Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_09s0002g02250.t01
CDS Infomation

cds chromosome:12X:9:2064010:2066136:1 gene:VIT_09s0002g02250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGCTTCATGGTTCTTCTCGGCGCCTCATCTCTATCTCATTCCTACCAAATCTGAGCCGT
TCAATCTCAATCATCCATCACCAACCCAACAATGATGTTCTTGATTTCTTCAATGATTTG
CTTCAACAATGCTCCAAATCTCACCTTTCCCAACAAATTCACTCCCAAATCATCGTCACT
GGCTCGCATCGATCTGCGTTCTTGGCCGCCCGGGTCGTGTCGGTTTATGCAGGTTTTGGG
CTGGTCAGTGATGCCCAGAGAGTGTTTGAAGTTAGCCCAATTGAGTGCTTTTCGAATCTG
CTTTTGTGGAATTCAATTTTGAGGGCTAATGTGGCTCATGGGTACTGTGAAGAAGCTCTT
GAAATTTATTGTAGAATGCGAAAGCTAGGGGTTTCGGCTGATGGGTTTACTTTTCCTTTG
GTTATAAGGGCTTGCGCTTTGATGGGTAGTCGTAAATTGTGCAGGAGCGTTCATGGGCAT
GTTGTGGAAATGGGGTTTCAGTGGAATCTTCATGTGGGGAATGAATTGATGGGAATGTAT
GGGAAGATTGGGAGAATGGACGATGCGCGCAAAGTGTTTGAGAGAATGGCTGTCAGGAGT
TGTGTTTCTTGGAACACTATGGTTTCGGGTTATGCACTTAATTATGATTGTCATGGTGCT
TCTGAGATGTTTCGGATGATGGGGTCTGCAGGGCTGGAGCCCAATTTGGTGACATGGACT
TCCCTGTTGTCGAGTCATGCTCGGTGTGGCCAACATGTCGAAACAATGGAGTTGTTTGGT
AGGATGAGGATGAGGGGAATTGGGGCTACTGCTGAAGCACTTGCTGTGGTGTTATCAGTC
TCTGTTGATTTGGCTGCTTTTGATGAGGGCAAGGTGATCCATGGATATGTTGTGAAGGGT
GGATTTGAAAACTACTTGTTTGTGAAAAACTCCCTTATATGCCTGTATGGGAAACATGGA
AATGTAAATGCTGCCCGAATTCTGTTTCTAGAAATCAAAACCAAGAATATAGTGAGTTGG
AATGCTCTGATATCATCATATGCAGATTTGGGTTGGTGTGATGAGGCTTTTGCAATATTT
TTGCAGCTGGAGAAGACAGATGAGTATCCGATGGTGAGGCCCAATGTGGTAAGTTGGAGT
GCTGTCATTGGAGGATTTGCTTCCAAAGGACAAGGGGAGGAGGCCCTTGAACTCTTTCGA
AGAATGCAGCTTGCTAAAGTAAAGGCAAATTCTGTGACAATTGCCAGTGTTTTATCAGTT
TGTGCAGAGTTAGCAGCACTGCATCTTGGTAGGGAGATCCATGGCCATGTAGTCAGATCT
TTGATGGATGGAAACATTTTGGTGGGGAATGGATTGATTAATATGTACACAAAAAGTGGA
AGTTTCAAGGAAGGGAATTTGGTATTTGAGAAAATTGAGAATAAGGATTTGATCTCTTGG
AACACTATGGTTGCAGGGTATGGCATACATGGACTTGGTGAGAATGCTATAAGAACTTTT
GATCAGATGATTAAAGATGGCTTTGAGCCAGATGGGGTCACTTTTGTTGCTGTCCTTTCA
GCATGTAGTCATGCTGGGCTTGTCGCTGAGGGCCGTGAACTCTTTGATAAGATGATCAAA
GAGTTCAGGGTTGAGCCCCAGATGGAGCACTATGCTTGTATGGTGGATCTTCTTGGCCGA
GCTGGGCTTCTACAGGAGGCAAGCAAGGTAGTGAAGAGCATGCCAGTGGAACCCAACGCT
TGTGTTTGGGGAGCTCTGCTGAACTCCTGCAGGATGCATAAAAACACAGAAGTGGCAGAG
GAAACTGCCTCTCAGATCTTTAATCTCAACTCAGAAATAGCAGGGAGCTACATGCTGCTC
TCAAATATTTATGCTGCGTCCGGGAGATGGGAGGATTCTGCAAAGGTCAGAATCTCAGCA
AAGACAAAGGGTCTAAAGAAAACCCCAGGCCAGAGTTGGATTCAGGTGAAGAAGAAGGTT
TACATGTTTTCAGCAGGCAACACCCAGCATGCAGAATTGGAAGAAGTTTACAGGATCCTC
AAGGATCTAGGTCTTCAAATGGAGGTAGAAGGCTATATTCCCGACATAGATGAAGAACAG
AGATCGATATTGCTTGGGTACAGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_09s0002g02250.t01
PEP Infomation

pep chromosome:12X:9:2064010:2066136:1 gene:VIT_09s0002g02250 transcript:VIT_09s0002g02250.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

MLHGSSRRLISISFLPNLSRSISIIHHQPNNDVLDFFNDLLQQCSKSHLSQQIHSQIIVT
GSHRSAFLAARVVSVYAGFGLVSDAQRVFEVSPIECFSNLLLWNSILRANVAHGYCEEAL
EIYCRMRKLGVSADGFTFPLVIRACALMGSRKLCRSVHGHVVEMGFQWNLHVGNELMGMY
GKIGRMDDARKVFERMAVRSCVSWNTMVSGYALNYDCHGASEMFRMMGSAGLEPNLVTWT
SLLSSHARCGQHVETMELFGRMRMRGIGATAEALAVVLSVSVDLAAFDEGKVIHGYVVKG
GFENYLFVKNSLICLYGKHGNVNAARILFLEIKTKNIVSWNALISSYADLGWCDEAFAIF
LQLEKTDEYPMVRPNVVSWSAVIGGFASKGQGEEALELFRRMQLAKVKANSVTIASVLSV
CAELAALHLGREIHGHVVRSLMDGNILVGNGLINMYTKSGSFKEGNLVFEKIENKDLISW
NTMVAGYGIHGLGENAIRTFDQMIKDGFEPDGVTFVAVLSACSHAGLVAEGRELFDKMIK
EFRVEPQMEHYACMVDLLGRAGLLQEASKVVKSMPVEPNACVWGALLNSCRMHKNTEVAE
ETASQIFNLNSEIAGSYMLLSNIYAASGRWEDSAKVRISAKTKGLKKTPGQSWIQVKKKV
YMFSAGNTQHAELEEVYRILKDLGLQMEVEGYIPDIDEEQRSILLGYR

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_09s0002g02250.t01
Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:9:2064010:2066136:1 gene:VIT_09s0002g02250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence

ATGCTTCATGGTTCTTCTCGGCGCCTCATCTCTATCTCATTCCTACCAAATCTGAGCCGT
TCAATCTCAATCATCCATCACCAACCCAACAATGATGTTCTTGATTTCTTCAATGATTTG
CTTCAACAATGCTCCAAATCTCACCTTTCCCAACAAATTCACTCCCAAATCATCGTCACT
GGCTCGCATCGATCTGCGTTCTTGGCCGCCCGGGTCGTGTCGGTTTATGCAGGTTTTGGG
CTGGTCAGTGATGCCCAGAGAGTGTTTGAAGTTAGCCCAATTGAGTGCTTTTCGAATCTG
CTTTTGTGGAATTCAATTTTGAGGGCTAATGTGGCTCATGGGTACTGTGAAGAAGCTCTT
GAAATTTATTGTAGAATGCGAAAGCTAGGGGTTTCGGCTGATGGGTTTACTTTTCCTTTG
GTTATAAGGGCTTGCGCTTTGATGGGTAGTCGTAAATTGTGCAGGAGCGTTCATGGGCAT
GTTGTGGAAATGGGGTTTCAGTGGAATCTTCATGTGGGGAATGAATTGATGGGAATGTAT
GGGAAGATTGGGAGAATGGACGATGCGCGCAAAGTGTTTGAGAGAATGGCTGTCAGGAGT
TGTGTTTCTTGGAACACTATGGTTTCGGGTTATGCACTTAATTATGATTGTCATGGTGCT
TCTGAGATGTTTCGGATGATGGGGTCTGCAGGGCTGGAGCCCAATTTGGTGACATGGACT
TCCCTGTTGTCGAGTCATGCTCGGTGTGGCCAACATGTCGAAACAATGGAGTTGTTTGGT
AGGATGAGGATGAGGGGAATTGGGGCTACTGCTGAAGCACTTGCTGTGGTGTTATCAGTC
TCTGTTGATTTGGCTGCTTTTGATGAGGGCAAGGTGATCCATGGATATGTTGTGAAGGGT
GGATTTGAAAACTACTTGTTTGTGAAAAACTCCCTTATATGCCTGTATGGGAAACATGGA
AATGTAAATGCTGCCCGAATTCTGTTTCTAGAAATCAAAACCAAGAATATAGTGAGTTGG
AATGCTCTGATATCATCATATGCAGATTTGGGTTGGTGTGATGAGGCTTTTGCAATATTT
TTGCAGCTGGAGAAGACAGATGAGTATCCGATGGTGAGGCCCAATGTGGTAAGTTGGAGT
GCTGTCATTGGAGGATTTGCTTCCAAAGGACAAGGGGAGGAGGCCCTTGAACTCTTTCGA
AGAATGCAGCTTGCTAAAGTAAAGGCAAATTCTGTGACAATTGCCAGTGTTTTATCAGTT
TGTGCAGAGTTAGCAGCACTGCATCTTGGTAGGGAGATCCATGGCCATGTAGTCAGATCT
TTGATGGATGGAAACATTTTGGTGGGGAATGGATTGATTAATATGTACACAAAAAGTGGA
AGTTTCAAGGAAGGGAATTTGGTATTTGAGAAAATTGAGAATAAGGATTTGATCTCTTGG
AACACTATGGTTGCAGGGTATGGCATACATGGACTTGGTGAGAATGCTATAAGAACTTTT
GATCAGATGATTAAAGATGGCTTTGAGCCAGATGGGGTCACTTTTGTTGCTGTCCTTTCA
GCATGTAGTCATGCTGGGCTTGTCGCTGAGGGCCGTGAACTCTTTGATAAGATGATCAAA
GAGTTCAGGGTTGAGCCCCAGATGGAGCACTATGCTTGTATGGTGGATCTTCTTGGCCGA
GCTGGGCTTCTACAGGAGGCAAGCAAGGTAGTGAAGAGCATGCCAGTGGAACCCAACGCT
TGTGTTTGGGGAGCTCTGCTGAACTCCTGCAGGATGCATAAAAACACAGAAGTGGCAGAG
GAAACTGCCTCTCAGATCTTTAATCTCAACTCAGAAATAGCAGGGAGCTACATGCTGCTC
TCAAATATTTATGCTGCGTCCGGGAGATGGGAGGATTCTGCAAAGGTCAGAATCTCAGCA
AAGACAAAGGGTCTAAAGAAAACCCCAGGCCAGAGTTGGATTCAGGTGAAGAAGAAGGTT
TACATGTTTTCAGCAGGCAACACCCAGCATGCAGAATTGGAAGAAGTTTACAGGATCCTC
AAGGATCTAGGTCTTCAAATGGAGGTAGAAGGCTATATTCCCGACATAGATGAAGAACAG
AGATCGATATTGCTTGGGTACAGGTAG