Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_12s0034g02020.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:12:18216578:18218135:1 gene:VIT_12s0034g02020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGCATTTTCTGGGACTTCTTGGTGATAATTTTACGCTCCCGTTTGTTCTCAAGTCGTGT
GCGGACTTGTCGCGTGTTTGTATGGGGAGATGCGTTCATGGGCAGGGCTTGAGAGTTGGA
TTGGAGGGTGATTTTTACGTGGGGGCTTCTTTGATTGATATGTATGTGAAATGTGGTGTG
ATTGGTGATGCCCGTAAGCTGTTTGATAAAATGATTGTTAGGGATATGGCTTCTTGGAAT
GCTTTGATTGCGGGTTATATGAAAGAGGGCGAGATTGGTGTTGCTGAGGATTTGTTCGAA
CGGATGGAGCACCGGAATATTGTTTCTTGGACTGCGATGATATCAGGCTACACACAGAAT
GGTTTTGCGGAGCAAGCACTGGGTTTGTTTGATGAGATGTTGCAAGACGGTTCAGAGATG
AAGCCCAATTGGGTAACTATTGTGAGTGTTCTCCCTGCTTGTGCTCAGTCAGCTGCTCTT
GAGCGTGGGAGGCGGATTCATGATTTTGCTAATGGAATTGGTTTGCATTTGAATTCATCA
GTGCAGACTGCACTTGCTGGGATGTATGCCAAATGTTATAGCCTTGTTGAAGCTCGATGC
TGTTTTGATATGATAGCTCAAAATGGAAAGAATTTGATTGCTTGGAACACTATGATAACG
GCTTATGCCTCTCATGGCTGTGGCGTAGAAGCAGTTTCAATTTTTGAGAACATGTTAAGA
GCTGGGGTTCAACCTGATGCTGTAACATTCATGGGATTGTTATCTGGATGCAGCCATTCA
GGTCTTATTGATGCTGGCTTGAACCACTTCAATGATATGGGTACAATTCACTCAGTTGAA
CCAAGAGTTGAGCATTATGCATGTGTCGTAGATCTTCTGGGCCGTGCTGGGCGATTGGTG
GAAGCAAAGGAGCTGATTAGTCAAATGCCAATGCAAGCAGGACCAAGCGTTTGGGGTGCA
CTGTTGGCTGCTTGCCGGAGCCACCGAAATTTGGAGATAGCAGAGTTGGCAGCTAGAAGG
CTCTTTGTTTTAGAACCAGATAATAGTGGGAATTATGTTCTCCTATCAAATTTGTATGCT
GAAGCTGGGATGTGGGAGGAGGTAAAGAAGTTGAGGGCTCTTTTAAAATATCAAGGCATG
AAGAAGAGTCCTGGATGCAGTTGGATCGAGATCAATGGGAAATCCCATTTATTTATGGGG
GCTGATAAATCTCACCCACAGGCTAAGGAAATTTACAAATTTTTGGAAGCCCTGCCTGAA
AAGATTAAGATGGCTGGGTACATACCAGATACTAGCTTTGTGTTGCATGATATTAGTGAA
GAAGAAAAAGAATATAACCTTACAACCCACAGTGAGAAGCTGGCAATTGCTTTTGGGCTT
CTTAACACCAGGCCTGGAGTAGTTCTCCGAGTAACAAAAAACCTTCGAATATGTGGAGAC
TGCCATGCGGCTACTAAGTTCATATCAAAAATCTATGAGCGGGAGATAATTGTGAGAGAT
TTGAATCGGTTCCATTGCTTCAAAGATGGTTCTTGTTCTTGTGGAGATTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_12s0034g02020.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:12:18216578:18218135:1 gene:VIT_12s0034g02020 transcript:VIT_12s0034g02020.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MHFLGLLGDNFTLPFVLKSCADLSRVCMGRCVHGQGLRVGLEGDFYVGASLIDMYVKCGV
IGDARKLFDKMIVRDMASWNALIAGYMKEGEIGVAEDLFERMEHRNIVSWTAMISGYTQN
GFAEQALGLFDEMLQDGSEMKPNWVTIVSVLPACAQSAALERGRRIHDFANGIGLHLNSS
VQTALAGMYAKCYSLVEARCCFDMIAQNGKNLIAWNTMITAYASHGCGVEAVSIFENMLR
AGVQPDAVTFMGLLSGCSHSGLIDAGLNHFNDMGTIHSVEPRVEHYACVVDLLGRAGRLV
EAKELISQMPMQAGPSVWGALLAACRSHRNLEIAELAARRLFVLEPDNSGNYVLLSNLYA
EAGMWEEVKKLRALLKYQGMKKSPGCSWIEINGKSHLFMGADKSHPQAKEIYKFLEALPE
KIKMAGYIPDTSFVLHDISEEEKEYNLTTHSEKLAIAFGLLNTRPGVVLRVTKNLRICGD
CHAATKFISKIYEREIIVRDLNRFHCFKDGSCSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_12s0034g02020.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:12:18216578:18218135:1 gene:VIT_12s0034g02020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGCATTTTCTGGGACTTCTTGGTGATAATTTTACGCTCCCGTTTGTTCTCAAGTCGTGT
GCGGACTTGTCGCGTGTTTGTATGGGGAGATGCGTTCATGGGCAGGGCTTGAGAGTTGGA
TTGGAGGGTGATTTTTACGTGGGGGCTTCTTTGATTGATATGTATGTGAAATGTGGTGTG
ATTGGTGATGCCCGTAAGCTGTTTGATAAAATGATTGTTAGGGATATGGCTTCTTGGAAT
GCTTTGATTGCGGGTTATATGAAAGAGGGCGAGATTGGTGTTGCTGAGGATTTGTTCGAA
CGGATGGAGCACCGGAATATTGTTTCTTGGACTGCGATGATATCAGGCTACACACAGAAT
GGTTTTGCGGAGCAAGCACTGGGTTTGTTTGATGAGATGTTGCAAGACGGTTCAGAGATG
AAGCCCAATTGGGTAACTATTGTGAGTGTTCTCCCTGCTTGTGCTCAGTCAGCTGCTCTT
GAGCGTGGGAGGCGGATTCATGATTTTGCTAATGGAATTGGTTTGCATTTGAATTCATCA
GTGCAGACTGCACTTGCTGGGATGTATGCCAAATGTTATAGCCTTGTTGAAGCTCGATGC
TGTTTTGATATGATAGCTCAAAATGGAAAGAATTTGATTGCTTGGAACACTATGATAACG
GCTTATGCCTCTCATGGCTGTGGCGTAGAAGCAGTTTCAATTTTTGAGAACATGTTAAGA
GCTGGGGTTCAACCTGATGCTGTAACATTCATGGGATTGTTATCTGGATGCAGCCATTCA
GGTCTTATTGATGCTGGCTTGAACCACTTCAATGATATGGGTACAATTCACTCAGTTGAA
CCAAGAGTTGAGCATTATGCATGTGTCGTAGATCTTCTGGGCCGTGCTGGGCGATTGGTG
GAAGCAAAGGAGCTGATTAGTCAAATGCCAATGCAAGCAGGACCAAGCGTTTGGGGTGCA
CTGTTGGCTGCTTGCCGGAGCCACCGAAATTTGGAGATAGCAGAGTTGGCAGCTAGAAGG
CTCTTTGTTTTAGAACCAGATAATAGTGGGAATTATGTTCTCCTATCAAATTTGTATGCT
GAAGCTGGGATGTGGGAGGAGGTAAAGAAGTTGAGGGCTCTTTTAAAATATCAAGGCATG
AAGAAGAGTCCTGGATGCAGTTGGATCGAGATCAATGGGAAATCCCATTTATTTATGGGG
GCTGATAAATCTCACCCACAGGCTAAGGAAATTTACAAATTTTTGGAAGCCCTGCCTGAA
AAGATTAAGATGGCTGGGTACATACCAGATACTAGCTTTGTGTTGCATGATATTAGTGAA
GAAGAAAAAGAATATAACCTTACAACCCACAGTGAGAAGCTGGCAATTGCTTTTGGGCTT
CTTAACACCAGGCCTGGAGTAGTTCTCCGAGTAACAAAAAACCTTCGAATATGTGGAGAC
TGCCATGCGGCTACTAAGTTCATATCAAAAATCTATGAGCGGGAGATAATTGTGAGAGAT
TTGAATCGGTTCCATTGCTTCAAAGATGGTTCTTGTTCTTGTGGAGATTATTGGTGAC