Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_09s0002g05690.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:9:5440878:5443991:-1 gene:VIT_09s0002g05690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCTGTTTCTGCTAAAATCCCCGCAATTCATCTCCAGACTAACCTCCCCAATCCTCAT CACTCCAAAACCCACAAACCCAAACCCCTAAATTTCTCTCGAAATATCCAAACCCGCCAA ATTTCCCTAAGAAAACACCACGAAATCTCAGTCCTCAACCCCAGCTCCATCACTGCCCAA AACCCGAACTCACTTATCTTGGAACTCTGCCTTAAAGGGGACTTAGAGAAAGCTTTAATC CACTTAGATTCAATGCAAGAACTTCAAGTTTCTGTCGAAGAAGAAACTTATATTGCCTTA TTGAGGCTCTGTGAGTGGAAGAGAGCTGCCAGTGAAGGCTCGAGGGTTCACTCGTACGTG AGTAAAACAGTAACCCGTTTGGGGGTTAGACTCGGTAATGCGTTATTGAGTATGTTTGTG AGATTTGGTGATTTAGTTGAAGCGTGGTATGTGTTTGGGAAAATGGCCGAGAGGGATTTG TTTTCTTGGAATGTTTTGGTGGGTGGGTATGCAAAAGCTGGGTATTTTGACGAAGCTTTG AATTTGTATCATAGGATGTTGTGGGTGGGGATTAGGCCTGATGTGTACACGTTTCCTTGT GTTTTGAGGACTTGCGGGGGTTTGCCAGACTTGGCGAGGGGTAGGGAGGTTCATTTGCAT GTAATTAGATATGGGTTCGAGTCAGATGTAGATGTGGTTAACGCTTTGATAACTATGTAC GTGAAGTGTGGAGATATTTTTAGTGCAAGGTTGGTGTTTGATAGAATGCCCAGGAGGGAT CGGATATCATGGAATGCGATGATTTCAGGGTACTTTGAGAATGATGTTTGCTTGGAAGGA TTGAGATTGTTCTTTATGATGCGTGAATTTTTCGTTGATCCGGATTTGATGACAATGACC AGTGTGATCTCGGCCTGTGAGGCTCTTGGTGATGAGAGATTAGGGAGGGAAGTTCATGGG TACGTGATCAAAACTGGGTTTGTTGCTGAAGTTTCGGTAAATAATTCATTGATTCAAATG CATTCAAGTGTTGGGTGTTGGGATGAAGCAGAAATGGTTTTTTCTAAAATGGAGTTTAAA GATTTGGTATCATGGACGGCAATGATTTCAGGTTATGAGAAGAATGGGTTGCCTGAAAAA GCTGTGGAAACATACACAATCATGGAGCACGAGGGGGTTGTGCCAGATGAGATCACAATA GCCAGTGTTCTTTCTGCTTGTGCTGGTTTAGGCCTTTTAGATAAGGGTATTATGCTTCAT GAGTTTGCTGATAGGACTGGACTTACTTCTTATGTCATAGTTGCAAACAGCCTTATAGAT ATGTATTCCAAGTGTCGATGCATTGATAAGGCTTTGGAAGTGTTTCATCGTATTCCTAAC AAGAACGTGATATCTTGGACTTCGATCATTCTTGGGCTTCGGCTCAACTATCGGAGCTTT GAGGCTCTGTTTTTCTTTCAGCAAATGATACTCAGTTTAAAACCCAATTCTGTTACCTTA GTTTCTGTCCTGTCTGCATGTGCTAGGATAGGAGCTTTGTCATGTGGAAAAGAGATTCAT GCTCATGCATTAAGAACTGGATTGGGGTTTGATGGTTTTTTACCCAATGCTCTTCTAGAC ATGTATGTAAGGTGTGGAAGGATGGAACCTGCATGGAACCAGTTTAATTCATGTGAAAAG GATGTTGCTTCATGGAACATTCTGCTTACAGGCTATGCCCAGCAGGGGAAAGGAGGACTT GCTGTGGAGCTATTTCATAAAATGATCGAGTCAGATGTCAATCCCGATGAGATTACATTT ACTTCCCTATTATGTGCTTGTAGTAGATCTGGAATGGTGACTGATGGCTTGGAGTATTTT GAAAGCATGGAACATAAGTTCCATATTGCCCCAAATCTGAAACATTATGCTAGTGTGGTG GATTTACTTGGCCGTGCAGGCCGGTTGGAGGATGCATACGAGTTTATAAAGAAAATGCCC ATAGATCCAGATCCTGCCATTTGGGGAGCCTTATTAAATGCATGTAGGATTTACCAGAAC GTTGAGCTTGGGGAACTTGCAGCTCAACATATCTTTGAAATGGATACAAAAAGTGTTGGC TATTACATTCTTTTGTGTAATCTTTATGCTGACAGTGGTAAGTGGGATGAAGTAGCCAGG GTGAGAAAGATAATGAGAGAAAACAGGCTTACTGTTGATCCTGGGTGCAGTTGGGTGGAA GTAGCAGGACAAGTTCATGCTTTCCTTACTGGTGATGATTTTCACCCTCAGATAAAGGAA ATAAATGCAGTTTTGGAGGGGTTTTATGAGAAGATGGAGGCAACAGGTCTGAGTATGTCA AAGGACAGTCGTAGAGATGATATTGACGCTTCAAAAGCTGAAATTTTTTGTGGGCACAGC GAGAGACTGGCCATTGCGTTTGGGCTCATAAATACTGTCCCTGGTACCCCTATTTGGGTG ACAAAGAATCTTTACATGTGTGAAAATTGCCATAACACCGTCAAATTCATTTCCAAGGTT GTTCGGAGGGGGATTTCAGTTAGGGATACCGAACAATTTCACCATTTCAAGGATGGAGTC TGCTCTTGTGGTGACGAGGGTTACTGGGGAAAAACTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_09s0002g05690.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:9:5440878:5443991:-1 gene:VIT_09s0002g05690 transcript:VIT_09s0002g05690.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MAVSAKIPAIHLQTNLPNPHHSKTHKPKPLNFSRNIQTRQISLRKHHEISVLNPSSITAQ NPNSLILELCLKGDLEKALIHLDSMQELQVSVEEETYIALLRLCEWKRAASEGSRVHSYV SKTVTRLGVRLGNALLSMFVRFGDLVEAWYVFGKMAERDLFSWNVLVGGYAKAGYFDEAL NLYHRMLWVGIRPDVYTFPCVLRTCGGLPDLARGREVHLHVIRYGFESDVDVVNALITMY VKCGDIFSARLVFDRMPRRDRISWNAMISGYFENDVCLEGLRLFFMMREFFVDPDLMTMT SVISACEALGDERLGREVHGYVIKTGFVAEVSVNNSLIQMHSSVGCWDEAEMVFSKMEFK DLVSWTAMISGYEKNGLPEKAVETYTIMEHEGVVPDEITIASVLSACAGLGLLDKGIMLH EFADRTGLTSYVIVANSLIDMYSKCRCIDKALEVFHRIPNKNVISWTSIILGLRLNYRSF EALFFFQQMILSLKPNSVTLVSVLSACARIGALSCGKEIHAHALRTGLGFDGFLPNALLD MYVRCGRMEPAWNQFNSCEKDVASWNILLTGYAQQGKGGLAVELFHKMIESDVNPDEITF TSLLCACSRSGMVTDGLEYFESMEHKFHIAPNLKHYASVVDLLGRAGRLEDAYEFIKKMP IDPDPAIWGALLNACRIYQNVELGELAAQHIFEMDTKSVGYYILLCNLYADSGKWDEVAR VRKIMRENRLTVDPGCSWVEVAGQVHAFLTGDDFHPQIKEINAVLEGFYEKMEATGLSMS KDSRRDDIDASKAEIFCGHSERLAIAFGLINTVPGTPIWVTKNLYMCENCHNTVKFISKV VRRGISVRDTEQFHHFKDGVCSCGDEGYWGKT

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_09s0002g05690.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:9:5440878:5443991:-1 gene:VIT_09s0002g05690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGCTGTTTCTGCTAAAATCCCCGCAATTCATCTCCAGACTAACCTCCCCAATCCTCAT CACTCCAAAACCCACAAACCCAAACCCCTAAATTTCTCTCGAAATATCCAAACCCGCCAA ATTTCCCTAAGAAAACACCACGAAATCTCAGTCCTCAACCCCAGCTCCATCACTGCCCAA AACCCGAACTCACTTATCTTGGAACTCTGCCTTAAAGGGGACTTAGAGAAAGCTTTAATC CACTTAGATTCAATGCAAGAACTTCAAGTTTCTGTCGAAGAAGAAACTTATATTGCCTTA TTGAGGCTCTGTGAGTGGAAGAGAGCTGCCAGTGAAGGCTCGAGGGTTCACTCGTACGTG AGTAAAACAGTAACCCGTTTGGGGGTTAGACTCGGTAATGCGTTATTGAGTATGTTTGTG AGATTTGGTGATTTAGTTGAAGCGTGGTATGTGTTTGGGAAAATGGCCGAGAGGGATTTG TTTTCTTGGAATGTTTTGGTGGGTGGGTATGCAAAAGCTGGGTATTTTGACGAAGCTTTG AATTTGTATCATAGGATGTTGTGGGTGGGGATTAGGCCTGATGTGTACACGTTTCCTTGT GTTTTGAGGACTTGCGGGGGTTTGCCAGACTTGGCGAGGGGTAGGGAGGTTCATTTGCAT GTAATTAGATATGGGTTCGAGTCAGATGTAGATGTGGTTAACGCTTTGATAACTATGTAC GTGAAGTGTGGAGATATTTTTAGTGCAAGGTTGGTGTTTGATAGAATGCCCAGGAGGGAT CGGATATCATGGAATGCGATGATTTCAGGGTACTTTGAGAATGATGTTTGCTTGGAAGGA TTGAGATTGTTCTTTATGATGCGTGAATTTTTCGTTGATCCGGATTTGATGACAATGACC AGTGTGATCTCGGCCTGTGAGGCTCTTGGTGATGAGAGATTAGGGAGGGAAGTTCATGGG TACGTGATCAAAACTGGGTTTGTTGCTGAAGTTTCGGTAAATAATTCATTGATTCAAATG CATTCAAGTGTTGGGTGTTGGGATGAAGCAGAAATGGTTTTTTCTAAAATGGAGTTTAAA GATTTGGTATCATGGACGGCAATGATTTCAGGTTATGAGAAGAATGGGTTGCCTGAAAAA GCTGTGGAAACATACACAATCATGGAGCACGAGGGGGTTGTGCCAGATGAGATCACAATA GCCAGTGTTCTTTCTGCTTGTGCTGGTTTAGGCCTTTTAGATAAGGGTATTATGCTTCAT GAGTTTGCTGATAGGACTGGACTTACTTCTTATGTCATAGTTGCAAACAGCCTTATAGAT ATGTATTCCAAGTGTCGATGCATTGATAAGGCTTTGGAAGTGTTTCATCGTATTCCTAAC AAGAACGTGATATCTTGGACTTCGATCATTCTTGGGCTTCGGCTCAACTATCGGAGCTTT GAGGCTCTGTTTTTCTTTCAGCAAATGATACTCAGTTTAAAACCCAATTCTGTTACCTTA GTTTCTGTCCTGTCTGCATGTGCTAGGATAGGAGCTTTGTCATGTGGAAAAGAGATTCAT GCTCATGCATTAAGAACTGGATTGGGGTTTGATGGTTTTTTACCCAATGCTCTTCTAGAC ATGTATGTAAGGTGTGGAAGGATGGAACCTGCATGGAACCAGTTTAATTCATGTGAAAAG GATGTTGCTTCATGGAACATTCTGCTTACAGGCTATGCCCAGCAGGGGAAAGGAGGACTT GCTGTGGAGCTATTTCATAAAATGATCGAGTCAGATGTCAATCCCGATGAGATTACATTT ACTTCCCTATTATGTGCTTGTAGTAGATCTGGAATGGTGACTGATGGCTTGGAGTATTTT GAAAGCATGGAACATAAGTTCCATATTGCCCCAAATCTGAAACATTATGCTAGTGTGGTG GATTTACTTGGCCGTGCAGGCCGGTTGGAGGATGCATACGAGTTTATAAAGAAAATGCCC ATAGATCCAGATCCTGCCATTTGGGGAGCCTTATTAAATGCATGTAGGATTTACCAGAAC GTTGAGCTTGGGGAACTTGCAGCTCAACATATCTTTGAAATGGATACAAAAAGTGTTGGC TATTACATTCTTTTGTGTAATCTTTATGCTGACAGTGGTAAGTGGGATGAAGTAGCCAGG GTGAGAAAGATAATGAGAGAAAACAGGCTTACTGTTGATCCTGGGTGCAGTTGGGTGGAA GTAGCAGGACAAGTTCATGCTTTCCTTACTGGTGATGATTTTCACCCTCAGATAAAGGAA ATAAATGCAGTTTTGGAGGGGTTTTATGAGAAGATGGAGGCAACAGGTCTGAGTATGTCA AAGGACAGTCGTAGAGATGATATTGACGCTTCAAAAGCTGAAATTTTTTGTGGGCACAGC GAGAGACTGGCCATTGCGTTTGGGCTCATAAATACTGTCCCTGGTACCCCTATTTGGGTG ACAAAGAATCTTTACATGTGTGAAAATTGCCATAACACCGTCAAATTCATTTCCAAGGTT GTTCGGAGGGGGATTTCAGTTAGGGATACCGAACAATTTCACCATTTCAAGGATGGAGTC TGCTCTTGTGGTGACGAGGGTTACTGGGGAAAAACTTGATTGGTGAGTACTAAAAACACC TACTTCTCATATATCTAGTGGTTCTAACTTGTAAGAGCATATATGACCTCAACCTCAAGA ATTTAATATGCACATAACTATCTGATAGAACCGGCCCCTCAGCAGTGAAGTGTATTAAGA TATGTGAAATTGCTAAGCTCAGATCATAACCACAAGGTTGAAGGAAAGATGTACATCCAT TGTCAAGGATGATATGACAAACAAAAGTGAAGAGGGAAGAAACTATTAATTCCTTCTTAT CACAGCACAGCATTCGATCAGGAAAATTGATGATGGAATATTGTAGGTTTGGTGCTGCTG GGAATTCAGTTAAGTCCCTCCTAAAAGTAGTATAGGGAAGGAACATTGAGCTGTAAAGAA GGGCTTCAGTTCCTGTTATTTTTATATATATGCCTTTTTTTCTTGTAATGTTAAACAAAC AGGCTTACTGCAAGTGGAATGTATTGTATAATGTTGCAAATTGCAAGTGCTTGG