Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_09s0002g01120.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:9:854287:866960:-1 gene:VIT_09s0002g01120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGAGGATCTCGAAAAGGCGATTCTGATAAGCTTTGATGAATCCGGGAGAGTTGAATCG GCGCTGAAACTGCAAGCAGTGGGGTTTATTGATAAGATAAAGGAGTCGCCTTTGATATGT AGTATATGCGTTGAGCGCTTGTGTTTTTCGAAGCTCGTTCAGGTGCAGTTCTGGTGCTTG CAGTGTTTACATGATGTGATTCGTGTGCGCTACTCTTCGATGAGTTTGGACGAGAAGGGT TTTGTGAGGAAATCCGTGTTTTCCATGGCGTGTTTCGAGCGTTTAGAGGGTGTGGATGAT GAGAGCTCTGTTAGGGTTTTAGAAGGTCCGCCATTCATAAAGAATAAGCTTGCTCAAGTT TTAGTAACTTTGATTTATTTTGAATATCCATTGATTTGGTCTTCGGTTTTTGTTGATTAT CTTCCTCATTTGGGTAAAGGCGCCCCAGTGATCGACATGTTTTGTCGGATTTTGAATGCC TTAGACGATGAATTGATTAGTTTGGACTACACTCGAACTCAGGATGAACTTGTGGTTGCA ACGCGGGTAAAGGATGCCATGAGGCAACAATGTGTGGCTCAGATAGTGAGAGCTTGGTAC AACATTGTATCTTTGTACAGAAATTCTGATCCGGATCTCTGTTCTAGTGTGTTGGACTCA ATGAGAAGATATATTTCTTGGATTGATATTGGGTTAATTGTGAATGATGCCTTTATCCCA TTATTGTTTGAGTTGATTTTGGTCAAGGGATTACCGGAACAACTTCGAGGTTCTGCTGCT GGGTGTGTTTTGGCGGTAGTCTCTAAGCGGATGGATCTGCAAGCCAAGCTCTCACTTTTG CAGAACCTTAAGATTAGTCGGGTTTTTGGGTTGGTGGCCGAGGATAGTGATTCTGAATTG GCTTCAAAAATAGCCTCATTACTCACTGGGTATGCCACAGAACTTCTAGAATGTTCCAAG AAGTTGAATTCTGAGGATCTTAAGCAGACCTCAATGGAGCTTTTGGATGAAGTTTTACCA TCAGTTTTTTTTGTAACACAGAACTGTGAGGTTGACAATGCATTCAGTATCGTTCAGTTT CTTTTGGGTTTTGTGGCCACTATGAAGAGCCTTTCACCTCTGACGGAGAAACAGCTGCTT CATGTGGGCCAGATATTGGAAGTAATACGCACACAGATTTGCTATGATCCTATTTATCGT AATAATCTTGATGTGTTTGATAAAATTGGGAGAGAAGAGGAAGGTAGGATGGTGGAGTTT CGGAAGGATTTCTTTGTGTTACTCCGTAGTGTTGGTCGTGTGGCACCGGATGTCACACAG ATGTTCATCAGAAATTCGTTAGGGAATGCTGTTGCATCTTCATCTGATAGAAATGTAGAA GAGGTAGAAGCTGCACTTTCCCTTTTCTATGCTTTTGGAGAATCAATAAATGATGAGGTG ATGAAAGTTGGAAATGGACCCCTGGGGCAATTGGTGCTGATGCTTTTATCAACAACCTTT GCTTGCCATTCCAATAGGCTGGTTGCACTTGTGTATTTGGAGACAGTAACAAGATATATG AAGTTTGTTCAGGTGAACGACCAATATCTACATTTGGTTCTTGCTGCCTTTCTTGATGAA AGAGGTATACACCATCCAAACATCAATGTGAGTCGAAGGGCAAGTTATCTTTTTATGAGG GTTGTGAAATCACTGAAAGCAAAGCTTGTCCCTTTCATAGAAAATATTTTGCAGAATCTG CAGGATACAGTTGCTCAATTTACGAGAATGAACAGCATGTCAAAAGAGCTTTCTGGATCC GAGGACGGTAGTCACATTTTTGAGGCTATTGGCTTATTAATTGGAATGGAAGATGTACCA CCAGAGAAGCAATCCGAGTACCTATCTTCATTGCTAACTCCTCTTTGTCAACAGGTTGAG GTATTGCTCATAAATGCCAAAGTACAGAATGCAGAGGACCCTGTTGCAAAAATTGCAAAC ATCCAGCAAATAATCATGGCAATTAATGCTTTAAGCAAGGGCTTCAGTGAGCGTCTTGTA ACTGCTAGTCGCCCTGCTATTGGTCTCATGTTTAAGCAGACATTGGATGTCCTTCTCCAA ATTCTTGTTGTATTTCCAAAAATAGAGCCTCTGCGGACTAAGGTTACATCATTTATTCAC CGAATGGTGGACACATTAGGAGCATCTGTATTTCCTTACCTCCCTAAGGCATTGGAACAA TTGCTCGCAGAAAGTGAGCCAAGAGAGTTGGTGGGTTTCCTTGTATTAATCAATCAGCTC ATATGCAAATTCAACACCTTGGTCCGTGACATATTGGAGGAAATATATCCTGCTGTTGCT GGTAGGATATTTAATATTCTCCCAAGGGATCCATTTCCATCAGGACCTGGGAGCAGTACT GAGGAAATCCGTGAGTTGCAAGAACTTCAGCGGACATTGTACACATTTCTCCATGTGATA GCGACACATGATCTGTCTTCAGTTTTCCTTTCCCCAAGAAGCAGGGGCTACTTGGATCCA ATGATGCAGTTGCTATTGCGCACCGCTTGTGGTCACAAGGATACTCTTGTAAGAAAGGCC TGCGTACAGATCTTTATTAGGCTAATTAAAGATTGGTGCACTAGATCTTATGGTGAAGAA ATGGTACCTGGTTTCCAGAGTTTCATAATTGAGGTCTTTGCAACAAACTGTTGTTTGTAC AGTGTGCTTGACAGATCCTTCGAGTTTCGTGATGCTAATACTCTTGTTTTGTTTGGAGAA ATAGTACTGGCTCAGAAGATTATGTATGAGAAATTTGGTAACGAGTTTCTCATTCATTTT GTTTCAAAAGGTTTCCCTGCTGCACATTGCCCTCAAGATTTGGCTGAGGAATATTGTCAA AAATTGCAGGGTAGTGATATAAAGGCTTTGAAATCTTTCTACCAGTCACTCATTGAAAGT TTGAGACACCAACAGAATGGAAGCCTTGTTTTCAGATAG

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_09s0002g01120.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:9:854287:866960:-1 gene:VIT_09s0002g01120 transcript:VIT_09s0002g01120.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MEDLEKAILISFDESGRVESALKLQAVGFIDKIKESPLICSICVERLCFSKLVQVQFWCL QCLHDVIRVRYSSMSLDEKGFVRKSVFSMACFERLEGVDDESSVRVLEGPPFIKNKLAQV LVTLIYFEYPLIWSSVFVDYLPHLGKGAPVIDMFCRILNALDDELISLDYTRTQDELVVA TRVKDAMRQQCVAQIVRAWYNIVSLYRNSDPDLCSSVLDSMRRYISWIDIGLIVNDAFIP LLFELILVKGLPEQLRGSAAGCVLAVVSKRMDLQAKLSLLQNLKISRVFGLVAEDSDSEL ASKIASLLTGYATELLECSKKLNSEDLKQTSMELLDEVLPSVFFVTQNCEVDNAFSIVQF LLGFVATMKSLSPLTEKQLLHVGQILEVIRTQICYDPIYRNNLDVFDKIGREEEGRMVEF RKDFFVLLRSVGRVAPDVTQMFIRNSLGNAVASSSDRNVEEVEAALSLFYAFGESINDEV MKVGNGPLGQLVLMLLSTTFACHSNRLVALVYLETVTRYMKFVQVNDQYLHLVLAAFLDE RGIHHPNINVSRRASYLFMRVVKSLKAKLVPFIENILQNLQDTVAQFTRMNSMSKELSGS EDGSHIFEAIGLLIGMEDVPPEKQSEYLSSLLTPLCQQVEVLLINAKVQNAEDPVAKIAN IQQIIMAINALSKGFSERLVTASRPAIGLMFKQTLDVLLQILVVFPKIEPLRTKVTSFIH RMVDTLGASVFPYLPKALEQLLAESEPRELVGFLVLINQLICKFNTLVRDILEEIYPAVA GRIFNILPRDPFPSGPGSSTEEIRELQELQRTLYTFLHVIATHDLSSVFLSPRSRGYLDP MMQLLLRTACGHKDTLVRKACVQIFIRLIKDWCTRSYGEEMVPGFQSFIIEVFATNCCLY SVLDRSFEFRDANTLVLFGEIVLAQKIMYEKFGNEFLIHFVSKGFPAAHCPQDLAEEYCQ KLQGSDIKALKSFYQSLIESLRHQQNGSLVFR

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_09s0002g01120.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:9:854287:866960:-1 gene:VIT_09s0002g01120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	TTTCGAACTATGGAGGATCTCGAAAAGGCGATTCTGATAAGCTTTGATGAATCCGGGAGA GTTGAATCGGCGCTGAAACTGCAAGCAGTGGGGTTTATTGATAAGATAAAGGAGTCGCCT TTGATATGTAGTATATGCGTTGAGCGCTTGTGTTTTTCGAAGCTCGTTCAGGTGCAGTTC TGGTGCTTGCAGTGTTTACATGATGTGATTCGTGTGCGCTACTCTTCGATGAGTTTGGAC GAGAAGGGTTTTGTGAGGAAATCCGTGTTTTCCATGGCGTGTTTCGAGCGTTTAGAGGGT GTGGATGATGAGAGCTCTGTTAGGGTTTTAGAAGGTCCGCCATTCATAAAGAATAAGCTT GCTCAAGTTTTAGTAACTTTGATTTATTTTGAATATCCATTGATTTGGTCTTCGGTTTTT GTTGATTATCTTCCTCATTTGGGTAAAGGCGCCCCAGTGATCGACATGTTTTGTCGGATT TTGAATGCCTTAGACGATGAATTGATTAGTTTGGACTACACTCGAACTCAGGATGAACTT GTGGTTGCAACGCGGGTAAAGGATGCCATGAGGCAACAATGTGTGGCTCAGATAGTGAGA GCTTGGTACAACATTGTATCTTTGTACAGAAATTCTGATCCGGATCTCTGTTCTAGTGTG TTGGACTCAATGAGAAGATATATTTCTTGGATTGATATTGGGTTAATTGTGAATGATGCC TTTATCCCATTATTGTTTGAGTTGATTTTGGTCAAGGGATTACCGGAACAACTTCGAGGT TCTGCTGCTGGGTGTGTTTTGGCGGTAGTCTCTAAGCGGATGGATCTGCAAGCCAAGCTC TCACTTTTGCAGAACCTTAAGATTAGTCGGGTTTTTGGGTTGGTGGCCGAGGATAGTGAT TCTGAATTGGCTTCAAAAATAGCCTCATTACTCACTGGGTATGCCACAGAACTTCTAGAA TGTTCCAAGAAGTTGAATTCTGAGGATCTTAAGCAGACCTCAATGGAGCTTTTGGATGAA GTTTTACCATCAGTTTTTTTTGTAACACAGAACTGTGAGGTTGACAATGCATTCAGTATC GTTCAGTTTCTTTTGGGTTTTGTGGCCACTATGAAGAGCCTTTCACCTCTGACGGAGAAA CAGCTGCTTCATGTGGGCCAGATATTGGAAGTAATACGCACACAGATTTGCTATGATCCT ATTTATCGTAATAATCTTGATGTGTTTGATAAAATTGGGAGAGAAGAGGAAGGTAGGATG GTGGAGTTTCGGAAGGATTTCTTTGTGTTACTCCGTAGTGTTGGTCGTGTGGCACCGGAT GTCACACAGATGTTCATCAGAAATTCGTTAGGGAATGCTGTTGCATCTTCATCTGATAGA AATGTAGAAGAGGTAGAAGCTGCACTTTCCCTTTTCTATGCTTTTGGAGAATCAATAAAT GATGAGGTGATGAAAGTTGGAAATGGACCCCTGGGGCAATTGGTGCTGATGCTTTTATCA ACAACCTTTGCTTGCCATTCCAATAGGCTGGTTGCACTTGTGTATTTGGAGACAGTAACA AGATATATGAAGTTTGTTCAGGTGAACGACCAATATCTACATTTGGTTCTTGCTGCCTTT CTTGATGAAAGAGGTATACACCATCCAAACATCAATGTGAGTCGAAGGGCAAGTTATCTT TTTATGAGGGTTGTGAAATCACTGAAAGCAAAGCTTGTCCCTTTCATAGAAAATATTTTG CAGAATCTGCAGGATACAGTTGCTCAATTTACGAGAATGAACAGCATGTCAAAAGAGCTT TCTGGATCCGAGGACGGTAGTCACATTTTTGAGGCTATTGGCTTATTAATTGGAATGGAA GATGTACCACCAGAGAAGCAATCCGAGTACCTATCTTCATTGCTAACTCCTCTTTGTCAA CAGGTTGAGGTATTGCTCATAAATGCCAAAGTACAGAATGCAGAGGACCCTGTTGCAAAA ATTGCAAACATCCAGCAAATAATCATGGCAATTAATGCTTTAAGCAAGGGCTTCAGTGAG CGTCTTGTAACTGCTAGTCGCCCTGCTATTGGTCTCATGTTTAAGCAGACATTGGATGTC CTTCTCCAAATTCTTGTTGTATTTCCAAAAATAGAGCCTCTGCGGACTAAGGTTACATCA TTTATTCACCGAATGGTGGACACATTAGGAGCATCTGTATTTCCTTACCTCCCTAAGGCA TTGGAACAATTGCTCGCAGAAAGTGAGCCAAGAGAGTTGGTGGGTTTCCTTGTATTAATC AATCAGCTCATATGCAAATTCAACACCTTGGTCCGTGACATATTGGAGGAAATATATCCT GCTGTTGCTGGTAGGATATTTAATATTCTCCCAAGGGATCCATTTCCATCAGGACCTGGG AGCAGTACTGAGGAAATCCGTGAGTTGCAAGAACTTCAGCGGACATTGTACACATTTCTC CATGTGATAGCGACACATGATCTGTCTTCAGTTTTCCTTTCCCCAAGAAGCAGGGGCTAC TTGGATCCAATGATGCAGTTGCTATTGCGCACCGCTTGTGGTCACAAGGATACTCTTGTA AGAAAGGCCTGCGTACAGATCTTTATTAGGCTAATTAAAGATTGGTGCACTAGATCTTAT GGTGAAGAAATGGTACCTGGTTTCCAGAGTTTCATAATTGAGGTCTTTGCAACAAACTGT TGTTTGTACAGTGTGCTTGACAGATCCTTCGAGTTTCGTGATGCTAATACTCTTGTTTTG TTTGGAGAAATAGTACTGGCTCAGAAGATTATGTATGAGAAATTTGGTAACGAGTTTCTC ATTCATTTTGTTTCAAAAGGTTTCCCTGCTGCACATTGCCCTCAAGATTTGGCTGAGGAA TATTGTCAAAAATTGCAGGGTAGTGATATAAAGGCTTTGAAATCTTTCTACCAGTCACTC ATTGAAAGTTTGAGACACCAACAGAATGGAAGCCTTGTTTTCAGATAGCATTTTCCTGAT ATGCTAATCTGATTATGCTGCTAAATGCTTCTTGTTCTATCCTATTGTCCTCGGTTGTTG GACTTCATTTTTGTTGTCAAAGGGTTCTTTTCTTTCTGTATATAACATTTGTGTGGCTAC CCCCTGAATAGTGAGGTGTAAATTTCCGGAATCAGTTTCTTTGAATATAAAAAAGTTGGC GATATCCATTGGTTTCGAGGTGCTGAGATTTAGTTCAAGTTTCCAGTACGAGTGGTTGTC TATATAACCTTATTGCCCCCCAAAGTTTTGTGCTTCTTGTCTTATCATTTTGTTTCATCT CTCTAAATTCAAACAATTTTCTAGCCTTCTAAACGAGTGGTGGATTATTGTTCATGTGGT CTGTACGTGGAGAGGCGGGGGTACGGTTTATTCTTTTTTATTATGCCAAAAAAGGGGAAA TCAATGAGCCACTGTTTGCCAAATCACCTGTAAGAAAAAGTTTGGGCATGGATTTTCCCA TAGAAATGAGTTCTCCTTTTACATGGCATTCAAAGTGAAGATTTCAGTTTTTTCATATCA ATGATCCATATCACATGTAATTCTTTCAAGCATGCCTCCTTTTCTCCCCAGTTT