSLQDLVDHYKTST SHCNTTLFSSSETFESLINRYQGSCCSEEARELHLQSIKYGFVGNLFLSNTLINIYVRIG DLGSAQKLFDEMSNRNLVTWACLISGYTQNGKPDEACARFRDMVRAGFIPNHYAFGSALR ACQESGPSGCKLGVQIHGLISKTRYGSDVVVCNVLISMYGSCLDSANDARSVFDGIGIRN SISWNSIISVYSRRGDAVSAYDLFSSMQKEGLGFSFKPNEYTFGSLITTACSSVDFGLCV LEQMLARVEKSGFLQDLYVSSALVSGFARFGLTDDAKNIFEQMGVRNVVSMNGLMVGLVK QKQGEAAAKVFHEMKDLVGINSDSYVVLLSAFSEFSVLEEGRRKGREVHAHVIRTGLNDN KVAIGNGLVNMYAKSGAIADACSVFELMVEKDSVSWNSLISGLDQNECSEDAAESFHRMR RTGSMPSNFTLISTLSSCASLGWIMLGEQIHCDGLKLGLDTDVSVSNALLALYAETGCFT ECLKVFSLMPEYDQVSWNSVIGALSDSEASVSQAVKYFLQMMRGGWGLSRVTFINILSAV SSLSLHEVSHQIHALVLKYCLSDDTAIGNALLSCYGKCGEMNECEKIFARMSETRDEVSW NSMISGYIHNELLHKAMDLVWFMMQKGQRLDSFTFATILSACASVATLERGMEVHACGIR ACLESDVVVGSALVDMYSKCGRIDYASRFFELMPLRNVYSWNSMISGYARHGHGEKALKL FTRMMLDGQPPDHVTFVGVLSACSHVGFVEEGFEHFKSMSEVYRLSPRVEHFSCMVDLLG RAGKLDEVGDFINSMPMKPNVLIWRTVLGACCRANGRNTELGRRAAEMLLELEPQNAVNY VLLANMYASGEKWEDVAKARTAMKEAAVKKEAGCSWVTMKDGVHVFVAGDKLHPEKDLIY DKLRELNRKMRDAGYIPQTKYALFDLELENKEELLSYHSEKIAVAFVLTRQSALPIRIMK NLRVCGDCHSAFGYISKIVGRQIVLRDSNRFHHFEDGKCSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_12s0057g00970.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:12:9653478:9656683:-1 gene:VIT_12s0057g00970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGTTTCGCGGCTTCCACTCATGCAAATCGAGGAGAATCTCCTACAATTCAACTCCTACT TTTACTACATTCACTGCTTCACCTTTTCCACCACTCAAATCTCTTCTTTTCAAACCCCTT AACCCCAATCAATGTACCAAATCATTGCAAGACTTGGTTGATCATTACAAGACATCTACT TCCCATTGCAACACCACACTGTTTTCGAGTTCTGAAACGTTTGAGTCCCTGATTAACCGA TATCAAGGTTCTTGCTGCTCTGAAGAGGCTAGAGAGCTTCATTTGCAAAGTATCAAATAT GGGTTTGTGGGCAATTTGTTCCTATCCAACACCCTTATTAATATATATGTCAGAATTGGC GATCTGGGTTCAGCACAGAAGTTGTTTGATGAAATGTCAAATAGGAATTTGGTTACGTGG GCTTGCTTGATTTCGGGTTATACTCAGAATGGCAAGCCTGATGAGGCGTGTGCTCGTTTT CGGGACATGGTTAGAGCAGGATTTATTCCAAATCATTATGCTTTTGGTAGTGCTCTACGG GCGTGCCAGGAGTCTGGGCCAAGTGGGTGCAAACTTGGGGTGCAAATTCATGGTTTAATT TCGAAAACACGGTATGGATCCGATGTGGTTGTTTGTAATGTGCTGATTTCCATGTATGGA AGTTGTTTAGATTCTGCCAATGACGCTCGTTCTGTTTTTGATGGGATAGGAATTAGGAAT TCAATATCATGGAATTCAATCATTTCTGTTTATTCTCGTAGAGGAGATGCTGTTTCTGCA TATGACCTTTTCTCAAGCATGCAAAAGGAAGGCTTAGGATTCAGTTTTAAACCCAATGAG TATACTTTTGGGAGCTTAATAACCACAGCCTGCTCTTCTGTTGATTTTGGTTTGTGTGTG CTTGAGCAGATGCTTGCCAGGGTTGAGAAATCAGGATTCTTACAAGATTTGTATGTAAGT AGTGCTTTGGTTAGTGGTTTTGCGAGGTTTGGGTTAACAGACGATGCCAAGAATATTTTT GAGCAGATGGGTGTGAGGAATGTGGTTTCCATGAATGGGCTGATGGTTGGATTGGTAAAG CAGAAGCAAGGAGAAGCAGCAGCTAAGGTATTCCATGAGATGAAGGACTTGGTTGGAATA AACTCTGATTCTTATGTGGTCCTTTTAAGCGCTTTTTCCGAATTTTCTGTGTTGGAAGAA GGAAGAAGAAAGGGTAGAGAAGTTCATGCACATGTAATCCGAACTGGATTAAATGACAAT AAGGTTGCAATTGGAAATGGGCTAGTCAATATGTATGCCAAATCTGGAGCCATTGCTGAT GCTTGCTCCGTTTTTGAACTCATGGTTGAGAAAGATTCAGTCTCTTGGAACTCCCTAATC TCTGGTCTTGACCAGAATGAATGTTCTGAAGATGCAGCTGAGAGTTTCCATAGAATGAGG AGAACTGGATCGATGCCTTCAAATTTCACATTGATAAGCACTTTGAGCTCTTGTGCAAGT TTGGGTTGGATCATGTTGGGGGAACAAATACATTGTGATGGGCTTAAATTAGGACTTGAT ACAGATGTTTCAGTCTCAAATGCCCTTCTTGCATTATATGCAGAGACTGGATGTTTCACT GAATGCCTAAAAGTGTTTTCCTTGATGCCAGAGTATGATCAAGTTTCATGGAATTCTGTT ATTGGGGCATTATCCGATTCAGAGGCATCAGTTTCCCAAGCTGTGAAATATTTCTTGCAA ATGATGCGAGGCGGATGGGGTCTTAGTAGAGTAACCTTTATAAACATTCTTTCAGCTGTG TCATCTCTTTCACTTCATGAAGTAAGCCATCAGATTCATGCTCTGGTGCTAAAATACTGT CTTTCTGATGACACTGCTATTGGGAACGCCCTTCTCTCTTGCTATGGGAAGTGTGGAGAG ATGAACGAGTGTGAGAAAATTTTTGCTAGAATGTCTGAGACAAGGGATGAAGTGAGTTGG AATTCCATGATTTCTGGATACATACATAATGAACTCCTGCACAAGGCAATGGATTTGGTC TGGTTTATGATGCAGAAGGGTCAGAGATTAGATAGCTTCACCTTTGCCACCATTCTTAGT GCATGTGCCTCAGTTGCAACATTGGAGCGTGGCATGGAAGTTCACGCATGTGGGATTAGA GCTTGTTTGGAATCTGATGTTGTAGTTGGGAGTGCACTTGTAGACATGTACTCCAAATGC GGAAGAATAGACTATGCTTCAAGATTCTTTGAGTTGATGCCCCTGAGGAATGTATATTCA TGGAATTCAATGATATCAGGATATGCACGACACGGGCATGGGGAGAAAGCTTTAAAGCTT TTTACACGAATGATGCTAGATGGTCAACCACCCGATCATGTCACCTTTGTTGGGGTCTTA TCAGCTTGTAGCCATGTGGGGTTTGTAGAAGAAGGGTTTGAGCATTTCAAATCTATGAGT GAGGTATACAGGTTGTCTCCTCGGGTGGAGCACTTTTCATGTATGGTGGATCTTCTTGGG CGGGCGGGCAAACTCGATGAGGTAGGGGACTTCATCAATAGCATGCCAATGAAGCCTAAT GTTCTCATTTGGAGGACAGTTCTTGGGGCTTGCTGTCGAGCAAATGGTCGCAACACAGAG CTGGGTAGGAGGGCTGCTGAAATGCTTTTGGAGTTGGAACCTCAAAATGCTGTGAACTAT GTGCTTCTTGCTAACATGTATGCCTCTGGAGAGAAGTGGGAAGACGTTGCAAAGGCTCGG ACGGCAATGAAGGAGGCGGCAGTGAAGAAGGAAGCGGGCTGCAGTTGGGTCACCATGAAG GATGGAGTTCATGTTTTTGTAGCTGGAGACAAATTACACCCTGAAAAAGACTTGATATAT GACAAACTCCGGGAACTGAACAGAAAAATGAGGGATGCAGGGTACATTCCGCAGACAAAA TATGCACTGTTTGATCTGGAGCTGGAGAACAAGGAAGAACTCCTGAGCTACCACAGTGAG AAAATTGCAGTTGCCTTTGTCCTCACCCGCCAATCAGCATTGCCTATAAGGATAATGAAA AATCTCCGGGTTTGTGGTGACTGTCACTCTGCCTTTGGATACATTTCAAAGATTGTCGGT CGACAAATAGTCCTACGAGATTCAAACAGATTTCATCATTTTGAAGATGGCAAATGTTCA TGTGGGGATTACTGGTAATCAACTTG