Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_10s0003g00970.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:10:2345176:2346809:1 gene:VIT_10s0003g00970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAAACATGTCAAATCATCCTCAATCAGACCGTCCATTTTCTCATCATCTCAAAACCAG AGACCTTCGGTCCCACCAAACCAGTCTTTCCCGCCTGCAAGCGACTACATTTCTAGCCCA ACTGCCATCTCTCTATCCGTTGCTCTGCAACACTATATCAATTCAGATTTTCCTTCCCAT GGCCAAAAGATCCATTCCCATATTCTTAAAATTGGGTTCGAACCCAATACCAATGTCTCT ATTAAGCTCCTTATTCTCCATTTGAAATCGCGTTGTTTGAGATATGCACGCCAGCTGTTT GATGAAATGCATCAGCCAACTCTGTCTGCTTATAATTATATGATTAGTGGGTATCTTAAA CATGGGCAAATCGAAGAATTGCTTAATTTGGTTTCTAGACTGACCTTTTCTTATGAAAAG CCTGATGGGTTTACGTTTTCGATGATTTTAAAGGCGACTGGTTGTGCTAGTGGTGGGATT TTTCCATTGACATATAGTTTAGGAAAAGTTGTACACGCCCAGATACTGAGATCTAATGTT GAGTCTGATGATGTTCTTTATACGGCACTTGTTGACTCGTATGTTAAAAATGGGAAGGTT GGTTATGCAAGGAGGGTGTTCGACATGATGTTGGACAAGAATGTGCTATGTTCAACATCA ATGATTTCAGGTTACATGAGTCAAGGGTCTGTGGAAGATGCTGAAGATATTTTCAAGAGA ACAGTTGAAAAAGATGTGGTGGTTTTCAATGCAATGATTGAAGGTTATAGCAAATCAGTT GAGACTGCTAGGAGATCACTTGAAGTTTATATTGACATGCAGCGGTTGAACTTCCGGCCC ACAATGTCAACTTTTGCTAGTGTAATTGGGGCTTGCTCAGTTTTGACAGTATTTGAAATT GGTCAGCAAGTTCAAAGTCAGCTTGTGAAGATGAATTTCTACAATGACATAAAAATGGGA AGTGCTCTTATAGACATGTACTCAAAATGTGGAAGAATTGAGGATGCGCGGAGAGTTTTC GACCACATGCCTGAAAAGAATGTATTTTCATGGACTTCCATGATTGATGGATATGGGAAG AATGGAAATTCCAATGAAGCACTTGAGCTCTTCAGTAGGATGCAAATAGAGTGCCATGTC AAGCCCAACTATGTTACATTCCTGAGTGCTCTGTCAGCTTGTGGACATGCTGGCTTAGTT GCTAAAGGCTGGACAATATTGGAGAGCATGGAGAGAGATTACTTGCTGAAACCGAGGATG GAGCATTATGCTTGCATGGTTGATCTCCTTGGGCGTGCGGGAAGTCTACAGCAGGCATGG GAGTTTGTAATGAGAATGCCTGAGAAGCCTGGTTCTGATGTTTGGGCAGCTTTGCTCAGT TCATGTCAGCTGCATGGTGATGTAGAGATGGCAAGTATGGCTGCCCATGAAATTTTTAAG TTGAATTCTGATGGTAGGCCTGGGGCGTATGTTGCACTATCTAATGCTTTGGCAGCTGCT GGAAAATGGGACAGTGTTAGTGAAGTTAGGCAGTTAATGAAGGTAAGAGGAGTATCAAAA GATACTGGCTGCAGTTGGGTAGGCACTGATAGTGGTCCATGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_10s0003g00970.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:10:2345176:2346809:1 gene:VIT_10s0003g00970 transcript:VIT_10s0003g00970.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MKHVKSSSIRPSIFSSSQNQRPSVPPNQSFPPASDYISSPTAISLSVALQHYINSDFPSH GQKIHSHILKIGFEPNTNVSIKLLILHLKSRCLRYARQLFDEMHQPTLSAYNYMISGYLK HGQIEELLNLVSRLTFSYEKPDGFTFSMILKATGCASGGIFPLTYSLGKVVHAQILRSNV ESDDVLYTALVDSYVKNGKVGYARRVFDMMLDKNVLCSTSMISGYMSQGSVEDAEDIFKR TVEKDVVVFNAMIEGYSKSVETARRSLEVYIDMQRLNFRPTMSTFASVIGACSVLTVFEI GQQVQSQLVKMNFYNDIKMGSALIDMYSKCGRIEDARRVFDHMPEKNVFSWTSMIDGYGK NGNSNEALELFSRMQIECHVKPNYVTFLSALSACGHAGLVAKGWTILESMERDYLLKPRM EHYACMVDLLGRAGSLQQAWEFVMRMPEKPGSDVWAALLSSCQLHGDVEMASMAAHEIFK LNSDGRPGAYVALSNALAAAGKWDSVSEVRQLMKVRGVSKDTGCSWVGTDSGP

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_10s0003g00970.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:10:2345176:2346809:1 gene:VIT_10s0003g00970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAAACATGTCAAATCATCCTCAATCAGACCGTCCATTTTCTCATCATCTCAAAACCAG AGACCTTCGGTCCCACCAAACCAGTCTTTCCCGCCTGCAAGCGACTACATTTCTAGCCCA ACTGCCATCTCTCTATCCGTTGCTCTGCAACACTATATCAATTCAGATTTTCCTTCCCAT GGCCAAAAGATCCATTCCCATATTCTTAAAATTGGGTTCGAACCCAATACCAATGTCTCT ATTAAGCTCCTTATTCTCCATTTGAAATCGCGTTGTTTGAGATATGCACGCCAGCTGTTT GATGAAATGCATCAGCCAACTCTGTCTGCTTATAATTATATGATTAGTGGGTATCTTAAA CATGGGCAAATCGAAGAATTGCTTAATTTGGTTTCTAGACTGACCTTTTCTTATGAAAAG CCTGATGGGTTTACGTTTTCGATGATTTTAAAGGCGACTGGTTGTGCTAGTGGTGGGATT TTTCCATTGACATATAGTTTAGGAAAAGTTGTACACGCCCAGATACTGAGATCTAATGTT GAGTCTGATGATGTTCTTTATACGGCACTTGTTGACTCGTATGTTAAAAATGGGAAGGTT GGTTATGCAAGGAGGGTGTTCGACATGATGTTGGACAAGAATGTGCTATGTTCAACATCA ATGATTTCAGGTTACATGAGTCAAGGGTCTGTGGAAGATGCTGAAGATATTTTCAAGAGA ACAGTTGAAAAAGATGTGGTGGTTTTCAATGCAATGATTGAAGGTTATAGCAAATCAGTT GAGACTGCTAGGAGATCACTTGAAGTTTATATTGACATGCAGCGGTTGAACTTCCGGCCC ACAATGTCAACTTTTGCTAGTGTAATTGGGGCTTGCTCAGTTTTGACAGTATTTGAAATT GGTCAGCAAGTTCAAAGTCAGCTTGTGAAGATGAATTTCTACAATGACATAAAAATGGGA AGTGCTCTTATAGACATGTACTCAAAATGTGGAAGAATTGAGGATGCGCGGAGAGTTTTC GACCACATGCCTGAAAAGAATGTATTTTCATGGACTTCCATGATTGATGGATATGGGAAG AATGGAAATTCCAATGAAGCACTTGAGCTCTTCAGTAGGATGCAAATAGAGTGCCATGTC AAGCCCAACTATGTTACATTCCTGAGTGCTCTGTCAGCTTGTGGACATGCTGGCTTAGTT GCTAAAGGCTGGACAATATTGGAGAGCATGGAGAGAGATTACTTGCTGAAACCGAGGATG GAGCATTATGCTTGCATGGTTGATCTCCTTGGGCGTGCGGGAAGTCTACAGCAGGCATGG GAGTTTGTAATGAGAATGCCTGAGAAGCCTGGTTCTGATGTTTGGGCAGCTTTGCTCAGT TCATGTCAGCTGCATGGTGATGTAGAGATGGCAAGTATGGCTGCCCATGAAATTTTTAAG TTGAATTCTGATGGTAGGCCTGGGGCGTATGTTGCACTATCTAATGCTTTGGCAGCTGCT GGAAAATGGGACAGTGTTAGTGAAGTTAGGCAGTTAATGAAGGTAAGAGGAGTATCAAAA GATACTGGCTGCAGTTGGGTAGGCACTGATAGTGGTCCATGAGGTTTCCATATCAAGAAA AAGATGCAACCAGA