Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_11s0037g00530.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:11:8370681:8375172:1 gene:VIT_11s0037g00530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Cellulose synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:D7U1D5]
Sequence	ATGGAAGCCAGTGCTGGCCTGGTCGCTGGATCCCATAACCGGAACGAGCTTGTTGTCATT CATGGCCATGAGGAGCCCAAGCCCTTGAGGTCTTTGAATGGTCAGGTGTGTGAGATATGC GGTGACGAAATCGGTCTGACGGTGGATGGAGAGGTGTTTGTGGCCTGCAATGAGTGTGGT TTTCCGGTTTGCCGGCCTTGCTATGAGTATGAAAGGAGAGAAGGGAGCCAGCTTTGCCCT CAGTGCAAGACCAGATTCAAGCGTCTCAAAGGGTGTGCAAGGGTGGAGGGGGATGACGAT GAAGAAGACATTGATGATATTGAACATGAATTCAACATCGATGATGAACAAAACAAGAAT AAGCTTATCGCAGAAGCTATGCTTCATGGGAAGATGAGCTATGGACGTGGCCCTGAAGAT GACGATAACGCTCAATTCCCACCTGTTATAACTGGTGTTCGATCCAGACCTGTGAGTGGA GAGTTCCCAATTTCGTCTCATGCCCCTGGAGAGCAGGGGCTGTCATCTTCACTTCATAAA CGTGTGCACCCTTATCCAGTGTCTGAACCAGGAAGCGCGAGATGGGATGAGAAGAAAGAG GGAGGGTGGAAAGAGCGAATGGATGACTGGAAAATGCAGCAAGGGAACCTCGGCCCTGAC GCTGACGACTACAATGACCCTGACATGGCCATGATTGAGGAAGCGAGGCAGCCACTGTCA AGGAAAGTACCGATTGCTTCAAGCAAGGTCAACCCTTACAGAATGGTGATCGTGGCTCGG CTTCTTGTTTTGGCGTTCTTCCTTCGCTATAGAATTTTGAATCCTGTACATGATGCCCTT GGGCTTTGGCTAGTGTCTGTGATATGTGAGATCTGGTTTGCCTTCTCATGGATTCTTGAT CAGTTCCCCAAGTGGTTCCCCATTGATCGCGAGACATATCTTGATCGCCTTTCTTTCAGG TATGAGAGGGAAGGGGAGCCCAATATGCTCTCTCCGGTGGATATCTTTGTCAGTACTGTG GATCCCTTGAAGGAACCTCCACTTGTTACAGCTAACACAGTTCTTTCAATCCTCGCCATG GACTACCCTGTCGACAAAATCTCATGCTACATCTCAGATGATGGAGCTTCCATCCTGACC TTTGAAGCACTCTCTGAAACTGCAGAATTCGCTAGGAGATGGGTTCCCTTCTGCAAGAAA TTCTCCATAGAGCCTCGAGCTCCTGAGATGTACTTCTCTCTCAAGATTGATTATCTCAAG GACAAAGTCCAGCCTACCTTTGTTAAGGAGCGCCGCGCTATGAAGAGGGAATATGAAGAA TTCAAGGTCCGGATCAATGCAATTGTTGCAAAGGCCGTGAAAGTTCCTCCAGAAGGGTGG ATCATGCAAGATGGAACTCCATGGCCGGGGAACAACACCAAGGATCACCCAGGTATGATT CAGGTTTTTCTTGGACACAGTGGAGGTCTCGATGCAGAAGGAAATGAGCTGCCTCGCCTT GTCTATGTCTCTCGTGAGAAGAGGCCTGGTTTCCATCATCACAAGAAAGCTGGGGCCATG AATGCCCTGATTCGTGTCTCCGCAGTCCTCACAAATGCTCCTTTCATGCTTAACTTGGAT TGTGATCATTATCTAAACAATAGCAAGGCTGTTCGAGAGGCAATGTGCTTCTTGATGGAT CCACAAACTGGAAGGAAGGTTTGTTATGTCCAATTCCCTCAAAGATTTGATGGCATAGAT AGGAACGATCGATATGCCAACAGAAACACAGTCTTCTTTGATATTAACATGAAGGGTCTA GATGGGATTCAGGGCCCGGTATATGTGGGTACTGGATGTGTTTTCAGAAGACAAGCCCTA TATGGATATGATCCTCCAAAGGGTCCCAAGCGCCCGAAGATGGTAAGCTGTGATTGCTGC CCCTGTTTTGGACGCCGCAAAAAGCTTCAAAAGTATGCTAAACATGGTGAAAATGGAGAA GGATTGGAAGAAGACAAAGAAATGTTGATGTCTCAGATGAACTTTGAAAAGAAATTTGGA CAGTCAGCTATTTTCGTAACCTCTACTTTAATGGAGCAAGGTGGTGTCCCTCCTTCCTCA AGTCCAGCAGCCCTGCTTAAGGAAGCCATTCATGTCATCAGCTGTGGCTATGAAGACAAA ACTGACTGGGGATTGGAGTTGGGATGGATATATGGGTCCATTACAGAGGATATTCTAACA GGGTTCAAGATGCATTGCCGTGGTTGGAGGTCTATATACTGCATGCCAAAGAGACCAGCA TTTAAGGGGTCAGCTCCCATTAACTTGTCTGATCGTCTCAACCAGGTGCTTCGGTGGGCT CTTGGCTCTGTTGAAATCTTCTTCAGTCGTCACAGCCCTGTCTGGTATGGCTACAAGGGA GGAAACCTCAAGTGGCTCGAGCGATTTGCATATGTCAACACAACAGTCTATCCCTTCACC TCCTTACCTCTCCTTGCCTATTGTACTCTTCCTGCCATCTGCTTGCTCACCGGAAAATTC ATCATGCCGACGATAAGCACTTTCGCAAGTCTCTTCTTCATTGCTCTCTTTATCTCTATC TTCGCAACTGGCATTCTGGAACTGAGGTGGAGTGGAGTGAGCATTGAGGAATGGTGGAGA AATGAGCAGTTCTGGGTCATTGGTGGTGTGTCAGCTCATCTCTTTGCAGTGGTGCAGGGT CTTCTGAAGGTTTTGGCTGGAATAGATACCAACTTCACAGTCACATCAAAGGCAGTCGAT GATGAGGAGTTCGGGGAGCTGTATACCTTCAAATGGACCACCCTCCTTATCCCTCCAACC ACTCTCTTAATCATCAACCTTGTTGGAGTAGTGGCTGGGATCTCTGATGCCATAAACAAT GGGTACCAATCATGGGGACCTCTATTCGGGAAGCTCTTCTTTGCCTTCTGGGTGATTGTT CATCTCTACCCATTCCTCAAAGGTCTCATGGGGCGGCAGAACCGGACACCTACCATTGTT GTCATATGGTCTGTGCTTCTGGCTTCTATCTTCTCCTTGCTTTGGGTCCGAATTGACCCA TTCATATTAAAGACCAAGGGACCTGATGTTAAGCAATGTGGAATCAATTGCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_11s0037g00530.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:11:8370681:8375172:1 gene:VIT_11s0037g00530 transcript:VIT_11s0037g00530.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Cellulose synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:D7U1D5]
Sequence	MEASAGLVAGSHNRNELVVIHGHEEPKPLRSLNGQVCEICGDEIGLTVDGEVFVACNECG FPVCRPCYEYERREGSQLCPQCKTRFKRLKGCARVEGDDDEEDIDDIEHEFNIDDEQNKN KLIAEAMLHGKMSYGRGPEDDDNAQFPPVITGVRSRPVSGEFPISSHAPGEQGLSSSLHK RVHPYPVSEPGSARWDEKKEGGWKERMDDWKMQQGNLGPDADDYNDPDMAMIEEARQPLS RKVPIASSKVNPYRMVIVARLLVLAFFLRYRILNPVHDALGLWLVSVICEIWFAFSWILD QFPKWFPIDRETYLDRLSFRYEREGEPNMLSPVDIFVSTVDPLKEPPLVTANTVLSILAM DYPVDKISCYISDDGASILTFEALSETAEFARRWVPFCKKFSIEPRAPEMYFSLKIDYLK DKVQPTFVKERRAMKREYEEFKVRINAIVAKAVKVPPEGWIMQDGTPWPGNNTKDHPGMI QVFLGHSGGLDAEGNELPRLVYVSREKRPGFHHHKKAGAMNALIRVSAVLTNAPFMLNLD CDHYLNNSKAVREAMCFLMDPQTGRKVCYVQFPQRFDGIDRNDRYANRNTVFFDINMKGL DGIQGPVYVGTGCVFRRQALYGYDPPKGPKRPKMVSCDCCPCFGRRKKLQKYAKHGENGE GLEEDKEMLMSQMNFEKKFGQSAIFVTSTLMEQGGVPPSSSPAALLKEAIHVISCGYEDK TDWGLELGWIYGSITEDILTGFKMHCRGWRSIYCMPKRPAFKGSAPINLSDRLNQVLRWA LGSVEIFFSRHSPVWYGYKGGNLKWLERFAYVNTTVYPFTSLPLLAYCTLPAICLLTGKF IMPTISTFASLFFIALFISIFATGILELRWSGVSIEEWWRNEQFWVIGGVSAHLFAVVQG LLKVLAGIDTNFTVTSKAVDDEEFGELYTFKWTTLLIPPTTLLIINLVGVVAGISDAINN GYQSWGPLFGKLFFAFWVIVHLYPFLKGLMGRQNRTPTIVVIWSVLLASIFSLLWVRIDP FILKTKGPDVKQCGINC

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_11s0037g00530.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:11:8370681:8375172:1 gene:VIT_11s0037g00530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding description:Cellulose synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:D7U1D5]
Sequence	CATTGTCCACCATGGAAGCCAGTGCTGGCCTGGTCGCTGGATCCCATAACCGGAACGAGC TTGTTGTCATTCATGGCCATGAGGAGCCCAAGCCCTTGAGGTCTTTGAATGGTCAGGTGT GTGAGATATGCGGTGACGAAATCGGTCTGACGGTGGATGGAGAGGTGTTTGTGGCCTGCA ATGAGTGTGGTTTTCCGGTTTGCCGGCCTTGCTATGAGTATGAAAGGAGAGAAGGGAGCC AGCTTTGCCCTCAGTGCAAGACCAGATTCAAGCGTCTCAAAGGGTGTGCAAGGGTGGAGG GGGATGACGATGAAGAAGACATTGATGATATTGAACATGAATTCAACATCGATGATGAAC AAAACAAGAATAAGCTTATCGCAGAAGCTATGCTTCATGGGAAGATGAGCTATGGACGTG GCCCTGAAGATGACGATAACGCTCAATTCCCACCTGTTATAACTGGTGTTCGATCCAGAC CTGTGAGTGGAGAGTTCCCAATTTCGTCTCATGCCCCTGGAGAGCAGGGGCTGTCATCTT CACTTCATAAACGTGTGCACCCTTATCCAGTGTCTGAACCAGGAAGCGCGAGATGGGATG AGAAGAAAGAGGGAGGGTGGAAAGAGCGAATGGATGACTGGAAAATGCAGCAAGGGAACC TCGGCCCTGACGCTGACGACTACAATGACCCTGACATGGCCATGATTGAGGAAGCGAGGC AGCCACTGTCAAGGAAAGTACCGATTGCTTCAAGCAAGGTCAACCCTTACAGAATGGTGA TCGTGGCTCGGCTTCTTGTTTTGGCGTTCTTCCTTCGCTATAGAATTTTGAATCCTGTAC ATGATGCCCTTGGGCTTTGGCTAGTGTCTGTGATATGTGAGATCTGGTTTGCCTTCTCAT GGATTCTTGATCAGTTCCCCAAGTGGTTCCCCATTGATCGCGAGACATATCTTGATCGCC TTTCTTTCAGGTATGAGAGGGAAGGGGAGCCCAATATGCTCTCTCCGGTGGATATCTTTG TCAGTACTGTGGATCCCTTGAAGGAACCTCCACTTGTTACAGCTAACACAGTTCTTTCAA TCCTCGCCATGGACTACCCTGTCGACAAAATCTCATGCTACATCTCAGATGATGGAGCTT CCATCCTGACCTTTGAAGCACTCTCTGAAACTGCAGAATTCGCTAGGAGATGGGTTCCCT TCTGCAAGAAATTCTCCATAGAGCCTCGAGCTCCTGAGATGTACTTCTCTCTCAAGATTG ATTATCTCAAGGACAAAGTCCAGCCTACCTTTGTTAAGGAGCGCCGCGCTATGAAGAGGG AATATGAAGAATTCAAGGTCCGGATCAATGCAATTGTTGCAAAGGCCGTGAAAGTTCCTC CAGAAGGGTGGATCATGCAAGATGGAACTCCATGGCCGGGGAACAACACCAAGGATCACC CAGGTATGATTCAGGTTTTTCTTGGACACAGTGGAGGTCTCGATGCAGAAGGAAATGAGC TGCCTCGCCTTGTCTATGTCTCTCGTGAGAAGAGGCCTGGTTTCCATCATCACAAGAAAG CTGGGGCCATGAATGCCCTGATTCGTGTCTCCGCAGTCCTCACAAATGCTCCTTTCATGC TTAACTTGGATTGTGATCATTATCTAAACAATAGCAAGGCTGTTCGAGAGGCAATGTGCT TCTTGATGGATCCACAAACTGGAAGGAAGGTTTGTTATGTCCAATTCCCTCAAAGATTTG ATGGCATAGATAGGAACGATCGATATGCCAACAGAAACACAGTCTTCTTTGATATTAACA TGAAGGGTCTAGATGGGATTCAGGGCCCGGTATATGTGGGTACTGGATGTGTTTTCAGAA GACAAGCCCTATATGGATATGATCCTCCAAAGGGTCCCAAGCGCCCGAAGATGGTAAGCT GTGATTGCTGCCCCTGTTTTGGACGCCGCAAAAAGCTTCAAAAGTATGCTAAACATGGTG AAAATGGAGAAGGATTGGAAGAAGACAAAGAAATGTTGATGTCTCAGATGAACTTTGAAA AGAAATTTGGACAGTCAGCTATTTTCGTAACCTCTACTTTAATGGAGCAAGGTGGTGTCC CTCCTTCCTCAAGTCCAGCAGCCCTGCTTAAGGAAGCCATTCATGTCATCAGCTGTGGCT ATGAAGACAAAACTGACTGGGGATTGGAGTTGGGATGGATATATGGGTCCATTACAGAGG ATATTCTAACAGGGTTCAAGATGCATTGCCGTGGTTGGAGGTCTATATACTGCATGCCAA AGAGACCAGCATTTAAGGGGTCAGCTCCCATTAACTTGTCTGATCGTCTCAACCAGGTGC TTCGGTGGGCTCTTGGCTCTGTTGAAATCTTCTTCAGTCGTCACAGCCCTGTCTGGTATG GCTACAAGGGAGGAAACCTCAAGTGGCTCGAGCGATTTGCATATGTCAACACAACAGTCT ATCCCTTCACCTCCTTACCTCTCCTTGCCTATTGTACTCTTCCTGCCATCTGCTTGCTCA CCGGAAAATTCATCATGCCGACGATAAGCACTTTCGCAAGTCTCTTCTTCATTGCTCTCT TTATCTCTATCTTCGCAACTGGCATTCTGGAACTGAGGTGGAGTGGAGTGAGCATTGAGG AATGGTGGAGAAATGAGCAGTTCTGGGTCATTGGTGGTGTGTCAGCTCATCTCTTTGCAG TGGTGCAGGGTCTTCTGAAGGTTTTGGCTGGAATAGATACCAACTTCACAGTCACATCAA AGGCAGTCGATGATGAGGAGTTCGGGGAGCTGTATACCTTCAAATGGACCACCCTCCTTA TCCCTCCAACCACTCTCTTAATCATCAACCTTGTTGGAGTAGTGGCTGGGATCTCTGATG CCATAAACAATGGGTACCAATCATGGGGACCTCTATTCGGGAAGCTCTTCTTTGCCTTCT GGGTGATTGTTCATCTCTACCCATTCCTCAAAGGTCTCATGGGGCGGCAGAACCGGACAC CTACCATTGTTGTCATATGGTCTGTGCTTCTGGCTTCTATCTTCTCCTTGCTTTGGGTCC GAATTGACCCATTCATATTAAAGACCAAGGGACCTGATGTTAAGCAATGTGGAATCAATT GCTGAAGCATCACTTCCACTTCTTTGTTT