Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Vitis vinifera

CDS Sequence

CDS ID

VIT_08s0040g01800.t01

CDS Infomation

cds chromosome:12X:8:12916459:12920258:-1 gene:VIT_08s0040g01800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ATGGCATGCATGAAGCTGGGCTCTAAACCTGAAGCCTTTCACCGTGAAGGCCATACCTGG
TTTTGCACAACTGGACTTCCAAGCGATGTTGCTGTTGAAATTGGTGAAATGTCCTTTAAT
CTCCACAAGTTTCCATTGCTTTCAAGAAGTGGTTTACTGGAAAAGCTTATAGAAAATTGC
TCCAATGAGGATGGATCCCATTGTGTTTTACAACTTCATGAATTACCTGGTGGGGCTAAG
GCATTTGAACTTGTAACAAAATTTTGCTATGGTGTTAAAATAGAGCTCACTTCTTTGAAC
ATAGTCAGCCTTAGGTGTGCGGCAGAGTACCTTCAAATGAATGAAAATTACGGCGAGGGA
AATCTTATTGCACAAACAGAGGGTTTCCTCAATGAAGTTTTCAGCAATTGGGTGGACTCA
ATAAAAGCTCTTGGAACATGTGAAGTTCTACCATATGCTGAGGATCTTCATATTGTTTCA
AGATGCATCGATTCATTGGCAATGAAAGCTTGTGCAGACCCAACCTTATTTGGTTGGCCT
GTGTCAGGTTGTACCAATGTGCAGAGTCCAGCAGGTGTCGTCTTATGGAATGGAATATCT
ACTGTGAATAAGCCACAATCAGTGCGTGAAGATTGGTGGTATGGAGATGTGTCCTTCCTT
AGTTTACCTTTCTATAAACGAATGATGCAAGCTGTTGAATTGAGAGGGATGAAGCCTGAG
AGAGTTGCTGGCTCCCTCATTTTCTATGCTAAGAGGTATCTCCCCTTGATGAATAGACAA
TCTAGCTTCAAGGATACAAATCATGTCAACCCAGGGACAACCATTCCCACTCCTTCTGAG
GCAGATCAAAGGGCTCTCCTAGAAGATATTGTGGATTTACTTCCTAATCAGAAGGGGGTC
ACATCGACTAAGTTTCTTCTTAGGCTGCTCCGAACAGCTATGATCTTGCATACAAGTTCA
TTATGTAGAGAAAATTTGGAGAGGAGGGTAGGAGCCCAATTGGACCAAGCTGTACTTGAG
GATCTTCTTATACCAAATATGGGTTATTCAGTAGAAACCCTCTATGATATAGACTGTGTT
CAGAGGATTCTTGATCATTTCATGTCAGTGGAGAATACTGCAGTTGCAACAGCTTCTCCA
TGTATAGTTGAGGAGGGAAAGTTGATGGATGGGCCTGATTTCCTGACACCTGTGATGTTG
GTGGCCAATCTGGTGGATGGATATCTTGCTGAGGTGGCACCAGATGTTAATTTGAAGTTA
CCAAAATTTCAGTCACTTGCTGCTGCTGTACCTGATTATGCTAGACCAGTTAATGACAGC
ATTTACCATGCAATTGATCTATACCTTAAGGCACATCCTTGGCTTATAGATTCGGAGAGA
GAGCAGATCTGCAGACTCATGAATTGCCAGAAGCTCTCATTAGAGGCCAGCACCCATGCT
GCTCAGAATGAGAGGCTACCTCTCCGAGTAATTGTCCAAGTCCTCTTCTTTGAACAGCTT
CGCCTCCGAACAACAGTTTCTGGTTGGTTCTTTGTGTCCGACAATCTTGCAAACTCACAA
GATCCCAATGACAACCTTGGGATCCCCAAAACTGATGGTTCCCATCAAGTGGACCCTGAA
CAAGATCATGGTGCTGGTGTTGATGACATGAGAGAGCGTGTTTTGGAGCTTGAGAAAGAG
TGCTTGAGCATGAAACAAGAGATTCAGAAGCTGGTGAAGATGAAGAGAAGTTGGAACATC
ATTCCCAAAATGTTGGTTTTTAGGCAAAAATCACAACGTTGCAATTCAAAAAAATCAAGG
CCGTGCGATGTAAAGACACCATTATCCTCTTCAAATGGGCACCAAAATCATGAACATGGT
GAGTTGGGCAATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

VIT_08s0040g01800.t01

PEP Infomation

pep chromosome:12X:8:12916459:12920258:-1 gene:VIT_08s0040g01800 transcript:VIT_08s0040g01800.t01 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

MACMKLGSKPEAFHREGHTWFCTTGLPSDVAVEIGEMSFNLHKFPLLSRSGLLEKLIENC
SNEDGSHCVLQLHELPGGAKAFELVTKFCYGVKIELTSLNIVSLRCAAEYLQMNENYGEG
NLIAQTEGFLNEVFSNWVDSIKALGTCEVLPYAEDLHIVSRCIDSLAMKACADPTLFGWP
VSGCTNVQSPAGVVLWNGISTVNKPQSVREDWWYGDVSFLSLPFYKRMMQAVELRGMKPE
RVAGSLIFYAKRYLPLMNRQSSFKDTNHVNPGTTIPTPSEADQRALLEDIVDLLPNQKGV
TSTKFLLRLLRTAMILHTSSLCRENLERRVGAQLDQAVLEDLLIPNMGYSVETLYDIDCV
QRILDHFMSVENTAVATASPCIVEEGKLMDGPDFLTPVMLVANLVDGYLAEVAPDVNLKL
PKFQSLAAAVPDYARPVNDSIYHAIDLYLKAHPWLIDSEREQICRLMNCQKLSLEASTHA
AQNERLPLRVIVQVLFFEQLRLRTTVSGWFFVSDNLANSQDPNDNLGIPKTDGSHQVDPE
QDHGAGVDDMRERVLELEKECLSMKQEIQKLVKMKRSWNIIPKMLVFRQKSQRCNSKKSR
PCDVKTPLSSSNGHQNHEHGELGN

Transcript Sequence

Transcript ID

VIT_08s0040g01800.t01

Transcript Infomation

cdna chromosome:12X:8:12916459:12920258:-1 gene:VIT_08s0040g01800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding

Sequence

ACATGGCATGCATGAAGCTGGGCTCTAAACCTGAAGCCTTTCACCGTGAAGGCCATACCT
GGTTTTGCACAACTGGACTTCCAAGCGATGTTGCTGTTGAAATTGGTGAAATGTCCTTTA
ATCTCCACAAGTTTCCATTGCTTTCAAGAAGTGGTTTACTGGAAAAGCTTATAGAAAATT
GCTCCAATGAGGATGGATCCCATTGTGTTTTACAACTTCATGAATTACCTGGTGGGGCTA
AGGCATTTGAACTTGTAACAAAATTTTGCTATGGTGTTAAAATAGAGCTCACTTCTTTGA
ACATAGTCAGCCTTAGGTGTGCGGCAGAGTACCTTCAAATGAATGAAAATTACGGCGAGG
GAAATCTTATTGCACAAACAGAGGGTTTCCTCAATGAAGTTTTCAGCAATTGGGTGGACT
CAATAAAAGCTCTTGGAACATGTGAAGTTCTACCATATGCTGAGGATCTTCATATTGTTT
CAAGATGCATCGATTCATTGGCAATGAAAGCTTGTGCAGACCCAACCTTATTTGGTTGGC
CTGTGTCAGGTTGTACCAATGTGCAGAGTCCAGCAGGTGTCGTCTTATGGAATGGAATAT
CTACTGTGAATAAGCCACAATCAGTGCGTGAAGATTGGTGGTATGGAGATGTGTCCTTCC
TTAGTTTACCTTTCTATAAACGAATGATGCAAGCTGTTGAATTGAGAGGGATGAAGCCTG
AGAGAGTTGCTGGCTCCCTCATTTTCTATGCTAAGAGGTATCTCCCCTTGATGAATAGAC
AATCTAGCTTCAAGGATACAAATCATGTCAACCCAGGGACAACCATTCCCACTCCTTCTG
AGGCAGATCAAAGGGCTCTCCTAGAAGATATTGTGGATTTACTTCCTAATCAGAAGGGGG
TCACATCGACTAAGTTTCTTCTTAGGCTGCTCCGAACAGCTATGATCTTGCATACAAGTT
CATTATGTAGAGAAAATTTGGAGAGGAGGGTAGGAGCCCAATTGGACCAAGCTGTACTTG
AGGATCTTCTTATACCAAATATGGGTTATTCAGTAGAAACCCTCTATGATATAGACTGTG
TTCAGAGGATTCTTGATCATTTCATGTCAGTGGAGAATACTGCAGTTGCAACAGCTTCTC
CATGTATAGTTGAGGAGGGAAAGTTGATGGATGGGCCTGATTTCCTGACACCTGTGATGT
TGGTGGCCAATCTGGTGGATGGATATCTTGCTGAGGTGGCACCAGATGTTAATTTGAAGT
TACCAAAATTTCAGTCACTTGCTGCTGCTGTACCTGATTATGCTAGACCAGTTAATGACA
GCATTTACCATGCAATTGATCTATACCTTAAGGCACATCCTTGGCTTATAGATTCGGAGA
GAGAGCAGATCTGCAGACTCATGAATTGCCAGAAGCTCTCATTAGAGGCCAGCACCCATG
CTGCTCAGAATGAGAGGCTACCTCTCCGAGTAATTGTCCAAGTCCTCTTCTTTGAACAGC
TTCGCCTCCGAACAACAGTTTCTGGTTGGTTCTTTGTGTCCGACAATCTTGCAAACTCAC
AAGATCCCAATGACAACCTTGGGATCCCCAAAACTGATGGTTCCCATCAAGTGGACCCTG
AACAAGATCATGGTGCTGGTGTTGATGACATGAGAGAGCGTGTTTTGGAGCTTGAGAAAG
AGTGCTTGAGCATGAAACAAGAGATTCAGAAGCTGGTGAAGATGAAGAGAAGTTGGAACA
TCATTCCCAAAATGTTGGTTTTTAGGCAAAAATCACAACGTTGCAATTCAAAAAAATCAA
GGCCGTGCGATGTAAAGACACCATTATCCTCTTCAAATGGGCACCAAAATCATGAACATG
GTGAGTTGGGCAATTGA