Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_12s0057g00880.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:12:9587450:9598955:-1 gene:VIT_12s0057g00880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGCAACGCTATACCGAGACACAGTGGATCATTACCCAAAATTTTCATATTAGGGAAC TGTTTGGCTGGAAAAGTTGAAAACAAAGGGAAGTCTGGGCTGGCGGAGGCCTTTATAAGT CAAACCCTAGGTCCTTTCTCTCTCTATTTCTCTCTAGAAAAACAAGCCCTAAGGAAAACC CTAGAGAACATGTCTGGTGTGTACGGTCACGACGGCGACGAATCGGGTCAGCCTCCCTCC TCCGGAGGCTACGGCGGTGGCGGTGGATACGGAGGAGGAGGATATGGTGGCGGAGGCGGT GGGGGAGGTTATGGGGGTAATAGTGGTGGCGGAGGTGGTGGACGGGGTGGAGGGTACGGT GGCGGTGGGGGCAGAGGAGGTGGTGGAGGAGGATATGGGGGTAATTCACAGAATCGAGGA GGTGGAGGTGGCGGAGGATACCAAGGAGGGGATCGTGGCGGCCGAGGTGGTGGCGGCGGT GGAAGGGGAGGTGGCCGGGGAGGAAGCGGCAGAGATGGGGATTGGCTTTGCCCCAATCCA AGCTGCGGGAATCTGAACTTTGCAAGAAGAGTTGAGTGTAACAAATGCGGTGCACCCTCT CCTGCTGGTGCAGGCAGCGATCGTGGTGGTGGCGGCGGCTATAACAGAGGAGGAAGTGGT GGGGGATTTGGTGGTAATCGAGGGGGAAGAGGTGGTAATTATGAGGGTGGCAGTGGAGGC AATAGAGGTGGTAATTATGAGGGTGGTAGTAGAGGGGGTTCTTATGGTGGTAATCAGGCA AGAGGTGGGGGTGGAGATGGTGGTTTTGGACAAGTTCCTCCAGCTGCACCCCAATCTTAT GGTGGTGGGTCTGCTGGATATTATCCTCCTCCAAATTCTTTTGGTGGAAACACTAATTAT GGTGGAGAGGCTGTTCCTCCACCAACAAGCTACACTGGTGGGCCTACATCGTATCCCCCA TCATATGGCGGCCCTGCGAGTGGTTATGATGGTCTAGGTGATACAAGAGGTGGTGGTCGG GCTGGTCCACCTGCTGGTGGATATGATGGTGGATTTGGTGGTCCCAGACAACAGGGAGGT GGTTATGCTGGGGGCAGTACTACTGAGGCCCCTGTTAAGGTGAAGCAATGCGATGAAAAT TGTGGGGATTCTTGTGATAATTCAAGAATTTACATATCAAATTTGCCACCGGATGTGACT GTTGATGAATTGAGAGAGCTTTTTGGTGGCATTGGACAAGTTGGAAGAATTAAGCAGAAG CGAGGTTATAAGGATCAATGGCCATGGAATATAAAAATATACACTGATGAAGGTGGAAAC AACAAAGGCGATGCATGTTTGTCTTATGAGGATCCTTCTGCTGCGCATTCTGCTGGTGGT TTTTATAACAATTATGAAATGAGGGGCTATAAAATCAATGTTGCAATGGCAGAGAAGTCT GCACCAAGGGCTCCACCTGCTTTTGGCCATGGGGGTGGTGGTAGAGGTGGCTATGGTGGT GGGGACCGGCGCAGAGACAATTACAGGGACAATGCAGGTTCTGGTCCAGATAGACATCAT CATGGTGGAAATCGTTCGCGTCCATACTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_12s0057g00880.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:12:9587450:9598955:-1 gene:VIT_12s0057g00880 transcript:VIT_12s0057g00880.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MSNAIPRHSGSLPKIFILGNCLAGKVENKGKSGLAEAFISQTLGPFSLYFSLEKQALRKT LENMSGVYGHDGDESGQPPSSGGYGGGGGYGGGGYGGGGGGGGYGGNSGGGGGGRGGGYG GGGGRGGGGGGYGGNSQNRGGGGGGGYQGGDRGGRGGGGGGRGGGRGGSGRDGDWLCPNP SCGNLNFARRVECNKCGAPSPAGAGSDRGGGGGYNRGGSGGGFGGNRGGRGGNYEGGSGG NRGGNYEGGSRGGSYGGNQARGGGGDGGFGQVPPAAPQSYGGGSAGYYPPPNSFGGNTNY GGEAVPPPTSYTGGPTSYPPSYGGPASGYDGLGDTRGGGRAGPPAGGYDGGFGGPRQQGG GYAGGSTTEAPVKVKQCDENCGDSCDNSRIYISNLPPDVTVDELRELFGGIGQVGRIKQK RGYKDQWPWNIKIYTDEGGNNKGDACLSYEDPSAAHSAGGFYNNYEMRGYKINVAMAEKS APRAPPAFGHGGGGRGGYGGGDRRRDNYRDNAGSGPDRHHHGGNRSRPY

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_12s0057g00880.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:12:9587450:9598955:-1 gene:VIT_12s0057g00880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGCAACGCTATACCGAGACACAGTGGATCATTACCCAAAATTTTCATATTAGGGAAC TGTTTGGCTGGAAAAGTTGAAAACAAAGGGAAGTCTGGGCTGGCGGAGGCCTTTATAAGT CAAACCCTAGGTCCTTTCTCTCTCTATTTCTCTCTAGAAAAACAAGCCCTAAGGAAAACC CTAGAGAACATGTCTGGTGTGTACGGTCACGACGGCGACGAATCGGGTCAGCCTCCCTCC TCCGGAGGCTACGGCGGTGGCGGTGGATACGGAGGAGGAGGATATGGTGGCGGAGGCGGT GGGGGAGGTTATGGGGGTAATAGTGGTGGCGGAGGTGGTGGACGGGGTGGAGGGTACGGT GGCGGTGGGGGCAGAGGAGGTGGTGGAGGAGGATATGGGGGTAATTCACAGAATCGAGGA GGTGGAGGTGGCGGAGGATACCAAGGAGGGGATCGTGGCGGCCGAGGTGGTGGCGGCGGT GGAAGGGGAGGTGGCCGGGGAGGAAGCGGCAGAGATGGGGATTGGCTTTGCCCCAATCCA AGCTGCGGGAATCTGAACTTTGCAAGAAGAGTTGAGTGTAACAAATGCGGTGCACCCTCT CCTGCTGGTGCAGGCAGCGATCGTGGTGGTGGCGGCGGCTATAACAGAGGAGGAAGTGGT GGGGGATTTGGTGGTAATCGAGGGGGAAGAGGTGGTAATTATGAGGGTGGCAGTGGAGGC AATAGAGGTGGTAATTATGAGGGTGGTAGTAGAGGGGGTTCTTATGGTGGTAATCAGGCA AGAGGTGGGGGTGGAGATGGTGGTTTTGGACAAGTTCCTCCAGCTGCACCCCAATCTTAT GGTGGTGGGTCTGCTGGATATTATCCTCCTCCAAATTCTTTTGGTGGAAACACTAATTAT GGTGGAGAGGCTGTTCCTCCACCAACAAGCTACACTGGTGGGCCTACATCGTATCCCCCA TCATATGGCGGCCCTGCGAGTGGTTATGATGGTCTAGGTGATACAAGAGGTGGTGGTCGG GCTGGTCCACCTGCTGGTGGATATGATGGTGGATTTGGTGGTCCCAGACAACAGGGAGGT GGTTATGCTGGGGGCAGTACTACTGAGGCCCCTGTTAAGGTGAAGCAATGCGATGAAAAT TGTGGGGATTCTTGTGATAATTCAAGAATTTACATATCAAATTTGCCACCGGATGTGACT GTTGATGAATTGAGAGAGCTTTTTGGTGGCATTGGACAAGTTGGAAGAATTAAGCAGAAG CGAGGTTATAAGGATCAATGGCCATGGAATATAAAAATATACACTGATGAAGGTGGAAAC AACAAAGGCGATGCATGTTTGTCTTATGAGGATCCTTCTGCTGCGCATTCTGCTGGTGGT TTTTATAACAATTATGAAATGAGGGGCTATAAAATCAATGTTGCAATGGCAGAGAAGTCT GCACCAAGGGCTCCACCTGCTTTTGGCCATGGGGGTGGTGGTAGAGGTGGCTATGGTGGT GGGGACCGGCGCAGAGACAATTACAGGGACAATGCAGGTTCTGGTCCAGATAGACATCAT CATGGTGGAAATCGTTCGCGTCCATACTGAGATAACTTCAGCACTGAGCATTTAATGTAC CTTAAATTATGGTCTGAGGGGTTTTATTATATTCCATTCACCCGGATTGTTCTTTAACTG GAGACTTAAGAGGTAGGTTGTTCACTTCTCTGAGCAAGACCCCTTTTTCTCCTTTATCTA CTTCTGCTACATGGAGGGGTTTTTATTCTTAAGCTTGGGATTGATTTAAATTGTGTGAAT GTTTTTCTAGAGGCAAGTGGATAATCTCCAAATTGCTGCTATAAGGTAGGTTGATATTTT CAGGTGAGTGCTGCTCAATTGAATTCTATCCCTTCTTTCAGAAATTGACCCAAGAGTGGT GAAATATGTGGAGTTAGCTTGCAATGTAGCCTTA