Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_11s0016g02500.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:11:1999828:2007867:1 gene:VIT_11s0016g02500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATGATTGAGAATTTGGCTTCTCGGAATAATCTTTTATCAGGATTTTGTGATACTGAA ACTTGTGATCAAGGACCAAGAATCCTCATCCAGTTGCTTGTGGAAGGTTTCGAACCCAAC ATGACTTGTGCTTCAAAAGGGGATTTAAATGAAGGGAAGGCCATTCATGGGCAGGTGATA AAAAGTGGGATAAACCCGGATTCCCATTTGTGGAATTCTTTGGTCAATGTTTATGCAAAA TGTGGGAGCGCTAACTACGCATGTAAGGTGTTTGGGGAAATACCTGAACGAGATGTTGTG TCCTGGACGGCTTTGATTACGGGGTTTGTTGCTGAAGGATATGGAAGTGGTGCTGTTAAT TTGTTTTGTGAGATGCGGAGGGAAGGTGTTGAGGCAAATGAGTTCACCTATGCGACTGCT TTGAAAGCTTGCTCCATGTGCTTGGATTTAGAGTTTGGGAAACAAGTGCATGCAGAAGCT ATTAAGGTTGGAGATTTTTCTGATTTATTTGTTGGGTCTGCTCTTGTTGACCTTTATGCA AAATGTGGTGAGATGGTGCTTGCAGAGAGAGTCTTCTTGTGCATGCCCAAGCAGAATGCT GTGTCATGGAATGCATTGCTTAATGGGTTTGCACAGATGGGTGATGCTGAAAAGGTTTTG AATTTGTTTTGCAGAATGACAGGATCAGAAATAAACTTCAGCAAGTTTACTTTGTCTACT GTCCTCAAGGGTTGTGCAAACTCAGGAAATTTAAGGGCAGGCCAAATCGTGCATTCTTTG GCAATCAGGATTGGTTGTGAGCTTGATGAGTTTATTAGTTGTTGTCTTGTTGATATGTAC TCCAAGTGCGGGCTGGCAGGTGATGCACTAAAAGTTTTTGTGAGGATTGAAGATCCTGAT GTTGTATCCTGGAGTGCAATTATCACATGCCTTGATCAAAAAGGGCAGAGCAGAGAAGCA GCTGAGGTATTTAAAAGAATGAGACACTCAGGTGTGATACCAAACCAGTTTACCCTTGCT AGTCTTGTCAGTGCTGCCACTGATTTGGGTGACCTATATTATGGTGAAAGCATCCATGCT TGTGTTTGCAAGTATGGTTTTGAATATGATAATACGGTTTGCAATGCCTTGGTCACAATG TATATGAAAATTGGTTCTGTTCAAGATGGTTGCCGGGTGTTTGAAGCGACAACTAATCGG GATTTAATTTCATGGAATGCCCTCTTATCTGGATTCCATGACAATGAAACTTGTGATACA GGGCTAAGGATCTTCAACCAGATGCTTGCGGAGGGTTTCAACCCAAACATGTACACATTT ATCAGCATTCTAAGATCTTGTTCCAGCCTTTCAGATGTAGACCTTGGGAAGCAAGTGCAT GCCCAAATAGTAAAGAACAGTCTTGATGGTAATGATTTTGTTGGAACAGCTCTGGTTGAT ATGTATGCCAAAAACAGGTTCTTGGAAGACGCAGAAACAATTTTTAACAGATTGATTAAA AGAGACCTCTTTGCTTGGACTGTGATTGTTGCTGGTTATGCACAGGATGGCCAAGGGGAG AAGGCTGTGAAGTGTTTCATTCAAATGCAACGAGAAGGTGTGAAGCCCAATGAGTTCACA CTTGCCAGCTCTTTGAGTGGTTGCTCCCGTATTGCAACTCTAGATAGTGGGCGGCAACTC CATTCCATGGCAATTAAGGCTGGGCAGTCAGGTGATATGTTTGTTGCTAGTGCTCTTGTT GATATGTATGCGAAATGTGGGTGCGTAGAAGATGCTGAGGTTGTTTTTGATGGCTTGGTT TCACGGGATACAGTCTCATGGAACACGATCATTTGTGGATACTCACAACATGGGCAAGGA GGGAAGGCTCTCAAAGCCTTTGAGGCTATGTTAGATGAGGGCACTGTGCCTGACGAGGTT ACCTTCATAGGTGTTCTTTCTGCATGTAGCCATATGGGTTTAATTGAAGAAGGGAAGAAG CATTTTAATTCATTGAGCAAAATCTATGGAATCACTCCTACTATTGAGCATTATGCTTGT ATGGTTGATATCCTTGGAAGGGCAGGAAAATTTCATGAGGTTGAAAGCTTTATTGAGGAG ATGAAGCTAACTTCAAATGTCTTGATCTGGGAGACTGTTCTTGGAGCTTGTAAAATGCAT GGAAACATAGAATTTGGTGAAAGAGCTGCAATGAAACTTTTTGAGCTTGAGCCTGAGATA GACTCAAATTATATACTACTATCTAATATGTTTGCAGCCAAAGGTATGTGGGATGATGTT ACAAATGTTAGGGCATTGATGTCCACTCGGGGGGTTAAAAAGGAACCTGGATGCAGCTGG GTTGAGGTCAATGGTCAAGTCCATGTCTTTTTGTCTCATGATGGTTCACATCCAAAAATT AGGGAAATCCATCTAAAGTTACAGGATCTACACCAGAAACTGATGTCAGTTGGCTATACT CCAAACACGGACCATGTGCTTCATAATGTCTCCGACAGAGAAAAACAGGAACTCCTCTTT TATCATAGTGAAAGATTGGCTCTTGCCTTTGCTCTTCTAAGCACCAGCACCAGGAAAACT ATTAGGATTTTCAAGAACCTCCGCATCTGTGGTGACTGCCATGATTTTATGAAGTCCATT TCAGAAATTACAAACCAAGAATTAGTTGTTCGTGACATTAATTGTTTTCACCACTTCAAG AATGGCTCTTGCTCTTGTCAGAATTTTTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_11s0016g02500.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:11:1999828:2007867:1 gene:VIT_11s0016g02500 transcript:VIT_11s0016g02500.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MMIENLASRNNLLSGFCDTETCDQGPRILIQLLVEGFEPNMTCASKGDLNEGKAIHGQVI KSGINPDSHLWNSLVNVYAKCGSANYACKVFGEIPERDVVSWTALITGFVAEGYGSGAVN LFCEMRREGVEANEFTYATALKACSMCLDLEFGKQVHAEAIKVGDFSDLFVGSALVDLYA KCGEMVLAERVFLCMPKQNAVSWNALLNGFAQMGDAEKVLNLFCRMTGSEINFSKFTLST VLKGCANSGNLRAGQIVHSLAIRIGCELDEFISCCLVDMYSKCGLAGDALKVFVRIEDPD VVSWSAIITCLDQKGQSREAAEVFKRMRHSGVIPNQFTLASLVSAATDLGDLYYGESIHA CVCKYGFEYDNTVCNALVTMYMKIGSVQDGCRVFEATTNRDLISWNALLSGFHDNETCDT GLRIFNQMLAEGFNPNMYTFISILRSCSSLSDVDLGKQVHAQIVKNSLDGNDFVGTALVD MYAKNRFLEDAETIFNRLIKRDLFAWTVIVAGYAQDGQGEKAVKCFIQMQREGVKPNEFT LASSLSGCSRIATLDSGRQLHSMAIKAGQSGDMFVASALVDMYAKCGCVEDAEVVFDGLV SRDTVSWNTIICGYSQHGQGGKALKAFEAMLDEGTVPDEVTFIGVLSACSHMGLIEEGKK HFNSLSKIYGITPTIEHYACMVDILGRAGKFHEVESFIEEMKLTSNVLIWETVLGACKMH GNIEFGERAAMKLFELEPEIDSNYILLSNMFAAKGMWDDVTNVRALMSTRGVKKEPGCSW VEVNGQVHVFLSHDGSHPKIREIHLKLQDLHQKLMSVGYTPNTDHVLHNVSDREKQELLF YHSERLALAFALLSTSTRKTIRIFKNLRICGDCHDFMKSISEITNQELVVRDINCFHHFK NGSCSCQNFW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_11s0016g02500.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:11:1999828:2007867:1 gene:VIT_11s0016g02500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATGATTGAGAATTTGGCTTCTCGGAATAATCTTTTATCAGGATTTTGTGATACTGAA ACTTGTGATCAAGGACCAAGAATCCTCATCCAGTTGCTTGTGGAAGGTTTCGAACCCAAC ATGACTTGTGCTTCAAAAGGGGATTTAAATGAAGGGAAGGCCATTCATGGGCAGGTGATA AAAAGTGGGATAAACCCGGATTCCCATTTGTGGAATTCTTTGGTCAATGTTTATGCAAAA TGTGGGAGCGCTAACTACGCATGTAAGGTGTTTGGGGAAATACCTGAACGAGATGTTGTG TCCTGGACGGCTTTGATTACGGGGTTTGTTGCTGAAGGATATGGAAGTGGTGCTGTTAAT TTGTTTTGTGAGATGCGGAGGGAAGGTGTTGAGGCAAATGAGTTCACCTATGCGACTGCT TTGAAAGCTTGCTCCATGTGCTTGGATTTAGAGTTTGGGAAACAAGTGCATGCAGAAGCT ATTAAGGTTGGAGATTTTTCTGATTTATTTGTTGGGTCTGCTCTTGTTGACCTTTATGCA AAATGTGGTGAGATGGTGCTTGCAGAGAGAGTCTTCTTGTGCATGCCCAAGCAGAATGCT GTGTCATGGAATGCATTGCTTAATGGGTTTGCACAGATGGGTGATGCTGAAAAGGTTTTG AATTTGTTTTGCAGAATGACAGGATCAGAAATAAACTTCAGCAAGTTTACTTTGTCTACT GTCCTCAAGGGTTGTGCAAACTCAGGAAATTTAAGGGCAGGCCAAATCGTGCATTCTTTG GCAATCAGGATTGGTTGTGAGCTTGATGAGTTTATTAGTTGTTGTCTTGTTGATATGTAC TCCAAGTGCGGGCTGGCAGGTGATGCACTAAAAGTTTTTGTGAGGATTGAAGATCCTGAT GTTGTATCCTGGAGTGCAATTATCACATGCCTTGATCAAAAAGGGCAGAGCAGAGAAGCA GCTGAGGTATTTAAAAGAATGAGACACTCAGGTGTGATACCAAACCAGTTTACCCTTGCT AGTCTTGTCAGTGCTGCCACTGATTTGGGTGACCTATATTATGGTGAAAGCATCCATGCT TGTGTTTGCAAGTATGGTTTTGAATATGATAATACGGTTTGCAATGCCTTGGTCACAATG TATATGAAAATTGGTTCTGTTCAAGATGGTTGCCGGGTGTTTGAAGCGACAACTAATCGG GATTTAATTTCATGGAATGCCCTCTTATCTGGATTCCATGACAATGAAACTTGTGATACA GGGCTAAGGATCTTCAACCAGATGCTTGCGGAGGGTTTCAACCCAAACATGTACACATTT ATCAGCATTCTAAGATCTTGTTCCAGCCTTTCAGATGTAGACCTTGGGAAGCAAGTGCAT GCCCAAATAGTAAAGAACAGTCTTGATGGTAATGATTTTGTTGGAACAGCTCTGGTTGAT ATGTATGCCAAAAACAGGTTCTTGGAAGACGCAGAAACAATTTTTAACAGATTGATTAAA AGAGACCTCTTTGCTTGGACTGTGATTGTTGCTGGTTATGCACAGGATGGCCAAGGGGAG AAGGCTGTGAAGTGTTTCATTCAAATGCAACGAGAAGGTGTGAAGCCCAATGAGTTCACA CTTGCCAGCTCTTTGAGTGGTTGCTCCCGTATTGCAACTCTAGATAGTGGGCGGCAACTC CATTCCATGGCAATTAAGGCTGGGCAGTCAGGTGATATGTTTGTTGCTAGTGCTCTTGTT GATATGTATGCGAAATGTGGGTGCGTAGAAGATGCTGAGGTTGTTTTTGATGGCTTGGTT TCACGGGATACAGTCTCATGGAACACGATCATTTGTGGATACTCACAACATGGGCAAGGA GGGAAGGCTCTCAAAGCCTTTGAGGCTATGTTAGATGAGGGCACTGTGCCTGACGAGGTT ACCTTCATAGGTGTTCTTTCTGCATGTAGCCATATGGGTTTAATTGAAGAAGGGAAGAAG CATTTTAATTCATTGAGCAAAATCTATGGAATCACTCCTACTATTGAGCATTATGCTTGT ATGGTTGATATCCTTGGAAGGGCAGGAAAATTTCATGAGGTTGAAAGCTTTATTGAGGAG ATGAAGCTAACTTCAAATGTCTTGATCTGGGAGACTGTTCTTGGAGCTTGTAAAATGCAT GGAAACATAGAATTTGGTGAAAGAGCTGCAATGAAACTTTTTGAGCTTGAGCCTGAGATA GACTCAAATTATATACTACTATCTAATATGTTTGCAGCCAAAGGTATGTGGGATGATGTT ACAAATGTTAGGGCATTGATGTCCACTCGGGGGGTTAAAAAGGAACCTGGATGCAGCTGG GTTGAGGTCAATGGTCAAGTCCATGTCTTTTTGTCTCATGATGGTTCACATCCAAAAATT AGGGAAATCCATCTAAAGTTACAGGATCTACACCAGAAACTGATGTCAGTTGGCTATACT CCAAACACGGACCATGTGCTTCATAATGTCTCCGACAGAGAAAAACAGGAACTCCTCTTT TATCATAGTGAAAGATTGGCTCTTGCCTTTGCTCTTCTAAGCACCAGCACCAGGAAAACT ATTAGGATTTTCAAGAACCTCCGCATCTGTGGTGACTGCCATGATTTTATGAAGTCCATT TCAGAAATTACAAACCAAGAATTAGTTGTTCGTGACATTAATTGTTTTCACCACTTCAAG AATGGCTCTTGCTCTTGTCAGAATTTTTGGTGATTTTGCTTGAGAGGGCATACAAGGAGA AGGGATACAGGCAACAAGGTTTAAGTCTAAACATATTCCTTGAAGCTGAAGTTGCTCTGC GCTCAGTGCCATGGTTTCCTGGCTAAAGAAATCCCATGAGATGATTTTTTTCTTTCCAAG GGCATTATTACTCCAGGAGAAAAGTTGCCTATTTATGAAGCTGCTGAATTCTGGAATCAT TCTTCTGTAGCTGTGGGAACAACTTCATAAAATGTTGAAGTTTTGGGTTCATCAGATATG AAAGTTCACCAAACTAAGGATGGAAATGCTTCTGGTCTTCAGTTCAAATATTTGATTTCA AAAGAAATCTGATTCATTTTGATTCTCTCAATGAGGTCCTGAAAACAAGCAGGGTGATGC ATTTGGCGGAGTTTGAGGATAAGCTCCAATCACTATTGTGGTCATTGTTGGAGCTGAGGC AATTGAAAATTGGTTAAACAATTTCTTAAAGAATTGACCAAATAGATAATTATGATGAAC AAATCACTGCTTATTTCGAAGAGCCTTTGATTAAGAGAAGAAAGCAGATAATTGTGCCAC TGAACAAAGACCATTGAGAAGAACTTGGCTTATATAGCATTAGACAAAAGCTCCAATCGG ACCTTGCAAGTGATGATGCTAGACCACTTGGTTTGTTGACAGGTTTCAAAGAGCTGAGTA CCCCCTGATCTCCTCCAACCTAGCTCAGAAAGATTCTGATCACACGCAGAGGAGAGCTCA CCCAACTGGGGCAGTGATGAGCTAAATGGAAGCCATGGAGAGATTCATGGTAATGCAATC CCCATCTTTTAATGGGGAGCCAAATGCTGAAGTGGCGAAGAATTGGCTAAAGCGAATAAG AAGAATATCTGAGGGCTCAGATATCCGAGAGAAATAAAGGGTGGGTTTGGCAACATATAT GTTAGTGGACAAAGCAGGGTTTTTTTATGGCAAACCATGAAAAGGGTGTATCATGTATGA TACAGATGTAATGACATGGGATCGATTTGAGAGAATTTTCTTAGACAAATA