Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_11s0103g00340.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:11:16015035:16018455:1 gene:VIT_11s0103g00340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGCTCAAACCAAAAGCATCTTCACATCTCATTTCCCGCCATTTCACAAAAGCCCTTGCT
AAATCCCAACGTCACGCACAACAAACCCTCACTGACAAGCTATTATCTCTCTTGAAACAA
TGCACTTCCACCAAATCACTCCAACAAATTCACACCCAAATGATCATCAACGCCATTCAC
AAACCCAATTTCCTCCTCCACAGATTCATTGATCTCAAAGACTTCAACAATGCTTCCCTT
CTCTTCTCCCAAATCCCGTATCCCAATGAGTATGCCTTCAACATTATGATCCGCGGCCTA
ACGACCACATGGCAAAAATTCAATCTCACTATTGAGTTTTATTACCAAATGAAGGACTTT
GGCATAAGGCCTAATAATTTCACTTACCCATTTGTGTTTATTGCTTGTGCCAATCTTTTA
GTGTTGAATCATGGGCAATGTGCTCATTCGGGGGTTTTGAAAAGTGGGTTGTGCGCGGAT
GGCCATGTGAGACATTCTTTGATCACGATGTATTCCCGGTGTGGGGAACTGGGGTGTGCT
CGGAGGGTGTTTGATGAAATTAGTGAAAAGGATTTGGTGTCGTGGAATTCGATGATATCG
GGGTATTCAAGGATGGGGTATGCAGGGGATGCGGTGGGGTTGTTTGGAGAAATGAGGGAT
GCAGGGTTTGAACCGGATGAGATGACTTTGGTGAGCATTCTTGGTGCCTGTGGGGACTTG
GGGGACTTGGGTTTGGGAAGTTGGATTGAGGGTTTTGTTGTGGAAAATGAGATGGATTTG
AACTCGTTTGTGGGTTCTGCACTGATTGGTATGTATGGCAAATGTGGGGATTTGTCATCG
GCCAGGAGGGTGTTTGACAGAATGGTGAAGAAAGATGTGGTCACTTGGAATGCTATGATT
ACTGGATATGCACAAAATGGAGTGTCAGATGAAGCAATCATACTATTTAGCGGCATGAGA
GAATCAGGTGTTAACCCAGATAAAATCACATTGGTTGGAGTATTGTCTGCATGTGCCTCA
ATTGGGGCCCTTGACTTTGGAAAGTGGCTTGATACATATGCATCAGAAAGAGGCTTACAA
AATGACATTTACGTTTCTACTGCCTTAATTGATATGTATGCAAAGTGTGGGAGCTTAGAT
GATGCACTTAGAGTTTTTGAAGACATGCCCCAGAAAAATGAGGTGTCTTGGAATGCCATG
ATTTCTGCCCTTGCTTTTCATGGGCGGCCCCAAGAGTCCTTGTCACTATTTAAGCGCATG
TCAAAGGAGGGTGGTGCTGTCCGACCAAATGATATCTCATTTATAGGAGTTCTATCTGCA
TGTGTACATGCTGGTTTGGTTGATGAGGGCCGTCAATTATTTGATTTGATGAGTTCATCT
TTTGGATTGGTTCCAAAAATTGAACACCACTCTTGCATGGTTGATCTTTTGGCACGTGCA
GGACATGTGCATGAAGCTTGGGACTTCATTGAGAAGATGCCTGAAAAACCAGATGAAGTT
GTATTAGGGGCATTGCTCGGTGCCTGTCAGAAACGCAGAAATGTAGATGTCAGTGAGCGT
GTAATGCATATGCTTTTAGAGATGGAGCCTTTGAATTCTGGAAACTATATAATCTCATCA
AAGATATTTGCAAACATGAAGAGGTGGGATGATTCAGCTAGGATGAGAGTGTTGATGAGG
CAGAGGGGTGTCACCAAAACTCCTGGTTGTAGCTGGATTGAGATTGAGAATCAAGTGCAT
GAATTTCATGCTGGTGATGTCTTACACTTCATTTCGCAAGATATGTGCCAGGTAATTAAC
TTGCTAAATGAGGAGATGAAGGTAGAAGGTTATGGTCCAAAGGTTGATTTTCTATAG

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_11s0103g00340.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:11:16015035:16018455:1 gene:VIT_11s0103g00340 transcript:VIT_11s0103g00340.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MLKPKASSHLISRHFTKALAKSQRHAQQTLTDKLLSLLKQCTSTKSLQQIHTQMIINAIH
KPNFLLHRFIDLKDFNNASLLFSQIPYPNEYAFNIMIRGLTTTWQKFNLTIEFYYQMKDF
GIRPNNFTYPFVFIACANLLVLNHGQCAHSGVLKSGLCADGHVRHSLITMYSRCGELGCA
RRVFDEISEKDLVSWNSMISGYSRMGYAGDAVGLFGEMRDAGFEPDEMTLVSILGACGDL
GDLGLGSWIEGFVVENEMDLNSFVGSALIGMYGKCGDLSSARRVFDRMVKKDVVTWNAMI
TGYAQNGVSDEAIILFSGMRESGVNPDKITLVGVLSACASIGALDFGKWLDTYASERGLQ
NDIYVSTALIDMYAKCGSLDDALRVFEDMPQKNEVSWNAMISALAFHGRPQESLSLFKRM
SKEGGAVRPNDISFIGVLSACVHAGLVDEGRQLFDLMSSSFGLVPKIEHHSCMVDLLARA
GHVHEAWDFIEKMPEKPDEVVLGALLGACQKRRNVDVSERVMHMLLEMEPLNSGNYIISS
KIFANMKRWDDSARMRVLMRQRGVTKTPGCSWIEIENQVHEFHAGDVLHFISQDMCQVIN
LLNEEMKVEGYGPKVDFL

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_11s0103g00340.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:11:16015035:16018455:1 gene:VIT_11s0103g00340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGCTCAAACCAAAAGCATCTTCACATCTCATTTCCCGCCATTTCACAAAAGCCCTTGCT
AAATCCCAACGTCACGCACAACAAACCCTCACTGACAAGCTATTATCTCTCTTGAAACAA
TGCACTTCCACCAAATCACTCCAACAAATTCACACCCAAATGATCATCAACGCCATTCAC
AAACCCAATTTCCTCCTCCACAGATTCATTGATCTCAAAGACTTCAACAATGCTTCCCTT
CTCTTCTCCCAAATCCCGTATCCCAATGAGTATGCCTTCAACATTATGATCCGCGGCCTA
ACGACCACATGGCAAAAATTCAATCTCACTATTGAGTTTTATTACCAAATGAAGGACTTT
GGCATAAGGCCTAATAATTTCACTTACCCATTTGTGTTTATTGCTTGTGCCAATCTTTTA
GTGTTGAATCATGGGCAATGTGCTCATTCGGGGGTTTTGAAAAGTGGGTTGTGCGCGGAT
GGCCATGTGAGACATTCTTTGATCACGATGTATTCCCGGTGTGGGGAACTGGGGTGTGCT
CGGAGGGTGTTTGATGAAATTAGTGAAAAGGATTTGGTGTCGTGGAATTCGATGATATCG
GGGTATTCAAGGATGGGGTATGCAGGGGATGCGGTGGGGTTGTTTGGAGAAATGAGGGAT
GCAGGGTTTGAACCGGATGAGATGACTTTGGTGAGCATTCTTGGTGCCTGTGGGGACTTG
GGGGACTTGGGTTTGGGAAGTTGGATTGAGGGTTTTGTTGTGGAAAATGAGATGGATTTG
AACTCGTTTGTGGGTTCTGCACTGATTGGTATGTATGGCAAATGTGGGGATTTGTCATCG
GCCAGGAGGGTGTTTGACAGAATGGTGAAGAAAGATGTGGTCACTTGGAATGCTATGATT
ACTGGATATGCACAAAATGGAGTGTCAGATGAAGCAATCATACTATTTAGCGGCATGAGA
GAATCAGGTGTTAACCCAGATAAAATCACATTGGTTGGAGTATTGTCTGCATGTGCCTCA
ATTGGGGCCCTTGACTTTGGAAAGTGGCTTGATACATATGCATCAGAAAGAGGCTTACAA
AATGACATTTACGTTTCTACTGCCTTAATTGATATGTATGCAAAGTGTGGGAGCTTAGAT
GATGCACTTAGAGTTTTTGAAGACATGCCCCAGAAAAATGAGGTGTCTTGGAATGCCATG
ATTTCTGCCCTTGCTTTTCATGGGCGGCCCCAAGAGTCCTTGTCACTATTTAAGCGCATG
TCAAAGGAGGGTGGTGCTGTCCGACCAAATGATATCTCATTTATAGGAGTTCTATCTGCA
TGTGTACATGCTGGTTTGGTTGATGAGGGCCGTCAATTATTTGATTTGATGAGTTCATCT
TTTGGATTGGTTCCAAAAATTGAACACCACTCTTGCATGGTTGATCTTTTGGCACGTGCA
GGACATGTGCATGAAGCTTGGGACTTCATTGAGAAGATGCCTGAAAAACCAGATGAAGTT
GTATTAGGGGCATTGCTCGGTGCCTGTCAGAAACGCAGAAATGTAGATGTCAGTGAGCGT
GTAATGCATATGCTTTTAGAGATGGAGCCTTTGAATTCTGGAAACTATATAATCTCATCA
AAGATATTTGCAAACATGAAGAGGTGGGATGATTCAGCTAGGATGAGAGTGTTGATGAGG
CAGAGGGGTGTCACCAAAACTCCTGGTTGTAGCTGGATTGAGATTGAGAATCAAGTGCAT
GAATTTCATGCTGGTGATGTCTTACACTTCATTTCGCAAGATATGTGCCAGGTAATTAAC
TTGCTAAATGAGGAGATGAAGGTAGAAGGTTATGGTCCAAAGGTTGATTTTCTATAG