Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_11s0016g00040.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:11_random:15303:18064:-1 gene:VIT_11s0016g00040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGGGTTTTGGTTCCTTGGGTTTTCTTCTGGTTCTAACACTGTTCTTCAGGCCTTTACCT
TGTCAACAACCCAATACGGATGGGTCCTTTGTGTTGGATTTCTTGGAGAAGATGGGTTTA
ACATCTTCTCAAGTTTACAACTTTTCTATCCCCTTTTGCTCATGGCCAGGAGTCTTCTGT
GATGCCAAAGAAGAAAATGTTGTGGGGTTGGTGGCTTCCGGGTTGGGTCTATCTGGTTTG
ATTCCTGACACCACCATTGGAAAACTCAGCAAGCTTCAGTCTTTGGATCTCAGCAACAAC
AAAATCACTGGTTTGTCTTCAGATTTCTGGAGTTTGGGCTCACTCAAGGCCCTTAATCTC
TCAAGTAACCTGATTTCTGGGTCCCTTCCTAGCAACATAGGCAATTTCGGTGTACTTGAA
ATCTTGGATCTTTCAAACAACAATTTCTCTGGGGAAATTCCCGCTGCTATAAGCTCCCTC
ACCAGTCTGCAAGTTCTTAAACTTGATCACAATGGTTTTGAATGGAATATTCCATTGGGG
ATTCTCAATTGCCAATCTCTTGTTTCAATGGATCTCTCTTTCAACCGGTTTAATGGAACA
GTTCCTGATGGCTTTGGTGCTGCATTTCCTAAGATCAGAATTTTGAACCTTGCTGGGAAT
GAGATTCATGGCCGGGTTTCAGATTTCTTGGAACTGAAATCCATCACAGTTCTAAACATT
TCCAGGAATCAGTTTCAGGGTTCTGTAATGGCTGTTTTTCAGGAGCCACTGCAGGTCATT
GACCTGAGTAAAAATCACTTTCAGGGTCACATTTCTCAGGTACATTCTAATTCTAGCTTC
AATTGGTCTCATTTGTTTTACCTAGACTTGTCTGAGAATGATCTCAGTGGAGAAATTTTT
CATTATTTGAATGAGGCCCAAAATCTCAAATACCTCAACCTTGCACACAATCGGTTTTCT
GAACAAGAATTCCCACAAATTGGGATGCTCTTCAGTTTAGAATATCTTAACCTGTCTGAA
ACTAGACTCACAGGTCCCATTCCCACCGACATCTCACAATTAAGTAGTTTGAATACGCTA
GACCTTTCCAAGAATCATCTTAGTGGTCAAGTTCCTCTCCCCAGTATCAAAAACCTTCAA
ATTTTTGATATTTCACACAACAACTTGAGTGGAGAAATCCCATTGTCACTCTTAGAGAAA
CTTCCATGGATGGAGAGATTCAACTTCTCTTACAACAACTTGAGCCTCTGCTCTTCAGAG
TTCTCACAGGAAACTCTCCAAACATCCTTCCTTGGTTCTACAGACAGCTGCCCAATTGCT
GCAAACCCTGCTTTCTTCAAAAAAAAAACCCCAAGACATGATGGGCTCAAGCTTGCTTTG
GTTTTAACCCTCTCAATGATCTGTTTATTCGTGGGATTGCTATTTCTAGCCTTTGGTTGC
AGAAGGAAAACCACCATGTGGGCAGTGAAGCAACTATCATATAAAGAAGAGCAAACTATT
TCTGGTCCTTTTTCATTCCAGACGGATTCAACCACTTGGGTAGCTGATGTTAAGCTTGCA
ACATCTGTTCCAGTGGTAATTTTCGAGAAGCCACTGTTAAATTTCACATTTGCAGACCTC
TTGTCTGCAACCTCAAATTTTGATCGGGGTACGCTATTGGCTGAAGGGAAGTTTGGACCT
GTTTATAGAGGATTTCTACCTGGTGGGATTCATGTAGCAGTAAAAGTTTTGGTCCATGGC
TTTACCATGACAGACCAAGAAGCTGCTAGAGAGCTGGAGCACCTTGGTCGTATCAAGCAT
CCTAATCTTGTTCCATTGACAGGATACTGCTTAGCTGGGGATCAAAGGATTGCTATTTAT
GAGTACATGGAGAATGGCAATTTGCAGAACTTGCTTCATGACTTACCACTTGGGGTTCAA
ACAACAGAGGATTGGAGTACAGATACATGGGAAGAAGATGACAACCATGGGATCCAAAAT
GTTGGATCTGAAGGGCTGTTAACAACATGGAGATTTCGTCACAAAATTGTACTAGGCACT
GCCCGTGCACTGGCATTTCTCCACCATGGCTGCTCACCTCCAATAATTCACAGGGATGTT
AAAGCTAGTAGTGTATACCTCGACACAAACTTAGAGCCAAGATTATCTGATTTTGGCTTG
GCTAAGATTGTTGGAAGTGGATTAGAGGATGACATCTCTCGTGGGTCACAGGGCTACATG
CCCCCAGAGCTATCTGATCCAGAATCTGGGACCCCAACACCAAAATCTGATGTTTATGGA
TTTGGCGTTGTTCTCTTGGAGCTAATTACCGGGAAAAAGCCCATTGGAGATGACTATCCA
GAGAAAGAATCAAGTTTGGTGAATTGGGTGAGAGGATTGGTGAGAAAGAACCAGGGATCA
AGAGCTATTGATCCAAAAATTCGTGGAACAGGACCGGATGCCCAAATGGAGGAGGCCTTG
AAGATTGGATATCTCTGCACCGCAGACCTTCCCTCAAAGCGGCCTAGCATGCAGCAGATA
GTTGGACTTCTTAAAGATATTGAACCAGTTGCGCATCGCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_11s0016g00040.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:11_random:15303:18064:-1 gene:VIT_11s0016g00040 transcript:VIT_11s0016g00040.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MGFGSLGFLLVLTLFFRPLPCQQPNTDGSFVLDFLEKMGLTSSQVYNFSIPFCSWPGVFC
DAKEENVVGLVASGLGLSGLIPDTTIGKLSKLQSLDLSNNKITGLSSDFWSLGSLKALNL
SSNLISGSLPSNIGNFGVLEILDLSNNNFSGEIPAAISSLTSLQVLKLDHNGFEWNIPLG
ILNCQSLVSMDLSFNRFNGTVPDGFGAAFPKIRILNLAGNEIHGRVSDFLELKSITVLNI
SRNQFQGSVMAVFQEPLQVIDLSKNHFQGHISQVHSNSSFNWSHLFYLDLSENDLSGEIF
HYLNEAQNLKYLNLAHNRFSEQEFPQIGMLFSLEYLNLSETRLTGPIPTDISQLSSLNTL
DLSKNHLSGQVPLPSIKNLQIFDISHNNLSGEIPLSLLEKLPWMERFNFSYNNLSLCSSE
FSQETLQTSFLGSTDSCPIAANPAFFKKKTPRHDGLKLALVLTLSMICLFVGLLFLAFGC
RRKTTMWAVKQLSYKEEQTISGPFSFQTDSTTWVADVKLATSVPVVIFEKPLLNFTFADL
LSATSNFDRGTLLAEGKFGPVYRGFLPGGIHVAVKVLVHGFTMTDQEAARELEHLGRIKH
PNLVPLTGYCLAGDQRIAIYEYMENGNLQNLLHDLPLGVQTTEDWSTDTWEEDDNHGIQN
VGSEGLLTTWRFRHKIVLGTARALAFLHHGCSPPIIHRDVKASSVYLDTNLEPRLSDFGL
AKIVGSGLEDDISRGSQGYMPPELSDPESGTPTPKSDVYGFGVVLLELITGKKPIGDDYP
EKESSLVNWVRGLVRKNQGSRAIDPKIRGTGPDAQMEEALKIGYLCTADLPSKRPSMQQI
VGLLKDIEPVAHR

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_11s0016g00040.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:11_random:15303:18064:-1 gene:VIT_11s0016g00040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

TTTCTTATTTCTGAGTGTTAGGACCTTATCTCCAATGGGTTTTGGTTCCTTGGGTTTTCT
TCTGGTTCTAACACTGTTCTTCAGGCCTTTACCTTGTCAACAACCCAATACGGATGGGTC
CTTTGTGTTGGATTTCTTGGAGAAGATGGGTTTAACATCTTCTCAAGTTTACAACTTTTC
TATCCCCTTTTGCTCATGGCCAGGAGTCTTCTGTGATGCCAAAGAAGAAAATGTTGTGGG
GTTGGTGGCTTCCGGGTTGGGTCTATCTGGTTTGATTCCTGACACCACCATTGGAAAACT
CAGCAAGCTTCAGTCTTTGGATCTCAGCAACAACAAAATCACTGGTTTGTCTTCAGATTT
CTGGAGTTTGGGCTCACTCAAGGCCCTTAATCTCTCAAGTAACCTGATTTCTGGGTCCCT
TCCTAGCAACATAGGCAATTTCGGTGTACTTGAAATCTTGGATCTTTCAAACAACAATTT
CTCTGGGGAAATTCCCGCTGCTATAAGCTCCCTCACCAGTCTGCAAGTTCTTAAACTTGA
TCACAATGGTTTTGAATGGAATATTCCATTGGGGATTCTCAATTGCCAATCTCTTGTTTC
AATGGATCTCTCTTTCAACCGGTTTAATGGAACAGTTCCTGATGGCTTTGGTGCTGCATT
TCCTAAGATCAGAATTTTGAACCTTGCTGGGAATGAGATTCATGGCCGGGTTTCAGATTT
CTTGGAACTGAAATCCATCACAGTTCTAAACATTTCCAGGAATCAGTTTCAGGGTTCTGT
AATGGCTGTTTTTCAGGAGCCACTGCAGGTCATTGACCTGAGTAAAAATCACTTTCAGGG
TCACATTTCTCAGGTACATTCTAATTCTAGCTTCAATTGGTCTCATTTGTTTTACCTAGA
CTTGTCTGAGAATGATCTCAGTGGAGAAATTTTTCATTATTTGAATGAGGCCCAAAATCT
CAAATACCTCAACCTTGCACACAATCGGTTTTCTGAACAAGAATTCCCACAAATTGGGAT
GCTCTTCAGTTTAGAATATCTTAACCTGTCTGAAACTAGACTCACAGGTCCCATTCCCAC
CGACATCTCACAATTAAGTAGTTTGAATACGCTAGACCTTTCCAAGAATCATCTTAGTGG
TCAAGTTCCTCTCCCCAGTATCAAAAACCTTCAAATTTTTGATATTTCACACAACAACTT
GAGTGGAGAAATCCCATTGTCACTCTTAGAGAAACTTCCATGGATGGAGAGATTCAACTT
CTCTTACAACAACTTGAGCCTCTGCTCTTCAGAGTTCTCACAGGAAACTCTCCAAACATC
CTTCCTTGGTTCTACAGACAGCTGCCCAATTGCTGCAAACCCTGCTTTCTTCAAAAAAAA
AACCCCAAGACATGATGGGCTCAAGCTTGCTTTGGTTTTAACCCTCTCAATGATCTGTTT
ATTCGTGGGATTGCTATTTCTAGCCTTTGGTTGCAGAAGGAAAACCACCATGTGGGCAGT
GAAGCAACTATCATATAAAGAAGAGCAAACTATTTCTGGTCCTTTTTCATTCCAGACGGA
TTCAACCACTTGGGTAGCTGATGTTAAGCTTGCAACATCTGTTCCAGTGGTAATTTTCGA
GAAGCCACTGTTAAATTTCACATTTGCAGACCTCTTGTCTGCAACCTCAAATTTTGATCG
GGGTACGCTATTGGCTGAAGGGAAGTTTGGACCTGTTTATAGAGGATTTCTACCTGGTGG
GATTCATGTAGCAGTAAAAGTTTTGGTCCATGGCTTTACCATGACAGACCAAGAAGCTGC
TAGAGAGCTGGAGCACCTTGGTCGTATCAAGCATCCTAATCTTGTTCCATTGACAGGATA
CTGCTTAGCTGGGGATCAAAGGATTGCTATTTATGAGTACATGGAGAATGGCAATTTGCA
GAACTTGCTTCATGACTTACCACTTGGGGTTCAAACAACAGAGGATTGGAGTACAGATAC
ATGGGAAGAAGATGACAACCATGGGATCCAAAATGTTGGATCTGAAGGGCTGTTAACAAC
ATGGAGATTTCGTCACAAAATTGTACTAGGCACTGCCCGTGCACTGGCATTTCTCCACCA
TGGCTGCTCACCTCCAATAATTCACAGGGATGTTAAAGCTAGTAGTGTATACCTCGACAC
AAACTTAGAGCCAAGATTATCTGATTTTGGCTTGGCTAAGATTGTTGGAAGTGGATTAGA
GGATGACATCTCTCGTGGGTCACAGGGCTACATGCCCCCAGAGCTATCTGATCCAGAATC
TGGGACCCCAACACCAAAATCTGATGTTTATGGATTTGGCGTTGTTCTCTTGGAGCTAAT
TACCGGGAAAAAGCCCATTGGAGATGACTATCCAGAGAAAGAATCAAGTTTGGTGAATTG
GGTGAGAGGATTGGTGAGAAAGAACCAGGGATCAAGAGCTATTGATCCAAAAATTCGTGG
AACAGGACCGGATGCCCAAATGGAGGAGGCCTTGAAGATTGGATATCTCTGCACCGCAGA
CCTTCCCTCAAAGCGGCCTAGCATGCAGCAGATAGTTGGACTTCTTAAAGATATTGAACC
AGTTGCGCATCGCTAAAGGAAAATTGACGTTGGTCTTTTGCTCTTTCCGTTATCTATTCA
TTTCCTTTTGCATGAGTTCTTTCTATATATGCTGCCATGGGAGGAAATGTACAGTAGTCC
CAAGACATGTTCTGGACTTTGGTTTCTCATTTCACCTTCCCATTGTTGATGGCAGAAAAG
CT