Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_09s0002g07350.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:9:7403775:7405949:1 gene:VIT_09s0002g07350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGATCTCCGCCACCACTCTTTCTCCACCACCCACTCACCTCCCTTCTCTCCCACAAACC
CCACCCCTTTCTCTCATCAAAACCTGCAAATCCATGGCCCAACTCAAGCAAATTCACTCC
CAAACAATCTGCACTGGCCTCATATCCAACCCCATTGTGCCTGCTCAGATAATTGCCTTC
TGTTGCAAGCATGAGCTGGGTGATATGGAATACGCCCGTATGGTGTTCGACACAATGCCT
GGACCAAATCACTTTGTTTGGAACAATATGATTAAGGGGTATTCTCGTGTGGGTTGCCCC
AATTCTGCGGTTTCAATGTATTGTGAGATGCTAGAGAGGGGTGTCATGCCGGATGAATAC
ACGTATCCGTTTTTGCTCAAACGGTTTACGCGGGATACGGCGGTGAAGTGTGGAAGGGAG
TTGCATGATCATATAGTGAAGTTAGGGTTTAGTTCCAATGTGTTTGTACAAAATGCTTTG
ATTCATTTGTACTCGTTGAGTGGAGAAGTGAGTGTTGCTCGTGGGGTTTTTGATAGGAGT
TCAAAGGGTGATGTTGTCACTTGGAATGTGATGATTTCAGGGTATAACAGAAGTAAGCAA
TTTGATGAGTCAATGAAGCTTTTTGATGAGATGGAGAGGATGAGAGTGTTACCCAGTTCA
ATTACACTTGTTTCAGTGTTGTCAGCATGCTCCAAGTTGAAGGATTTGAATGTAGGGAAG
CGGGTTCATCGGTATGTCAAAGATCTGAAGATTGAGCCTGTCCGTGTATTGGAAAATGCT
TTGATTGATATGTATGCAGCTTGTGGTGATATGGATACAGCTCTTGGGATATTTGATAAT
ATGAAGAGTAGGGACGTGATTTCATGGACTGCTATTGTTACCGGGTTCACAAATTTGGGA
CAAGTTGGTCTAGCTAGGAATTATTTTGATAAAATGCCTGAACGGGACTTCGTCTCATGG
ACAGCAATGATTGATGGGTACCTTCAGGTGAACCGGTTTAAAGAGGTTTTATCACTTTTT
CGTGAGATGCAGGCTGCTAATATAAAGCCGGATGAGTTCACCATGGTCAGCATCCTTACA
GCTTGTGCACATCTGGGAGCGCTTGAATTAGGAGAATGGATAAAAGCCTACATTGACAAG
AATGAGATCAAGATCGATTCCTTTGTGGGAAATGCTTTGATAGACATGTATTTCAATTGT
GGAAACGTAGAAAAAGCAATAAGAATTTTCAATGCAATGCCTCACAGGGACAAGATTTCA
TGGACGGCCGTGATTTTTGGTCTTGCCATAAATGGATATGGAGAAGAAGCTCTTGATATG
TTCTCTCAGATGCTGAAAGCTTCAATCACACCAGATGAGGTGACGTGCATTGGCGTTCTT
TGTGCTTGTACCCACAGTGGAATGGTAGATAAGGGGAAAAAGTTCTTTGCCCGAATGACC
ACGCAACATGGGATTGAACCCAATGTAGCACATTATGGGTGCATGGTTGACCTTCTTGGC
CGAGCTGGGCATCTAAAAGAAGCTCATGAGGTGATCAAGAATATGCCAGTAAAACCTAAT
TCAATCGTCTGGGGATCACTTCTTGGTGCTTGTAGGGTTCATAGAGACGAAGAGATGGCT
GAAATGGCAGCTCAACAGATTCTTGAGTTAGAGCCCGAAAATGGGGCTGTCTATGTTCTG
TTATGCAATATATATGCAGCCTGCAACAGATGGGAAAAGTTGCATGAAGTAAGAAAATTA
ATGATGGATAGAGGAATCAAGAAAACCCCTGGTTGCAGTTTGATAGAGATGAACGGTTCT
GTTCATGAATTTGTGGCTGGGGACCAGGTTCATCCTCAATCGAAAGAAATCTACTCGAAG
TTAGATGAAATGTCGGTAGACTTGAAATTTGCAGGTTACTCGCCGGATACTTCAGAGGTG
TTCCTTGATATAGGGGAAGAGGAGAAAGAGAGTGCCGTTTACCGGCACAGTGAGAAGTTG
GCTATTGCCTTTGGGTTGATCAGTTCAGGACCTGGGGTCACTATTAGAATTGTGAAGAAC
CTTAGAATGTGTGTGGATTGTCATTATGTAGCAAAGTTGGTATCGAAGGTGTACAATAGA
GAAGTAATTGTTAGGGATCGAACCAGATTCCACCATTTTAGGCATGGCTCATGTTCCTGC
AAAGATTATTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_09s0002g07350.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:9:7403775:7405949:1 gene:VIT_09s0002g07350 transcript:VIT_09s0002g07350.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MISATTLSPPPTHLPSLPQTPPLSLIKTCKSMAQLKQIHSQTICTGLISNPIVPAQIIAF
CCKHELGDMEYARMVFDTMPGPNHFVWNNMIKGYSRVGCPNSAVSMYCEMLERGVMPDEY
TYPFLLKRFTRDTAVKCGRELHDHIVKLGFSSNVFVQNALIHLYSLSGEVSVARGVFDRS
SKGDVVTWNVMISGYNRSKQFDESMKLFDEMERMRVLPSSITLVSVLSACSKLKDLNVGK
RVHRYVKDLKIEPVRVLENALIDMYAACGDMDTALGIFDNMKSRDVISWTAIVTGFTNLG
QVGLARNYFDKMPERDFVSWTAMIDGYLQVNRFKEVLSLFREMQAANIKPDEFTMVSILT
ACAHLGALELGEWIKAYIDKNEIKIDSFVGNALIDMYFNCGNVEKAIRIFNAMPHRDKIS
WTAVIFGLAINGYGEEALDMFSQMLKASITPDEVTCIGVLCACTHSGMVDKGKKFFARMT
TQHGIEPNVAHYGCMVDLLGRAGHLKEAHEVIKNMPVKPNSIVWGSLLGACRVHRDEEMA
EMAAQQILELEPENGAVYVLLCNIYAACNRWEKLHEVRKLMMDRGIKKTPGCSLIEMNGS
VHEFVAGDQVHPQSKEIYSKLDEMSVDLKFAGYSPDTSEVFLDIGEEEKESAVYRHSEKL
AIAFGLISSGPGVTIRIVKNLRMCVDCHYVAKLVSKVYNREVIVRDRTRFHHFRHGSCSC
KDYW

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_09s0002g07350.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:9:7403775:7405949:1 gene:VIT_09s0002g07350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGATCTCCGCCACCACTCTTTCTCCACCACCCACTCACCTCCCTTCTCTCCCACAAACC
CCACCCCTTTCTCTCATCAAAACCTGCAAATCCATGGCCCAACTCAAGCAAATTCACTCC
CAAACAATCTGCACTGGCCTCATATCCAACCCCATTGTGCCTGCTCAGATAATTGCCTTC
TGTTGCAAGCATGAGCTGGGTGATATGGAATACGCCCGTATGGTGTTCGACACAATGCCT
GGACCAAATCACTTTGTTTGGAACAATATGATTAAGGGGTATTCTCGTGTGGGTTGCCCC
AATTCTGCGGTTTCAATGTATTGTGAGATGCTAGAGAGGGGTGTCATGCCGGATGAATAC
ACGTATCCGTTTTTGCTCAAACGGTTTACGCGGGATACGGCGGTGAAGTGTGGAAGGGAG
TTGCATGATCATATAGTGAAGTTAGGGTTTAGTTCCAATGTGTTTGTACAAAATGCTTTG
ATTCATTTGTACTCGTTGAGTGGAGAAGTGAGTGTTGCTCGTGGGGTTTTTGATAGGAGT
TCAAAGGGTGATGTTGTCACTTGGAATGTGATGATTTCAGGGTATAACAGAAGTAAGCAA
TTTGATGAGTCAATGAAGCTTTTTGATGAGATGGAGAGGATGAGAGTGTTACCCAGTTCA
ATTACACTTGTTTCAGTGTTGTCAGCATGCTCCAAGTTGAAGGATTTGAATGTAGGGAAG
CGGGTTCATCGGTATGTCAAAGATCTGAAGATTGAGCCTGTCCGTGTATTGGAAAATGCT
TTGATTGATATGTATGCAGCTTGTGGTGATATGGATACAGCTCTTGGGATATTTGATAAT
ATGAAGAGTAGGGACGTGATTTCATGGACTGCTATTGTTACCGGGTTCACAAATTTGGGA
CAAGTTGGTCTAGCTAGGAATTATTTTGATAAAATGCCTGAACGGGACTTCGTCTCATGG
ACAGCAATGATTGATGGGTACCTTCAGGTGAACCGGTTTAAAGAGGTTTTATCACTTTTT
CGTGAGATGCAGGCTGCTAATATAAAGCCGGATGAGTTCACCATGGTCAGCATCCTTACA
GCTTGTGCACATCTGGGAGCGCTTGAATTAGGAGAATGGATAAAAGCCTACATTGACAAG
AATGAGATCAAGATCGATTCCTTTGTGGGAAATGCTTTGATAGACATGTATTTCAATTGT
GGAAACGTAGAAAAAGCAATAAGAATTTTCAATGCAATGCCTCACAGGGACAAGATTTCA
TGGACGGCCGTGATTTTTGGTCTTGCCATAAATGGATATGGAGAAGAAGCTCTTGATATG
TTCTCTCAGATGCTGAAAGCTTCAATCACACCAGATGAGGTGACGTGCATTGGCGTTCTT
TGTGCTTGTACCCACAGTGGAATGGTAGATAAGGGGAAAAAGTTCTTTGCCCGAATGACC
ACGCAACATGGGATTGAACCCAATGTAGCACATTATGGGTGCATGGTTGACCTTCTTGGC
CGAGCTGGGCATCTAAAAGAAGCTCATGAGGTGATCAAGAATATGCCAGTAAAACCTAAT
TCAATCGTCTGGGGATCACTTCTTGGTGCTTGTAGGGTTCATAGAGACGAAGAGATGGCT
GAAATGGCAGCTCAACAGATTCTTGAGTTAGAGCCCGAAAATGGGGCTGTCTATGTTCTG
TTATGCAATATATATGCAGCCTGCAACAGATGGGAAAAGTTGCATGAAGTAAGAAAATTA
ATGATGGATAGAGGAATCAAGAAAACCCCTGGTTGCAGTTTGATAGAGATGAACGGTTCT
GTTCATGAATTTGTGGCTGGGGACCAGGTTCATCCTCAATCGAAAGAAATCTACTCGAAG
TTAGATGAAATGTCGGTAGACTTGAAATTTGCAGGTTACTCGCCGGATACTTCAGAGGTG
TTCCTTGATATAGGGGAAGAGGAGAAAGAGAGTGCCGTTTACCGGCACAGTGAGAAGTTG
GCTATTGCCTTTGGGTTGATCAGTTCAGGACCTGGGGTCACTATTAGAATTGTGAAGAAC
CTTAGAATGTGTGTGGATTGTCATTATGTAGCAAAGTTGGTATCGAAGGTGTACAATAGA
GAAGTAATTGTTAGGGATCGAACCAGATTCCACCATTTTAGGCATGGCTCATGTTCCTGC
AAAGATTATTGGTAA