Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_10s0042g00130.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:10:12841595:12845393:-1 gene:VIT_10s0042g00130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGATGTGAGGAGATGGTGGTGGGTGGCGGTGGTGGTAGAGGCTCAACGGTTCCTTTT GTTTCAAAGCTCAATCATCTTTCTCTATTTACTAATAAAATGCTAAGAAATCAACACCAT GTCTATACATCCAAATCCTGCAATTGTTCCTCTTCTCTCTCATTTAGAAATGACCCAACT GCCCTCTCCACTGCACTTACTCACTCTGCAAATTCAAAATGTATTCTTCTCGGAAGTCAA ATACACGCCCAGATCATCAAGTTGGGATTCTGCAATGACATTTTCTCACAAAATAATCTC ATCAGGATGTACACCAAATGTGGGTTCTTGGCTGGTGGGCTTAAGGTGTTTGGTGAAATG CCTATGAAAAACCTTGTTTCTTGGACTTTGGTGGTCTCTGGTGCTGTACAAAATGGTGAG TTTGAGATGGGTCTGGGAGTGTATTTGGAGATGATAAGAACTGGGTTGGTCCCTAATGAG TTTGCTCTTGGCTGTGTTACGAAGGCGTGTGCTGCTTTGGGGGGTAAAGAATTGGGTTTG TGCGTACATTGTTTTGCTCTGAAAGTTGGAATGGAGAAGAATCCATTTGTGGGTAGTTCC ATTTTGAACATGTATGCTAAGTTGGGGGATATTGAAGATGCTGAGCGGGTGTTTGAGTGT ATGGACAATCTTGTTGTTGGTTGTTGGAATGCTATGATTGGAGGCTATGCACAATGTAGT TATGGCTTTGAAAGTCTCAAGATTGTGTCTGTGATGCAATATAAAGGAATAAGTATGGAT GCTTTCACCTTCATTAATGCTCTCAAAGGGTGCTTGGTTGTGGGTAATTTGAATTTTGGA AGACAGATTCATGGATTGATCATTCAGAGTGAGGTGGGATTTAGTACTGCAGTAATGAAT TCTCTTATGGACATGTACTTTAAAAATGGTGGAGGGTTGTATGCTTTGAAGGTTTTTGAT AGGTTGCAAGATAAAGATATTATATCTTGGAATACTGTGTTTGCAGGCTTATCACAAGGT GATGATGCAAGAGAAATAGGAAGATTCTTCCATAAATTAATGTTAACAGGCTTAAAGCCC AACTGTGTGACTTTCTCAATCTTGTTTAGATTTTGTGGAGAGGCTCTTGATCTTGTTTCT GGGCTTCAGTTTCATTGTCTTGCTTTTCGGTTTGGAATCTCTGATGAAGCAAGTGTCACC AGCTCACTCATCAATATGTTCTCTAGATGTGGGGCAATGAGGATGGCATGTTTAGTGTTT GACAGTGCACCTTTCAAAAGCATACATACTTGCAATGAAATGATTTCTGGTTATAATTTA AATTGTCATAATGCAGAAGCCCTGAACCTTTTCTGTAACTTAAACGGCCTGGGACTTGAA GCAGACGAGTGTACCTTCTCAAGCGCCTTGGAAGCTTGTTTCAGAACTGAAAACCAAAAA TTAGGTAGACAAATGCATGGCACTATAGTTAAGTCTGGTTTTGCATCTCAAGGATATGTC TGTAGTTCATTACTTAAGTGTTATGTTGGATTTGGACTGCTAGATGATTCTTTTGAGTTT TTTAATGGGGTTGAGAGATTAGATTTGGTATCTTGGGGGGCCATGATTTCTGCATTGGTG CATAAAGGTTATAGCTCAGAAGCTATTGGTCTTCTTAACCGTCTGAAGGAAGCTGGTGGG AAGCCTGACGAGTTTATCTTTGGCAGCATTTTTAATTGTTGTGCTGGTATTGCAGCTTAT CGCCAAACTAAATCTGTCCATTCCCTTGTTGTCAAAATGGGATATGAGGCACATGTATTT GTAGCGAGTGCAGTAATAGATGCGTATGCAAAATGTGGGGACATTGAAAATGCAAGGAGA GTTTTTGATCAAACATCCAGATTTCGTGATGTTATTCTTTTTAATACTATGGTCATGGCA TATGCACATCATGGTCTTGTAAGGGAAGCTGTGGAAACGTTTGAAAAGATGAAGTTGGCT ACCCTAGAGCCTAGCCAAGCCACTTTTGTTTCAGTTATATCTGCTTGTAGTCATCTTGGT CTTGTTGAACAAGGTGATATTTTCTTCAAATCGATGAACTTGGATTATGGGATGGACCCT TCTCCAGATAATTACGGCTGCTTAGTTGACTTGTTTTCACGAAATGGATTTCTTGAAGAT GCTAAACATATAATTGAAACAATGCCTTTTCCTCCCTGGCCAGCTATTTGGAGATCCTTG TTGAATGGCTGTAGGATACATGGAAATAAAGAATTGGGAGAATGGGCTGCTAAGAAACTA CTTCAGTTGGTTCCTGAGAATGATGCAGCATATGTTTTACTGTCAAAGGTTTATTCTGAA GAGGGTAGTTGGAGTGATGCTGCAAAGGTGAGGAAGGGGATGATAGAAAGAGGATTATGG AAAGATCCAGGTTGTAGTTGGATTGAGATATAA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_10s0042g00130.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:10:12841595:12845393:-1 gene:VIT_10s0042g00130 transcript:VIT_10s0042g00130.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MGCEEMVVGGGGGRGSTVPFVSKLNHLSLFTNKMLRNQHHVYTSKSCNCSSSLSFRNDPT ALSTALTHSANSKCILLGSQIHAQIIKLGFCNDIFSQNNLIRMYTKCGFLAGGLKVFGEM PMKNLVSWTLVVSGAVQNGEFEMGLGVYLEMIRTGLVPNEFALGCVTKACAALGGKELGL CVHCFALKVGMEKNPFVGSSILNMYAKLGDIEDAERVFECMDNLVVGCWNAMIGGYAQCS YGFESLKIVSVMQYKGISMDAFTFINALKGCLVVGNLNFGRQIHGLIIQSEVGFSTAVMN SLMDMYFKNGGGLYALKVFDRLQDKDIISWNTVFAGLSQGDDAREIGRFFHKLMLTGLKP NCVTFSILFRFCGEALDLVSGLQFHCLAFRFGISDEASVTSSLINMFSRCGAMRMACLVF DSAPFKSIHTCNEMISGYNLNCHNAEALNLFCNLNGLGLEADECTFSSALEACFRTENQK LGRQMHGTIVKSGFASQGYVCSSLLKCYVGFGLLDDSFEFFNGVERLDLVSWGAMISALV HKGYSSEAIGLLNRLKEAGGKPDEFIFGSIFNCCAGIAAYRQTKSVHSLVVKMGYEAHVF VASAVIDAYAKCGDIENARRVFDQTSRFRDVILFNTMVMAYAHHGLVREAVETFEKMKLA TLEPSQATFVSVISACSHLGLVEQGDIFFKSMNLDYGMDPSPDNYGCLVDLFSRNGFLED AKHIIETMPFPPWPAIWRSLLNGCRIHGNKELGEWAAKKLLQLVPENDAAYVLLSKVYSE EGSWSDAAKVRKGMIERGLWKDPGCSWIEI

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_10s0042g00130.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:10:12841595:12845393:-1 gene:VIT_10s0042g00130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGATGTGAGGAGATGGTGGTGGGTGGCGGTGGTGGTAGAGGCTCAACGGTTCCTTTT GTTTCAAAGCTCAATCATCTTTCTCTATTTACTAATAAAATGCTAAGAAATCAACACCAT GTCTATACATCCAAATCCTGCAATTGTTCCTCTTCTCTCTCATTTAGAAATGACCCAACT GCCCTCTCCACTGCACTTACTCACTCTGCAAATTCAAAATGTATTCTTCTCGGAAGTCAA ATACACGCCCAGATCATCAAGTTGGGATTCTGCAATGACATTTTCTCACAAAATAATCTC ATCAGGATGTACACCAAATGTGGGTTCTTGGCTGGTGGGCTTAAGGTGTTTGGTGAAATG CCTATGAAAAACCTTGTTTCTTGGACTTTGGTGGTCTCTGGTGCTGTACAAAATGGTGAG TTTGAGATGGGTCTGGGAGTGTATTTGGAGATGATAAGAACTGGGTTGGTCCCTAATGAG TTTGCTCTTGGCTGTGTTACGAAGGCGTGTGCTGCTTTGGGGGGTAAAGAATTGGGTTTG TGCGTACATTGTTTTGCTCTGAAAGTTGGAATGGAGAAGAATCCATTTGTGGGTAGTTCC ATTTTGAACATGTATGCTAAGTTGGGGGATATTGAAGATGCTGAGCGGGTGTTTGAGTGT ATGGACAATCTTGTTGTTGGTTGTTGGAATGCTATGATTGGAGGCTATGCACAATGTAGT TATGGCTTTGAAAGTCTCAAGATTGTGTCTGTGATGCAATATAAAGGAATAAGTATGGAT GCTTTCACCTTCATTAATGCTCTCAAAGGGTGCTTGGTTGTGGGTAATTTGAATTTTGGA AGACAGATTCATGGATTGATCATTCAGAGTGAGGTGGGATTTAGTACTGCAGTAATGAAT TCTCTTATGGACATGTACTTTAAAAATGGTGGAGGGTTGTATGCTTTGAAGGTTTTTGAT AGGTTGCAAGATAAAGATATTATATCTTGGAATACTGTGTTTGCAGGCTTATCACAAGGT GATGATGCAAGAGAAATAGGAAGATTCTTCCATAAATTAATGTTAACAGGCTTAAAGCCC AACTGTGTGACTTTCTCAATCTTGTTTAGATTTTGTGGAGAGGCTCTTGATCTTGTTTCT GGGCTTCAGTTTCATTGTCTTGCTTTTCGGTTTGGAATCTCTGATGAAGCAAGTGTCACC AGCTCACTCATCAATATGTTCTCTAGATGTGGGGCAATGAGGATGGCATGTTTAGTGTTT GACAGTGCACCTTTCAAAAGCATACATACTTGCAATGAAATGATTTCTGGTTATAATTTA AATTGTCATAATGCAGAAGCCCTGAACCTTTTCTGTAACTTAAACGGCCTGGGACTTGAA GCAGACGAGTGTACCTTCTCAAGCGCCTTGGAAGCTTGTTTCAGAACTGAAAACCAAAAA TTAGGTAGACAAATGCATGGCACTATAGTTAAGTCTGGTTTTGCATCTCAAGGATATGTC TGTAGTTCATTACTTAAGTGTTATGTTGGATTTGGACTGCTAGATGATTCTTTTGAGTTT TTTAATGGGGTTGAGAGATTAGATTTGGTATCTTGGGGGGCCATGATTTCTGCATTGGTG CATAAAGGTTATAGCTCAGAAGCTATTGGTCTTCTTAACCGTCTGAAGGAAGCTGGTGGG AAGCCTGACGAGTTTATCTTTGGCAGCATTTTTAATTGTTGTGCTGGTATTGCAGCTTAT CGCCAAACTAAATCTGTCCATTCCCTTGTTGTCAAAATGGGATATGAGGCACATGTATTT GTAGCGAGTGCAGTAATAGATGCGTATGCAAAATGTGGGGACATTGAAAATGCAAGGAGA GTTTTTGATCAAACATCCAGATTTCGTGATGTTATTCTTTTTAATACTATGGTCATGGCA TATGCACATCATGGTCTTGTAAGGGAAGCTGTGGAAACGTTTGAAAAGATGAAGTTGGCT ACCCTAGAGCCTAGCCAAGCCACTTTTGTTTCAGTTATATCTGCTTGTAGTCATCTTGGT CTTGTTGAACAAGGTGATATTTTCTTCAAATCGATGAACTTGGATTATGGGATGGACCCT TCTCCAGATAATTACGGCTGCTTAGTTGACTTGTTTTCACGAAATGGATTTCTTGAAGAT GCTAAACATATAATTGAAACAATGCCTTTTCCTCCCTGGCCAGCTATTTGGAGATCCTTG TTGAATGGCTGTAGGATACATGGAAATAAAGAATTGGGAGAATGGGCTGCTAAGAAACTA CTTCAGTTGGTTCCTGAGAATGATGCAGCATATGTTTTACTGTCAAAGGTTTATTCTGAA GAGGGTAGTTGGAGTGATGCTGCAAAGGTGAGGAAGGGGATGATAGAAAGAGGATTATGG AAAGATCCAGGTTGTAGTTGGATTGAGATATAA