Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_10s0003g02630.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:10:4618250:4620232:1 gene:VIT_10s0003g02630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATCACCGATCATCTAAGGAACCAAAGAATAGATGAAGCTCGAACGGTTTTTGATAAA GTATCTTTTCCCGATGTTTATCTGTACACCATGATGATCACGGGTTATGCCCGAAATTAC AGATTTGATCATGCATTGCAACTGTTCTACGAAATGCCTGTTAAGGATGTGGTTTCTTGG AATTCCATGATTAAAGGGTGTTTTGATTGTGCTGACTTAACTATGGCTAGAAAGCTTTTC GATGAAATGCCTGAGAGGAGTGTGGTTTCTTGGACAACAATGATAAATGGGTTCTTGCAG TTTGGGAAAATCGAAGTAGCCGAGGGCTTGTTTTATAAGATGCCTTTCAGGGACATTGCC GCATGGAATTCAATGATTTATGGGTATTGTTGTAATGGTAGAGTTGAAGATGGCCTTAGG TTGTTTCAGGAGATGCCCTGTAGGAATGTGATTTCGTGGACTTCCATGATTGGAGGGCTT GATCAGCATGGGAGGAGTGAGGAAGCTTTGGGTCTTTTCCGGCAGATGATGGGCTGTGGA GTAGAAGTAAAACCCACTTCAAGCACTTACTGTTGTGTCATAACAGCTTGTGCCAATGCA TCAGCTTTATATCAGGGTGTTCAGATTCATGCTCACGTATTCAAGTTAGGTTACAGTTTT GATGCTTATATATCCGCTGCGCTTATCACATTTTATGCAAACTGCAAGCAAATGGAGGAT TCTCTTAGGGTTTTCCATGGAAAATTGCATATGAATGTGGTCATATGGACGGCTCTTGTA ACGGGTTATGGTCTGAACTGCAAGCATGAAGATGCCTTGAAGGTTTTTGGTGAGATGATG AGGGAGGGTGTCCTTCCCAATCAATCTTCTTTCACTAGTGCCTTGAATTCATGCTGTGGA CTGGAGGCACTTGACTGGGGGAGAGAGATCCATACAGCTGCTGTTAAGTTAGGGTTGGAG ACTGATGTGTTTGTGGGTAACTCTCTTATAGTCATGTATTATAGATGTGGCAATCTAAAT GATGGAGTTGTCATATTTAAGAGAATCAGCAAGAAGAACATTGTATCATGGAACTCAGTT ATTGTTGGGTGTGCACAACATGGCTGTGGCATGTGGGCATTGGCATTCTTCAACCAAATG GTGCGGTCCATGGTAGAACCGGATGAGATCACATTCACTGGGTTGCTTTCTGCTTGCAGC CATTCTGGGATGTCACAGAAGGGGAGATGCCTTTTCAAGTATTTCAGTGAGAATAAGTCT GCAGAGGTGAAGCTTGACCACTATGCATGTATGGTGGATATCCTGGGCCGATCGGGGAAG TTGGAGGAAGCAGAGGAGTTAATTAGGAACATGCCAGTAAAAGCAAATTCCATGGTATGG CTGGTTTTGCTTAGTGCTTGTACGATGCATTCTAAGCTAGAAGTGGCTGAAAGAGCTGCA AAATGCATAATTGACCTGGAACCACATTGCAGCTCTGCATATGTCTTGTTGTCGAATTTA TATGCTTCTGCCAGCAGATGGAGTGATGTCTCCAGAATAAGAAGGGAGATGAAACAGAGA GGAATAACAAAACAACCAGGGAGGAGTTGGATTACTATAAAGGGGTGGAGGAATGAATTT CTTTCAGGAGATAGGTCCCACCCTTCAAGTGATAGGATATATCAAAAACTGGAGTGGCTG GGTGGAAAATTGAAGGAACTGGGATATGTTCCTGATCAAAGGTTTGCTCTGCATGATGTT GAGGATGAACAGAAAGAAGTGATGCTGTCTTATCACAGTGAGAGGCTTGCAATTGGATTT GGTCTTATTAGCACTGTAGAGGGCAGTACCATTACAGTGATGAAGAATCTCCGCGTCTGT GGTGATTGCCATTCTGCCATTAAGCTAATAGCAAAGATTGTTAGACGCAAGATCATTGTA AGAGATTCTACCCGCTTTCATCACTTCATGGATGGGAGATGTTCTTGTGGGGATTACTGG TAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_10s0003g02630.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:10:4618250:4620232:1 gene:VIT_10s0003g02630 transcript:VIT_10s0003g02630.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MITDHLRNQRIDEARTVFDKVSFPDVYLYTMMITGYARNYRFDHALQLFYEMPVKDVVSW NSMIKGCFDCADLTMARKLFDEMPERSVVSWTTMINGFLQFGKIEVAEGLFYKMPFRDIA AWNSMIYGYCCNGRVEDGLRLFQEMPCRNVISWTSMIGGLDQHGRSEEALGLFRQMMGCG VEVKPTSSTYCCVITACANASALYQGVQIHAHVFKLGYSFDAYISAALITFYANCKQMED SLRVFHGKLHMNVVIWTALVTGYGLNCKHEDALKVFGEMMREGVLPNQSSFTSALNSCCG LEALDWGREIHTAAVKLGLETDVFVGNSLIVMYYRCGNLNDGVVIFKRISKKNIVSWNSV IVGCAQHGCGMWALAFFNQMVRSMVEPDEITFTGLLSACSHSGMSQKGRCLFKYFSENKS AEVKLDHYACMVDILGRSGKLEEAEELIRNMPVKANSMVWLVLLSACTMHSKLEVAERAA KCIIDLEPHCSSAYVLLSNLYASASRWSDVSRIRREMKQRGITKQPGRSWITIKGWRNEF LSGDRSHPSSDRIYQKLEWLGGKLKELGYVPDQRFALHDVEDEQKEVMLSYHSERLAIGF GLISTVEGSTITVMKNLRVCGDCHSAIKLIAKIVRRKIIVRDSTRFHHFMDGRCSCGDYW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_10s0003g02630.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:10:4618250:4620232:1 gene:VIT_10s0003g02630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGATCACCGATCATCTAAGGAACCAAAGAATAGATGAAGCTCGAACGGTTTTTGATAAA GTATCTTTTCCCGATGTTTATCTGTACACCATGATGATCACGGGTTATGCCCGAAATTAC AGATTTGATCATGCATTGCAACTGTTCTACGAAATGCCTGTTAAGGATGTGGTTTCTTGG AATTCCATGATTAAAGGGTGTTTTGATTGTGCTGACTTAACTATGGCTAGAAAGCTTTTC GATGAAATGCCTGAGAGGAGTGTGGTTTCTTGGACAACAATGATAAATGGGTTCTTGCAG TTTGGGAAAATCGAAGTAGCCGAGGGCTTGTTTTATAAGATGCCTTTCAGGGACATTGCC GCATGGAATTCAATGATTTATGGGTATTGTTGTAATGGTAGAGTTGAAGATGGCCTTAGG TTGTTTCAGGAGATGCCCTGTAGGAATGTGATTTCGTGGACTTCCATGATTGGAGGGCTT GATCAGCATGGGAGGAGTGAGGAAGCTTTGGGTCTTTTCCGGCAGATGATGGGCTGTGGA GTAGAAGTAAAACCCACTTCAAGCACTTACTGTTGTGTCATAACAGCTTGTGCCAATGCA TCAGCTTTATATCAGGGTGTTCAGATTCATGCTCACGTATTCAAGTTAGGTTACAGTTTT GATGCTTATATATCCGCTGCGCTTATCACATTTTATGCAAACTGCAAGCAAATGGAGGAT TCTCTTAGGGTTTTCCATGGAAAATTGCATATGAATGTGGTCATATGGACGGCTCTTGTA ACGGGTTATGGTCTGAACTGCAAGCATGAAGATGCCTTGAAGGTTTTTGGTGAGATGATG AGGGAGGGTGTCCTTCCCAATCAATCTTCTTTCACTAGTGCCTTGAATTCATGCTGTGGA CTGGAGGCACTTGACTGGGGGAGAGAGATCCATACAGCTGCTGTTAAGTTAGGGTTGGAG ACTGATGTGTTTGTGGGTAACTCTCTTATAGTCATGTATTATAGATGTGGCAATCTAAAT GATGGAGTTGTCATATTTAAGAGAATCAGCAAGAAGAACATTGTATCATGGAACTCAGTT ATTGTTGGGTGTGCACAACATGGCTGTGGCATGTGGGCATTGGCATTCTTCAACCAAATG GTGCGGTCCATGGTAGAACCGGATGAGATCACATTCACTGGGTTGCTTTCTGCTTGCAGC CATTCTGGGATGTCACAGAAGGGGAGATGCCTTTTCAAGTATTTCAGTGAGAATAAGTCT GCAGAGGTGAAGCTTGACCACTATGCATGTATGGTGGATATCCTGGGCCGATCGGGGAAG TTGGAGGAAGCAGAGGAGTTAATTAGGAACATGCCAGTAAAAGCAAATTCCATGGTATGG CTGGTTTTGCTTAGTGCTTGTACGATGCATTCTAAGCTAGAAGTGGCTGAAAGAGCTGCA AAATGCATAATTGACCTGGAACCACATTGCAGCTCTGCATATGTCTTGTTGTCGAATTTA TATGCTTCTGCCAGCAGATGGAGTGATGTCTCCAGAATAAGAAGGGAGATGAAACAGAGA GGAATAACAAAACAACCAGGGAGGAGTTGGATTACTATAAAGGGGTGGAGGAATGAATTT CTTTCAGGAGATAGGTCCCACCCTTCAAGTGATAGGATATATCAAAAACTGGAGTGGCTG GGTGGAAAATTGAAGGAACTGGGATATGTTCCTGATCAAAGGTTTGCTCTGCATGATGTT GAGGATGAACAGAAAGAAGTGATGCTGTCTTATCACAGTGAGAGGCTTGCAATTGGATTT GGTCTTATTAGCACTGTAGAGGGCAGTACCATTACAGTGATGAAGAATCTCCGCGTCTGT GGTGATTGCCATTCTGCCATTAAGCTAATAGCAAAGATTGTTAGACGCAAGATCATTGTA AGAGATTCTACCCGCTTTCATCACTTCATGGATGGGAGATGTTCTTGTGGGGATTACTGG TAG