Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_08s0058g00620.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:8:9710698:9717411:-1 gene:VIT_08s0058g00620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGTCTTAGGGAGGAAAGCTGATGGAAGTTCACCTTTTACTGCAAGCCTATCGAATAGT TCCATAAGCGCTAGAAACTTGAGGAAGGGTCACCTTGGTGGAGTCATATTTGGCTGCAAG AACAGCACCATAAAAGAATGTCTTTTTAAACAACTCTTTGGTTTACCAGCTCAACATTTT TTATATGTAAAGAATGTTGATCCTGGTTTGCCACTGTTTCTATTCAACTACAGTGATAGG AAATTGCATGGAATATTTGAAGCTGCTAGTCCTGGTCAAATGAACATCAATCCATATGGA TGGACAACAGATGGTGCGGAGAGAACACTCTATCCTGCACAGGTTCAGATCCGTGTCCGG CTACAATGCCAACCACTACCTGAAGAGCAATTTAGACCAATTATTGCAGATAACTACTAC AGTCAGAGCCATTTCTGGTTTGAGCTGGACCATGCTCAAGCAAGTAAGTTGATCTCCTTA TTATCATCTCGAGCAGTTGCTCCAAGTGCTTCTGTGCCACAAAATTCTGCAGCATGGAGG ACTCTGTTCCGACCTCTGCCTCTATGCAACAAGAAAGAGGAAGGTGAAGACTCTAAGCCA CCTTCAAAGATTGATTCTGCTCATTCTGATCAGTTAGATAGGAAATTGGGTTCTTCAGAT GTTGCTCCATGTTTAGATGAAAGCAATTTACCCCTTGAAGCTTCCTCAGATAAACAGGTG GTGGAAAATGATGAGAAGGGCCTTATACTTTTAAAACTTCAGGAATTGGTTCTTAATCGA GAATATAAGGACTCATCTTCATCGAGCTATGTAGAAGATTCTGCTGTTGTGAATGATTCA CATTTGGATGACAAAGGTCTTGTAAAGGAACAAATGGTTTTAGAAGACAGGAATGAAGAT AGTCCGGTTTCTTCATCTGATTTTCACCCTGTCATTGCACAGTTGATCAGGGAAGAGCTA AAGGGTTTCAAAGCAGAATATATTCAAAGGATGAGTTACATGGAGCAGAGGCTGGCTGAT GCAGAGAAAGAAATTCAACAATTAAAAGAGCATTGTATGATGTTGGAATCTATATGTAGT CCCTCCATGTCACTAGTTGATCAAACTGTGAATGAGTCATTTGATGAAATGAATATGGAT CCTGATGATTTGATATTCCTAGTGGGTGGATGTGATGGTGAATCATGGTTATCAACTTTG GATTCTTATTCACCTTCTCAGGATATGAAGAAATCTCTTAGTCCTATGACTATGCCTCGT TCTTATGCCTCAGTTGCAGTGTTAAATGGTGAGCTTTACATATTTGGTGGTGGAAATGGT TCTGAGTGGTATGACACAGTTGAAGCATACAACCTTGTTAGTAACGAATGGACTTTACGC GCTCCTTTGAATAAGGAAAAAGGAAGCTTAGCTGGTGCCACTTTAAATGGAAAAATATTT GCTCTTGGTGGTGGAAATGGAATTGAATGCTTTTCAGATGTTGATATGTTTGACTTAGAT GTTGGACGTTGGATCCCTACACGGTCTATGTTACAAAAGAGATTTGCTCTTGGAGCAGCA GAGCTTAATGGTGTGCTGTATGCGGTTGGGGGATATGATGGAAAAGATTATTTGAATTCT GTTGAAAGACTTGACCCCAGAGAACATTCTTGGACCAGAATTGGAGGGATGAAAACAAAG AGGGGTTCTCACACGGTGGTGGTTTTGAATGAAAAGTTATATGCTATGGGTGGTTTTGAT GGAAATACAATGGTTCCAAGTGTTGAAATATATGATCCTCGTGTTGATTCATGGATGGAT GGGGACTCAATGAACCAGTCAAGGGGATATTCAGCTGCTGCCGTTGTTAACAAGTCTATT TATGTAATCGGAGGGGTGGAAGATGGTGAAAATGTTGTTGGCACTGTTGAACTTTATGAG GAAGGTGAGGGTTGGCGAGTGATAAAGCAGACAGCCATTGGGAAAAGGTGTTTTGCCTCA GCCATAGTTCCATGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_08s0058g00620.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:8:9710698:9717411:-1 gene:VIT_08s0058g00620 transcript:VIT_08s0058g00620.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MVLGRKADGSSPFTASLSNSSISARNLRKGHLGGVIFGCKNSTIKECLFKQLFGLPAQHF LYVKNVDPGLPLFLFNYSDRKLHGIFEAASPGQMNINPYGWTTDGAERTLYPAQVQIRVR LQCQPLPEEQFRPIIADNYYSQSHFWFELDHAQASKLISLLSSRAVAPSASVPQNSAAWR TLFRPLPLCNKKEEGEDSKPPSKIDSAHSDQLDRKLGSSDVAPCLDESNLPLEASSDKQV VENDEKGLILLKLQELVLNREYKDSSSSSYVEDSAVVNDSHLDDKGLVKEQMVLEDRNED SPVSSSDFHPVIAQLIREELKGFKAEYIQRMSYMEQRLADAEKEIQQLKEHCMMLESICS PSMSLVDQTVNESFDEMNMDPDDLIFLVGGCDGESWLSTLDSYSPSQDMKKSLSPMTMPR SYASVAVLNGELYIFGGGNGSEWYDTVEAYNLVSNEWTLRAPLNKEKGSLAGATLNGKIF ALGGGNGIECFSDVDMFDLDVGRWIPTRSMLQKRFALGAAELNGVLYAVGGYDGKDYLNS VERLDPREHSWTRIGGMKTKRGSHTVVVLNEKLYAMGGFDGNTMVPSVEIYDPRVDSWMD GDSMNQSRGYSAAAVVNKSIYVIGGVEDGENVVGTVELYEEGEGWRVIKQTAIGKRCFAS AIVP

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_08s0058g00620.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:8:9710698:9717411:-1 gene:VIT_08s0058g00620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGGTCTTAGGGAGGAAAGCTGATGGAAGTTCACCTTTTACTGCAAGCCTATCGAATAGT TCCATAAGCGCTAGAAACTTGAGGAAGGGTCACCTTGGTGGAGTCATATTTGGCTGCAAG AACAGCACCATAAAAGAATGTCTTTTTAAACAACTCTTTGGTTTACCAGCTCAACATTTT TTATATGTAAAGAATGTTGATCCTGGTTTGCCACTGTTTCTATTCAACTACAGTGATAGG AAATTGCATGGAATATTTGAAGCTGCTAGTCCTGGTCAAATGAACATCAATCCATATGGA TGGACAACAGATGGTGCGGAGAGAACACTCTATCCTGCACAGGTTCAGATCCGTGTCCGG CTACAATGCCAACCACTACCTGAAGAGCAATTTAGACCAATTATTGCAGATAACTACTAC AGTCAGAGCCATTTCTGGTTTGAGCTGGACCATGCTCAAGCAAGTAAGTTGATCTCCTTA TTATCATCTCGAGCAGTTGCTCCAAGTGCTTCTGTGCCACAAAATTCTGCAGCATGGAGG ACTCTGTTCCGACCTCTGCCTCTATGCAACAAGAAAGAGGAAGGTGAAGACTCTAAGCCA CCTTCAAAGATTGATTCTGCTCATTCTGATCAGTTAGATAGGAAATTGGGTTCTTCAGAT GTTGCTCCATGTTTAGATGAAAGCAATTTACCCCTTGAAGCTTCCTCAGATAAACAGGTG GTGGAAAATGATGAGAAGGGCCTTATACTTTTAAAACTTCAGGAATTGGTTCTTAATCGA GAATATAAGGACTCATCTTCATCGAGCTATGTAGAAGATTCTGCTGTTGTGAATGATTCA CATTTGGATGACAAAGGTCTTGTAAAGGAACAAATGGTTTTAGAAGACAGGAATGAAGAT AGTCCGGTTTCTTCATCTGATTTTCACCCTGTCATTGCACAGTTGATCAGGGAAGAGCTA AAGGGTTTCAAAGCAGAATATATTCAAAGGATGAGTTACATGGAGCAGAGGCTGGCTGAT GCAGAGAAAGAAATTCAACAATTAAAAGAGCATTGTATGATGTTGGAATCTATATGTAGT CCCTCCATGTCACTAGTTGATCAAACTGTGAATGAGTCATTTGATGAAATGAATATGGAT CCTGATGATTTGATATTCCTAGTGGGTGGATGTGATGGTGAATCATGGTTATCAACTTTG GATTCTTATTCACCTTCTCAGGATATGAAGAAATCTCTTAGTCCTATGACTATGCCTCGT TCTTATGCCTCAGTTGCAGTGTTAAATGGTGAGCTTTACATATTTGGTGGTGGAAATGGT TCTGAGTGGTATGACACAGTTGAAGCATACAACCTTGTTAGTAACGAATGGACTTTACGC GCTCCTTTGAATAAGGAAAAAGGAAGCTTAGCTGGTGCCACTTTAAATGGAAAAATATTT GCTCTTGGTGGTGGAAATGGAATTGAATGCTTTTCAGATGTTGATATGTTTGACTTAGAT GTTGGACGTTGGATCCCTACACGGTCTATGTTACAAAAGAGATTTGCTCTTGGAGCAGCA GAGCTTAATGGTGTGCTGTATGCGGTTGGGGGATATGATGGAAAAGATTATTTGAATTCT GTTGAAAGACTTGACCCCAGAGAACATTCTTGGACCAGAATTGGAGGGATGAAAACAAAG AGGGGTTCTCACACGGTGGTGGTTTTGAATGAAAAGTTATATGCTATGGGTGGTTTTGAT GGAAATACAATGGTTCCAAGTGTTGAAATATATGATCCTCGTGTTGATTCATGGATGGAT GGGGACTCAATGAACCAGTCAAGGGGATATTCAGCTGCTGCCGTTGTTAACAAGTCTATT TATGTAATCGGAGGGGTGGAAGATGGTGAAAATGTTGTTGGCACTGTTGAACTTTATGAG GAAGGTGAGGGTTGGCGAGTGATAAAGCAGACAGCCATTGGGAAAAGGTGTTTTGCCTCA GCCATAGTTCCATGAGGGAACAATATTTGATATGGTGGCAAATGGGTAGAGGCTTCATGT CGGGCATTTTTTTGTGAAGTCATGGGATGGAAAGCTACCCATGTTCTGCAATTGAGTGGG AACATGGGAGACTAAAATCTTAAATGGCTCTCACTTTTGCCATTTTTGGTAATCCTTGAA TCAGCCTTCCCCATTACGTCGCAGCAATGTAAAAGCATTTTGATTTTGGCCATAAAGTAG TATAGTTCT