Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_10s0003g05800.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:10:10910793:10912559:-1 gene:VIT_10s0003g05800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGTGGGTTGGCAGACAGTGATCAAGTCAACGAGGCTTTCAGACTGTTTAGGTTGATG CTAAGAAATAGAATTCATGTTGATTCTGTCTCACTGTCAAGCGTTTTGGGTGTTTGTTCC AGAGGAGGATGTGGGGAATTTGGTCTTCATGACTCAAATGATGTGCTTTCATCTGATGTG CATGGGCAACAGGTGCACTGTCTCACAATTAAACATGGATTTGAATCAGATCTTCATTTA AATAATTCATTGCTTGATATGTATGCAAAGAATGGGAACATGGATAGTGCTGAGATGATT TTTGTTAATATGCCCGAAGTCAGTGTTGTTTCATGGAATGTTATGATAGCTGGGTATGGC CAAAAATCCCAAAGCAGTAAAGCCATAGAGTACCTGCAGAGAATGCAGTATCATGGTTTC GAGCCAGATGAGATCACGTATGTCAATATGCTTGTGGCATGCATAAAGTCTGGTGATATC GAAGCTGGGCGCCAAATGTTTGATGGGATGTCATCCCCAAGCTTGAGTTCATGGAACACT ATACTTTCTGGGTATTCCCAGAATGAGAACCACAAGGAGGCAGTAAAACTTTTCAGGGAA ATGCAATTTCGAAGTGTCCACCCTGATCGCACTACTTTGGCAATTATACTGAGCTCACTT GCAGGGATGATGCTTCTGGAAGGTGGAAGACAGGTCCATGCTGTCTCACAAAAGGCTGTC TTTCGTACTGACATATATCTTGCCAGTGGACTTATTGGCATGTATTCAAAGTGTGGGAAG GTCGAGATGGCAAAGCGTATTTTTGACAGAATAGCTGAACTGGATATTGTCTGCTGGAAT TCTATGATGGCAGGTCTCTCGCTCAATTCTCTAGACAAGGAAGCTTTTACTTTCTTCAAG AAGATGCGAGAAAAGGGGATGTTTCCTTCGCAATTCTCATATGCTACTGTACTCAGTTGT TGTGCAAAACTATCTTCTTTGTCTCAAGGCAGACAGGTTCACTCTCAGATAGCAAGGGAA GGATACATGAATGATGCCTTTGTGGGGAGTGCTCTGATTGATATGTATTCTAAATGTGGT GATGTAGATGCAGCCCGGTGGGTTTTTGACATGATGCTTGGTAAAAATACTGTCACTTGG AATGAAATGATACATGGTTATGCACAGAACGGATGTGGGGATGAGGCTGTTCTTCTTTAT GAAGACATGATTGGATCAGGTGAGAAACCTGATGGCATAACATTTGTTGCTGTTTTAACC GCTTGTAGCCATTCTGGATTGGTTGACACAGGAATCAAAATATTCAATTCAATGCAGCAA GAACATGGAGTGGAACCACTTGTAGATCATTATACCTGCATCATTGACTCTTTAGGCAGA GCTGGTCGGTTACATGAAGCAGAAGTTCTTATAGATAAGATGCCATGTAAATATGATCCA ATCATATGGGAGGTTTTGCTCAGTTCTTGTAGAGTTTATGCTGATGTGAGCTTAGCAAGA AGAGCAGCAGAGGAGCTCTTTCACTTGGATCCCCAAAACTCTGCTCCTTATGTGCTTCTT GCTAACATCTATTCTTCCCTGGGAAGATGGGATGATGCCAAGGCTGTTAGAGAACTGATG AGTTACAATCAGGTAGTTAAGGATCCAGGTTATAGTTGGATTGAGCATAAGAATGGGATG CAAGCCTTTATGGTTGATGATAATGGTAGGATGGTTGATGATGAAGTTGTAGTTGTAAAT GATGGAATGTCTTGTTCCAGTGGATAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_10s0003g05800.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:10:10910793:10912559:-1 gene:VIT_10s0003g05800 transcript:VIT_10s0003g05800.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MGGLADSDQVNEAFRLFRLMLRNRIHVDSVSLSSVLGVCSRGGCGEFGLHDSNDVLSSDV HGQQVHCLTIKHGFESDLHLNNSLLDMYAKNGNMDSAEMIFVNMPEVSVVSWNVMIAGYG QKSQSSKAIEYLQRMQYHGFEPDEITYVNMLVACIKSGDIEAGRQMFDGMSSPSLSSWNT ILSGYSQNENHKEAVKLFREMQFRSVHPDRTTLAIILSSLAGMMLLEGGRQVHAVSQKAV FRTDIYLASGLIGMYSKCGKVEMAKRIFDRIAELDIVCWNSMMAGLSLNSLDKEAFTFFK KMREKGMFPSQFSYATVLSCCAKLSSLSQGRQVHSQIAREGYMNDAFVGSALIDMYSKCG DVDAARWVFDMMLGKNTVTWNEMIHGYAQNGCGDEAVLLYEDMIGSGEKPDGITFVAVLT ACSHSGLVDTGIKIFNSMQQEHGVEPLVDHYTCIIDSLGRAGRLHEAEVLIDKMPCKYDP IIWEVLLSSCRVYADVSLARRAAEELFHLDPQNSAPYVLLANIYSSLGRWDDAKAVRELM SYNQVVKDPGYSWIEHKNGMQAFMVDDNGRMVDDEVVVVNDGMSCSSG

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_10s0003g05800.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:10:10910793:10912559:-1 gene:VIT_10s0003g05800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGGTGGGTTGGCAGACAGTGATCAAGTCAACGAGGCTTTCAGACTGTTTAGGTTGATG CTAAGAAATAGAATTCATGTTGATTCTGTCTCACTGTCAAGCGTTTTGGGTGTTTGTTCC AGAGGAGGATGTGGGGAATTTGGTCTTCATGACTCAAATGATGTGCTTTCATCTGATGTG CATGGGCAACAGGTGCACTGTCTCACAATTAAACATGGATTTGAATCAGATCTTCATTTA AATAATTCATTGCTTGATATGTATGCAAAGAATGGGAACATGGATAGTGCTGAGATGATT TTTGTTAATATGCCCGAAGTCAGTGTTGTTTCATGGAATGTTATGATAGCTGGGTATGGC CAAAAATCCCAAAGCAGTAAAGCCATAGAGTACCTGCAGAGAATGCAGTATCATGGTTTC GAGCCAGATGAGATCACGTATGTCAATATGCTTGTGGCATGCATAAAGTCTGGTGATATC GAAGCTGGGCGCCAAATGTTTGATGGGATGTCATCCCCAAGCTTGAGTTCATGGAACACT ATACTTTCTGGGTATTCCCAGAATGAGAACCACAAGGAGGCAGTAAAACTTTTCAGGGAA ATGCAATTTCGAAGTGTCCACCCTGATCGCACTACTTTGGCAATTATACTGAGCTCACTT GCAGGGATGATGCTTCTGGAAGGTGGAAGACAGGTCCATGCTGTCTCACAAAAGGCTGTC TTTCGTACTGACATATATCTTGCCAGTGGACTTATTGGCATGTATTCAAAGTGTGGGAAG GTCGAGATGGCAAAGCGTATTTTTGACAGAATAGCTGAACTGGATATTGTCTGCTGGAAT TCTATGATGGCAGGTCTCTCGCTCAATTCTCTAGACAAGGAAGCTTTTACTTTCTTCAAG AAGATGCGAGAAAAGGGGATGTTTCCTTCGCAATTCTCATATGCTACTGTACTCAGTTGT TGTGCAAAACTATCTTCTTTGTCTCAAGGCAGACAGGTTCACTCTCAGATAGCAAGGGAA GGATACATGAATGATGCCTTTGTGGGGAGTGCTCTGATTGATATGTATTCTAAATGTGGT GATGTAGATGCAGCCCGGTGGGTTTTTGACATGATGCTTGGTAAAAATACTGTCACTTGG AATGAAATGATACATGGTTATGCACAGAACGGATGTGGGGATGAGGCTGTTCTTCTTTAT GAAGACATGATTGGATCAGGTGAGAAACCTGATGGCATAACATTTGTTGCTGTTTTAACC GCTTGTAGCCATTCTGGATTGGTTGACACAGGAATCAAAATATTCAATTCAATGCAGCAA GAACATGGAGTGGAACCACTTGTAGATCATTATACCTGCATCATTGACTCTTTAGGCAGA GCTGGTCGGTTACATGAAGCAGAAGTTCTTATAGATAAGATGCCATGTAAATATGATCCA ATCATATGGGAGGTTTTGCTCAGTTCTTGTAGAGTTTATGCTGATGTGAGCTTAGCAAGA AGAGCAGCAGAGGAGCTCTTTCACTTGGATCCCCAAAACTCTGCTCCTTATGTGCTTCTT GCTAACATCTATTCTTCCCTGGGAAGATGGGATGATGCCAAGGCTGTTAGAGAACTGATG AGTTACAATCAGGTAGTTAAGGATCCAGGTTATAGTTGGATTGAGCATAAGAATGGGATG CAAGCCTTTATGGTTGATGATAATGGTAGGATGGTTGATGATGAAGTTGTAGTTGTAAAT GATGGAATGTCTTGTTCCAGTGGATAG