Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_10s0042g00220.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:10:13051229:13052844:1 gene:VIT_10s0042g00220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATCAATGGCTATGCAATTGTTGGGAAGATTGACGAAGCTAAGAGACTGTTTGATGAA ATGCCTGAGAGAAATCTGGTATCTTGGAATTCCATGTTGGCTGGGTTTGTCAAATGTGGG AATGTGGAGGACGCTTTTGGGCTGTTCAGTGAGATGCCCTGTAGGGATGTAGTGTCATGG AACTCCATGTTGGCGTGCTACGCGCAGTGTGGGAAGCCGAATGAGGCCCTTGCACTTTTT GATCAAATGCGGGCTGTGGGCGTAAAGCCAACTGAAGCAACTGTTGTCAGCCTCTTATCG GCTTGTGCCCATTTGGGCGCTTTGGACAAGGGTTTGCATTTGCATACTTATATCAATGAT AATAGAATTGAGGTCAATTCCATTGTTGGCACTGCACTTGTGGACATGTATGCGAAATGT GGAAAAATTTCCCTTGCCACACAAGTTTTTAATGCAATGGAGTCCAAAGATGTTCTAGCT TGGAACACAATCATAGCAGGCATGGCCATACACGGCCATGTCAAAGAAGCCCAACGGCTT TTCAAGGAGATGAAAGAGGCGGGTGTTGAACCAAATGACATAACCTTTGTGGCTATGCTT AGTGCCTGTAGCCATGCTGGAATGGTGGATGAAGGTCAAAAACTCTTAGACTGCATGAGC AGCAGTTACGGGATTGAACCAAAGGTTGAGCACTATGGTTGTGTTATTGATCTCCTTGCC CGTGCAGGGCTCTTGGAGGAGGCTATGGAACTTATAGGGACCATGCCCATGGAGCCCAAC CCATGTGCATTGGGGGCATTGCTTGGAGGCTGCAGGATCCATGGCAACTTTGAGCTGGGT GAGATGGTGGGAAAACGCCTCATCAACCTTCAGCCATGCCACAGTGGCCGCTACATCCTC CTCTCAAACATATATGCAGCAGCAAAAAAATGGGACGATGCAAGAAAAGTGAGGAACCTT ATGAAGGTCAACGGCATCTCCAAGGTGCCAGGAGTGAGCGTGATCGAGCTGAAAGGCATG GTGCATCGGTTTGTGGCCGGTGACTGGTCACACCCGGAATCAAACAAGATATATGAGAAG TTGAATGAGATACACACAAGGCTGAAGAGTGCAATTGGGCATTCAGCAGATACCGGGGAT GTGTTGTTGGACATGGAAGAGGAAGATAAAGAACATGCTCTACCTGTTCATAGTGAGAAG CTGGCCATTGCTTATGGGCTACTACACTTGGATTCAAAAGAAGCCATTAGGATTGTGAAG AACCTTAGGGTTTGCAGAGATTGTCACCATGTCACCAAGCTGATTTCAAAGGTTTATGGT CGAGAAATTATTGTAAGGGATCGGAATCGGTTTCATCATTTTGAAGATGGTGAATGTTCC TGTCTTGATTTTTGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_10s0042g00220.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:10:13051229:13052844:1 gene:VIT_10s0042g00220 transcript:VIT_10s0042g00220.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MINGYAIVGKIDEAKRLFDEMPERNLVSWNSMLAGFVKCGNVEDAFGLFSEMPCRDVVSW NSMLACYAQCGKPNEALALFDQMRAVGVKPTEATVVSLLSACAHLGALDKGLHLHTYIND NRIEVNSIVGTALVDMYAKCGKISLATQVFNAMESKDVLAWNTIIAGMAIHGHVKEAQRL FKEMKEAGVEPNDITFVAMLSACSHAGMVDEGQKLLDCMSSSYGIEPKVEHYGCVIDLLA RAGLLEEAMELIGTMPMEPNPCALGALLGGCRIHGNFELGEMVGKRLINLQPCHSGRYIL LSNIYAAAKKWDDARKVRNLMKVNGISKVPGVSVIELKGMVHRFVAGDWSHPESNKIYEK LNEIHTRLKSAIGHSADTGDVLLDMEEEDKEHALPVHSEKLAIAYGLLHLDSKEAIRIVK NLRVCRDCHHVTKLISKVYGREIIVRDRNRFHHFEDGECSCLDFW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_10s0042g00220.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:10:13051229:13052844:1 gene:VIT_10s0042g00220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATCAATGGCTATGCAATTGTTGGGAAGATTGACGAAGCTAAGAGACTGTTTGATGAA ATGCCTGAGAGAAATCTGGTATCTTGGAATTCCATGTTGGCTGGGTTTGTCAAATGTGGG AATGTGGAGGACGCTTTTGGGCTGTTCAGTGAGATGCCCTGTAGGGATGTAGTGTCATGG AACTCCATGTTGGCGTGCTACGCGCAGTGTGGGAAGCCGAATGAGGCCCTTGCACTTTTT GATCAAATGCGGGCTGTGGGCGTAAAGCCAACTGAAGCAACTGTTGTCAGCCTCTTATCG GCTTGTGCCCATTTGGGCGCTTTGGACAAGGGTTTGCATTTGCATACTTATATCAATGAT AATAGAATTGAGGTCAATTCCATTGTTGGCACTGCACTTGTGGACATGTATGCGAAATGT GGAAAAATTTCCCTTGCCACACAAGTTTTTAATGCAATGGAGTCCAAAGATGTTCTAGCT TGGAACACAATCATAGCAGGCATGGCCATACACGGCCATGTCAAAGAAGCCCAACGGCTT TTCAAGGAGATGAAAGAGGCGGGTGTTGAACCAAATGACATAACCTTTGTGGCTATGCTT AGTGCCTGTAGCCATGCTGGAATGGTGGATGAAGGTCAAAAACTCTTAGACTGCATGAGC AGCAGTTACGGGATTGAACCAAAGGTTGAGCACTATGGTTGTGTTATTGATCTCCTTGCC CGTGCAGGGCTCTTGGAGGAGGCTATGGAACTTATAGGGACCATGCCCATGGAGCCCAAC CCATGTGCATTGGGGGCATTGCTTGGAGGCTGCAGGATCCATGGCAACTTTGAGCTGGGT GAGATGGTGGGAAAACGCCTCATCAACCTTCAGCCATGCCACAGTGGCCGCTACATCCTC CTCTCAAACATATATGCAGCAGCAAAAAAATGGGACGATGCAAGAAAAGTGAGGAACCTT ATGAAGGTCAACGGCATCTCCAAGGTGCCAGGAGTGAGCGTGATCGAGCTGAAAGGCATG GTGCATCGGTTTGTGGCCGGTGACTGGTCACACCCGGAATCAAACAAGATATATGAGAAG TTGAATGAGATACACACAAGGCTGAAGAGTGCAATTGGGCATTCAGCAGATACCGGGGAT GTGTTGTTGGACATGGAAGAGGAAGATAAAGAACATGCTCTACCTGTTCATAGTGAGAAG CTGGCCATTGCTTATGGGCTACTACACTTGGATTCAAAAGAAGCCATTAGGATTGTGAAG AACCTTAGGGTTTGCAGAGATTGTCACCATGTCACCAAGCTGATTTCAAAGGTTTATGGT CGAGAAATTATTGTAAGGGATCGGAATCGGTTTCATCATTTTGAAGATGGTGAATGTTCC TGTCTTGATTTTTGGTAGAGTCAGTGTTAAATATTGAATATGGGTTTATTTATTATAATT TAATAATAAAAAGATAAAAATTGATAATATTTTTAATAATATGTTATGTAATAAAATTTA ATCAACTTTTAAATTGATTTTTAATAAGAGAAGCAGTTTTTT