Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_10s0003g04670.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:10:8333667:8341190:1 gene:VIT_10s0003g04670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCGCTTTCTATGCACAAAGAGTCTAAGCAGCAGATGGATTCCAGCAAGTATGTAAGG TATACGCCCGAGCAGGTTGAAGCTTTAGAGAGGGTGTATAGTGAATGCCCAAAGCCAAGC TCCATGAGAAGGCAGCAGCTCATAAGAGAGTGTCCCATACTCTCTAATATCGAGCCCAAA CAGATCAAAGTCTGGTTTCAAAATCGCAGGTGCCGTGAAAAGCAAAGGAAGGAAGCTTCT CGTCTCCAGACTGTGAATCGGAAGTTGACTGCAATGAACAAGCTGTTGATGGAAGAGAAT GACCGGTTACAGAAGCAGGTCTCGCAGTTGGTTTATGAAAATGGATACATGAGACAGCAG CTGCAGAGTGCATCTACAGCGACCACAGACACTAGCTGCGAGTCTGTGGTCATGAGCGGT CAGCACCAACAACAGCAAAACCCAACACCTCAGCATCCTCAAAGGGATGCAAGCAACCCA GCTGGTCTACTCGCAATAGCTGAGGAGACCCTGGCAGAGTTCCTGTCCAAGGCTACTGGA ACTGCTGTCGACTGGGTCCAGATGATTGGGATGAAGCCTGGTCCGGATTCTATTGGAATC GTTGCTGTTTCCCGCAACTGTAGTGGGGTAGCAGCACGAGCCTGTGGCCTCGTGAGTCTA GAACCCACGAAGGTTGCGGAAATCCTCAAAGATCGTCCATCTTGGTTTCGTGACTGCCGA TGCCTCGATGTATTGAGTGTAATCCCTACAGGAAATGGGGGGACAATAGAACTCATATAC ATGCAGACATATGCTCCTACAACATTGGCATCAGCACGTGATTTTTGGACATTGAGATAT ACTACAAGCTTGGAAGATGGCAGTCTAGTGATTTGTGAGAGGTCATTGACATCTTCTACT GGTGGCCCTACTGGACCCCCTGCATCAAGTTATATAAGAGCGGAAATGCTTCCTAGTGGC TATCTAATCCGACCTTGTGAGGGTGGTGGCTCCATTATTCACATTGTTGATCATGTTGAT TTGGATGCATGGAGTGTTCCTGAAGTTCTTAGGCCGCTATATGAATCATCTAAAATTCTC GCTCAGAAAACGACTGTTGCTGCATTACGGCACATACGACAAATTGCACAAGAAACCAGT GGAGAAATTCAGTATGGTGGGGGCCGCCAACCTGCTGTTTTAAGGACGTTTAGCCAGAGA TTGTGCAGGGGGTTCAATGATGCTGTTAATGGGTTTGCGGATGATGGTTGGTCGCTCATG GGTAGTGATGGGGTGGAGGACGTAACCATTGTGATTAACTCATCTCCAAGCAAATTCCTC GGGCCCCAGTATAACTCAACAATGTTTCCAACTTTTGGAGGTGGCGTGCTGTGTGCCAAA GCATCAATGCTGCTACAGAATGTTCCCCCTGCTTTACTTGTTCGATTCCTGAGAGAACAC CGTTCTGAGTGGGCTGACTATGGTGTTGATGCTTATTCTGCTGCATGTCTTAAAGCTAGT CCTTATGAAGTTCCCTGTGCAAGACCTGGAGGCTTCCCCAGTAGCCAGGTCATTTTACCT CTCGCCCATACAGTGGAGCATGAGGAGTTCTTGGAGGTGGTTCGTCTAGAAGGACATGCA TTCTCGCCTGAGGATGTGGCTTTGACACGGGACATGTACTTACTACAGCTATGCAGTGGG GTTGATGAGAATGCAGCTGGTGCCTGTGCTCAGCTGGTTTTTGCACCTATTGATGAATCA TTTGCTGATGATGCTCCTTTGCTGCCATCTGGCTTCCGCGTCATACCATTGGATCCTAAA ACGGATGGACCTGCTGCTACTAGGACATTGGATTTGGCCTCTACACTTGAAGTGGGAGCT GGTGGGGCACGCCCAGCCAATGAGTCTGATTTGAACAATTATAACCTCAGATCTGTTCTG ACTATTGCATTCCAATTTACTTTTGAGAACCATGTTCGAGACAATGTGGCTGCTATGGCT CGCCAATATGTACGTAGTGTTATGGCCTCTGTTCAGAGGGTTGCCATGGCTATTGCCCCT TCCCGGCTCAGCTCCCATATGGGCCTAAAACCACTTCCTGGTTCTCCTGAGGCTCTTACT TTGGCACGGTGGATTTGTCGTAGCTACAGGATTCACACTGGGGGAGAGCTCCTTCGGGTT GACTCCCAAGGTGGTGATGCTGTCTTGAAGTTACTTTGGAACCATTCTGATGCAATCATG TGCTGCTCCCTGAAAACAAATGCATCTCCAGTTTTCACATTTGCTAACCAGGCTGGGCTT GATATGCTTGAAACCACTCTGGTGGCCCTTCAAGATATAATGCTAGACAAGATTCTTGAT GAAGCTGGGAGGAAGATTCTCTGCTCTGAGTTCTCTAAGATCATGCAACAGGGCTTTGCG TATCTGCCAGCAGGGATATGCACATCCAGCATGGGCAGGCCTGTGTCTTATGAGCAGGCC ATTGCATGGAAAGTCCTGAACGATGAGGACTCCAATCACTGCCTGGCTTTCATGTTTATA AACTGGTCCTTTGTGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_10s0003g04670.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:10:8333667:8341190:1 gene:VIT_10s0003g04670 transcript:VIT_10s0003g04670.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MALSMHKESKQQMDSSKYVRYTPEQVEALERVYSECPKPSSMRRQQLIRECPILSNIEPK QIKVWFQNRRCREKQRKEASRLQTVNRKLTAMNKLLMEENDRLQKQVSQLVYENGYMRQQ LQSASTATTDTSCESVVMSGQHQQQQNPTPQHPQRDASNPAGLLAIAEETLAEFLSKATG TAVDWVQMIGMKPGPDSIGIVAVSRNCSGVAARACGLVSLEPTKVAEILKDRPSWFRDCR CLDVLSVIPTGNGGTIELIYMQTYAPTTLASARDFWTLRYTTSLEDGSLVICERSLTSST GGPTGPPASSYIRAEMLPSGYLIRPCEGGGSIIHIVDHVDLDAWSVPEVLRPLYESSKIL AQKTTVAALRHIRQIAQETSGEIQYGGGRQPAVLRTFSQRLCRGFNDAVNGFADDGWSLM GSDGVEDVTIVINSSPSKFLGPQYNSTMFPTFGGGVLCAKASMLLQNVPPALLVRFLREH RSEWADYGVDAYSAACLKASPYEVPCARPGGFPSSQVILPLAHTVEHEEFLEVVRLEGHA FSPEDVALTRDMYLLQLCSGVDENAAGACAQLVFAPIDESFADDAPLLPSGFRVIPLDPK TDGPAATRTLDLASTLEVGAGGARPANESDLNNYNLRSVLTIAFQFTFENHVRDNVAAMA RQYVRSVMASVQRVAMAIAPSRLSSHMGLKPLPGSPEALTLARWICRSYRIHTGGELLRV DSQGGDAVLKLLWNHSDAIMCCSLKTNASPVFTFANQAGLDMLETTLVALQDIMLDKILD EAGRKILCSEFSKIMQQGFAYLPAGICTSSMGRPVSYEQAIAWKVLNDEDSNHCLAFMFI NWSFV

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_10s0003g04670.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:10:8333667:8341190:1 gene:VIT_10s0003g04670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	TGTTTTCCTTGGTGGTATGGCGCTTTCTATGCACAAAGAGTCTAAGCAGCAGATGGATTC CAGCAAGTATGTAAGGTATACGCCCGAGCAGGTTGAAGCTTTAGAGAGGGTGTATAGTGA ATGCCCAAAGCCAAGCTCCATGAGAAGGCAGCAGCTCATAAGAGAGTGTCCCATACTCTC TAATATCGAGCCCAAACAGATCAAAGTCTGGTTTCAAAATCGCAGGTGCCGTGAAAAGCA AAGGAAGGAAGCTTCTCGTCTCCAGACTGTGAATCGGAAGTTGACTGCAATGAACAAGCT GTTGATGGAAGAGAATGACCGGTTACAGAAGCAGGTCTCGCAGTTGGTTTATGAAAATGG ATACATGAGACAGCAGCTGCAGAGTGCATCTACAGCGACCACAGACACTAGCTGCGAGTC TGTGGTCATGAGCGGTCAGCACCAACAACAGCAAAACCCAACACCTCAGCATCCTCAAAG GGATGCAAGCAACCCAGCTGGTCTACTCGCAATAGCTGAGGAGACCCTGGCAGAGTTCCT GTCCAAGGCTACTGGAACTGCTGTCGACTGGGTCCAGATGATTGGGATGAAGCCTGGTCC GGATTCTATTGGAATCGTTGCTGTTTCCCGCAACTGTAGTGGGGTAGCAGCACGAGCCTG TGGCCTCGTGAGTCTAGAACCCACGAAGGTTGCGGAAATCCTCAAAGATCGTCCATCTTG GTTTCGTGACTGCCGATGCCTCGATGTATTGAGTGTAATCCCTACAGGAAATGGGGGGAC AATAGAACTCATATACATGCAGACATATGCTCCTACAACATTGGCATCAGCACGTGATTT TTGGACATTGAGATATACTACAAGCTTGGAAGATGGCAGTCTAGTGATTTGTGAGAGGTC ATTGACATCTTCTACTGGTGGCCCTACTGGACCCCCTGCATCAAGTTATATAAGAGCGGA AATGCTTCCTAGTGGCTATCTAATCCGACCTTGTGAGGGTGGTGGCTCCATTATTCACAT TGTTGATCATGTTGATTTGGATGCATGGAGTGTTCCTGAAGTTCTTAGGCCGCTATATGA ATCATCTAAAATTCTCGCTCAGAAAACGACTGTTGCTGCATTACGGCACATACGACAAAT TGCACAAGAAACCAGTGGAGAAATTCAGTATGGTGGGGGCCGCCAACCTGCTGTTTTAAG GACGTTTAGCCAGAGATTGTGCAGGGGGTTCAATGATGCTGTTAATGGGTTTGCGGATGA TGGTTGGTCGCTCATGGGTAGTGATGGGGTGGAGGACGTAACCATTGTGATTAACTCATC TCCAAGCAAATTCCTCGGGCCCCAGTATAACTCAACAATGTTTCCAACTTTTGGAGGTGG CGTGCTGTGTGCCAAAGCATCAATGCTGCTACAGAATGTTCCCCCTGCTTTACTTGTTCG ATTCCTGAGAGAACACCGTTCTGAGTGGGCTGACTATGGTGTTGATGCTTATTCTGCTGC ATGTCTTAAAGCTAGTCCTTATGAAGTTCCCTGTGCAAGACCTGGAGGCTTCCCCAGTAG CCAGGTCATTTTACCTCTCGCCCATACAGTGGAGCATGAGGAGTTCTTGGAGGTGGTTCG TCTAGAAGGACATGCATTCTCGCCTGAGGATGTGGCTTTGACACGGGACATGTACTTACT ACAGCTATGCAGTGGGGTTGATGAGAATGCAGCTGGTGCCTGTGCTCAGCTGGTTTTTGC ACCTATTGATGAATCATTTGCTGATGATGCTCCTTTGCTGCCATCTGGCTTCCGCGTCAT ACCATTGGATCCTAAAACGGATGGACCTGCTGCTACTAGGACATTGGATTTGGCCTCTAC ACTTGAAGTGGGAGCTGGTGGGGCACGCCCAGCCAATGAGTCTGATTTGAACAATTATAA CCTCAGATCTGTTCTGACTATTGCATTCCAATTTACTTTTGAGAACCATGTTCGAGACAA TGTGGCTGCTATGGCTCGCCAATATGTACGTAGTGTTATGGCCTCTGTTCAGAGGGTTGC CATGGCTATTGCCCCTTCCCGGCTCAGCTCCCATATGGGCCTAAAACCACTTCCTGGTTC TCCTGAGGCTCTTACTTTGGCACGGTGGATTTGTCGTAGCTACAGGATTCACACTGGGGG AGAGCTCCTTCGGGTTGACTCCCAAGGTGGTGATGCTGTCTTGAAGTTACTTTGGAACCA TTCTGATGCAATCATGTGCTGCTCCCTGAAAACAAATGCATCTCCAGTTTTCACATTTGC TAACCAGGCTGGGCTTGATATGCTTGAAACCACTCTGGTGGCCCTTCAAGATATAATGCT AGACAAGATTCTTGATGAAGCTGGGAGGAAGATTCTCTGCTCTGAGTTCTCTAAGATCAT GCAACAGGGCTTTGCGTATCTGCCAGCAGGGATATGCACATCCAGCATGGGCAGGCCTGT GTCTTATGAGCAGGCCATTGCATGGAAAGTCCTGAACGATGAGGACTCCAATCACTGCCT GGCTTTCATGTTTATAAACTGGTCCTTTGTGTGATGCAC