Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Vitis vinifera ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID	VIT_08s0040g02940.t01
CDS Infomation	cds chromosome:12X:8:13964471:13966598:1 gene:VIT_08s0040g02940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGGCTCACAAAGTTTCTTCAAATTCAAATATCGCCCACTCCCAACGGTGGAATCCAC CACTGTCTACAAAACCTCTGCAGCGTCAATGGACTCGACTATGGCGCTTTCGGCCGTCTC ATCCAACACTGCAGCGACCACCGCCTCCTGCGTCAGGCCAAGCAGCTTCACGCCCGCATC GTTCTGTCGTCTCTTACGCCTGACAACTTCCTTGCTTCAAAGCTCATCACTTTTTACTCG AAGTCCAATCATCTTTATGAAGCGCACAAGGTGTTCGATAAAATTCTTGACAAGAACATC TTTTCTTGGAACGCTATGCTCATTGGGTACTCCATTCATAACATGCATGTGCACACGCTT AATCTGTTATCGTCTCTGCTGCCGTCTTATTCCCTCACTCTGAAACCTGATAATTTCACG ATCACTTGTGTTTTAAAGGCGCTATCGGTTTTATTTCCTGACTCAATCTTGGCTAAGGAG GTTCAATGCTTTGTTTTACGGCATGGATTTGATTCGGATATCTTTGTTGTCAATGCTCTG ATTACCTACTACTCGAGATGTGATGAATATGGTATAGCGAGAATTTTGTTTGATAGGATG CATGACAGAGATATTGTATCATGGAATTCGATGATTGCGGGCTATTCACAGGGTGGGTTT TATGAAGATTGCAAGGAGTTGTATAGAAAAATGCTAGATTCAACAGGGTTGAGACCAAAT GGCGTAACAGTGGTCAGTGTTTTGCAGGCCTGTGCACAGACAAATGATCTCGTTTTTGGG ATGAAAGTTCACCAGTTTATAATTGAAAGAAAGGTTGAGATGGATGTTTCAGCCCATAAT TCGCTTATTGGGTTATATGCGAAATGTGGGAGCTTGGATTATGCTCGAGAATTATTTAAT GAGATGAGTAACAAGGATGAAGTCACTTACGGGTCAATTGTATCTGGGTACATGACTCAT GGGTTTGTTGACAAAGCCATGGATCTTTTTCGGGAAATGAAAAACCCAAGATTGAGTACA TGGAATGCTGTGATTTCAGGACTGGTTCAGAACAACTGCAATGAGGGCATTTTGGAATTA GTTCAAGAGATGCAGGAATTTGGGTTTAGGCCAAATGCTGTGACGCTTTCTAGTATTCTT CCTACATTTTCTTGTTTTTCAAATCTTAAAGGAGGGAAAGCAATTCATGCGTATGCTATT AGGAATGGTTATGCTCATAATATTTATGTGGCAACTTCCATTATTGATGCTTATGCAAAA TTAGGATTTCTTCGTGGGGCACAATGGGTTTTCGATCAATCAAAGGATAGGAGCTTGATA GTTTGGACAGCAATAATCTCAGCATATTCAGCCCATGGAGATGCTAATGCAGCCCTTAGG TTGTTTGGTGATATGCTGAGTAATGGAACTCAGCCTGACCCTGTCACTTTCACTGCAGTG TTAGCAGCTTGTGCCCATTCTGGGATGGTCAATGAAGCTTGGAAGATATTTGATGAGATG TTTCTAAAATATGGCTTTCAGCCCTGTGTTGAACATTATGCTTGCATGGTAGGAGTTCTA AGCCGAGCTGGAATGCTCTCTGAAGCAGCAGAATTCATTTGTAAAATGCCAATTGAACCA AATGCCAAAGTTTGGGGTGCACTGCTCAATGGGGTTTCAGTTTCTGGTGATGTTGAACTT GGGAAGTTTGTTTGTGATCATTTGTTCAATATGGAGCCTGAAAACACAGGTAATTATGTC ATTATGGCAAATTTATACTCACAAGCTGGGAGATGGGAAGAAGCTGAAAATATTAGGGAG AAGATGAAGAAAATTGGTTTGAAGAAGATCCCAGGAACAAGTTGGATTGAAACAAGTGGA GGGTTACGAAGCTTTATAGCTAGGGATGTATCAAGTGAAAGATCTGAAGAGATATATGGG ATGCTGGAAGGGTTGCTTGGGTTGATGAGAGAAGAAGGGTACACTTTGCAGGATGAGCTT GATGAGGAGTGTGCTTATATTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	VIT_08s0040g02940.t01
PEP Infomation	pep chromosome:12X:8:13964471:13966598:1 gene:VIT_08s0040g02940 transcript:VIT_08s0040g02940.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	MRLTKFLQIQISPTPNGGIHHCLQNLCSVNGLDYGAFGRLIQHCSDHRLLRQAKQLHARI VLSSLTPDNFLASKLITFYSKSNHLYEAHKVFDKILDKNIFSWNAMLIGYSIHNMHVHTL NLLSSLLPSYSLTLKPDNFTITCVLKALSVLFPDSILAKEVQCFVLRHGFDSDIFVVNAL ITYYSRCDEYGIARILFDRMHDRDIVSWNSMIAGYSQGGFYEDCKELYRKMLDSTGLRPN GVTVVSVLQACAQTNDLVFGMKVHQFIIERKVEMDVSAHNSLIGLYAKCGSLDYARELFN EMSNKDEVTYGSIVSGYMTHGFVDKAMDLFREMKNPRLSTWNAVISGLVQNNCNEGILEL VQEMQEFGFRPNAVTLSSILPTFSCFSNLKGGKAIHAYAIRNGYAHNIYVATSIIDAYAK LGFLRGAQWVFDQSKDRSLIVWTAIISAYSAHGDANAALRLFGDMLSNGTQPDPVTFTAV LAACAHSGMVNEAWKIFDEMFLKYGFQPCVEHYACMVGVLSRAGMLSEAAEFICKMPIEP NAKVWGALLNGVSVSGDVELGKFVCDHLFNMEPENTGNYVIMANLYSQAGRWEEAENIRE KMKKIGLKKIPGTSWIETSGGLRSFIARDVSSERSEEIYGMLEGLLGLMREEGYTLQDEL DEECAYI

Transcript Sequence

Transcript ID	VIT_08s0040g02940.t01
Transcript Infomation	cdna chromosome:12X:8:13964471:13966598:1 gene:VIT_08s0040g02940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding
Sequence	ATGAGGCTCACAAAGTTTCTTCAAATTCAAATATCGCCCACTCCCAACGGTGGAATCCAC CACTGTCTACAAAACCTCTGCAGCGTCAATGGACTCGACTATGGCGCTTTCGGCCGTCTC ATCCAACACTGCAGCGACCACCGCCTCCTGCGTCAGGCCAAGCAGCTTCACGCCCGCATC GTTCTGTCGTCTCTTACGCCTGACAACTTCCTTGCTTCAAAGCTCATCACTTTTTACTCG AAGTCCAATCATCTTTATGAAGCGCACAAGGTGTTCGATAAAATTCTTGACAAGAACATC TTTTCTTGGAACGCTATGCTCATTGGGTACTCCATTCATAACATGCATGTGCACACGCTT AATCTGTTATCGTCTCTGCTGCCGTCTTATTCCCTCACTCTGAAACCTGATAATTTCACG ATCACTTGTGTTTTAAAGGCGCTATCGGTTTTATTTCCTGACTCAATCTTGGCTAAGGAG GTTCAATGCTTTGTTTTACGGCATGGATTTGATTCGGATATCTTTGTTGTCAATGCTCTG ATTACCTACTACTCGAGATGTGATGAATATGGTATAGCGAGAATTTTGTTTGATAGGATG CATGACAGAGATATTGTATCATGGAATTCGATGATTGCGGGCTATTCACAGGGTGGGTTT TATGAAGATTGCAAGGAGTTGTATAGAAAAATGCTAGATTCAACAGGGTTGAGACCAAAT GGCGTAACAGTGGTCAGTGTTTTGCAGGCCTGTGCACAGACAAATGATCTCGTTTTTGGG ATGAAAGTTCACCAGTTTATAATTGAAAGAAAGGTTGAGATGGATGTTTCAGCCCATAAT TCGCTTATTGGGTTATATGCGAAATGTGGGAGCTTGGATTATGCTCGAGAATTATTTAAT GAGATGAGTAACAAGGATGAAGTCACTTACGGGTCAATTGTATCTGGGTACATGACTCAT GGGTTTGTTGACAAAGCCATGGATCTTTTTCGGGAAATGAAAAACCCAAGATTGAGTACA TGGAATGCTGTGATTTCAGGACTGGTTCAGAACAACTGCAATGAGGGCATTTTGGAATTA GTTCAAGAGATGCAGGAATTTGGGTTTAGGCCAAATGCTGTGACGCTTTCTAGTATTCTT CCTACATTTTCTTGTTTTTCAAATCTTAAAGGAGGGAAAGCAATTCATGCGTATGCTATT AGGAATGGTTATGCTCATAATATTTATGTGGCAACTTCCATTATTGATGCTTATGCAAAA TTAGGATTTCTTCGTGGGGCACAATGGGTTTTCGATCAATCAAAGGATAGGAGCTTGATA GTTTGGACAGCAATAATCTCAGCATATTCAGCCCATGGAGATGCTAATGCAGCCCTTAGG TTGTTTGGTGATATGCTGAGTAATGGAACTCAGCCTGACCCTGTCACTTTCACTGCAGTG TTAGCAGCTTGTGCCCATTCTGGGATGGTCAATGAAGCTTGGAAGATATTTGATGAGATG TTTCTAAAATATGGCTTTCAGCCCTGTGTTGAACATTATGCTTGCATGGTAGGAGTTCTA AGCCGAGCTGGAATGCTCTCTGAAGCAGCAGAATTCATTTGTAAAATGCCAATTGAACCA AATGCCAAAGTTTGGGGTGCACTGCTCAATGGGGTTTCAGTTTCTGGTGATGTTGAACTT GGGAAGTTTGTTTGTGATCATTTGTTCAATATGGAGCCTGAAAACACAGGTAATTATGTC ATTATGGCAAATTTATACTCACAAGCTGGGAGATGGGAAGAAGCTGAAAATATTAGGGAG AAGATGAAGAAAATTGGTTTGAAGAAGATCCCAGGAACAAGTTGGATTGAAACAAGTGGA GGGTTACGAAGCTTTATAGCTAGGGATGTATCAAGTGAAAGATCTGAAGAGATATATGGG ATGCTGGAAGGGTTGCTTGGGTTGATGAGAGAAGAAGGGTACACTTTGCAGGATGAGCTT GATGAGGAGTGTGCTTATATTTGAGCATGGAATCATCAAATATCAATGGATTTGTTGCCG ATTCAGAATATACATGATGTGCAAAGGCCATCGTGATTCATGGTGAATGTTCCCACCTTC AAGAGATACCCTTTTGGTTAAAATTCCT