Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_08s0058g00890.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:8:10159125:10177168:-1 gene:VIT_08s0058g00890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGGCATTGGGAGATTTGATGGCCTCCCGATTTTCGCAATCTTCGGTGGCCGTTTCGAAC
CACTTGGACGAGTGTTCCAGCCACGAAGATGGGGATTTGAATTCAAATAGGAGGGATAGG
GATTCTGATGCTGCTAGTAGTAGTTATACTAATGCCACTGCGACCACTAGTATGGCCTAT
TTTCCTCAGAATATTGTGCTTTGCGAGCTCCGGCACGAGGCGTTCGAGGCTTGTGCGCCA
TCCGGTCCGTCCGATAGCGGATTGGTCTCGAAATGGCGGCCTAAAGACCGAATGAAGACA
GGATGTGTAGCTCTTGTTTTATGTTTAAACATTAGTGTTGATCCACCTGATGTAATTAAG
ATATCTCCTTGTGCCAGAATGGAGTGCTGGATAGATCCATTTTCTATGGCTCCTCAAAGA
GCACTGGAGATGATTGGAAAAAACTTGAGTGCTCAGTATGAAAGGTGGCAACCCAAGGCC
CGCTGTAAGTATCAACTAGATCCTACTGTGGAGGAAGTGAAGAAACTTTGTAATTCGTGT
CGTAAATATGCCAAGTCTGAGAGAGTTTTGTTTCACTATAATGGACATGGTGTACCAAAG
CCGACTGCTAATGGTGAAATTTGGCTTTTCAATAAGAGCTATACTCAGTATATCCCCTTG
CCAATCAGCGACCTGGATTCCTGGTTGAAGACACCGTCAATATATGTTTTTGATTGCTCT
GCTGCTGGGATGATTGTCAATGCCTTCATAGAGCTCCACGATTGGAATGCTTCTGTTTCC
TCTGGATCTGCAAGGGATTGCATTCTGCTTGCAGCCTGTGAAGCACATGAAACTCTTCCT
CAGAGTGCTGAATTTCCTGCTGATGTGTTCACATCTTGTCTCACTACACCTATCAAGATG
GCATTGAGATGGTTCTGTACACGTTCGTTACTTCGTGAATCCCTTGATTATTCACTGATA
GATAAAATTCCTGGCCGCCAAAATGACCGCAAAACACTTTTGGGAGAACTGAACTGGATC
TTTACAGCAGTGACTGACACCATTGCTTGGAATGTTCTTCCCCATGATCTTTTTCAGAGA
TTGTTCAGGCAAGACCTGTTAGTTGCCAGTCTGTTTCGAAATTTCTTACTTGCTGAGAGA
ATTATGCGATCTGCAAACTGTTCCCCTATTTCACACCCCATGTTGCCCCCAACTCATCAG
CATCATATGTGGGATGCATGGGACATGGCTGCTGAAATCTGCCTTTCTCAGCTTAAGTCA
TTGGTTGATGATCCCAATGCAGAGTTTCAGCCAAGTCCTTTCTTCACTGAGCAGCTGACT
GCTTTTGAGGTATGGCTAGATCATGGATCAGAACACAAGAAACCACCAGAGCAGTTGCCA
ATTGTTCTTCAGGTTTTACTGAGTCAATGCCATCGATTTCGAGCGCTGGTGCTTCTTGGA
AGATTCCTTGATATGGGACCATGGGCTGTAGATCTGGCCCTGTCCGTTGGAATATTTCCA
TATGTTCTGAAGCTGTTGCAAACAACAACTCCAGAATTAAGACAAATTCTTGTATTTATA
TGGACAAAGATCCTTGCACTTGATAAGTCATGTCAGGTTGATCTGGTAAAGGATGGTGGC
CACATATATTTCATCAGGTTTCTTGACAGTGTGGAAGCATATCCTGAACAGCGTGCAATG
GCTGCATTTGTTTTGGCTGTCATTGTGGATGGGCATAAGCGGGGTCAGGAAGCCTGTATT
CGAGCTGGTTTGATAGATGTGTGCTTAAAGCACCTTCAGGGTTCAATTCCAAATGATGGG
CAAACTGAACCTCTATTTCTTCAGTGGCTTTGTCTCTGTCTTGGAAAGCTGTGGGAGGAC
TTCACAGACACACAAATCATAGGTTTGCAGGCAGGTGCCCCAGCTATATACGCACCTCTA
TTATCACTATTATCTGAGCCCCAGCCTGAGGTTAGGGCATCAGCTGTATTTGCATTAGGT
ACCTTGCTTGATGTTGGATTTGACTCAACCCGAGAGGGTACTGGAGATGAAGACTGTGAT
GATGATGATGAAAAGATTAAGGCTGAAATTAGTGTTATTAAAAGCCTTTTAAATGTTGTT
TCAGATGGATCCCCACTGGTCAGGGCAGAGGTTGCTGTAGCTCTCGGACGCTTTGCCTTT
GGCCACAACAAGCACCTGAAGTCGATTGCTGCTGCATATTGGAAACCTCAGTCAAACCTG
CTGAATTCTTTACCATCGTTGGCTCATGCCAAAGGTACTACTAATGTATATACTAATCCA
AACCAATACATGCCATATGGAAGTATTGTTCCTCCAGTTGGTCCTCTGTTGAGGGTTGGC
AATGACAACTCGGTAACTCGAGATGGAAGGGTCTCCACTAGCAGCAGCCCTCTTGCTAAT
ACAGGAATAATGCATGGATCTCCATTGTCTGATGATTCATCTCAACTTTCTGATTCTGGG
ATATTAAATGATGGTGTTAGCAATGGGATTGTTAACCATTCAAGGCCTAAACCACTAGAC
AATGCTATTTATTCACAATGTGTATTGGCTATGCGTGCTTTAGCTAAAGATCCTTCACCA
CGTATTGCCAGCCTTGGTCGGCGAGTTCTTTCTATTATTGGGATAGAACAAGTGGTGAAT
AAACCTGTGAAGTCTGCTGGTACTAGTGTTCGACCTGCTGAACCCACACTATTATCCCCA
ACTCCTAGTCTTATTGGACTAGCTCGTTCAACTTCATGGTTTGACATGAATGGAGGTAAT
TTGCCTATGACCTTTAGAACCCCTCCTGTTAGTCCTCCTCGGCCAAGTTACTTAACAGGA
ATGCGGAGGGTTTATTCTTTAGAGTTCAGGCCACACCAGCTGAATTCTCCAGACACAGGA
TTAGCTGATCCACTTTTGGGTTCAGCTGGATCTTCTGGGGTTTCTGAGCGCAGTTTTCTT
CCACAATCAATTATCTATAATTGGAGTTGTGGCCACTTCTCAAAACCACTTCTCTCTGCA
GCAGATGATAATGAAGAAATATTAGCTAGAAGAGAAGAAAGGGAAAAATTTGCATTGGAT
CACATCTCAAAATGCCAGCACTCATCTGTAAGCAAGCTGAATAATCAAATTGCTAGCTGG
GATACAAGATTTGAGGCAGGGGCAAAAACAGCTTTGCTGCAACCTTTTTCTCCTATTGTA
GTTGCTGCAGACGAGAATGAACGGATCAGGATTTGGAATTATGATGAAGCTACCCTTCTC
AACAGCTTTGACAATCATAATTTTCCTGATAAAGGAATTTCTAAACTCTGCCTTGTGAAC
GAGCTTGATGACAGCTTGCTGCTTGTTGCCTCATGTGATGGAAATGTTCGGATTTGGAAA
GATTACACACTTAGGGGTCAACAGAAACTTGTAACTGCATTCTCTTCAATCCAAGGTCAT
AGACCTGGTGTAAGAAGTGTGAATGCTGTTGTGGACTGGCAACAGCAATCTGGATATCTG
TATGCTGCTGGCGAGATATCATCCATCATGGCTTGGGATCTGGATAAGGAGCAGCTTGTT
TATTCAATTCCTTCATTATCGGATTCCAGCATCTCAGCACTGTCTGCATCTCAAGTTCAT
GGGGGTCAACTTGCAGCTGGTTTTGTGGATGGTTCTGTCAAGCTATTTGATGTCCGAACC
CCTGAAATGCTTGTTTGTGCAGCACGGCCACACACTCAGAGGGTAGAAAGAGTAGTGGGA
ATTGGCTTTCAGCCCGGGCTGGATCCTGCGAAGATTGTGAGTGCATCTCAGGCTGGTGAC
ATTCAGTTCCTTGATGTGAGAAATGGCAATTGTGCCTACCTCACAATTGATGCTCACAGG
GGCTCTCTTACTGCTTTGGCTATTCATCGACATGCCCCGCTTATTGCCAGTGGTTCAGCA
AAACAGATCATCAAAGTCTTTAACCTGGAGGGTTCACAATTAGGCACCATCCGATTCTAC
CCAACCTTCATGGCCCAGAAGATTGGATCTGTGAATTGCCTCACATTTCATCCATATCAG
GTGCTACTTGCTGCTGGTGCTGCAGATGCTCTTGTCTCTATCTATGCTGATGACAACTCT
CAAGCACGATGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_08s0058g00890.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:8:10159125:10177168:-1 gene:VIT_08s0058g00890 transcript:VIT_08s0058g00890.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MALGDLMASRFSQSSVAVSNHLDECSSHEDGDLNSNRRDRDSDAASSSYTNATATTSMAY
FPQNIVLCELRHEAFEACAPSGPSDSGLVSKWRPKDRMKTGCVALVLCLNISVDPPDVIK
ISPCARMECWIDPFSMAPQRALEMIGKNLSAQYERWQPKARCKYQLDPTVEEVKKLCNSC
RKYAKSERVLFHYNGHGVPKPTANGEIWLFNKSYTQYIPLPISDLDSWLKTPSIYVFDCS
AAGMIVNAFIELHDWNASVSSGSARDCILLAACEAHETLPQSAEFPADVFTSCLTTPIKM
ALRWFCTRSLLRESLDYSLIDKIPGRQNDRKTLLGELNWIFTAVTDTIAWNVLPHDLFQR
LFRQDLLVASLFRNFLLAERIMRSANCSPISHPMLPPTHQHHMWDAWDMAAEICLSQLKS
LVDDPNAEFQPSPFFTEQLTAFEVWLDHGSEHKKPPEQLPIVLQVLLSQCHRFRALVLLG
RFLDMGPWAVDLALSVGIFPYVLKLLQTTTPELRQILVFIWTKILALDKSCQVDLVKDGG
HIYFIRFLDSVEAYPEQRAMAAFVLAVIVDGHKRGQEACIRAGLIDVCLKHLQGSIPNDG
QTEPLFLQWLCLCLGKLWEDFTDTQIIGLQAGAPAIYAPLLSLLSEPQPEVRASAVFALG
TLLDVGFDSTREGTGDEDCDDDDEKIKAEISVIKSLLNVVSDGSPLVRAEVAVALGRFAF
GHNKHLKSIAAAYWKPQSNLLNSLPSLAHAKGTTNVYTNPNQYMPYGSIVPPVGPLLRVG
NDNSVTRDGRVSTSSSPLANTGIMHGSPLSDDSSQLSDSGILNDGVSNGIVNHSRPKPLD
NAIYSQCVLAMRALAKDPSPRIASLGRRVLSIIGIEQVVNKPVKSAGTSVRPAEPTLLSP
TPSLIGLARSTSWFDMNGGNLPMTFRTPPVSPPRPSYLTGMRRVYSLEFRPHQLNSPDTG
LADPLLGSAGSSGVSERSFLPQSIIYNWSCGHFSKPLLSAADDNEEILARREEREKFALD
HISKCQHSSVSKLNNQIASWDTRFEAGAKTALLQPFSPIVVAADENERIRIWNYDEATLL
NSFDNHNFPDKGISKLCLVNELDDSLLLVASCDGNVRIWKDYTLRGQQKLVTAFSSIQGH
RPGVRSVNAVVDWQQQSGYLYAAGEISSIMAWDLDKEQLVYSIPSLSDSSISALSASQVH
GGQLAAGFVDGSVKLFDVRTPEMLVCAARPHTQRVERVVGIGFQPGLDPAKIVSASQAGD
IQFLDVRNGNCAYLTIDAHRGSLTALAIHRHAPLIASGSAKQIIKVFNLEGSQLGTIRFY
PTFMAQKIGSVNCLTFHPYQVLLAAGAADALVSIYADDNSQAR

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_08s0058g00890.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:8:10159125:10177168:-1 gene:VIT_08s0058g00890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

AATGGACATAAACCCACACCCACAGCCACAGTCCTCTATTCTCACAAAATCCTTTTTCTC
GGACCTCCTTTTTGCTCTGCCGCCACTTCTATATGCGCCTCCCTTCTCATCATCATCACC
ACCAACACCACCGCCGCCTAGGGTTTCTAGAGTTTTCGGAGGCCCACTGGTCTCTCCTCT
TCGGCATTTCTAGGGTTTTCCGAGCTGGATTCGCTCTCCTTTCTCAGGCGAATCTCCATG
CGCCGCTGGTTTAGCGGCTTCGTTGATTAGGTTACAAAGGCCTCCTCTCGATCGCGTGAT
TGCGGACAAAGCGAGGCCTTTCGTGCTTCTTCTCCTTCTTTGATTTTCGTTATGATTTTT
TCTTGTTTTTGCTTTGGTGATGCGCTGGGCCGTTGTCGATTAGGGCAAGGTTGATTTCGG
TTGTATCGCTTTGCGTTGGTTCTCGATTTGAATGGCATTGGGAGATTTGATGGCCTCCCG
ATTTTCGCAATCTTCGGTGGCCGTTTCGAACCACTTGGACGAGTGTTCCAGCCACGAAGA
TGGGGATTTGAATTCAAATAGGAGGGATAGGGATTCTGATGCTGCTAGTAGTAGTTATAC
TAATGCCACTGCGACCACTAGTATGGCCTATTTTCCTCAGAATATTGTGCTTTGCGAGCT
CCGGCACGAGGCGTTCGAGGCTTGTGCGCCATCCGGTCCGTCCGATAGCGGATTGGTCTC
GAAATGGCGGCCTAAAGACCGAATGAAGACAGGATGTGTAGCTCTTGTTTTATGTTTAAA
CATTAGTGTTGATCCACCTGATGTAATTAAGATATCTCCTTGTGCCAGAATGGAGTGCTG
GATAGATCCATTTTCTATGGCTCCTCAAAGAGCACTGGAGATGATTGGAAAAAACTTGAG
TGCTCAGTATGAAAGGTGGCAACCCAAGGCCCGCTGTAAGTATCAACTAGATCCTACTGT
GGAGGAAGTGAAGAAACTTTGTAATTCGTGTCGTAAATATGCCAAGTCTGAGAGAGTTTT
GTTTCACTATAATGGACATGGTGTACCAAAGCCGACTGCTAATGGTGAAATTTGGCTTTT
CAATAAGAGCTATACTCAGTATATCCCCTTGCCAATCAGCGACCTGGATTCCTGGTTGAA
GACACCGTCAATATATGTTTTTGATTGCTCTGCTGCTGGGATGATTGTCAATGCCTTCAT
AGAGCTCCACGATTGGAATGCTTCTGTTTCCTCTGGATCTGCAAGGGATTGCATTCTGCT
TGCAGCCTGTGAAGCACATGAAACTCTTCCTCAGAGTGCTGAATTTCCTGCTGATGTGTT
CACATCTTGTCTCACTACACCTATCAAGATGGCATTGAGATGGTTCTGTACACGTTCGTT
ACTTCGTGAATCCCTTGATTATTCACTGATAGATAAAATTCCTGGCCGCCAAAATGACCG
CAAAACACTTTTGGGAGAACTGAACTGGATCTTTACAGCAGTGACTGACACCATTGCTTG
GAATGTTCTTCCCCATGATCTTTTTCAGAGATTGTTCAGGCAAGACCTGTTAGTTGCCAG
TCTGTTTCGAAATTTCTTACTTGCTGAGAGAATTATGCGATCTGCAAACTGTTCCCCTAT
TTCACACCCCATGTTGCCCCCAACTCATCAGCATCATATGTGGGATGCATGGGACATGGC
TGCTGAAATCTGCCTTTCTCAGCTTAAGTCATTGGTTGATGATCCCAATGCAGAGTTTCA
GCCAAGTCCTTTCTTCACTGAGCAGCTGACTGCTTTTGAGGTATGGCTAGATCATGGATC
AGAACACAAGAAACCACCAGAGCAGTTGCCAATTGTTCTTCAGGTTTTACTGAGTCAATG
CCATCGATTTCGAGCGCTGGTGCTTCTTGGAAGATTCCTTGATATGGGACCATGGGCTGT
AGATCTGGCCCTGTCCGTTGGAATATTTCCATATGTTCTGAAGCTGTTGCAAACAACAAC
TCCAGAATTAAGACAAATTCTTGTATTTATATGGACAAAGATCCTTGCACTTGATAAGTC
ATGTCAGGTTGATCTGGTAAAGGATGGTGGCCACATATATTTCATCAGGTTTCTTGACAG
TGTGGAAGCATATCCTGAACAGCGTGCAATGGCTGCATTTGTTTTGGCTGTCATTGTGGA
TGGGCATAAGCGGGGTCAGGAAGCCTGTATTCGAGCTGGTTTGATAGATGTGTGCTTAAA
GCACCTTCAGGGTTCAATTCCAAATGATGGGCAAACTGAACCTCTATTTCTTCAGTGGCT
TTGTCTCTGTCTTGGAAAGCTGTGGGAGGACTTCACAGACACACAAATCATAGGTTTGCA
GGCAGGTGCCCCAGCTATATACGCACCTCTATTATCACTATTATCTGAGCCCCAGCCTGA
GGTTAGGGCATCAGCTGTATTTGCATTAGGTACCTTGCTTGATGTTGGATTTGACTCAAC
CCGAGAGGGTACTGGAGATGAAGACTGTGATGATGATGATGAAAAGATTAAGGCTGAAAT
TAGTGTTATTAAAAGCCTTTTAAATGTTGTTTCAGATGGATCCCCACTGGTCAGGGCAGA
GGTTGCTGTAGCTCTCGGACGCTTTGCCTTTGGCCACAACAAGCACCTGAAGTCGATTGC
TGCTGCATATTGGAAACCTCAGTCAAACCTGCTGAATTCTTTACCATCGTTGGCTCATGC
CAAAGGTACTACTAATGTATATACTAATCCAAACCAATACATGCCATATGGAAGTATTGT
TCCTCCAGTTGGTCCTCTGTTGAGGGTTGGCAATGACAACTCGGTAACTCGAGATGGAAG
GGTCTCCACTAGCAGCAGCCCTCTTGCTAATACAGGAATAATGCATGGATCTCCATTGTC
TGATGATTCATCTCAACTTTCTGATTCTGGGATATTAAATGATGGTGTTAGCAATGGGAT
TGTTAACCATTCAAGGCCTAAACCACTAGACAATGCTATTTATTCACAATGTGTATTGGC
TATGCGTGCTTTAGCTAAAGATCCTTCACCACGTATTGCCAGCCTTGGTCGGCGAGTTCT
TTCTATTATTGGGATAGAACAAGTGGTGAATAAACCTGTGAAGTCTGCTGGTACTAGTGT
TCGACCTGCTGAACCCACACTATTATCCCCAACTCCTAGTCTTATTGGACTAGCTCGTTC
AACTTCATGGTTTGACATGAATGGAGGTAATTTGCCTATGACCTTTAGAACCCCTCCTGT
TAGTCCTCCTCGGCCAAGTTACTTAACAGGAATGCGGAGGGTTTATTCTTTAGAGTTCAG
GCCACACCAGCTGAATTCTCCAGACACAGGATTAGCTGATCCACTTTTGGGTTCAGCTGG
ATCTTCTGGGGTTTCTGAGCGCAGTTTTCTTCCACAATCAATTATCTATAATTGGAGTTG
TGGCCACTTCTCAAAACCACTTCTCTCTGCAGCAGATGATAATGAAGAAATATTAGCTAG
AAGAGAAGAAAGGGAAAAATTTGCATTGGATCACATCTCAAAATGCCAGCACTCATCTGT
AAGCAAGCTGAATAATCAAATTGCTAGCTGGGATACAAGATTTGAGGCAGGGGCAAAAAC
AGCTTTGCTGCAACCTTTTTCTCCTATTGTAGTTGCTGCAGACGAGAATGAACGGATCAG
GATTTGGAATTATGATGAAGCTACCCTTCTCAACAGCTTTGACAATCATAATTTTCCTGA
TAAAGGAATTTCTAAACTCTGCCTTGTGAACGAGCTTGATGACAGCTTGCTGCTTGTTGC
CTCATGTGATGGAAATGTTCGGATTTGGAAAGATTACACACTTAGGGGTCAACAGAAACT
TGTAACTGCATTCTCTTCAATCCAAGGTCATAGACCTGGTGTAAGAAGTGTGAATGCTGT
TGTGGACTGGCAACAGCAATCTGGATATCTGTATGCTGCTGGCGAGATATCATCCATCAT
GGCTTGGGATCTGGATAAGGAGCAGCTTGTTTATTCAATTCCTTCATTATCGGATTCCAG
CATCTCAGCACTGTCTGCATCTCAAGTTCATGGGGGTCAACTTGCAGCTGGTTTTGTGGA
TGGTTCTGTCAAGCTATTTGATGTCCGAACCCCTGAAATGCTTGTTTGTGCAGCACGGCC
ACACACTCAGAGGGTAGAAAGAGTAGTGGGAATTGGCTTTCAGCCCGGGCTGGATCCTGC
GAAGATTGTGAGTGCATCTCAGGCTGGTGACATTCAGTTCCTTGATGTGAGAAATGGCAA
TTGTGCCTACCTCACAATTGATGCTCACAGGGGCTCTCTTACTGCTTTGGCTATTCATCG
ACATGCCCCGCTTATTGCCAGTGGTTCAGCAAAACAGATCATCAAAGTCTTTAACCTGGA
GGGTTCACAATTAGGCACCATCCGATTCTACCCAACCTTCATGGCCCAGAAGATTGGATC
TGTGAATTGCCTCACATTTCATCCATATCAGGTGCTACTTGCTGCTGGTGCTGCAGATGC
TCTTGTCTCTATCTATGCTGATGACAACTCTCAAGCACGATGAATGCATATTCTTTCATG
ATTATATGCTTGATAACAGGCTTCAATTCGGAGGCTGCAAAGTGCACATCAACTTACATC
AAGATATCACCAAAATCAGTGCACTTGGGTCTTCAGGCGTGTCACATTCTGCTGCCCCAA
TACCTCTTCGCACTCAATGTTTCTGGAAATGCTGTCTGGGCATGCTGTGTTGAAATTGTA
TGCTATATATATTCATTAGCCTCCAGTGGAGAGGATCACACATGTTGGGAAGGAATGCTG
GGAAGTTCATTGGAGGCTTTGGCAAATAATCTCTCATATATATATATATAT