Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_10s0042g00770.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:10:14042781:14046546:-1 gene:VIT_10s0042g00770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGAGTGGTGTTCCATTAATCCATGTAGGGTGTTGGTGGTTTCAGTGGTATTGTTATCA TATAACATGCTCTTGATCTCATCACCTCCTGCTGCTGCTGCTACAACTGACGCACAGGTG GAGGCCGAGGCCGAAGCTCTCCGCAACTCCACTTGGTGGTGGTACATGGAAAACATTACT TCTCATCATTGCACATGGGACGGCATCACCTGCAACAGGGAGGGACATGTTATTCAGATT ACCTATTCACATTACAATTCCCCACGTATCTCTGATTGTGGACTTGATGGTGAGCTACCT GTTTCACTGGGTAACCTCACTCTATTAGTATACTTATCCCTTAATTTCAATCGAATCAAC GGTTCCATCCCTTCTGAAATTGGGAATTTAAAGAATCTAATTCATTTGGATTTGAGTTAT AACTATTACCTCTCTGGTGCCATCCCTTCCTCTCTTGGATATTTGAAGAATCTTATTCAT TTGGATTTGAGTCATTGCTATAGCCTCTATGGTGCCATCCCTTCCTCTCTTGGATATTTG AAGAATCTTATTCATTTGGATTTGAGTCATAACTCTGACCTCTATGGTGTCATTCCTTCC TCTCTTGGAAATTTAACCAACCTGGTATACTTATCCCTTAATTTCAATCGAATCAACGGT TCCATCCCTTCTGAAATTGGGAATTTAAAGAATCTAATTCATTTGGATTTGAGTTATAAC TATTACCTCTCTGGTGCCATCCCTTCCTCTATTGGATATTTGAAGAATCTGATTCATTTG GATTTGGGTTCTAACTCTCTTTCCAGTGTCATTCCTTCCTCTCTTGGAAGTTTAACCAAC CTGGAATACTTGTACCTTAATTTCAATCGAATCAACGGTTCCATCCCTTCTGAAATTGGG AATTTAAAAAATTTGGTTCAATTGTCCTTGAGTCATAATGCCCTTCTTGGTACTATTCCT TCATCTTTGGGTAATCTTATCAATTTGACTTATTTCCATCTCATCGACAATCAAATCCAG GGTCTCATCCCCTTGTCATTTGGTAATCTTACCAATTTGACTCATTTGTATCTTCGTTAT AATCAAATCAATGGTTCCATCCCTCCTGTAATTTGGAATCTGAAGAATTTAATTCATCTC AGATTGGATCACAACAACCTTACCGGTGTTATTCCTTCTTTGGGCTATCTCATTCATTTA AATGTGTTCAACATTCGTAGAAATCGAATCAGAGGTCACATTCCTTCTAAGATAGGAAAT TTGAATAATCTGACTAGCCTCGACCTTAGTGATAACTTGATCGATGGAAAGATACCTTCC CAGCTCCAAAATTTGAAGAGTTTAGAAAGCTTGAACCTCTCCCACAATAAACTCTCGGGT CACATTCCTCCTCTTTCTATATATATCCACAAAGGGTCATCCATTGATTTTTCACACAAT GATTTTGAGGGTCATATACCCCATGAATTGCAGTTTGTATATCCACCAAGGGTTTTTGGC CACAATAAAGGTTTATGTGGTGAAAGGGAAGGCTTGCCTCATTGCAAAAGAGGACACAAA ACTATTCTCATCATTTCTTTATCTACCATCTTGTTTCTTTCTTTTGTGGCCCTTGGGATT CTCTTGCTTTCACGGAAGACAAGAAGAAATCAAACCAAGGCAACTTCGACAAAAAATGGA GATATATTTTCAGTGTGGAACTATGATGGTAAGATTGCTTATGAAGATATCATTGAAGCA ACAGAAGATTTCGATATCAAATATTGCATAGGTACTGGAGGTTATGGCAGTGTTTACAAG GCTCAATTGCCTACAGGTAATGTGGTAGCCTTGAAAAAGCTTCATGGATGGGAAAGAGAT GAGGCAACATACTTGAAAAGTTTTCAAAATGAGGTGCAGGTTTTGTCAAAAATACAACAT CGGAATATCATAAAACTTCACGGCTATTGTCTGCACAAAAGATGCATGTTTTTGATTTAC AAGTACATGGAAAGAGGAAGCTTATACTGTGTATTGAGCAATGAAGTTGAAGCTTTGGAA TTGGATTGGATTAAAAGGGTGAATGTAATCAAAAGCATAGTCCATGCTTTATGTTACATG CATCATGACTCTACTCCACCCATTATTCATAGGGATGTATCAAGTAACAATATTCTTTTG GACTTTAAACTGGACGCTTTTCTATCTGATTTTGGCACTGCTAGACTGCTACATCCTGAT TCATCCAATCAAACTCTTCTTGCAGGCACTTATGGTTACATAGCACCAGAGCTTGCCTAC ACTATGGCTGTGACGGAAAAATGTGATGTTTACAGCTTTGGAGTGGTAGCGCTTGAGACA ATGATGGGAAGGCATCCGAGAGAACTTTTCACCTTATTGTCTTCCTCATCAGCTCAAAAC ATAATGCTCACCGACATATTAGATTCACGTCTACCATCTCCTCAAGATCGACAAGTTGCT AGAGATGTAGTTCTTGTTGTGTGGTTGGCACTTAAATGCATACATTCTAATCCAAGATCT CGTCCAACGATGCAACACATCTCATCGAAGCTTCTTATTCAATCACCATTTCTTGAACCT TTTCATGGGATTTCACTTTGGCAACTAAATATTCAAGAAATATAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_10s0042g00770.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:10:14042781:14046546:-1 gene:VIT_10s0042g00770 transcript:VIT_10s0042g00770.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MEWCSINPCRVLVVSVVLLSYNMLLISSPPAAAATTDAQVEAEAEALRNSTWWWYMENIT SHHCTWDGITCNREGHVIQITYSHYNSPRISDCGLDGELPVSLGNLTLLVYLSLNFNRIN GSIPSEIGNLKNLIHLDLSYNYYLSGAIPSSLGYLKNLIHLDLSHCYSLYGAIPSSLGYL KNLIHLDLSHNSDLYGVIPSSLGNLTNLVYLSLNFNRINGSIPSEIGNLKNLIHLDLSYN YYLSGAIPSSIGYLKNLIHLDLGSNSLSSVIPSSLGSLTNLEYLYLNFNRINGSIPSEIG NLKNLVQLSLSHNALLGTIPSSLGNLINLTYFHLIDNQIQGLIPLSFGNLTNLTHLYLRY NQINGSIPPVIWNLKNLIHLRLDHNNLTGVIPSLGYLIHLNVFNIRRNRIRGHIPSKIGN LNNLTSLDLSDNLIDGKIPSQLQNLKSLESLNLSHNKLSGHIPPLSIYIHKGSSIDFSHN DFEGHIPHELQFVYPPRVFGHNKGLCGEREGLPHCKRGHKTILIISLSTILFLSFVALGI LLLSRKTRRNQTKATSTKNGDIFSVWNYDGKIAYEDIIEATEDFDIKYCIGTGGYGSVYK AQLPTGNVVALKKLHGWERDEATYLKSFQNEVQVLSKIQHRNIIKLHGYCLHKRCMFLIY KYMERGSLYCVLSNEVEALELDWIKRVNVIKSIVHALCYMHHDSTPPIIHRDVSSNNILL DFKLDAFLSDFGTARLLHPDSSNQTLLAGTYGYIAPELAYTMAVTEKCDVYSFGVVALET MMGRHPRELFTLLSSSSAQNIMLTDILDSRLPSPQDRQVARDVVLVVWLALKCIHSNPRS RPTMQHISSKLLIQSPFLEPFHGISLWQLNIQEI

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_10s0042g00770.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:10:14042781:14046546:-1 gene:VIT_10s0042g00770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGAGTGGTGTTCCATTAATCCATGTAGGGTGTTGGTGGTTTCAGTGGTATTGTTATCA TATAACATGCTCTTGATCTCATCACCTCCTGCTGCTGCTGCTACAACTGACGCACAGGTG GAGGCCGAGGCCGAAGCTCTCCGCAACTCCACTTGGTGGTGGTACATGGAAAACATTACT TCTCATCATTGCACATGGGACGGCATCACCTGCAACAGGGAGGGACATGTTATTCAGATT ACCTATTCACATTACAATTCCCCACGTATCTCTGATTGTGGACTTGATGGTGAGCTACCT GTTTCACTGGGTAACCTCACTCTATTAGTATACTTATCCCTTAATTTCAATCGAATCAAC GGTTCCATCCCTTCTGAAATTGGGAATTTAAAGAATCTAATTCATTTGGATTTGAGTTAT AACTATTACCTCTCTGGTGCCATCCCTTCCTCTCTTGGATATTTGAAGAATCTTATTCAT TTGGATTTGAGTCATTGCTATAGCCTCTATGGTGCCATCCCTTCCTCTCTTGGATATTTG AAGAATCTTATTCATTTGGATTTGAGTCATAACTCTGACCTCTATGGTGTCATTCCTTCC TCTCTTGGAAATTTAACCAACCTGGTATACTTATCCCTTAATTTCAATCGAATCAACGGT TCCATCCCTTCTGAAATTGGGAATTTAAAGAATCTAATTCATTTGGATTTGAGTTATAAC TATTACCTCTCTGGTGCCATCCCTTCCTCTATTGGATATTTGAAGAATCTGATTCATTTG GATTTGGGTTCTAACTCTCTTTCCAGTGTCATTCCTTCCTCTCTTGGAAGTTTAACCAAC CTGGAATACTTGTACCTTAATTTCAATCGAATCAACGGTTCCATCCCTTCTGAAATTGGG AATTTAAAAAATTTGGTTCAATTGTCCTTGAGTCATAATGCCCTTCTTGGTACTATTCCT TCATCTTTGGGTAATCTTATCAATTTGACTTATTTCCATCTCATCGACAATCAAATCCAG GGTCTCATCCCCTTGTCATTTGGTAATCTTACCAATTTGACTCATTTGTATCTTCGTTAT AATCAAATCAATGGTTCCATCCCTCCTGTAATTTGGAATCTGAAGAATTTAATTCATCTC AGATTGGATCACAACAACCTTACCGGTGTTATTCCTTCTTTGGGCTATCTCATTCATTTA AATGTGTTCAACATTCGTAGAAATCGAATCAGAGGTCACATTCCTTCTAAGATAGGAAAT TTGAATAATCTGACTAGCCTCGACCTTAGTGATAACTTGATCGATGGAAAGATACCTTCC CAGCTCCAAAATTTGAAGAGTTTAGAAAGCTTGAACCTCTCCCACAATAAACTCTCGGGT CACATTCCTCCTCTTTCTATATATATCCACAAAGGGTCATCCATTGATTTTTCACACAAT GATTTTGAGGGTCATATACCCCATGAATTGCAGTTTGTATATCCACCAAGGGTTTTTGGC CACAATAAAGGTTTATGTGGTGAAAGGGAAGGCTTGCCTCATTGCAAAAGAGGACACAAA ACTATTCTCATCATTTCTTTATCTACCATCTTGTTTCTTTCTTTTGTGGCCCTTGGGATT CTCTTGCTTTCACGGAAGACAAGAAGAAATCAAACCAAGGCAACTTCGACAAAAAATGGA GATATATTTTCAGTGTGGAACTATGATGGTAAGATTGCTTATGAAGATATCATTGAAGCA ACAGAAGATTTCGATATCAAATATTGCATAGGTACTGGAGGTTATGGCAGTGTTTACAAG GCTCAATTGCCTACAGGTAATGTGGTAGCCTTGAAAAAGCTTCATGGATGGGAAAGAGAT GAGGCAACATACTTGAAAAGTTTTCAAAATGAGGTGCAGGTTTTGTCAAAAATACAACAT CGGAATATCATAAAACTTCACGGCTATTGTCTGCACAAAAGATGCATGTTTTTGATTTAC AAGTACATGGAAAGAGGAAGCTTATACTGTGTATTGAGCAATGAAGTTGAAGCTTTGGAA TTGGATTGGATTAAAAGGGTGAATGTAATCAAAAGCATAGTCCATGCTTTATGTTACATG CATCATGACTCTACTCCACCCATTATTCATAGGGATGTATCAAGTAACAATATTCTTTTG GACTTTAAACTGGACGCTTTTCTATCTGATTTTGGCACTGCTAGACTGCTACATCCTGAT TCATCCAATCAAACTCTTCTTGCAGGCACTTATGGTTACATAGCACCAGAGCTTGCCTAC ACTATGGCTGTGACGGAAAAATGTGATGTTTACAGCTTTGGAGTGGTAGCGCTTGAGACA ATGATGGGAAGGCATCCGAGAGAACTTTTCACCTTATTGTCTTCCTCATCAGCTCAAAAC ATAATGCTCACCGACATATTAGATTCACGTCTACCATCTCCTCAAGATCGACAAGTTGCT AGAGATGTAGTTCTTGTTGTGTGGTTGGCACTTAAATGCATACATTCTAATCCAAGATCT CGTCCAACGATGCAACACATCTCATCGAAGCTTCTTATTCAATCACCATTTCTTGAACCT TTTCATGGGATTTCACTTTGGCAACTAAATATTCAAGAAATATAA