Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_11s0016g05410.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:11:4745581:4749038:1 gene:VIT_11s0016g05410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGCCTATGTCTACCCTCGTCAATTACAGTGGGGACGATGATTTCTATCCTGGGGGGTCA
TTTTACATAAATCCCATGGATTCCGGCTTATTGGTTTCAATTGGCTCCTGTATGGATGTA
TACTGCCCTCCTCGCAAGCGGTCTCGCATTACTGCTCCATATATCTTCAGGGAAAACAAC
CTTGAGCTGGAAAAGCGACCATCCATTGATGTTCTTCCAGATGAATGCCTCTTTGAGATC
TTGAGACGCCTTCCTGGAGGCCAAGAGAGGAGCTCCTGCGCTCGGGTCTCCAAGCGGTGG
CTTATGCTCCTTAGCAGTATCCGTAGGACTGAGATCTGCCCAAGAAAGAGCTCTCAATCT
TTGAATGAGTCCTCAAAGCTGGACAAGGAGTTAACCATTCCCGTTCCTGATGATATTGAA
ATGATCTCTGCTGAAGATCGGGAACTTGGGAGTGATGGGTACCTTACAAGATGTTTGGAA
GGGAAGAAGGCAACAGATATAAGCCTTGCTGCTATTGCAGTTGGAACCAGTAGTCGAGGG
GGATTGGGAAAGCTTTCAATCAGGGAGAGCAGTTCTTCTCGTGGAGTTACCAACCTTGGT
CTTTCCAAAATTGCCCATGGTTGCCCTTCTCTAAGGGTTCTTTCTCTGTGGAATGTCTCA
GCTGTTGGGGATGAAGGTCTATTTGAGATAGGTAACGGATGCCACATGTTAGAGAAGCTC
GATCTCTGTCAGTGTCCTTTGATTTCCGACAAGGGTTTGATTGCTATTGCAAAGAATTGC
CCTAATTTGACTGCTTTAACAATTGAGTCTTGTGCAAACATTGGGAATGAGAGCTTGCAA
GCTATTGGAAGTCTCTGCCCCAAACTACAATCCATCTCTATCAAAGACTGCCCTCTTGTT
GGGGATCAAGGAGTTGCTGGTCTGTTATCATCAGCGACTTCTATCCTTTCCAGGGTAAAG
CTTCAATCCTTGAACATCACAGATTTCTCTCTTGCCGTAGTTGGGCACTATGGCAAGGCT
ATCACCAGTCTTACCCTCAGTGGTCTCCAAAATGTGAGTGAGAAAGGCTTTTGGGTCATG
GGCAATGCCATGGGCCTCCAGACCCTGATCTCTTTGACAATTACTTCCTGCCGGGGTATA
ACAGATGTGAGTCTTGAAGCCATGGGAAAGGGTTGTCCCAATCTAAAACAGATGTGTCTG
CGGAAGTGTTGCTTTGTATCTGACAATGGGCTGATTGCCTTTGCAAAAGCTGCAGGATCT
CTTGAGGGCCTGCAATTGGAGGAGTGCAACAGGGTCACCCAGTTGGGGGTTATTGGTTCC
CTTTCAAATTGTGGATCTAAATTAAAATCTCTTTCACTGGTGAAATGCATGGGAATCAAG
GACATAGCTGTGGGAACACCTATGCTCTCTCCTTGCCACTCTCTTCGGTCCTTGTCCATC
CGAAACTGCCCAGGGTTTGGCAGCGCTAGCTTGGCAATGGTGGGAAAGTTATGCCCTCAA
TTGCATCATGTTGATCTGAGCGGACTTGATGGAATGACAGATGCTGGGCTTCTCCCACTT
CTTGAAAGCTGTGAGGCAGGACTTGCCAAGGTGAACCTTAGTGGCTGCTTGAATTTGACA
GATGAGGTGGTTTTAGCCATGGCTAGGCTGCATGGTGAAACCCTCGAACTGCTGAATCTT
GATGGGTGCAGGAAGATTACTGATGCAAGCTTGGTGGCGATTGCAGATAATTGTCTATTA
CTTAATGATCTCGATTTATCAAAGTGTGCAATTACTGATTCTGGCATTGCTGCTCTGTCC
TGTGGAGAGAAGCTCAATTTGCAAATCCTTTCAGTGTCAGGTTGTTCTAAGGTATCAAAC
AAGAGCATGCCTTCTTTATGCAAATTGGGCAAGACTCTGCTGGGCCTGAATCTCCAACAC
TGCAATAAAATCAGCAGCAGCTCAGTCGAGCTGCTTATGGAGAGCTTGTGGAGGTGTGAT
ATCCTCTTCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_11s0016g05410.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:11:4745581:4749038:1 gene:VIT_11s0016g05410 transcript:VIT_11s0016g05410.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MPMSTLVNYSGDDDFYPGGSFYINPMDSGLLVSIGSCMDVYCPPRKRSRITAPYIFRENN
LELEKRPSIDVLPDECLFEILRRLPGGQERSSCARVSKRWLMLLSSIRRTEICPRKSSQS
LNESSKLDKELTIPVPDDIEMISAEDRELGSDGYLTRCLEGKKATDISLAAIAVGTSSRG
GLGKLSIRESSSSRGVTNLGLSKIAHGCPSLRVLSLWNVSAVGDEGLFEIGNGCHMLEKL
DLCQCPLISDKGLIAIAKNCPNLTALTIESCANIGNESLQAIGSLCPKLQSISIKDCPLV
GDQGVAGLLSSATSILSRVKLQSLNITDFSLAVVGHYGKAITSLTLSGLQNVSEKGFWVM
GNAMGLQTLISLTITSCRGITDVSLEAMGKGCPNLKQMCLRKCCFVSDNGLIAFAKAAGS
LEGLQLEECNRVTQLGVIGSLSNCGSKLKSLSLVKCMGIKDIAVGTPMLSPCHSLRSLSI
RNCPGFGSASLAMVGKLCPQLHHVDLSGLDGMTDAGLLPLLESCEAGLAKVNLSGCLNLT
DEVVLAMARLHGETLELLNLDGCRKITDASLVAIADNCLLLNDLDLSKCAITDSGIAALS
CGEKLNLQILSVSGCSKVSNKSMPSLCKLGKTLLGLNLQHCNKISSSSVELLMESLWRCD
ILF

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_11s0016g05410.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:11:4745581:4749038:1 gene:VIT_11s0016g05410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

CTTCTTCTTCTTCTGCTTCTTCTTGGTGTTCGTGTTGGCTCTTCAGTCATGCCTATGTCT
ACCCTCGTCAATTACAGTGGGGACGATGATTTCTATCCTGGGGGGTCATTTTACATAAAT
CCCATGGATTCCGGCTTATTGGTTTCAATTGGCTCCTGTATGGATGTATACTGCCCTCCT
CGCAAGCGGTCTCGCATTACTGCTCCATATATCTTCAGGGAAAACAACCTTGAGCTGGAA
AAGCGACCATCCATTGATGTTCTTCCAGATGAATGCCTCTTTGAGATCTTGAGACGCCTT
CCTGGAGGCCAAGAGAGGAGCTCCTGCGCTCGGGTCTCCAAGCGGTGGCTTATGCTCCTT
AGCAGTATCCGTAGGACTGAGATCTGCCCAAGAAAGAGCTCTCAATCTTTGAATGAGTCC
TCAAAGCTGGACAAGGAGTTAACCATTCCCGTTCCTGATGATATTGAAATGATCTCTGCT
GAAGATCGGGAACTTGGGAGTGATGGGTACCTTACAAGATGTTTGGAAGGGAAGAAGGCA
ACAGATATAAGCCTTGCTGCTATTGCAGTTGGAACCAGTAGTCGAGGGGGATTGGGAAAG
CTTTCAATCAGGGAGAGCAGTTCTTCTCGTGGAGTTACCAACCTTGGTCTTTCCAAAATT
GCCCATGGTTGCCCTTCTCTAAGGGTTCTTTCTCTGTGGAATGTCTCAGCTGTTGGGGAT
GAAGGTCTATTTGAGATAGGTAACGGATGCCACATGTTAGAGAAGCTCGATCTCTGTCAG
TGTCCTTTGATTTCCGACAAGGGTTTGATTGCTATTGCAAAGAATTGCCCTAATTTGACT
GCTTTAACAATTGAGTCTTGTGCAAACATTGGGAATGAGAGCTTGCAAGCTATTGGAAGT
CTCTGCCCCAAACTACAATCCATCTCTATCAAAGACTGCCCTCTTGTTGGGGATCAAGGA
GTTGCTGGTCTGTTATCATCAGCGACTTCTATCCTTTCCAGGGTAAAGCTTCAATCCTTG
AACATCACAGATTTCTCTCTTGCCGTAGTTGGGCACTATGGCAAGGCTATCACCAGTCTT
ACCCTCAGTGGTCTCCAAAATGTGAGTGAGAAAGGCTTTTGGGTCATGGGCAATGCCATG
GGCCTCCAGACCCTGATCTCTTTGACAATTACTTCCTGCCGGGGTATAACAGATGTGAGT
CTTGAAGCCATGGGAAAGGGTTGTCCCAATCTAAAACAGATGTGTCTGCGGAAGTGTTGC
TTTGTATCTGACAATGGGCTGATTGCCTTTGCAAAAGCTGCAGGATCTCTTGAGGGCCTG
CAATTGGAGGAGTGCAACAGGGTCACCCAGTTGGGGGTTATTGGTTCCCTTTCAAATTGT
GGATCTAAATTAAAATCTCTTTCACTGGTGAAATGCATGGGAATCAAGGACATAGCTGTG
GGAACACCTATGCTCTCTCCTTGCCACTCTCTTCGGTCCTTGTCCATCCGAAACTGCCCA
GGGTTTGGCAGCGCTAGCTTGGCAATGGTGGGAAAGTTATGCCCTCAATTGCATCATGTT
GATCTGAGCGGACTTGATGGAATGACAGATGCTGGGCTTCTCCCACTTCTTGAAAGCTGT
GAGGCAGGACTTGCCAAGGTGAACCTTAGTGGCTGCTTGAATTTGACAGATGAGGTGGTT
TTAGCCATGGCTAGGCTGCATGGTGAAACCCTCGAACTGCTGAATCTTGATGGGTGCAGG
AAGATTACTGATGCAAGCTTGGTGGCGATTGCAGATAATTGTCTATTACTTAATGATCTC
GATTTATCAAAGTGTGCAATTACTGATTCTGGCATTGCTGCTCTGTCCTGTGGAGAGAAG
CTCAATTTGCAAATCCTTTCAGTGTCAGGTTGTTCTAAGGTATCAAACAAGAGCATGCCT
TCTTTATGCAAATTGGGCAAGACTCTGCTGGGCCTGAATCTCCAACACTGCAATAAAATC
AGCAGCAGCTCAGTCGAGCTGCTTATGGAGAGCTTGTGGAGGTGTGATATCCTCTTCTAA
GCAACAAAAAATTGGCAAATATGAAGGTGTTCAACCAGATCAGGAATTTCAAGAACTTGC
AGTTTGGAAAGATAGTTGAAGCATGATGCTCGTACAGTCAGCTCACACGTAGCAATGTAG
TTTTTTGGCTCTCCGCTGTGGGCCTGCTGGTAGCTCAGTGGTTTGGTTGTTTTCCAGGGG
ACTTTGGCGGTTCACTTTTCCACCCTCTTTTTGCAGGTTTTCTATCATTGGAAAGCTTGT
TACAACTGTTTGGCCTCCCATTAACGGGAGGCCACCTCTTTCATGGCCATGGTTCCCTGA
GAATACAGTCACCAAGTCCTGGTTTTAGGTTACCACTAGTGTTTGGTCCTGGTTTTGTAT
TGCTGGGTGTGCTATACCTGGTGTTTTAGCTTTGTCACACATTCCTTTGATGGTGTGGCT
GGACTAAGCTTTCTCTATTTTCAGTCCTACAATCTGTTTTCTGGGTCAGTCCATATTAGT
TGCAAGTGTCCTTACGAGCCTTGTGTTTGCAACTCTTTCCAAGAGTTGAGAGTCCTTGTT
TTTCCTTTTATTTAAGTTCCTAGTTAATGGTTGCTTTGGACAGTTCCTGGTGGGGGGGCT
TGTTTTTACGGGCTTTGGCCGTGGCTACGTCATTCAGCTTGCCACCACAACCCTGATGGT
TGTTTTTTTGTAACCAAGTCCTTATCTGCGTATGAATTGTACTCTGCAACAACTTTGTTA
TTAAGTAAAGGATTGGGATTTTGCCATTTTT