Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_10s0003g01540.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:10:2933446:2936385:1 gene:VIT_10s0003g01540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGTTGTTGATATCCAAAACCACGCCAAACTTATGGGTCTCTCCACCCCACCAAATTCAC AGAGAAAACTCTCTCACATATCCAAATGGTTTCATATTCTTCAGACCATCCTCCAAAACC CCACTTGTATCTTCAAATTTGTATCATTCTTGTGCCACCATTGGCACCTCAGTCTTGCCC AGTGAGACCATTGATTGTAAAATTACGGATTACAACATTGAAATATGCAGATTCTGTGAA TTGGGTAATCTGAGAAGGGCCATGGAATTGATCAACCAGTCTCCGAAACCAGACCTGGAG TTAAGAACCTATTGCTCTGTCTTACAGCTCTGTGCGGATCTTAAATCCATACAAGATGGT AGGAGAATTCATTCGATTATTCAATCTAATGATGTCGAAGTTGATGGTGTTTTGGGTTCC AAACTTGTGTTTATGTATGTGACTTGCGGGGATTTGAGGGAAGGGAGACGGATTTTCGAT AAAGTTGCTAACGAAAAGGTCTTTCTTTGGAACCTTTTGATGAATGGATATGCGAAGATT GGTAATTTTAGGGAAAGTTTATCTTTATTCAAGCGGATGAGGGAGTTGGGAGTTAAAATG AATTCTTATACATTTTCTTGCGTTATGAAGTGTTATGCGGCTTCAGGAAGTGTAGAAGAA GGGGAAGGGGTCCATGCGTATCTGTCGAGACTGGGTTTTGGGTCTTACAATACAGTTGTG AATTCTCTAATTGCTTTCTATTTCAAGATTAGAAGAGTTGAAAGTGCACGCAAGTTGTTT GATGAATTGGGTGATCGAGATGTTATATCATGGAATTCTATGATAAGTGGGTATGTGTCA AATGGTCTTTCGGAGAAGGGACTTGACCTTTTTGAACAAATGCTGCTTTTGGGGATTAAT ACGGATTTAGCTACTATGGTCAGTGTAGTTGCAGGATGTTCAAATACTGGTATGCTTTTA TTGGGTAGAGCACTTCATGGCTATGCAATAAAGGCTTCTTTTGGTAAGGAACTTACTCTC AATAATTGTTTGTTGGACATGTATTCAAAATCTGGCAATCTAAATAGTGCCATACAAGTT TTCGAGACGATGGGTGAAAGAAGTGTGGTGTCTTGGACATCCATGATAGCTGGATATGCT CGGGAAGGCCTATCTGATATGTCGGTTCGATTATTTCATGAAATGGAAAAGGAAGGTATT AGTCCTGATATCTTTACCATCACAACCATCCTTCATGCTTGCGCATGTACTGGCTTGTTG GAAAATGGCAAGGATGTCCATAATTACATCAAGGAGAATAAAATGCAATCAGATCTGTTC GTCTCTAATGCTCTGATGGACATGTATGCAAAATGTGGAAGTATGGGAGATGCTCACTCG GTTTTTTCTGAGATGCAGGTCAAGGACATCGTCTCATGGAATACCATGATTGGAGGTTAT TCAAAAAACTCACTTCCCAATGAAGCACTCAATTTGTTTGTTGAAATGCAATATAACTCA AAGCCCAACAGCATAACAATGGCCTGCATCCTTCCAGCTTGTGCCAGCCTAGCAGCTCTA GAAAGAGGCCAAGAGATCCACGGTCATATATTGAGAAATGGGTTTTCTCTAGATCGGCAT GTTGCAAATGCACTTGTTGACATGTATCTGAAGTGTGGGGCACTAGGTCTTGCACGTTTA CTTTTTGATATGATTCCTGAAAAGGATCTGGTCTCATGGACAGTCATGATTGCTGGATAT GGAATGCACGGGTATGGGAGTGAAGCTATTGCTGCATTCAATGAGATGAGAAATTCAGGT ATTGAGCCTGATGAAGTTTCCTTCATTTCAATATTGTATGCCTGCAGTCATTCTGGATTA CTTGATGAAGGATGGGGATTCTTTAATATGATGAGAAACAACTGTTGCATTGAGCCCAAG TCGGAGCACTATGCTTGCATTGTGGATCTTCTTGCCCGCGCAGGCAATTTGTCCAAGGCA TATAAATTCATTAAAATGATGCCAATTGAACCAGATGCCACTATCTGGGGTGCTTTGCTC TGTGGGTGTAGAATCTACCATGATGTAAAACTAGCAGAGAAAGTTGCTGAACATGTTTTT GAGCTAGAGCCAGAGAACACAGGATATTATGTACTTCTAGCAAATATTTATGCAGAAGCA GAGAAGTGGGAAGAAGTGAAAAAATTGAGGGAGAGAATTGGCCGGCGTGGCTTAAGAAAG AACCCTGGGTGTAGTTGGATAGAGATCAAGGGCAAAGTCCATATCTTTGTTACTGGAGAT AGTTCACACCCACTAGCCAATAAGATAGAATTGTTATTAAAGAAGACGAGAACACGAATG AAGGAAGAGGGTCACTTTCCAAAAATGAGGTATGCTTTGATTAAGGCAGATGACACGGAG AAAGAAATGGCTCTCTGTGGGCACAGCGAGAAGATAGCCATGGCTTTTGGAATTTTGAGC TTGCCACCGGGCAAAACTGTAAGGGTCACCAAGAATTTAAGAGTATGTGGTGATTGTCAT GAGATGGCCAAATTCATGTCCAAGATGGTAAAGAGAGATATCATCTTGAGAGATTCTAAT CGCTTTCATCATTTCAAGGATGGGTCTTGTTCTTGCAGAGGTCACTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_10s0003g01540.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:10:2933446:2936385:1 gene:VIT_10s0003g01540 transcript:VIT_10s0003g01540.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MLLISKTTPNLWVSPPHQIHRENSLTYPNGFIFFRPSSKTPLVSSNLYHSCATIGTSVLP SETIDCKITDYNIEICRFCELGNLRRAMELINQSPKPDLELRTYCSVLQLCADLKSIQDG RRIHSIIQSNDVEVDGVLGSKLVFMYVTCGDLREGRRIFDKVANEKVFLWNLLMNGYAKI GNFRESLSLFKRMRELGVKMNSYTFSCVMKCYAASGSVEEGEGVHAYLSRLGFGSYNTVV NSLIAFYFKIRRVESARKLFDELGDRDVISWNSMISGYVSNGLSEKGLDLFEQMLLLGIN TDLATMVSVVAGCSNTGMLLLGRALHGYAIKASFGKELTLNNCLLDMYSKSGNLNSAIQV FETMGERSVVSWTSMIAGYAREGLSDMSVRLFHEMEKEGISPDIFTITTILHACACTGLL ENGKDVHNYIKENKMQSDLFVSNALMDMYAKCGSMGDAHSVFSEMQVKDIVSWNTMIGGY SKNSLPNEALNLFVEMQYNSKPNSITMACILPACASLAALERGQEIHGHILRNGFSLDRH VANALVDMYLKCGALGLARLLFDMIPEKDLVSWTVMIAGYGMHGYGSEAIAAFNEMRNSG IEPDEVSFISILYACSHSGLLDEGWGFFNMMRNNCCIEPKSEHYACIVDLLARAGNLSKA YKFIKMMPIEPDATIWGALLCGCRIYHDVKLAEKVAEHVFELEPENTGYYVLLANIYAEA EKWEEVKKLRERIGRRGLRKNPGCSWIEIKGKVHIFVTGDSSHPLANKIELLLKKTRTRM KEEGHFPKMRYALIKADDTEKEMALCGHSEKIAMAFGILSLPPGKTVRVTKNLRVCGDCH EMAKFMSKMVKRDIILRDSNRFHHFKDGSCSCRGHW

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_10s0003g01540.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:10:2933446:2936385:1 gene:VIT_10s0003g01540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGTTGTTGATATCCAAAACCACGCCAAACTTATGGGTCTCTCCACCCCACCAAATTCAC AGAGAAAACTCTCTCACATATCCAAATGGTTTCATATTCTTCAGACCATCCTCCAAAACC CCACTTGTATCTTCAAATTTGTATCATTCTTGTGCCACCATTGGCACCTCAGTCTTGCCC AGTGAGACCATTGATTGTAAAATTACGGATTACAACATTGAAATATGCAGATTCTGTGAA TTGGGTAATCTGAGAAGGGCCATGGAATTGATCAACCAGTCTCCGAAACCAGACCTGGAG TTAAGAACCTATTGCTCTGTCTTACAGCTCTGTGCGGATCTTAAATCCATACAAGATGGT AGGAGAATTCATTCGATTATTCAATCTAATGATGTCGAAGTTGATGGTGTTTTGGGTTCC AAACTTGTGTTTATGTATGTGACTTGCGGGGATTTGAGGGAAGGGAGACGGATTTTCGAT AAAGTTGCTAACGAAAAGGTCTTTCTTTGGAACCTTTTGATGAATGGATATGCGAAGATT GGTAATTTTAGGGAAAGTTTATCTTTATTCAAGCGGATGAGGGAGTTGGGAGTTAAAATG AATTCTTATACATTTTCTTGCGTTATGAAGTGTTATGCGGCTTCAGGAAGTGTAGAAGAA GGGGAAGGGGTCCATGCGTATCTGTCGAGACTGGGTTTTGGGTCTTACAATACAGTTGTG AATTCTCTAATTGCTTTCTATTTCAAGATTAGAAGAGTTGAAAGTGCACGCAAGTTGTTT GATGAATTGGGTGATCGAGATGTTATATCATGGAATTCTATGATAAGTGGGTATGTGTCA AATGGTCTTTCGGAGAAGGGACTTGACCTTTTTGAACAAATGCTGCTTTTGGGGATTAAT ACGGATTTAGCTACTATGGTCAGTGTAGTTGCAGGATGTTCAAATACTGGTATGCTTTTA TTGGGTAGAGCACTTCATGGCTATGCAATAAAGGCTTCTTTTGGTAAGGAACTTACTCTC AATAATTGTTTGTTGGACATGTATTCAAAATCTGGCAATCTAAATAGTGCCATACAAGTT TTCGAGACGATGGGTGAAAGAAGTGTGGTGTCTTGGACATCCATGATAGCTGGATATGCT CGGGAAGGCCTATCTGATATGTCGGTTCGATTATTTCATGAAATGGAAAAGGAAGGTATT AGTCCTGATATCTTTACCATCACAACCATCCTTCATGCTTGCGCATGTACTGGCTTGTTG GAAAATGGCAAGGATGTCCATAATTACATCAAGGAGAATAAAATGCAATCAGATCTGTTC GTCTCTAATGCTCTGATGGACATGTATGCAAAATGTGGAAGTATGGGAGATGCTCACTCG GTTTTTTCTGAGATGCAGGTCAAGGACATCGTCTCATGGAATACCATGATTGGAGGTTAT TCAAAAAACTCACTTCCCAATGAAGCACTCAATTTGTTTGTTGAAATGCAATATAACTCA AAGCCCAACAGCATAACAATGGCCTGCATCCTTCCAGCTTGTGCCAGCCTAGCAGCTCTA GAAAGAGGCCAAGAGATCCACGGTCATATATTGAGAAATGGGTTTTCTCTAGATCGGCAT GTTGCAAATGCACTTGTTGACATGTATCTGAAGTGTGGGGCACTAGGTCTTGCACGTTTA CTTTTTGATATGATTCCTGAAAAGGATCTGGTCTCATGGACAGTCATGATTGCTGGATAT GGAATGCACGGGTATGGGAGTGAAGCTATTGCTGCATTCAATGAGATGAGAAATTCAGGT ATTGAGCCTGATGAAGTTTCCTTCATTTCAATATTGTATGCCTGCAGTCATTCTGGATTA CTTGATGAAGGATGGGGATTCTTTAATATGATGAGAAACAACTGTTGCATTGAGCCCAAG TCGGAGCACTATGCTTGCATTGTGGATCTTCTTGCCCGCGCAGGCAATTTGTCCAAGGCA TATAAATTCATTAAAATGATGCCAATTGAACCAGATGCCACTATCTGGGGTGCTTTGCTC TGTGGGTGTAGAATCTACCATGATGTAAAACTAGCAGAGAAAGTTGCTGAACATGTTTTT GAGCTAGAGCCAGAGAACACAGGATATTATGTACTTCTAGCAAATATTTATGCAGAAGCA GAGAAGTGGGAAGAAGTGAAAAAATTGAGGGAGAGAATTGGCCGGCGTGGCTTAAGAAAG AACCCTGGGTGTAGTTGGATAGAGATCAAGGGCAAAGTCCATATCTTTGTTACTGGAGAT AGTTCACACCCACTAGCCAATAAGATAGAATTGTTATTAAAGAAGACGAGAACACGAATG AAGGAAGAGGGTCACTTTCCAAAAATGAGGTATGCTTTGATTAAGGCAGATGACACGGAG AAAGAAATGGCTCTCTGTGGGCACAGCGAGAAGATAGCCATGGCTTTTGGAATTTTGAGC TTGCCACCGGGCAAAACTGTAAGGGTCACCAAGAATTTAAGAGTATGTGGTGATTGTCAT GAGATGGCCAAATTCATGTCCAAGATGGTAAAGAGAGATATCATCTTGAGAGATTCTAAT CGCTTTCATCATTTCAAGGATGGGTCTTGTTCTTGCAGAGGTCACTGGTGAAACAAAGTG GGAAAAGGAGTTGAAATGTAAGGAGCTCTTCATCCAGGCACTCTCACTGTCTCACCCTGA CACAAGTTGATTTTCAAGATTTGATTGGTAAGAGTTTTGCAAATTGTGATTTAACAGAGA TTAACATATTGCTGTTGTTGATCTAAGCTATGGCTCAGGACCATGTTCTGGATCATATTA ATGGTCCTACTTATTCCACAGGCTGAATTTTGTGATGCAATTTTACCAAAAAGCCAGAAC GCATCCCTGTACCTCTCATTTCTAACTTGCTAGTGTTCACAATTTACCTAGATTGTGTTT