Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_11s0016g01170.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:11:935907:937912:-1 gene:VIT_11s0016g01170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGTCGCCTAAGTCTCTCTCTACGCTCTTGAAAGGGTTAGCGCCAATTAAGAGAGTTTTG
TTTGATTTCCGTACCAACTACCACTCCCGCTCCTTCAACTACCTTTTGAATTGTTGTTCT
TCTCTACCAGACCTTAGTCGAATCCATGCTTTGGTTGTGACAAATGGGTGCGGTCAAAAC
CTCCTCCTTTCAACAAAGCTTATCATCACGGCATGCTGCTTGGCTCCGACAATGGACTAT
GCTCGGAAGATGTTTGATCAAATGCCTAAAAGGGATGTTTTCCTTTGGAACACCCTGATT
CGGGGTTATGCGGATGCGGGTCCATGCGAAGAAGCTTTGGCTCTTTACAGTAACATGCAT
GGTGCTGGGTTGTTTCCCGATAACTATACTTTCCCTTTTGTGGTTCGGTCTTGTGCGGTT
TTGTCGGCTTTGAGGGAAGGGAAGGAGGTTCATTGTAACATAGTCAAGCATGGGTTTGAT
TCGGATGTGTTTGTGCAGAGCTCTTTGGTTGCTATGTATTCTCAGAGTGGAGAGACTTTG
GGGATGGAGCTGGTTTTTGGTGAAATGGTTGTAAGGAACATTGTTTCTTGGACAGCGGTG
ATTGCGGGTTATGTGCAAAACCGGTATTTTAAAGAGGGGTTGGGTGTTTTTAGGGAGATG
GTGGGGTCAGGGACTCAGCCGAATGCGGTTACACTTGTGAGCGTCCTTCCTGCTTGTGCT
GGTTTAGAGTTTTTGAATTTAGGAAAGTTGATTCATGGGTATGGCATTAAATTGGGCGTG
GATCCAGATGTCTCACTGACGAACGCTTTGATTGCATTGTATGGTAAGTGTGGGAATGTT
GAGACAGCCAGATCCTTGTTTGATGGGATGGTGGTTCAGAATCTGGTGTCTTGGAATGCC
ATGATTGCTGCTTATGAACAGAATAATGCTGGTGCTAATGCGGTCAAGCTCTTTCGAAGG
ATGCAAGCTGAAAAGGTAGACTTTGACTACATTACGATGGTTAGTGTTATTTCGGCATGT
GCTAGTTTGGGAGCCTTAAATACTGGAAGGTGGATGCATGAGCTTGTCAAAAGAAAAGGC
CTTGAAATCAATGTCTCAATCACAAATGCACTCATCGACATGTATGCAAAATGTGGAAAT
ATAGATTTGGCCAGGGAAGTTTTTGAGAGGTTACCTTGTAGAAGCGTTGTATCTTGGACT
TCAATGATAGGAGCTTGTGCGTCTCATGGGCATGGGGAGGATGCCCTCAAGCTCTTCTCA
CGAATGAAGGACGAGGGAGTTAAACCAAACAGCTTCACCTTTGCTGCTGTTTTTACTGCT
TGTAGACATTCAGGACTTGTAGAAGAAGGAAGGAAGCATTTTGAGAGCATGATGAGAGAT
TACTCAATCATGCCTGGTGTAGAACACTGTGCCTGTATGGTTGATCTTCTTGGTCGAGCA
GGTTCTTTGATGGAGGCTTATGAGTTTATTGATAAGATGCCAGTTGAACCAGATGTGAGT
GTTTGGGGAGCTCTGCTTGGTTCTTGCAGAATTCATAGCAATCTTGAGCTTGCTGAGCTG
GTGGCAGAGAAGTTGTTCCTATTGGATCCTCAAACTGTTACTTTCTATGTCCTCATGTCA
AATATTTATGCTGAAGCTGGTAGGTGGGAAGATGCAGCTAGATTGCGGAAACTAATGGAG
GAAAGGGAGTTGAAAAAGATACCTGGTCATAGTTTGGTTGAGGTAAATCGGAGGTTCCAT
ACATTTCTATCAGGTTCAAGGTCTCAATCCTCTTTGAGAGGCTCAATCAACTAG

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_11s0016g01170.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:11:935907:937912:-1 gene:VIT_11s0016g01170 transcript:VIT_11s0016g01170.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MSPKSLSTLLKGLAPIKRVLFDFRTNYHSRSFNYLLNCCSSLPDLSRIHALVVTNGCGQN
LLLSTKLIITACCLAPTMDYARKMFDQMPKRDVFLWNTLIRGYADAGPCEEALALYSNMH
GAGLFPDNYTFPFVVRSCAVLSALREGKEVHCNIVKHGFDSDVFVQSSLVAMYSQSGETL
GMELVFGEMVVRNIVSWTAVIAGYVQNRYFKEGLGVFREMVGSGTQPNAVTLVSVLPACA
GLEFLNLGKLIHGYGIKLGVDPDVSLTNALIALYGKCGNVETARSLFDGMVVQNLVSWNA
MIAAYEQNNAGANAVKLFRRMQAEKVDFDYITMVSVISACASLGALNTGRWMHELVKRKG
LEINVSITNALIDMYAKCGNIDLAREVFERLPCRSVVSWTSMIGACASHGHGEDALKLFS
RMKDEGVKPNSFTFAAVFTACRHSGLVEEGRKHFESMMRDYSIMPGVEHCACMVDLLGRA
GSLMEAYEFIDKMPVEPDVSVWGALLGSCRIHSNLELAELVAEKLFLLDPQTVTFYVLMS
NIYAEAGRWEDAARLRKLMEERELKKIPGHSLVEVNRRFHTFLSGSRSQSSLRGSIN

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_11s0016g01170.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:11:935907:937912:-1 gene:VIT_11s0016g01170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATTTTTTCCCCCCGGCCAGATTCCTTCATTCCAATCAGAGTCTAAAAGAGAAAAAGTTAA
GACAGTTTGGTTTGTGTAGAAGGATGTCAAGTACATGTCGCCTAAGTCTCTCTCTACGCT
CTTGAAAGGGTTAGCGCCAATTAAGAGAGTTTTGTTTGATTTCCGTACCAACTACCACTC
CCGCTCCTTCAACTACCTTTTGAATTGTTGTTCTTCTCTACCAGACCTTAGTCGAATCCA
TGCTTTGGTTGTGACAAATGGGTGCGGTCAAAACCTCCTCCTTTCAACAAAGCTTATCAT
CACGGCATGCTGCTTGGCTCCGACAATGGACTATGCTCGGAAGATGTTTGATCAAATGCC
TAAAAGGGATGTTTTCCTTTGGAACACCCTGATTCGGGGTTATGCGGATGCGGGTCCATG
CGAAGAAGCTTTGGCTCTTTACAGTAACATGCATGGTGCTGGGTTGTTTCCCGATAACTA
TACTTTCCCTTTTGTGGTTCGGTCTTGTGCGGTTTTGTCGGCTTTGAGGGAAGGGAAGGA
GGTTCATTGTAACATAGTCAAGCATGGGTTTGATTCGGATGTGTTTGTGCAGAGCTCTTT
GGTTGCTATGTATTCTCAGAGTGGAGAGACTTTGGGGATGGAGCTGGTTTTTGGTGAAAT
GGTTGTAAGGAACATTGTTTCTTGGACAGCGGTGATTGCGGGTTATGTGCAAAACCGGTA
TTTTAAAGAGGGGTTGGGTGTTTTTAGGGAGATGGTGGGGTCAGGGACTCAGCCGAATGC
GGTTACACTTGTGAGCGTCCTTCCTGCTTGTGCTGGTTTAGAGTTTTTGAATTTAGGAAA
GTTGATTCATGGGTATGGCATTAAATTGGGCGTGGATCCAGATGTCTCACTGACGAACGC
TTTGATTGCATTGTATGGTAAGTGTGGGAATGTTGAGACAGCCAGATCCTTGTTTGATGG
GATGGTGGTTCAGAATCTGGTGTCTTGGAATGCCATGATTGCTGCTTATGAACAGAATAA
TGCTGGTGCTAATGCGGTCAAGCTCTTTCGAAGGATGCAAGCTGAAAAGGTAGACTTTGA
CTACATTACGATGGTTAGTGTTATTTCGGCATGTGCTAGTTTGGGAGCCTTAAATACTGG
AAGGTGGATGCATGAGCTTGTCAAAAGAAAAGGCCTTGAAATCAATGTCTCAATCACAAA
TGCACTCATCGACATGTATGCAAAATGTGGAAATATAGATTTGGCCAGGGAAGTTTTTGA
GAGGTTACCTTGTAGAAGCGTTGTATCTTGGACTTCAATGATAGGAGCTTGTGCGTCTCA
TGGGCATGGGGAGGATGCCCTCAAGCTCTTCTCACGAATGAAGGACGAGGGAGTTAAACC
AAACAGCTTCACCTTTGCTGCTGTTTTTACTGCTTGTAGACATTCAGGACTTGTAGAAGA
AGGAAGGAAGCATTTTGAGAGCATGATGAGAGATTACTCAATCATGCCTGGTGTAGAACA
CTGTGCCTGTATGGTTGATCTTCTTGGTCGAGCAGGTTCTTTGATGGAGGCTTATGAGTT
TATTGATAAGATGCCAGTTGAACCAGATGTGAGTGTTTGGGGAGCTCTGCTTGGTTCTTG
CAGAATTCATAGCAATCTTGAGCTTGCTGAGCTGGTGGCAGAGAAGTTGTTCCTATTGGA
TCCTCAAACTGTTACTTTCTATGTCCTCATGTCAAATATTTATGCTGAAGCTGGTAGGTG
GGAAGATGCAGCTAGATTGCGGAAACTAATGGAGGAAAGGGAGTTGAAAAAGATACCTGG
TCATAGTTTGGTTGAGGTAAATCGGAGGTTCCATACATTTCTATCAGGTTCAAGGTCTCA
ATCCTCTTTGAGAGGCTCAATCAACTAGATTATACTTATGTGAAGAATTGATTCCAAAAA
CTTGAAAGGAATGCATAATCAGATGAAGGATTTTGGTTTTCAGGAGTGTGCAAAGCAATC
AGGTCATACAATTCTGGGTACAGCCT