Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_11s0016g04640.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:11:3966363:3968501:1 gene:VIT_11s0016g04640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGCTACTCCTTTATCCCTCCACCACCCTAGACCACCCTTACCCACGGAATATCCTCTT
CCTTTGAGGAACGCTGCAACCACCGCTAACAACAACAATATTAACAGCCAAATTCAACTA
CACCCATGTCTGCTATCACTGGAAAAATGCACCACCATGTCCCAGCTCAAGCAAATCCAT
GCCCAAATGCTCAGGACTTGCCTCTTCGTTGACCCCTTCTCTGCCAGTAAAATCGTCGCC
TTTTGTGCCCTCCACGACTCTGGAAGCCTCCCTTACGCCCGTCTCGTCTTCAACCAAATC
CCCAATCCCACCACCTTCACCTGTAACTCCATAATCCGGGGTTACACCAACAAGAATTTG
CCCCGCCAAGCTATTCTTTTCTATCAACTAATGATGCTCCAGGGGTTGGACCCCGACAGG
TTCACATTCCCTTCTTTGTTTAAATCATGTGGGGTTTTGTGTGAAGGAAAACAGCTGCAT
TGTCACTCTACAAAATTGGGGTTCGCGTCTGACGCTTATATTCAAAACACATTGATGAAC
ATGTACTCGAATTGTGGATGTTTGGTTTCAGCCCGAAAAGTGTTTGATAAAATGGTTAAC
AAAAGTGTGGTTTCTTGGGCAACCATGATTGGGGCTTATGCGCAATGGGATCTGCCCCAT
GAAGCCATCAAGCTGTTCAGGAGAATGGAAATTGCGAGTGTGAAGCCGAATGAGATTACT
TTGGTGAATGTGTTAACAGCATGTGCGAGATCAAGAGATTTGGAAACGGCCAAGCAGGTG
CACAAGTATATTGATGAGACTGGAATCGGGTTCCACACGGTCCTAACCTCTGCTCTCATG
GATGTTTATTGCAAGTGCGGCTGCTACCCACTTGCCCGGGATTTATTCAATAAGATGCCT
GAAAAGAACTTGTTTTGTTGGAACATCATGATTAATGGACATGTTGAGGATAGTGATTAT
GAGGAGGCTTTGTCACTCTTCAATGAGATGCAACTCAGCGGTGTTAAAGGGGATAAGGTG
ACTATGGCAAGCTTATTGATCGCTTGCACTCATCTGGGTGCTCTTGAGCTTGGCAAGTGG
TTGCATGTTTATATTGAGAAGGAGAAAATTGAGGTGGATGTTGCCTTGGGAACGGCACTT
GTGGACATGTATGCAAAATGTGGAAGTATAGAAAGTGCAATGAGAGTCTTCCAAGAGATG
CCTGAAAAAGATGTTATGACTTGGACAGCCTTGATTGTTGGTCTTGCGATGTGCGGACAA
GGGTTGAAAGCTTTGGAACTTTTCCATGAGATGCAGATGAGTGAGGTGAAACCAGATGCA
ATCACCTTCGTTGGGGTTTTGGCTGCTTGCAGTCATGCAGGATTGGTGAATGAAGGAATT
GCATATTTTAATTCCATGCCTAATAAATATGGCATTCAGCCTAGCATTGAGCATTATGGT
TGTATGGTTGACATGCTAGGGCGGGCTGGTCGAATAGCTGAAGCAGAGGATTTGATACAG
AACATGCCAATGGCGCCAGATTATTTTGTTTTGGTAGGCCTTCTTAGCGCCTGCAGAATT
CATGGCAATCTCGTGGTGGCAGAAAGAGCAGCCCAACAACTTATAGAGCTAGACCCAAAA
AATGGAGGAACCTATGTGCTTTTATCAAACATATACAGCTCAATGAAGAACTGGGAAGCA
GCTAAAAAAATGAGGGAACTCATGGTAGAAAGAAACATTAAGAAGCCCCCAGGATGCAGT
GCGATAGAGGTTGGTGGTGTTGTGCATGAGTTCGTCAAGGGTGATGTCTCGCATCCACAA
TCCTCAGAAATTTATGAAACCTTGGATGATATGATGCGCAGGTTAAAGTCAGCTGGTTAT
GTTCCTGATAAATCAGAAGTGTTGTTTGACATGGATGAAAAGGAAAAGGAGAATGAGCTT
AGCCTCCATAGTGAGAAGCTAGCAATTGCATTCGGGCTCTTAAGTACAACACCTGGAACA
CCAATCCGAGTTGTGAAAAACCTTCGTGTGTGTAGTGATTGCCACTCTGCAATGAAGTTC
ATCTCCGAAGTGTACAATAGGGAGATTATTGTACGAGATAGGAACCGGTTTCATCATTTC
ACGAAGGGATCTTGTTCATGCAGGGACTTCTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_11s0016g04640.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:11:3966363:3968501:1 gene:VIT_11s0016g04640 transcript:VIT_11s0016g04640.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MATPLSLHHPRPPLPTEYPLPLRNAATTANNNNINSQIQLHPCLLSLEKCTTMSQLKQIH
AQMLRTCLFVDPFSASKIVAFCALHDSGSLPYARLVFNQIPNPTTFTCNSIIRGYTNKNL
PRQAILFYQLMMLQGLDPDRFTFPSLFKSCGVLCEGKQLHCHSTKLGFASDAYIQNTLMN
MYSNCGCLVSARKVFDKMVNKSVVSWATMIGAYAQWDLPHEAIKLFRRMEIASVKPNEIT
LVNVLTACARSRDLETAKQVHKYIDETGIGFHTVLTSALMDVYCKCGCYPLARDLFNKMP
EKNLFCWNIMINGHVEDSDYEEALSLFNEMQLSGVKGDKVTMASLLIACTHLGALELGKW
LHVYIEKEKIEVDVALGTALVDMYAKCGSIESAMRVFQEMPEKDVMTWTALIVGLAMCGQ
GLKALELFHEMQMSEVKPDAITFVGVLAACSHAGLVNEGIAYFNSMPNKYGIQPSIEHYG
CMVDMLGRAGRIAEAEDLIQNMPMAPDYFVLVGLLSACRIHGNLVVAERAAQQLIELDPK
NGGTYVLLSNIYSSMKNWEAAKKMRELMVERNIKKPPGCSAIEVGGVVHEFVKGDVSHPQ
SSEIYETLDDMMRRLKSAGYVPDKSEVLFDMDEKEKENELSLHSEKLAIAFGLLSTTPGT
PIRVVKNLRVCSDCHSAMKFISEVYNREIIVRDRNRFHHFTKGSCSCRDFW

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_11s0016g04640.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:11:3966363:3968501:1 gene:VIT_11s0016g04640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGGCTACTCCTTTATCCCTCCACCACCCTAGACCACCCTTACCCACGGAATATCCTCTT
CCTTTGAGGAACGCTGCAACCACCGCTAACAACAACAATATTAACAGCCAAATTCAACTA
CACCCATGTCTGCTATCACTGGAAAAATGCACCACCATGTCCCAGCTCAAGCAAATCCAT
GCCCAAATGCTCAGGACTTGCCTCTTCGTTGACCCCTTCTCTGCCAGTAAAATCGTCGCC
TTTTGTGCCCTCCACGACTCTGGAAGCCTCCCTTACGCCCGTCTCGTCTTCAACCAAATC
CCCAATCCCACCACCTTCACCTGTAACTCCATAATCCGGGGTTACACCAACAAGAATTTG
CCCCGCCAAGCTATTCTTTTCTATCAACTAATGATGCTCCAGGGGTTGGACCCCGACAGG
TTCACATTCCCTTCTTTGTTTAAATCATGTGGGGTTTTGTGTGAAGGAAAACAGCTGCAT
TGTCACTCTACAAAATTGGGGTTCGCGTCTGACGCTTATATTCAAAACACATTGATGAAC
ATGTACTCGAATTGTGGATGTTTGGTTTCAGCCCGAAAAGTGTTTGATAAAATGGTTAAC
AAAAGTGTGGTTTCTTGGGCAACCATGATTGGGGCTTATGCGCAATGGGATCTGCCCCAT
GAAGCCATCAAGCTGTTCAGGAGAATGGAAATTGCGAGTGTGAAGCCGAATGAGATTACT
TTGGTGAATGTGTTAACAGCATGTGCGAGATCAAGAGATTTGGAAACGGCCAAGCAGGTG
CACAAGTATATTGATGAGACTGGAATCGGGTTCCACACGGTCCTAACCTCTGCTCTCATG
GATGTTTATTGCAAGTGCGGCTGCTACCCACTTGCCCGGGATTTATTCAATAAGATGCCT
GAAAAGAACTTGTTTTGTTGGAACATCATGATTAATGGACATGTTGAGGATAGTGATTAT
GAGGAGGCTTTGTCACTCTTCAATGAGATGCAACTCAGCGGTGTTAAAGGGGATAAGGTG
ACTATGGCAAGCTTATTGATCGCTTGCACTCATCTGGGTGCTCTTGAGCTTGGCAAGTGG
TTGCATGTTTATATTGAGAAGGAGAAAATTGAGGTGGATGTTGCCTTGGGAACGGCACTT
GTGGACATGTATGCAAAATGTGGAAGTATAGAAAGTGCAATGAGAGTCTTCCAAGAGATG
CCTGAAAAAGATGTTATGACTTGGACAGCCTTGATTGTTGGTCTTGCGATGTGCGGACAA
GGGTTGAAAGCTTTGGAACTTTTCCATGAGATGCAGATGAGTGAGGTGAAACCAGATGCA
ATCACCTTCGTTGGGGTTTTGGCTGCTTGCAGTCATGCAGGATTGGTGAATGAAGGAATT
GCATATTTTAATTCCATGCCTAATAAATATGGCATTCAGCCTAGCATTGAGCATTATGGT
TGTATGGTTGACATGCTAGGGCGGGCTGGTCGAATAGCTGAAGCAGAGGATTTGATACAG
AACATGCCAATGGCGCCAGATTATTTTGTTTTGGTAGGCCTTCTTAGCGCCTGCAGAATT
CATGGCAATCTCGTGGTGGCAGAAAGAGCAGCCCAACAACTTATAGAGCTAGACCCAAAA
AATGGAGGAACCTATGTGCTTTTATCAAACATATACAGCTCAATGAAGAACTGGGAAGCA
GCTAAAAAAATGAGGGAACTCATGGTAGAAAGAAACATTAAGAAGCCCCCAGGATGCAGT
GCGATAGAGGTTGGTGGTGTTGTGCATGAGTTCGTCAAGGGTGATGTCTCGCATCCACAA
TCCTCAGAAATTTATGAAACCTTGGATGATATGATGCGCAGGTTAAAGTCAGCTGGTTAT
GTTCCTGATAAATCAGAAGTGTTGTTTGACATGGATGAAAAGGAAAAGGAGAATGAGCTT
AGCCTCCATAGTGAGAAGCTAGCAATTGCATTCGGGCTCTTAAGTACAACACCTGGAACA
CCAATCCGAGTTGTGAAAAACCTTCGTGTGTGTAGTGATTGCCACTCTGCAATGAAGTTC
ATCTCCGAAGTGTACAATAGGGAGATTATTGTACGAGATAGGAACCGGTTTCATCATTTC
ACGAAGGGATCTTGTTCATGCAGGGACTTCTGGTGATGT