Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_11s0016g04580.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:11:3888012:3891011:-1 gene:VIT_11s0016g04580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGAGTTTGAAGATTTCCAAATTGGGCCGGAAATTTACGGAGAGCTCCTTCAGGGATGC GTCTACGAGCGTGCCCTTCACACGGGTCAGCAAATTCACGCCCGAATTCTTAAGAACGGG GATTTCTTTGCTAAAAATGAGTATGTTGAAACGAAACTAGTGGTTTTCTATGCCAAATGC GACTTTCCGGAGGTGGCCGTACGTTTGTTTCACAGACTCCGTGTGCGGAACGTCTTCTCT TGGGCTGCCATTGTTGGGCTGCAGTGTAGAATGGGTTTTAGTGAAGATGCTTTACTGGGT TTCATTGAAATGCAAGAGAATGGGGTTTTTCCGGATAATTTTGTTCTTCCGAATGTACTG AAGGCTTGTGGTAGTTTGCAGTTGATTGGTTTGGGGAAAGGAGTTCATGGTTACGTATTG AAGATGGGTTTTGGAGCGTGTGTCTTTGTTTCAAGTAGCCTTGTTGATATGTATGGGAAG TGTGGGGTTTTGGAGGATGCAAGGAAGGTGTTTGATAGTATGGTCGAGAAAAACGTAGTG ACTTGGAACTCGATGATTGTAGGATATGTTCAAAATGGGCTCAACCAGGAAGCTATTGAT GTATTCTATGACATGAGAGTGGAAGGCATTGAACCAACAAGAGTCACTGTGGCAAGCTTC CTTTCGGCGTCTGCCAATTTAGATGCTCTTATAGAAGGTAAGCAGGGGCATGCAATTGCA ATTTTAAACAGTTTAGATTTGGATAATATTTTGGGTAGTTCAATTATAAACTTCTATTCA AAGGTTGGTTTGATTGAGGATGCCGAGCTAGTTTTTAGTAGAATGCTTGAGAAAGATGTG GTGACATGGAATTTGCTCATTTCTAGTTATGTTCAACATCATCAGGTTGGTAAGGCATTG AATATGTGCCATCTGATGAGATCAGAAAACTTGAGATTCGACTCTGTAACTCTGTCATCC ATATTGTCTGCCTCTGCTGTTACAAGCAATATAAAACTTGGCAAAGAGGGCCACTGTTAT TGTATTAGGAGAAACCTTGAATCGGATGTGGTTGTTGCGAATAGCATCATTGATATGTAT GCCAAATGTGAAAGAATTGATGATGCAAGAAAAGTATTTGACTCCACAACTGAAAGAGAT CTTGTTTTGTGGAATACCCTACTGGCTGCTTATGCACAGGTGGGTCTAAGTGGTGAGGCC TTGAAATTGTTCTATCAGATGCAGTTTGACAGTGTACCACCAAATGTGATATCATGGAAT TCGGTAATTTTGGGATTCCTGAGAAATGGTCAGGTTAATGAGGCAAAGGACATGTTCTCA CAGATGCAGTCCCTTGGGTTCCAGCCTAACCTCATCACTTGGACTACCCTTATCTCTGGT TTAGCTCAAAGTGGATTTGGCTATGAAGCAATTCTGTTTTTCCAGAAAATGCAGGAAGCA GGAATCCGACCTAGTATTGCCAGCATTACCAGTGTACTTTTGGCTTGTACAGATATACCA TCATTGTGGTATGGAAGAGCCATTCATGGCTTCATTACAAGGCATGAATTTTGCTTGTCT GTTCCAGTTGCAACTTCTTTAGTGGACATGTATGCTAAATGTGGAAGCATAGATGAAGCA AAGAAAGTGTTTCATATGATGTCAAGCAAAGAGTTGCCTATCTATAATGCAATGATTTCT GCTTATGCATTACATGGCCAAGCTGTAGAAGCTCTTGCACTATTTAAACATCTGCAGAAG GAAGGTATAGAACCAGATAGCATAACCTTCACCAGCATTTTATCAGCATGCAGTCATGCT GGGCTCGTGAATGAAGGTTTGAATCTTTTCGCTGATATGGTTTCTAAACACAATATGAAT CCAATTATGGAGCATTATGGTTGTGTGGTTAGTCTTCTTTCACGATGTGGTAATTTGGAT GAAGCTCTTAGGCTTATTCTCACAATGCCATTTCAACCTGATGCACATATATTAGGATCA TTGCTTACTGCTTGCAGAGAACACCACGAAATTGAACTTGGGGAGTATTTATCCAAACAC TTGTTTAAATTGGAACCCAGTAATTCAGGAAACTATGTAGCTCTTTCAAATGCATATGCC GCAGCAGGAAGGTGGGTTGAGGTATCCAACATGAGGGATTTGATGAAAGTAAGGGGCCTG AGGAAGAATCCTGGATGCAGCTGGATTCAAACTGGAGGCAAACTTAATGTTTTTGTTGCT GGGGATGGATCACACCCAAAAACCGAGGAAATTTATGCAATGCTGGCTATGCTGCTAAGT GAAATGCGATTTATGGGATATGTTCCTATTGCTAGTAATGAAGAAAATCTCTGCTCTAGA GCGCAAAAGTTCATCCATGGATTCAAATGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_11s0016g04580.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:11:3888012:3891011:-1 gene:VIT_11s0016g04580 transcript:VIT_11s0016g04580.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MEFEDFQIGPEIYGELLQGCVYERALHTGQQIHARILKNGDFFAKNEYVETKLVVFYAKC DFPEVAVRLFHRLRVRNVFSWAAIVGLQCRMGFSEDALLGFIEMQENGVFPDNFVLPNVL KACGSLQLIGLGKGVHGYVLKMGFGACVFVSSSLVDMYGKCGVLEDARKVFDSMVEKNVV TWNSMIVGYVQNGLNQEAIDVFYDMRVEGIEPTRVTVASFLSASANLDALIEGKQGHAIA ILNSLDLDNILGSSIINFYSKVGLIEDAELVFSRMLEKDVVTWNLLISSYVQHHQVGKAL NMCHLMRSENLRFDSVTLSSILSASAVTSNIKLGKEGHCYCIRRNLESDVVVANSIIDMY AKCERIDDARKVFDSTTERDLVLWNTLLAAYAQVGLSGEALKLFYQMQFDSVPPNVISWN SVILGFLRNGQVNEAKDMFSQMQSLGFQPNLITWTTLISGLAQSGFGYEAILFFQKMQEA GIRPSIASITSVLLACTDIPSLWYGRAIHGFITRHEFCLSVPVATSLVDMYAKCGSIDEA KKVFHMMSSKELPIYNAMISAYALHGQAVEALALFKHLQKEGIEPDSITFTSILSACSHA GLVNEGLNLFADMVSKHNMNPIMEHYGCVVSLLSRCGNLDEALRLILTMPFQPDAHILGS LLTACREHHEIELGEYLSKHLFKLEPSNSGNYVALSNAYAAAGRWVEVSNMRDLMKVRGL RKNPGCSWIQTGGKLNVFVAGDGSHPKTEEIYAMLAMLLSEMRFMGYVPIASNEENLCSR AQKFIHGFK

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_11s0016g04580.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:11:3888012:3891011:-1 gene:VIT_11s0016g04580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	AAACCTAGAAAATCTTCAAAATTTGCATCAACCCGTCTCGCAAAACTCCAAGAAAAAGAC GAGAATCGTCGAAGTTTATACAAATCTTACTTCCACCACATCTCCTCGCTATGTAAAGAT GGACACCTACAGGAATCCGTACACCTTCTTTCTGAAATGGAGTTTGAAGATTTCCAAATT GGGCCGGAAATTTACGGAGAGCTCCTTCAGGGATGCGTCTACGAGCGTGCCCTTCACACG GGTCAGCAAATTCACGCCCGAATTCTTAAGAACGGGGATTTCTTTGCTAAAAATGAGTAT GTTGAAACGAAACTAGTGGTTTTCTATGCCAAATGCGACTTTCCGGAGGTGGCCGTACGT TTGTTTCACAGACTCCGTGTGCGGAACGTCTTCTCTTGGGCTGCCATTGTTGGGCTGCAG TGTAGAATGGGTTTTAGTGAAGATGCTTTACTGGGTTTCATTGAAATGCAAGAGAATGGG GTTTTTCCGGATAATTTTGTTCTTCCGAATGTACTGAAGGCTTGTGGTAGTTTGCAGTTG ATTGGTTTGGGGAAAGGAGTTCATGGTTACGTATTGAAGATGGGTTTTGGAGCGTGTGTC TTTGTTTCAAGTAGCCTTGTTGATATGTATGGGAAGTGTGGGGTTTTGGAGGATGCAAGG AAGGTGTTTGATAGTATGGTCGAGAAAAACGTAGTGACTTGGAACTCGATGATTGTAGGA TATGTTCAAAATGGGCTCAACCAGGAAGCTATTGATGTATTCTATGACATGAGAGTGGAA GGCATTGAACCAACAAGAGTCACTGTGGCAAGCTTCCTTTCGGCGTCTGCCAATTTAGAT GCTCTTATAGAAGGTAAGCAGGGGCATGCAATTGCAATTTTAAACAGTTTAGATTTGGAT AATATTTTGGGTAGTTCAATTATAAACTTCTATTCAAAGGTTGGTTTGATTGAGGATGCC GAGCTAGTTTTTAGTAGAATGCTTGAGAAAGATGTGGTGACATGGAATTTGCTCATTTCT AGTTATGTTCAACATCATCAGGTTGGTAAGGCATTGAATATGTGCCATCTGATGAGATCA GAAAACTTGAGATTCGACTCTGTAACTCTGTCATCCATATTGTCTGCCTCTGCTGTTACA AGCAATATAAAACTTGGCAAAGAGGGCCACTGTTATTGTATTAGGAGAAACCTTGAATCG GATGTGGTTGTTGCGAATAGCATCATTGATATGTATGCCAAATGTGAAAGAATTGATGAT GCAAGAAAAGTATTTGACTCCACAACTGAAAGAGATCTTGTTTTGTGGAATACCCTACTG GCTGCTTATGCACAGGTGGGTCTAAGTGGTGAGGCCTTGAAATTGTTCTATCAGATGCAG TTTGACAGTGTACCACCAAATGTGATATCATGGAATTCGGTAATTTTGGGATTCCTGAGA AATGGTCAGGTTAATGAGGCAAAGGACATGTTCTCACAGATGCAGTCCCTTGGGTTCCAG CCTAACCTCATCACTTGGACTACCCTTATCTCTGGTTTAGCTCAAAGTGGATTTGGCTAT GAAGCAATTCTGTTTTTCCAGAAAATGCAGGAAGCAGGAATCCGACCTAGTATTGCCAGC ATTACCAGTGTACTTTTGGCTTGTACAGATATACCATCATTGTGGTATGGAAGAGCCATT CATGGCTTCATTACAAGGCATGAATTTTGCTTGTCTGTTCCAGTTGCAACTTCTTTAGTG GACATGTATGCTAAATGTGGAAGCATAGATGAAGCAAAGAAAGTGTTTCATATGATGTCA AGCAAAGAGTTGCCTATCTATAATGCAATGATTTCTGCTTATGCATTACATGGCCAAGCT GTAGAAGCTCTTGCACTATTTAAACATCTGCAGAAGGAAGGTATAGAACCAGATAGCATA ACCTTCACCAGCATTTTATCAGCATGCAGTCATGCTGGGCTCGTGAATGAAGGTTTGAAT CTTTTCGCTGATATGGTTTCTAAACACAATATGAATCCAATTATGGAGCATTATGGTTGT GTGGTTAGTCTTCTTTCACGATGTGGTAATTTGGATGAAGCTCTTAGGCTTATTCTCACA ATGCCATTTCAACCTGATGCACATATATTAGGATCATTGCTTACTGCTTGCAGAGAACAC CACGAAATTGAACTTGGGGAGTATTTATCCAAACACTTGTTTAAATTGGAACCCAGTAAT TCAGGAAACTATGTAGCTCTTTCAAATGCATATGCCGCAGCAGGAAGGTGGGTTGAGGTA TCCAACATGAGGGATTTGATGAAAGTAAGGGGCCTGAGGAAGAATCCTGGATGCAGCTGG ATTCAAACTGGAGGCAAACTTAATGTTTTTGTTGCTGGGGATGGATCACACCCAAAAACC GAGGAAATTTATGCAATGCTGGCTATGCTGCTAAGTGAAATGCGATTTATGGGATATGTT CCTATTGCTAGTAATGAAGAAAATCTCTGCTCTAGAGCGCAAAAGTTCATCCATGGATTC AAATGAAGTGATTTGAGGAACTCCAAGAGATAGGCAAGTTATTGAGAGGAAAATAAGGGT ACAACGATTGCTGCAGACAACTCCAGGGCATTCTGAGATATCTACATAGATAGGCTGCTT CTGGAAGAAAAATGTGTTACATTAATAGCCTGGAAGATGAATTCAAAGTTTCTAAGGATA AGGAAGAGTCTCGAAGACCTGAGTGGCAAAAAAAACATTTGTGTAACTCATGACATGGAG GTTACTTGTGAGAAGCTGAAAAGACTCTCATTCCTATCGACCAAGAGCCAAACATTATGA AAACCATATGGAAGCTGTTAGATGTGAATGGTGACTTAAAGTTCCATTTGGATTCTGCTC AAGGCGGTTCTTGTATATATGTAGTTGAGTTTAAAGGTGACTATCATTCTCAAGGTTGTT ATGTAAATATGCAGTTGAGTTAGAACACACACCAATTAAAATTTCTTGGTTAGAATTGCT