Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_10s0042g00570.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:10:13497183:13498909:-1 gene:VIT_10s0042g00570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGTATGGTTCTTGTGGCGATATCGGATCTGCCCGTAAGGTGTTTGATGAAATGCTTATT AGAAACTCGGTTTCTTGGAATGCAATGCTGGATGGGTATGCCAAGTGTGGGGACTTGGAC TCGGCCCGCCAAGTGTTTGAGTCGATGCCGGATAGAGATGTCGTGTCGTGGAGCTCGATG ATTGATGGGTGTGTCAAGGGTGGTGAGTATGGCGTGGCTCTGGCCATTTTTGAGAGAATG CGGGTGGTGGGGCCTAAGGCGAATGAGGTGACAATGGTGAGCGTTTTGTGTGCTTGTGCC CACTTGGGGGCGCTCGAGCAAGGGAGGACGATGCATCAGTACATGGTGGATAATACAATG CGGTTTACTTTAGTGTTGAGGACGTCGCTTATGGACATGTACGCCAAATGTGGGGCGATA GAGGAGGCTATCGCTGTGTTTCGTGGGGTTCCAATGGATCAAACCGATGTTTTGATGTGG AACACCATCATTGGAGGGCTCGCGACACATGGACTAGTTCATGAGTCACTTGAGTTGTTC AAGGAAATGCAAGTTCTAGGAATTGTTCCTGACGAGATCACATACTTGTGCTTGTTCAGC GCTTGTGCTCATGGGGGTTTAGTACATGAAGCTTGGCATTTCTTCAAGTCCCTTGGGAAA CAAGGCATGGTGCCCAAGAGCGAGCACTATGCCTGCATGGTGGATGTTCTATCACGCGCA GGCCAATTAGCAGAGGCATACGATTTCATAGCTCAAATGCCAATGGAACCAACCGCTTCA ATGCTAGGTGCTCTGCTTAACGGGTGTATGAACCATAGAAGATTCGACCTTGCAGAAAGA GTTGGGAGAAAGCTTATAGAATTGGAGCCTGATCATGATGGTAGGTACATTGGTTTATCA AACGTTTATGCAGGCGTGAAGCTCTGGGACAATGCGAGAATGATGAGGGAAGCCATGGAG AGGAGAGGGGTGAAGAAATCGCCTGGGTTTAGTTTTGTGGAAGTGTTGGGAACTCTTCAT AGATTCATAGCTCATGATAAAACACATAACGATTTAGAGAAAATTTATATGATGCTGAAC ACCATTGTGAGGCAAATGATGGTTGATGTTGATTTTGAAACTCAAGAACGTGGTTTCTAT GATATAGAAGTCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_10s0042g00570.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:10:13497183:13498909:-1 gene:VIT_10s0042g00570 transcript:VIT_10s0042g00570.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MYGSCGDIGSARKVFDEMLIRNSVSWNAMLDGYAKCGDLDSARQVFESMPDRDVVSWSSM IDGCVKGGEYGVALAIFERMRVVGPKANEVTMVSVLCACAHLGALEQGRTMHQYMVDNTM RFTLVLRTSLMDMYAKCGAIEEAIAVFRGVPMDQTDVLMWNTIIGGLATHGLVHESLELF KEMQVLGIVPDEITYLCLFSACAHGGLVHEAWHFFKSLGKQGMVPKSEHYACMVDVLSRA GQLAEAYDFIAQMPMEPTASMLGALLNGCMNHRRFDLAERVGRKLIELEPDHDGRYIGLS NVYAGVKLWDNARMMREAMERRGVKKSPGFSFVEVLGTLHRFIAHDKTHNDLEKIYMMLN TIVRQMMVDVDFETQERGFYDIEV

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_10s0042g00570.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:10:13497183:13498909:-1 gene:VIT_10s0042g00570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	TGCCGATCAATGTCTGAATTCAAGCAAATTCAGGCTTTCTTCATCACCTCTGGCCTCTCC CAACATCACCCTTTTGCCTCAAGGCTCCTATCTTTCTCTGCAATTTCCAGTTGGGGCGAT ATCGATCACTCGTATCGCATTTTTCTGCAAATTCCCAGCCCAACAATCTCCAACTGGAAC AGCATCATAAGGGGTTTCTCCAAAGGCAAAAACCCAAATCCATCTGTCTCAGTATTTGTC AAAATGCTGCGGTTTGGGGTCTGCCCCGACCACCTAACATACCCCTTTATTGCAAAGGCA GTCGCGCGTCTGTCCGAGCTCCGGCTCGCACTGGCGGTGCATTGCCGCATTGCGAAAGAG GGCTTGTGGTTTGATAGGTTTATTGCGAATTCTTTGATCCATATGTATGGTTCTTGTGGC GATATCGGATCTGCCCGTAAGGTGTTTGATGAAATGCTTATTAGAAACTCGGTTTCTTGG AATGCAATGCTGGATGGGTATGCCAAGTGTGGGGACTTGGACTCGGCCCGCCAAGTGTTT GAGTCGATGCCGGATAGAGATGTCGTGTCGTGGAGCTCGATGATTGATGGGTGTGTCAAG GGTGGTGAGTATGGCGTGGCTCTGGCCATTTTTGAGAGAATGCGGGTGGTGGGGCCTAAG GCGAATGAGGTGACAATGGTGAGCGTTTTGTGTGCTTGTGCCCACTTGGGGGCGCTCGAG CAAGGGAGGACGATGCATCAGTACATGGTGGATAATACAATGCGGTTTACTTTAGTGTTG AGGACGTCGCTTATGGACATGTACGCCAAATGTGGGGCGATAGAGGAGGCTATCGCTGTG TTTCGTGGGGTTCCAATGGATCAAACCGATGTTTTGATGTGGAACACCATCATTGGAGGG CTCGCGACACATGGACTAGTTCATGAGTCACTTGAGTTGTTCAAGGAAATGCAAGTTCTA GGAATTGTTCCTGACGAGATCACATACTTGTGCTTGTTCAGCGCTTGTGCTCATGGGGGT TTAGTACATGAAGCTTGGCATTTCTTCAAGTCCCTTGGGAAACAAGGCATGGTGCCCAAG AGCGAGCACTATGCCTGCATGGTGGATGTTCTATCACGCGCAGGCCAATTAGCAGAGGCA TACGATTTCATAGCTCAAATGCCAATGGAACCAACCGCTTCAATGCTAGGTGCTCTGCTT AACGGGTGTATGAACCATAGAAGATTCGACCTTGCAGAAAGAGTTGGGAGAAAGCTTATA GAATTGGAGCCTGATCATGATGGTAGGTACATTGGTTTATCAAACGTTTATGCAGGCGTG AAGCTCTGGGACAATGCGAGAATGATGAGGGAAGCCATGGAGAGGAGAGGGGTGAAGAAA TCGCCTGGGTTTAGTTTTGTGGAAGTGTTGGGAACTCTTCATAGATTCATAGCTCATGAT AAAACACATAACGATTTAGAGAAAATTTATATGATGCTGAACACCATTGTGAGGCAAATG ATGGTTGATGTTGATTTTGAAACTCAAGAACGTGGTTTCTATGATATAGAAGTCTGAATT GTTCTGAGATGGATTGTTTGTATGGTAACTCATGAGTGATTGTAAATGGGAGAGCTGTGA TTCAGGATTTATGGTACATTTTCTTATGGCTTCAAGAATCAAGCCAATGTTTGCTTCTCA AGAAAAGAATACCCCTTTTGCCAAGGCCCTCCTCTCATTTGAAATAT