Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_09s0054g00700.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:9:21518781:21535560:1 gene:VIT_09s0054g00700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGATGACGATGTGGAGAGTGGTGCTTTGGGGCCTTACCAAGATAAGCCAAGGATTTTC CCCAACATGCGGAGTAAATCTTACACCCCATTGATTTTTCGAATTTTCATGGGAATAAAT GTCCGTGTGCTTTTTGTACTTCTGCTCTTGGGCTTGGGAGCTGTTTTTTATGTTGGGGCA AGAACTTCTCCAATCCTTGTGTTTGTCTTCTCAGTGTGCATCATCAGCTTCCTTTTATCA GTCTATCTTACTAAATGGGTACTAGCGAAGGACGAGGGGCCTCCTGAGATGGCTCAGATA TCAGATGCGATACGTGATGGAGCAGAAGGTTTCTTCAGGACCCAATATGGGACTATTTCC AAGATGGCAATGTTACTAGCTCTTGTGATCCTTAGCATATATTTGTTTCGCAGTACAACT CCTCAACAAGAATCTTCTGGCATAGGAAGGTCAACAACTGCATATATTACTGTTGCTGCC TTTCTCCTAGGGGCTCTTTGTTCAGGAATTGCTGGGTATGTTGGAATGTGGGTGTCGGTA CGTGCAAACGTTCGAGTCTCAAGTGCTGCAAGACGGTCTGCAAGAGAAGCATTGCAGATA GCTGTTCGTGCTGGTGGTTTCTCTGCCCTTGTTGTTGTTGGTATGGCTGTAATTGGTGTT GCCATCCTTTATGCCACATTTTATGTTTGGTTGGGCGTAGATTCGACAGGTTCAATGAAG GTTACTGATTTGCCTCTTCTTCTTGTGGGATATGGATTTGGAGCTTCATTTGTTGCCCTT TTTGCTCAGTTGGGTGGTGGAATATATACAAAAGCAGCAGATGTTGGAGCTGATCTGGTT GGAAAGGTGGAGCAGGGAATACCTGAAGATGATCCTCGAAATCCTGCTGTCATTGCAGAT TTGGTTGGAGACAATGTTGGTGATTGTGCTGCTAGAGGTGCTGATCTGTTTGAAAGTATT GCAGCTGAAATCATCAGTGCTATGATACTGGGTGGAACAATGGCTCAACGTTGCAAGATT GAAGATCCATCTGGTTTCATCCTGTTTCCTCTTGTCATTCACTCTTTTGACCTGGTAATA TCATCGGTTGGAATATTTTCAATAAGGGGGACACGTGACTCTGGAGTGAAGTCACCTGTC GAGGATCCAATGGCAATTCTTCAGAAAGGATACTCCATTACAATAATTTTAGCTGTTTTG ACATTTGGCTTGTCTACCCGTTGGCTACTTTACACCGAACAAGCACCTTCTGCTTGGATG AACTTTGCCTTATGTGGATTAGTTGGAATTATGACAGCTTATGTTTTTGTCTGGATCACC AAGTACTATACTGACTACAAGCATGAACCTGTTCGCACTCTAGCTCTTTCTAGCTCCACA GGGCATGGGACCAACATAATAGCAGGTGTCAGTTTGGGTCTGGAATCTACTGCTCTTCCT GTCATCGTCATTAGCATATCTATTGTCTCAGCTTTCTGGCTCGGCCAAACTTCGGGCCTA GTGGATGAAACTGGGAACCCAACTGGTGGGCTGTTTGGGACTGCTGTTGCAACAATGGGA ATGCTGAGCACTGCTGCCTATGTTCTAACTATGGATATGTTTGGTCCAATAGCTGATAAT GCTGGTGGAATAGTAGAGATGAGTCAGCAGCCTGAAAGTGTTCGGGAGATCACTGATCTT CTTGATGCAGTTGGGAACACCACAAAAGCTACCACCAAGGGATTCGCCATTGGATCCGCG GCACTCGCATCCTTCCTTCTGTTCAGTGCTTATATGGATGAGGTGTCAGCATTTGCTCAT GAACCTTTTAAGCAGGTTGATATTGCCATTCCAGAAGTTTTTGTTGGTGGGTTGTTGGGC TCTATGCTTATTTTCCTATTTAGTGCATGGGCATGTTCTGCAGTTGGCCGGACTGCTCAA GAGGTTGTCAATGAAGTAAGAAGACAGTTTATTGAGAGGCCAGGTATCATGGACTATAAA GAGAAACCAGACTATGGTCGTTGTGTTGCCATTGTAGCATCTGCATCTCTGAGGGAGATG ATAAAACCCGGTGCTTTGGCTATTGTATCACCTATAGTGGTTGGCTTTCTGTTCCGGATT TTGGGATACTACACCGGACATCCTCTACTCGGGGCTAAAGTTGTGGCTTCAATGTTGATG TTTGCAACAGTTGCGGGTATACTTATGGCCCTTTTCCTGAACACAGCTGGTGGTGCCTGG GACAATGCAAAGAAGTATATAGAGACGGGCGCGCTTGGAGGCAAGGGAAGTGATGCCCAC AAAGCTGCAGTTACCGGAGACACTGTGGGAGACCCCTTCAAAGACACGGCTGGACCGTCG CTCCATGTTCTAATCAAAATGTTGGCAACCATCACTCTGGTCATGGCACCGGTCTTTCTG TGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_09s0054g00700.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:9:21518781:21535560:1 gene:VIT_09s0054g00700 transcript:VIT_09s0054g00700.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MDDDVESGALGPYQDKPRIFPNMRSKSYTPLIFRIFMGINVRVLFVLLLLGLGAVFYVGA RTSPILVFVFSVCIISFLLSVYLTKWVLAKDEGPPEMAQISDAIRDGAEGFFRTQYGTIS KMAMLLALVILSIYLFRSTTPQQESSGIGRSTTAYITVAAFLLGALCSGIAGYVGMWVSV RANVRVSSAARRSAREALQIAVRAGGFSALVVVGMAVIGVAILYATFYVWLGVDSTGSMK VTDLPLLLVGYGFGASFVALFAQLGGGIYTKAADVGADLVGKVEQGIPEDDPRNPAVIAD LVGDNVGDCAARGADLFESIAAEIISAMILGGTMAQRCKIEDPSGFILFPLVIHSFDLVI SSVGIFSIRGTRDSGVKSPVEDPMAILQKGYSITIILAVLTFGLSTRWLLYTEQAPSAWM NFALCGLVGIMTAYVFVWITKYYTDYKHEPVRTLALSSSTGHGTNIIAGVSLGLESTALP VIVISISIVSAFWLGQTSGLVDETGNPTGGLFGTAVATMGMLSTAAYVLTMDMFGPIADN AGGIVEMSQQPESVREITDLLDAVGNTTKATTKGFAIGSAALASFLLFSAYMDEVSAFAH EPFKQVDIAIPEVFVGGLLGSMLIFLFSAWACSAVGRTAQEVVNEVRRQFIERPGIMDYK EKPDYGRCVAIVASASLREMIKPGALAIVSPIVVGFLFRILGYYTGHPLLGAKVVASMLM FATVAGILMALFLNTAGGAWDNAKKYIETGALGGKGSDAHKAAVTGDTVGDPFKDTAGPS LHVLIKMLATITLVMAPVFL

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_09s0054g00700.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:9:21518781:21535560:1 gene:VIT_09s0054g00700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	AGAAAATTCCCTATCTAAAAAAATTTATTTTTTCTCTTTTTCTCTTCTATTCAATTTCTC TCTCTAAAACTCTGCAGAAATCATAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGGAGCTGTCGGAGGC CCTAAGTGAAGAAAAAGGAAAAAAAAAAGCTTCCGTTAATGGCGGTTACAGAAGTTCATT CAATGGCCTGGAACTGATCTGCATTAAAGGACTGGACGAGGATTTTTCTTCCCTAAAGCT TTAATTCTTGAAAGGCAAGGCAAGAGAACAGAAGTTGGAAAACTGGGAGAAGAGTGAAAG AGTAATTTGATGGTTTTTTAACTATATAAGATTAGATTTTAACCTTCACTGTCTGCATAA CAACATTCAAAATTCAGCGACCAGGTTCAGGGGGTGACTTGCCCCAAAGTGGCGAGTTCA TCCCTTTCCCTGTAGCCAGGAGGGTGAATTCCTCCCATGCTGTAACTATGGATGACGATG TGGAGAGTGGTGCTTTGGGGCCTTACCAAGATAAGCCAAGGATTTTCCCCAACATGCGGA GTAAATCTTACACCCCATTGATTTTTCGAATTTTCATGGGAATAAATGTCCGTGTGCTTT TTGTACTTCTGCTCTTGGGCTTGGGAGCTGTTTTTTATGTTGGGGCAAGAACTTCTCCAA TCCTTGTGTTTGTCTTCTCAGTGTGCATCATCAGCTTCCTTTTATCAGTCTATCTTACTA AATGGGTACTAGCGAAGGACGAGGGGCCTCCTGAGATGGCTCAGATATCAGATGCGATAC GTGATGGAGCAGAAGGTTTCTTCAGGACCCAATATGGGACTATTTCCAAGATGGCAATGT TACTAGCTCTTGTGATCCTTAGCATATATTTGTTTCGCAGTACAACTCCTCAACAAGAAT CTTCTGGCATAGGAAGGTCAACAACTGCATATATTACTGTTGCTGCCTTTCTCCTAGGGG CTCTTTGTTCAGGAATTGCTGGGTATGTTGGAATGTGGGTGTCGGTACGTGCAAACGTTC GAGTCTCAAGTGCTGCAAGACGGTCTGCAAGAGAAGCATTGCAGATAGCTGTTCGTGCTG GTGGTTTCTCTGCCCTTGTTGTTGTTGGTATGGCTGTAATTGGTGTTGCCATCCTTTATG CCACATTTTATGTTTGGTTGGGCGTAGATTCGACAGGTTCAATGAAGGTTACTGATTTGC CTCTTCTTCTTGTGGGATATGGATTTGGAGCTTCATTTGTTGCCCTTTTTGCTCAGTTGG GTGGTGGAATATATACAAAAGCAGCAGATGTTGGAGCTGATCTGGTTGGAAAGGTGGAGC AGGGAATACCTGAAGATGATCCTCGAAATCCTGCTGTCATTGCAGATTTGGTTGGAGACA ATGTTGGTGATTGTGCTGCTAGAGGTGCTGATCTGTTTGAAAGTATTGCAGCTGAAATCA TCAGTGCTATGATACTGGGTGGAACAATGGCTCAACGTTGCAAGATTGAAGATCCATCTG GTTTCATCCTGTTTCCTCTTGTCATTCACTCTTTTGACCTGGTAATATCATCGGTTGGAA TATTTTCAATAAGGGGGACACGTGACTCTGGAGTGAAGTCACCTGTCGAGGATCCAATGG CAATTCTTCAGAAAGGATACTCCATTACAATAATTTTAGCTGTTTTGACATTTGGCTTGT CTACCCGTTGGCTACTTTACACCGAACAAGCACCTTCTGCTTGGATGAACTTTGCCTTAT GTGGATTAGTTGGAATTATGACAGCTTATGTTTTTGTCTGGATCACCAAGTACTATACTG ACTACAAGCATGAACCTGTTCGCACTCTAGCTCTTTCTAGCTCCACAGGGCATGGGACCA ACATAATAGCAGGTGTCAGTTTGGGTCTGGAATCTACTGCTCTTCCTGTCATCGTCATTA GCATATCTATTGTCTCAGCTTTCTGGCTCGGCCAAACTTCGGGCCTAGTGGATGAAACTG GGAACCCAACTGGTGGGCTGTTTGGGACTGCTGTTGCAACAATGGGAATGCTGAGCACTG CTGCCTATGTTCTAACTATGGATATGTTTGGTCCAATAGCTGATAATGCTGGTGGAATAG TAGAGATGAGTCAGCAGCCTGAAAGTGTTCGGGAGATCACTGATCTTCTTGATGCAGTTG GGAACACCACAAAAGCTACCACCAAGGGATTCGCCATTGGATCCGCGGCACTCGCATCCT TCCTTCTGTTCAGTGCTTATATGGATGAGGTGTCAGCATTTGCTCATGAACCTTTTAAGC AGGTTGATATTGCCATTCCAGAAGTTTTTGTTGGTGGGTTGTTGGGCTCTATGCTTATTT TCCTATTTAGTGCATGGGCATGTTCTGCAGTTGGCCGGACTGCTCAAGAGGTTGTCAATG AAGTAAGAAGACAGTTTATTGAGAGGCCAGGTATCATGGACTATAAAGAGAAACCAGACT ATGGTCGTTGTGTTGCCATTGTAGCATCTGCATCTCTGAGGGAGATGATAAAACCCGGTG CTTTGGCTATTGTATCACCTATAGTGGTTGGCTTTCTGTTCCGGATTTTGGGATACTACA CCGGACATCCTCTACTCGGGGCTAAAGTTGTGGCTTCAATGTTGATGTTTGCAACAGTTG CGGGTATACTTATGGCCCTTTTCCTGAACACAGCTGGTGGTGCCTGGGACAATGCAAAGA AGTATATAGAGACGGGCGCGCTTGGAGGCAAGGGAAGTGATGCCCACAAAGCTGCAGTTA CCGGAGACACTGTGGGAGACCCCTTCAAAGACACGGCTGGACCGTCGCTCCATGTTCTAA TCAAAATGTTGGCAACCATCACTCTGGTCATGGCACCGGTCTTTCTGTGAGAAGAATTGA GGCTATATTTAATCTATTTTGGTAAATACGGTACCCATTGCTCTCTTCGAATCATTTTGA TATCTTCTTGCAAATATACAGAGATAGGTGGATGTAACTCAATTAGAGTGCCTGAATTTT CTTTCTTTTAACTTGAAATAAGAGATGTTCAATAGTTAGCTTTTATCAACATTCTTTTAT AAATATGCAGCTAAGTGTCCGGATTGATGGATCAGTAGATCAGTTTAAACCCTTAAA