Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_11s0103g00560.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:11:16641637:16648979:1 gene:VIT_11s0103g00560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGATTACGGAAACTCTCAGTTCACTTTTGCATCACTGCTCCAAAACCAAGGCACTTCGT
TGTGGTCTTTCCCTTCATGCTGCCGTTTTGAAGACAGGCACACAATCAGATGTTTTTATG
TCCAACCATGTTCTCAACATGTATGCCAAGTGTGGACACACTACCTTTGCTCGTCAAGTG
TTTGATGAAATGTTTGAAAAAAACCTTGTCTCTTGGTCAGCTATGATCTCTGGCTATGAC
CAGGCTGGGGAGCCTCAGATGGCAATTGACCTGTATTCCCAAATGTTCCTTGTTCCAAAT
GAATATGTCTTTGCAAGTGTTATTAGTGCCTGTGCCAGCCTCTCAGCTGTGACTCTAGGG
CAAAAGATTCATTCTCGATCATTGAAGTTTGGCTATGAATCCATCTCTTTTGTCTCCAAC
TCGCTTATCTCTATGTATATGAAATGTAATCAATGTAGTGATGCCTTATCAGTCTTCACT
AATACTCCTGAACCAAATTGTGTCTCCTACAATGCACTAATTACTGGATTTGTGGAAAAC
CAGCAACTGGAAAGAGGGCTTGAATTTTTCAAACTTATGCGCCAACAAGGTCTCATTCCA
GACCGTTTTGCTTTCATGGGAGTTTTGGGGATTTGCACCACTACAGAGAATTTGAAGAGA
GGAGCAGAATTGCATTGCCAGACAGTCAAACTTAATCTTGACTCCACCCCTTTTATTGGC
AATGTGATAATAACAATGTATTCAGAGTTAAATCTAATACAAGAAGCAGAGAAGGCCTTT
AGATTGATTGAAGAGAAAGATGTGATTTCATGGAACACCCTTATTGCTGCTTGTTCTCAT
TGTGATGATCATGCAAAGGGCTTGAGAGTTTTCAAGCACATGACAGAAGAAACTAATGTA
AGGCCTGATGACTTCACTTTTACCAGTGCCCTTGCTGCCTGTGCAGGGCTTGCTTCAATG
AGCCATGGTAAGCAGATACATGCTCATCTAATGAGAACGAGGCTGTATCAGGATCTGGGA
GTTGGCAATGCACTTGTGAACATGTATGCTAAATGTGGTTGTATTGGCTATGCATATGAT
ATATTCAGCAAAATGGTCCATCACAATCTTGTCTCATGGAACACCATAATTGCTGGATTT
GGAAATCATGGGCTTGGGGAGAGAGCTGTAGAACTTTTTGAGCAGATGAATGCAAGTGGG
ATAAGGCCAGATTCAGTTACATTTATTGGACTTCTAACAGCTTGCAATCATGCAGGGCTA
GTAGATAAGGGGCAATTATACTTCAATTCTATGGAAGAAACTTACGGAATTGCCCCTGAC
ATAGAGCATTTCTCTTGTCTTATTGATATGCTGGGACGGGCTGGGAGATTAAATGAGGCA
GAAGAGTACATGAGGAAATTCCCTTTCTGGAATGATCCAGTTGTTCTAGTGAGCTTGCTT
TCTGCTAGCCGTCTGCATGGAGATGTTGTAATTGGGGAGCGTTTGGCTAAATGGCTTCTA
AAACTTCAGCCTGTGACTACTTCTCCTTATGTATTATTATCAAACTTGTATGCTTCAGAT
GGGATGTGGGACAGTGTTGCAGAGGCAAGGAAGAGGTTGAAGGGTAGTGGTTTGAAGAAG
GAGCCTGGCCATAGTCTGATTGAAGTGAATGGAAGTGTAGAAAAGTTTACAATAGGGGAT
TTTACTCACTTGAGGATTAAAGAGATAAAGGGCATACTCAAAACTTTGAGCTGGGCAGTA
GGATCCAACTTTTGGCTTACCAAGAGGCTGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_11s0103g00560.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:11:16641637:16648979:1 gene:VIT_11s0103g00560 transcript:VIT_11s0103g00560.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MITETLSSLLHHCSKTKALRCGLSLHAAVLKTGTQSDVFMSNHVLNMYAKCGHTTFARQV
FDEMFEKNLVSWSAMISGYDQAGEPQMAIDLYSQMFLVPNEYVFASVISACASLSAVTLG
QKIHSRSLKFGYESISFVSNSLISMYMKCNQCSDALSVFTNTPEPNCVSYNALITGFVEN
QQLERGLEFFKLMRQQGLIPDRFAFMGVLGICTTTENLKRGAELHCQTVKLNLDSTPFIG
NVIITMYSELNLIQEAEKAFRLIEEKDVISWNTLIAACSHCDDHAKGLRVFKHMTEETNV
RPDDFTFTSALAACAGLASMSHGKQIHAHLMRTRLYQDLGVGNALVNMYAKCGCIGYAYD
IFSKMVHHNLVSWNTIIAGFGNHGLGERAVELFEQMNASGIRPDSVTFIGLLTACNHAGL
VDKGQLYFNSMEETYGIAPDIEHFSCLIDMLGRAGRLNEAEEYMRKFPFWNDPVVLVSLL
SASRLHGDVVIGERLAKWLLKLQPVTTSPYVLLSNLYASDGMWDSVAEARKRLKGSGLKK
EPGHSLIEVNGSVEKFTIGDFTHLRIKEIKGILKTLSWAVGSNFWLTKRL

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_11s0103g00560.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:11:16641637:16648979:1 gene:VIT_11s0103g00560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

TATGGGAGCTATGAGGGTATTATACAATGGATGTGAGGAACAGGAAAAGAAGAGTTGGAA
AATGTGGTGTTTGAGGAAGATGGTAAATTTGGATGATGCTGAATTTCCTTATATTTTGAG
AATGGCCTTGAGCTGTGACTGAGAGTATTTATTCATGAAGGACTGAATTTGACAGCAAAC
TCTCAAAGATTTCTTGTTTTTTCTTTGGAGTGCACATGTATACCTTAGGTGTACTGGATG
TACCCTTTTTTTGGCTCTTTAATCTATATTTCTCTTTTGCCTATCAAAAACAAACTTAGT
TGGCTTTCGGTTTGTAATTCGAAGGGGGATGGATAATGTTGAGAGGTGTTTGTCTATGTG
TATAGTTCTCCTTGTATAGGGGAGGTGTTTAGTCTTACGTTGATCAAGTTTTATATTTTG
AGGGGAAGACCTCTCATCCTTCTCTTGTACGTTTTATCATAATCAATATATGGTTAATGG
TTTCAAAATCTGGTAGATAATTTTCTCTTTAATGATTACGGAAACTCTCAGTTCACTTTT
GCATCACTGCTCCAAAACCAAGGCACTTCGTTGTGGTCTTTCCCTTCATGCTGCCGTTTT
GAAGACAGGCACACAATCAGATGTTTTTATGTCCAACCATGTTCTCAACATGTATGCCAA
GTGTGGACACACTACCTTTGCTCGTCAAGTGTTTGATGAAATGTTTGAAAAAAACCTTGT
CTCTTGGTCAGCTATGATCTCTGGCTATGACCAGGCTGGGGAGCCTCAGATGGCAATTGA
CCTGTATTCCCAAATGTTCCTTGTTCCAAATGAATATGTCTTTGCAAGTGTTATTAGTGC
CTGTGCCAGCCTCTCAGCTGTGACTCTAGGGCAAAAGATTCATTCTCGATCATTGAAGTT
TGGCTATGAATCCATCTCTTTTGTCTCCAACTCGCTTATCTCTATGTATATGAAATGTAA
TCAATGTAGTGATGCCTTATCAGTCTTCACTAATACTCCTGAACCAAATTGTGTCTCCTA
CAATGCACTAATTACTGGATTTGTGGAAAACCAGCAACTGGAAAGAGGGCTTGAATTTTT
CAAACTTATGCGCCAACAAGGTCTCATTCCAGACCGTTTTGCTTTCATGGGAGTTTTGGG
GATTTGCACCACTACAGAGAATTTGAAGAGAGGAGCAGAATTGCATTGCCAGACAGTCAA
ACTTAATCTTGACTCCACCCCTTTTATTGGCAATGTGATAATAACAATGTATTCAGAGTT
AAATCTAATACAAGAAGCAGAGAAGGCCTTTAGATTGATTGAAGAGAAAGATGTGATTTC
ATGGAACACCCTTATTGCTGCTTGTTCTCATTGTGATGATCATGCAAAGGGCTTGAGAGT
TTTCAAGCACATGACAGAAGAAACTAATGTAAGGCCTGATGACTTCACTTTTACCAGTGC
CCTTGCTGCCTGTGCAGGGCTTGCTTCAATGAGCCATGGTAAGCAGATACATGCTCATCT
AATGAGAACGAGGCTGTATCAGGATCTGGGAGTTGGCAATGCACTTGTGAACATGTATGC
TAAATGTGGTTGTATTGGCTATGCATATGATATATTCAGCAAAATGGTCCATCACAATCT
TGTCTCATGGAACACCATAATTGCTGGATTTGGAAATCATGGGCTTGGGGAGAGAGCTGT
AGAACTTTTTGAGCAGATGAATGCAAGTGGGATAAGGCCAGATTCAGTTACATTTATTGG
ACTTCTAACAGCTTGCAATCATGCAGGGCTAGTAGATAAGGGGCAATTATACTTCAATTC
TATGGAAGAAACTTACGGAATTGCCCCTGACATAGAGCATTTCTCTTGTCTTATTGATAT
GCTGGGACGGGCTGGGAGATTAAATGAGGCAGAAGAGTACATGAGGAAATTCCCTTTCTG
GAATGATCCAGTTGTTCTAGTGAGCTTGCTTTCTGCTAGCCGTCTGCATGGAGATGTTGT
AATTGGGGAGCGTTTGGCTAAATGGCTTCTAAAACTTCAGCCTGTGACTACTTCTCCTTA
TGTATTATTATCAAACTTGTATGCTTCAGATGGGATGTGGGACAGTGTTGCAGAGGCAAG
GAAGAGGTTGAAGGGTAGTGGTTTGAAGAAGGAGCCTGGCCATAGTCTGATTGAAGTGAA
TGGAAGTGTAGAAAAGTTTACAATAGGGGATTTTACTCACTTGAGGATTAAAGAGATAAA
GGGCATACTCAAAACTTTGAGCTGGGCAGTAGGATCCAACTTTTGGCTTACCAAGAGGCT
GTGA