Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_12s0035g00250.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:12:19497404:19499527:1 gene:VIT_12s0035g00250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGAGGGACTGAAGAGCAGAGCTCTCCACCACCTCTCGCACACCCACAAGGTTCTCGCC
CTCCCCTCCTTACACCATTTCTACGACCACCTCCTCCAATGCTGCACCAGCCTCACCACC
CTCAAACTCATCCACTCTTCCCTCTCCACTCGTGGCTTCCTCCTCCACACCCCTCATTTT
CTTGCTCGCCTCATCATCCTATACTCCAAACTCGGCGACCTCCATAGCGCTCGCACCCTT
TTCGACCACCGTCATCACCACCACCATGGCCACACCCAGGCACCCAATTCCTTCCTCTGT
AACACCATGCTTCGCGCTTATGCGAATGCCGGCCGATCTTACGAAGCTATAGACTTGTAT
ATTTATATGCAGAGAATGGGGGTTGGAGTTAATAATTTTACGTACCCGTTTGTGCTGAAA
GTCTGTGCTTCTGAACTGGGTGCTGTTTTTGGAGAAGTGGTCCATGGGCAGGTTGTGAGA
ACTGGGTTTGGGTCGGATCTCTTTGTGGAGGCGGCTTTGGTGGACATGTATGCGAAATGT
GGGGAGATTGGGGACGCCCACGAAGTGTTCGATCGAATGTTGATAAGGGATGTTGTGTGC
TGGACAGCGATGATCACGCTGTATGAGCAGGCTGAGCGGCCCCTGAAGGCCCTAATGTTG
TTTCGGAAGATGCAGGAGGAAGGGTTTTTAGGAGATGAGATTACGGCTATTTCTGTTGCG
TCTGCTGTTGGGCAACTGGGAGATGGCAGGATGGCGATATCAGTTCATGGCTATGCAGTG
CTTAATGGGTTCATTGGAGATGTTAGTGTTGGGAATTCAATAGTAGGGATGTATGCGAAA
TGTGGGAATGTGGAGAGGGCGAGATTGGTCTTTGACAGGATGGAAGAAAGAAATGGCATT
TCGTGGAATTCTATGCTTTCGGGGTATACACAAAATGGACGACCAACTGATGCTTTGTCA
CTTTTTAATCAAATGCAAGCTTCTGAATGTGATCCTAATCCAGTGACAGCCTTGATTATG
GTTTCGGCATGTTCTTATCTCGGTTCTAAGCATCTTGGAAGGAAGCTTCACAATTTTGTA
ATAAGTAGCAAAATGGATATCGATACTACTCTTAGGAATGCGATAATGGACATGTATATG
AAATGTGGAGATTTAGACACTGCTGTTGAAATGTTCAACAATTGTGAGCTGGGCGAACGA
GACGTTAGTTCTTGGAATGTTTTGATATCAGGATATGGAGTGCATGGGCATGGGAAGGAA
GCTCTTGAGCTCTTCTCAAGAATGCAAGTGGAGGGTGTTGAACCAAATGATATCACTTTC
ACATCCATTCTTTCCGCTTGTAGTCATGCAGGTCTTATTGATGAAGGTAGGAAGTGTTTT
GCCGATATGACCAAGCTGTCTGTCAGACCTGAGATGAAACATTATGCTTGCATGGTTGAT
ATGCTTGGTCGAGCTGGGTTCTTGAATGAAGCTTTTAGATTGATCAAAAAGATTCCATCA
CGACCAAGTGATGAGGTATGGGGTGCATTACTTTTGGCTTGCAGAATCCATGGGAATACT
GAGTTGGGGGAAATTGCAGCCAATAATCTCTTTCAGCTTGAGCCAGAACATACTGGTTAC
TATGTGCTAATGTCAAATATCTATGCCGCATCAAACAAATGGAAGGAAGTTGAGATGGTG
AGACAAAATATGAAAAGTAGGGGATTGAAGAAGCCTGCAGCCTTCAGTGTGATTGAGTTT
GGAACAGAAGTTCATGGGTTCCACACAGCAGACCAGTCAAGTCCGTACTACAGAGAGGTT
TACAGAAAGGTAGAGAGCTTGGCAATTGAGATGAAGATGGTAGGCTATGTGCCAGACCTG
TCTTGTGTTCTCCATGATGTGGAACCGGAAGACAAGGAGCACTTACTCAACTATCACAGT
GAGAAGTTGGCTGTGGCATTTGGGATAATGAAAATGGACCAAGGAATGCCAATTCAGGTC
ACCAAGAACCTAAGGGTTTGTAGTGATTGTCACTGGGCCTTCAAGTTTATTTCGTCTATT
TATGGCCGGAAGATTATTGTAAGAGATGGCAATCGATTCCATCACTTTCAAGGTGGTAGA
TGCTCATGCGGGGACTATTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_12s0035g00250.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:12:19497404:19499527:1 gene:VIT_12s0035g00250 transcript:VIT_12s0035g00250.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MEGLKSRALHHLSHTHKVLALPSLHHFYDHLLQCCTSLTTLKLIHSSLSTRGFLLHTPHF
LARLIILYSKLGDLHSARTLFDHRHHHHHGHTQAPNSFLCNTMLRAYANAGRSYEAIDLY
IYMQRMGVGVNNFTYPFVLKVCASELGAVFGEVVHGQVVRTGFGSDLFVEAALVDMYAKC
GEIGDAHEVFDRMLIRDVVCWTAMITLYEQAERPLKALMLFRKMQEEGFLGDEITAISVA
SAVGQLGDGRMAISVHGYAVLNGFIGDVSVGNSIVGMYAKCGNVERARLVFDRMEERNGI
SWNSMLSGYTQNGRPTDALSLFNQMQASECDPNPVTALIMVSACSYLGSKHLGRKLHNFV
ISSKMDIDTTLRNAIMDMYMKCGDLDTAVEMFNNCELGERDVSSWNVLISGYGVHGHGKE
ALELFSRMQVEGVEPNDITFTSILSACSHAGLIDEGRKCFADMTKLSVRPEMKHYACMVD
MLGRAGFLNEAFRLIKKIPSRPSDEVWGALLLACRIHGNTELGEIAANNLFQLEPEHTGY
YVLMSNIYAASNKWKEVEMVRQNMKSRGLKKPAAFSVIEFGTEVHGFHTADQSSPYYREV
YRKVESLAIEMKMVGYVPDLSCVLHDVEPEDKEHLLNYHSEKLAVAFGIMKMDQGMPIQV
TKNLRVCSDCHWAFKFISSIYGRKIIVRDGNRFHHFQGGRCSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_12s0035g00250.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:12:19497404:19499527:1 gene:VIT_12s0035g00250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGAGGGACTGAAGAGCAGAGCTCTCCACCACCTCTCGCACACCCACAAGGTTCTCGCC
CTCCCCTCCTTACACCATTTCTACGACCACCTCCTCCAATGCTGCACCAGCCTCACCACC
CTCAAACTCATCCACTCTTCCCTCTCCACTCGTGGCTTCCTCCTCCACACCCCTCATTTT
CTTGCTCGCCTCATCATCCTATACTCCAAACTCGGCGACCTCCATAGCGCTCGCACCCTT
TTCGACCACCGTCATCACCACCACCATGGCCACACCCAGGCACCCAATTCCTTCCTCTGT
AACACCATGCTTCGCGCTTATGCGAATGCCGGCCGATCTTACGAAGCTATAGACTTGTAT
ATTTATATGCAGAGAATGGGGGTTGGAGTTAATAATTTTACGTACCCGTTTGTGCTGAAA
GTCTGTGCTTCTGAACTGGGTGCTGTTTTTGGAGAAGTGGTCCATGGGCAGGTTGTGAGA
ACTGGGTTTGGGTCGGATCTCTTTGTGGAGGCGGCTTTGGTGGACATGTATGCGAAATGT
GGGGAGATTGGGGACGCCCACGAAGTGTTCGATCGAATGTTGATAAGGGATGTTGTGTGC
TGGACAGCGATGATCACGCTGTATGAGCAGGCTGAGCGGCCCCTGAAGGCCCTAATGTTG
TTTCGGAAGATGCAGGAGGAAGGGTTTTTAGGAGATGAGATTACGGCTATTTCTGTTGCG
TCTGCTGTTGGGCAACTGGGAGATGGCAGGATGGCGATATCAGTTCATGGCTATGCAGTG
CTTAATGGGTTCATTGGAGATGTTAGTGTTGGGAATTCAATAGTAGGGATGTATGCGAAA
TGTGGGAATGTGGAGAGGGCGAGATTGGTCTTTGACAGGATGGAAGAAAGAAATGGCATT
TCGTGGAATTCTATGCTTTCGGGGTATACACAAAATGGACGACCAACTGATGCTTTGTCA
CTTTTTAATCAAATGCAAGCTTCTGAATGTGATCCTAATCCAGTGACAGCCTTGATTATG
GTTTCGGCATGTTCTTATCTCGGTTCTAAGCATCTTGGAAGGAAGCTTCACAATTTTGTA
ATAAGTAGCAAAATGGATATCGATACTACTCTTAGGAATGCGATAATGGACATGTATATG
AAATGTGGAGATTTAGACACTGCTGTTGAAATGTTCAACAATTGTGAGCTGGGCGAACGA
GACGTTAGTTCTTGGAATGTTTTGATATCAGGATATGGAGTGCATGGGCATGGGAAGGAA
GCTCTTGAGCTCTTCTCAAGAATGCAAGTGGAGGGTGTTGAACCAAATGATATCACTTTC
ACATCCATTCTTTCCGCTTGTAGTCATGCAGGTCTTATTGATGAAGGTAGGAAGTGTTTT
GCCGATATGACCAAGCTGTCTGTCAGACCTGAGATGAAACATTATGCTTGCATGGTTGAT
ATGCTTGGTCGAGCTGGGTTCTTGAATGAAGCTTTTAGATTGATCAAAAAGATTCCATCA
CGACCAAGTGATGAGGTATGGGGTGCATTACTTTTGGCTTGCAGAATCCATGGGAATACT
GAGTTGGGGGAAATTGCAGCCAATAATCTCTTTCAGCTTGAGCCAGAACATACTGGTTAC
TATGTGCTAATGTCAAATATCTATGCCGCATCAAACAAATGGAAGGAAGTTGAGATGGTG
AGACAAAATATGAAAAGTAGGGGATTGAAGAAGCCTGCAGCCTTCAGTGTGATTGAGTTT
GGAACAGAAGTTCATGGGTTCCACACAGCAGACCAGTCAAGTCCGTACTACAGAGAGGTT
TACAGAAAGGTAGAGAGCTTGGCAATTGAGATGAAGATGGTAGGCTATGTGCCAGACCTG
TCTTGTGTTCTCCATGATGTGGAACCGGAAGACAAGGAGCACTTACTCAACTATCACAGT
GAGAAGTTGGCTGTGGCATTTGGGATAATGAAAATGGACCAAGGAATGCCAATTCAGGTC
ACCAAGAACCTAAGGGTTTGTAGTGATTGTCACTGGGCCTTCAAGTTTATTTCGTCTATT
TATGGCCGGAAGATTATTGTAAGAGATGGCAATCGATTCCATCACTTTCAAGGTGGTAGA
TGCTCATGCGGGGACTATTGGTAA